Automated genome mining for natural products

Abstract Background Discovery of new medicinal agents from natural sources has largely been an adventitious process based on screening of plant and microbial extracts combined with bioassay-guided identification and natural product structure elucidation. Increasingly rapid and more cost-effective genome sequencing technologies coupled with advanced computational power have converged to transform this trend toward a more rational and predictive pursuit. Results We have developed a rapid method of scanning genome sequences for multiple polyketide, nonribosomal peptide, and mixed combination natural products with output in a text format that can be readily converted to two and three dimensional structures using conventional software. Our open-source and web-based program can assemble various small molecules composed of twenty standard amino acids and twenty two other chain-elongation intermediates used in nonribosomal peptide systems, and four acyl-CoA extender units incorporated into polyketides by reading a hidden Markov model of DNA. This process evaluates and selects the substrate specificities along the assembly line of nonribosomal synthetases and modular polyketide synthases. Conclusion Using this approach we have predicted the structures of natural products from a diverse range of bacteria based on a limited number of signature sequences. In accelerating direct DNA to metabolomic analysis, this method bridges the interface between chemists and biologists and enables rapid scanning for compounds with potential therapeutic value.http://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/112362/1/12859_2008_Article_2915.pd

Towards a qualified classicism

The intent of this thesis is to first, demonstrate that classicism remains valid as an underlying idea for the creation of architecture and second, that in order to exist in a meaningful and critical position, classicism must be 'qualified.' The term qualification is meant to describe the shift that has occurred in the nature of classicism since the Enlightenment. Classicism is no longer absolute and pure. The purity and unity of classical canon have been violated, compromised, and inverted since this time. A qualified classicism acknowledges this violation not through pastiche or image appropriation, but in a critical synthesis. There is no turning back to the times of the ancients, for modernism is now part of our architectural heritage as much as classicism is. However, classicism has been the basis for Western architecture for over 2, years -- and at its heart lie principles which are timeless and permanent. Idealization, hierarchy,and centrality are among several principles that may form a solid basis for an architecture, regardless of style. These principles may be used as a syntax or datum, which may them be? qualified by more relative and contemporary concerns. The introduction to the paper establishes the validity of classicism and the need for qualification. The next two sections describe how Sir Edwin Lutyens and Le Corbusier approach the idea of a qualified classicism in their work. The examples used for each are the Viceroy's Residence in New Delhi, and the Capitol complex at Chandigarh, respectively. They were chosen because of their unique proximity in time and place, and because they demonstrate that a qualified classicism can be approached from two poles; Lutyens from the normative and Corb from the relative. In the conclusion , several points are set forth which delineate the characteristics for a qualified classicism. The design project accompanying this thesis is a design for a city hall in College Station, Texas

Analysis of night sky pollution with artificial light, emitted by existing sports buildings, using DIALux simulation software

W niniejszym artykule przedstawione zostały możliwości analizy poziomu zanieczyszczenia nieboskłonu nocnego światłem sztucznym, pochodzącym z obiektów sportowych, takich jak stadiony, czy boiska piłkarskie. Za pomocą oprogramowania symulacyjnego DIALux stworzono model komputerowy Stadionu Miejskiego, znajdującego się w Białymstoku oraz wykonano symulacje i obliczenia, na podstawie których określono ilość strumienia świetlnego, wydobywającego się poza obszar badanego obiektu. Pomiary przeprowadzono dla różnych wysokości chmur, uwzględniając odpowiedni współczynnik odbicia światła. Jednocześnie oznaczono poziom natężenia oświetlenia na powierzchni dróg, biegnących obok Stadionu Miejskiego oraz przeanalizowano możliwości wykorzystania światła pochodzącego z obiektu sportowego, w celu poprawy efektywności energetycznej oświetlenia drogowego w okolicy badanego budynku.This article presents the possibilities of analyzing the level of the night sky pollution by artificial light from sports buildings such as stadiums and football pitches. Using the DIALux simulation software, a computer model of the Municipal Stadium in Bialystok was created and simulations and calculations were also made. On this basis, the number of luminous flux emitted outside the area of the tested object was determined. The measurements were carried out for different cloud heights, taking into account the appropriate light reflection coefficient. At the same time, the level of illuminance on the roads surfaces next to the Municipal Stadium was determined and the possibilities of using the light coming from the sports buildings were analyzed in order to improve the energy efficiency of road lighting in the area next to analyzed building

