Tekoälyn potentiaali organisaatioiden tietoturvan hallinnassa

Tämän tutkimuksen tavoitteena oli selvittää, millainen potentiaali laajoilla kielimalleilla on organisaatioiden tietoturvan hallinnassa. Tarkoituksena oli kartoittaa kielimallien käyttömahdollisuuksia sekä käyttöönoton haasteita tietoturvan hallinnassa. Laajat kielimallit, jotka ovat eräs tekoälyn sovellusmuoto, kykenevät käsittelemään ja generoimaan erilaisia tekstejä. Tietoturvan hallinnalla pyritään suojaamaan organisaation tiedot varmistamalla tietojen saatavuus, eheys ja luottamuksellisuus. Sekä kielimallit että tietoturvan hallinta ovat tutkimusalueina merkittävässä murrosvaiheessa teknologian kehittymisen vuoksi. Tämän tutkimuksen toteuttaminen koettiin perustelluksi, koska kielimallien osuutta tietoturvan hallinnassa on tutkimuskirjallisuudessa käsitelty varsin niukasti. Tutkimusaihetta käsittelevä kirjallisuus koostui pääosin vertaisarvioiduista akateemisista artikkeleista. Kirjallisuuskatsaus toteutettiin narratiivisena ja se käsiteltiin kolmessa osassa. Ensin kartoitettiin tietoturvan hallintaa yleisellä tasolla, minkä jälkeen perehdyttiin laajojen kielimallien ominaisuuksiin ja haasteisiin. Kirjallisuuskatsauksen päätteeksi tarkasteltiin vielä kielimallien hyödyntämistä tietoturvan hallinnassa. Kirjallisuuskatsauksen avulla laadittiin tutkielmalle teoreettinen viitekehys. Tutkimusaiheen luonteen vuoksi tutkimusmenetelmäksi valikoitui laadullinen tutkimus. Empiirinen aineisto perustui kahteen teemahaastatteluun, joissa asiantuntijoilta kysyttiin näkemyksiä kielimallien potentiaalista tietoturvan hallinnasta. Haastattelut litteroitiin ja dokumentoitiin tutkielman empiirisessä osassa, jonka jälkeen aineistoa analysoitiin suhteessa kirjallisuuskatsauksessa esiin nousseisiin aihealueen pääkohtiin. Tutkimuksen tulokset mukailivat pääsääntöisesti kirjallisuuskatsauksessa tehtyjä havaintoja. Kielimallien todettiin olevan tekstinkäsittelyä tehostavia työkaluja, jotka kykenevät tuottamaan varsin yksityiskohtaista tekstiä, analysoimaan suuria datamääriä sekä avustamaan ideoinnissa. Näitä kykyjä voidaan hyödyntää muun muassa tietoturvapolitiikkojen luomisessa, raporttien kirjoittamisessa, räätälöityjen koulutusmateriaalien laatimisessa, osittaisessa prosessien automatisoinnissa sekä tietoturvallisen ohjelmistokoodin tuottamisessa. Toisaalta tutkimuksessa ilmeni myös kielimallien hyödyntämiseen liittyviä haasteita. Sensitiivisen datan käsittely tekoälyn kanssa herättää epäluottamusta, ja kielimallien käyttöönottoon on iso digitalisaatiokynnys. Tämän tutkimuksen perusteella kielimalleilla on potentiaalia avustaa organisaatioita työn tehostamisen työkaluna. Tutkimus tarjoaa näkökulmia kielimallien käyttömahdollisuuksista organisaatioiden tietoturvan hallintaan sekä käsittelee sen käyttöönottoon liittyviä haasteita ja rajoituksia

A multistage antimalarial targets the plasmepsins IX and X essential for invasion and egress.

: Regulated exocytosis by secretory organelles is important for malaria parasite invasion and egress. Many parasite effector proteins, including perforins, adhesins, and proteases, are extensively proteolytically processed both pre- and postexocytosis. Here we report the multistage antiplasmodial activity of the aspartic protease inhibitor hydroxyl-ethyl-amine-based scaffold compound 49c. This scaffold inhibits the preexocytosis processing of several secreted rhoptry and microneme proteins by targeting the corresponding maturases plasmepsins IX (PMIX) and X (PMX), respectively. Conditional excision of PMIX revealed its crucial role in invasion, and recombinantly active PMIX and PMX cleave egress and invasion factors in a 49c-sensitive manner.<br/

Compositional and expression analyses of the glideosome during the Plasmodium life cycle reveal an additional myosin light chain required for maximum motility

Myosin A (MyoA) is a Class XIV myosin implicated in gliding motility and host cell and tissue invasion by malaria parasites. MyoA is part of a membrane-associated protein complex called the glideosome, which is essential for parasite motility and includes the MyoA light chain MTIP, and several glideosome-associated proteins (GAPs). However, most studies of MyoA have focused on single stages of the parasite life cycle. We examined MyoA expression throughout the Plasmodium berghei life cycle in both mammalian and insect hosts. In extracellular ookinetes, sporozoites and merozoites, MyoA was located at the parasite periphery. In the sexual stages, zygote formation and initial ookinete differentiation precede MyoA synthesis and deposition, which occurred only in the developing protuberance. In developing intracellular asexual blood stages, MyoA was synthesized in mature schizonts and was located at the periphery of segmenting merozoites, where it remained throughout maturation, merozoite egress and host cell invasion. Besides the known GAPs in the malaria parasite, the complex included GAP40, an additional myosin light chain designated essential light chain (ELC) and several other candidate components. This ELC bound the MyoA neck region adjacent to the MTIP binding site, and both myosin light chains co-located to the glideosome. Co-expression of MyoA with its two light chains revealed that the presence of both light chains enhances MyoA-dependent actin motility. In conclusion, we have established a system to study the interplay and function of the three glideosome components, enabling the assessment of inhibitors that target this motor complex to block host cell invasion

A rapid antibody screening haemagglutination test for predicting immunity to SARS-CoV-2 variants of concern

Background: Evaluation of susceptibility to emerging SARS-CoV-2 variants of concern (VOC) requires rapid screening tests for neutralising antibodies which provide protection. Methods: Firstly, we developed a receptor-binding domain-specific haemagglutination test (HAT) to Wuhan and VOC (alpha, beta, gamma and delta) and compared to pseudotype, microneutralisation and virus neutralisation assays in 835 convalescent sera. Secondly, we investigated the antibody response using the HAT after two doses of mRNA (BNT162b2) vaccination. Sera were collected at baseline, three weeks after the first and second vaccinations from older (80–99 years, n = 89) and younger adults (23–77 years, n = 310) and compared to convalescent sera from naturally infected individuals (1–89 years, n = 307). Results: Here we show that HAT antibodies highly correlated with neutralising antibodies (R = 0.72–0.88) in convalescent sera. Home-dwelling older individuals have significantly lower antibodies to the Wuhan strain after one and two doses of BNT162b2 vaccine than younger adult vaccinees and naturally infected individuals. Moverover, a second vaccine dose boosts and broadens the antibody repertoire to VOC in naïve, not previously infected older and younger adults. Most (72–76%) older adults respond after two vaccinations to alpha and delta, but only 58–62% to beta and gamma, compared to 96–97% of younger vaccinees and 68–76% of infected individuals. Previously infected older individuals have, similarly to younger adults, high antibody titres after one vaccination. Conclusions: Overall, HAT provides a surrogate marker for neutralising antibodies, which can be used as a simple inexpensive, rapid test. HAT can be rapidly adaptable to emerging