History of the light in Poland

The article presents the most important events in the development of lighting technology. In the next part discusses the development history of research centers, the most deserved characters and the current state lighting technology in Poland.Artykuł przedstawia najważniejsze wydarzenia w rozwoju techniki świetlnej. W dalszej części opracowanie omawia historię ośrodków naukowych, najbardziej zasłużone postacie oraz stan obecny techniki świetlnej w Polsce

Modelling of illuminance distribution on the optical way cooperating with phosphor

Luminofory fosforowe stosowane do źródeł półprzewodnikowych współpracują z quasi-monochromatycznym źródłem promieniowania z zakresu barwy niebieskiej i emitują światło białe. Długość fali promieniowania wmuszającego zawiera się w wąskim przedziale absorpcyjnym materiału luminescencyjnego dla którego uzyskiwane są określone parametry barwne. Zmiana charakteru spektralnego promieniowania pierwotnego wpływa na sprawność konwersji oraz parametry kolorymetryczne strumienia wyjściowego uzyskiwanego w wyniku fotoluminescencji. Realizacja układu złożonego z kilku niezależnych emiterów półprzewodnikowych sprzężonych z torem optycznym pozwoli na oświetlenie wybranego fragmentu powierzchni luminoforu oraz sterowanie zakresem widmowym promieniowania wymuszającego. Geometria prowadnicy optycznej powinna zapewnić wysoką sprawność układu, jak również równomierność oświetlanej powierzchni luminoforu. Artykuł przedstawia analizę procesu formowania wiązki świetlnej w torze optycznym, w zależności od jej wymiarów geometrycznych oraz usytuowania źródła promieniowania.Used for white semiconductor light sources phosphoric phosphors cooperate with quasi–monochromatic blue light source. Forcing radiation wavelength closes in narrow adsorption range of phosphor material for with exact colour parameters are achieved. Primary radiation spectral nature alteration affects conversion efficiency and colorimetric parameters of optical flux obtained by photoluminescence. Realization of the system containing few independent semiconductor emitters coupled with optical path will allow to illuminate selected phosphor surface and control forcing radiation spectral range. Optical way geometry should ensure system high efficiency, as well as illuminated phosphorus surface uniformity. Article presents the analysis of light beam formation process in optical path, depending on its geometrical dimensions and light source location

Modelling flux phosfor forsed halogen source

Luminofory fosforowe stosowane do diod elektroluminescencyjnych współpracują z emiterami półprzewodnikowymi emitującymi promieniowanie z zakresu VIS o fali długości 440-480 nm (barwa niebieska). W artykule przedstawiono pomiary charakterystyk spektralnych dla przypadku, gdy źródłem wymuszającym fotoluminescencje jest żarówka halogenowa o ciągłym widmie promieniowania zbliżonym do rozkładu Plancka. Kształtowanie bryły fotometrycznej powierzchni luminoforu która emituje promieniowanie zbliżone do rozsyłu lambertowskiego należy rozpatrywać jako zbiór punktów świetlnych. Analiza doboru wielkości luminoforu oraz kształtu reflektora współpracującego z powierzchnią emitującą światło prowadzi do określenia sprawności oprawy, kształtu i profilu wiązki wyjściowej. W artykule przedstawiono również model matematyczny konstrukcji świetlno-optycznej współpracującej z luminoforem i odbłyśnikiem parabolicznym oraz wyniki obliczeń symulacyjnych.Phosphorous used in the light-emitting diode emitters cooperate with the semiconductor emitters emitting VIS radiation of wave length in range 440-480nm (blue). The article shows results of spectral characteristics for the case when the source forcing the photoluminescence is a halogen lamp with a continuous spectrum of radiation close to the Planck spectral distribution. Analysis size phosphor and the shape of the reflector cooperating with a light-emitting surface leads to a determination in efficiency, the shape and profile of the output beam. The paper also presents the mathematical model of lightand- optical cooperating with phosphor and parabolic reflector and the results of calculations lighting system

Inverter control of paraller active power filter with TOSLINK optical transmission

Artykuł przedstawia wyniki badań równoległego filtra aktywnego poprawiającego właściwości odbiornika nieliniowego, w którym wykorzystano transmisję sygnałów sterujących łączem światłowodowym. Transmisję światłowodową zrealizowano przy wykorzystaniu układu TOTO/ TORX 173 i polimerowego włókna optycznego (POF). Dotychczasowe rozwiązania wykorzystujące klasyczne łącza miedziane sprawdzały się do transmisji na odległość tylko rzędu kilkunastu centymetrów, ze względu na bardzo duże zniekształcenia wynikające z oddziaływania zewnętrznego pola elektromagnetycznego na przewody transmisyjne. Stosując optyczne łącze światłowodowe uzyskano poprawną pracę układu z możliwością odseparowania modułów sterujących na odległość rzędu 10 m, z perspektywą wydłużenia linii transmisyjnej, wykorzystując technikę WDM.The paper presents investigation results of the parallel active power filter, which improves the propriety of nonlinear receiver set. Control system is using the TOSLINK optical link transmission.The optical systems of data transmision usually be used in telecommunicational optical nets, audio-video connection or there, where assured the suitable quality of signal has to be. The light is insensitive on electromagnetic field, under regard his speed of changes and the value of field amplitude. This optical track proprieties can transfer information in subject to electromagnetic disturbance environments Fig. 4) [3]. The system control was executed in two ways. Technologically simpler was the system of individual input-output channels (Fig. 5). The more advanced WDM system (Fig. 6), was using the multiplexation and demultiplexation of optical signal broadcast with single fiber. The transoptors elimination from control systems and leaning in their place the optical broadcast system besed on TOTX/TORX 173 (Fig. 7) improves the quality of steering signal quality and increases the transmission band in comparison to integrated arrangements. The use of optical fiber separation permits on shortening the distance between module and inverter. The signal analysis from oscilloscope (Fig. 8) shows small delay, which results from the time of detection by TORX and insignificant disconnection time of TOTX. The test of optical link was executed by the optical fiber of length nearly 10 m

Use of solar radiation in shaping the energy efficiency in public buildings

Zwiększanie efektywności energetycznej jest realizowane poprzez zmniejszanie zużycia energii i ograniczenie jej strat. Racjonalne wykorzystywanie dostępnych źródeł energii, systemy automatyki oraz odpowiednia architektura budynku, należą do przedsięwzięć służących poprawie efektywności energetycznej budynków. W artykule przedstawiono główne wymagania dotyczące zapotrzebowania budynku użyteczności publicznej na energię, metodykę obliczania zapotrzebowania na energię dla budynku oraz znaczenie promieniowania słonecznego w kształtowaniu bilansu energetycznego budynków. Głównym celem opracowania było wskazanie wybranych narzędzi oraz programów do przeprowadzania analiz technicznych, ekonomicznych i środowiskowych systemów fotowoltaicznych i systemów kolektorów słonecznych.Increasing energy efficiency is achieved by reducing energy consumption and limiting its losses. The rational use of available energy sources, automation systems and proper building architecture belong to projects aimed at improving the energy efficiency of buildings. The article describes the main requirements for public building demand for energy, the methodology for calculating the energy requirements for the building and the impact of solar radiation in shaping the energy balance of buildings. The main aim of the study was to indicate most widely used tools and programs to conduct analysis of technical, economic and environmental systems, solar photovoltaic and solar thermal systems

Diagnosis of glow plugs using thermography

Przedstawiono inowacyjny sposób diagnostyki świec żarowych za pomocą termowizji. Artykuł pokazuje alternatywny sposób ich diagnostyki, bez potrzeby ich wymontowywania. Zostały załączone zdjęcia z kamery termowizyjnej świec żarowych kilku aut o silniku diesla.Shows inovation method for the diagnosis of glow plugs using thermal imaging. The article shows an alternative method of diagnosis, without having to remove them from the vehicle. They have attached photos of the infrared camera of glow plugs of several cars with diesel engine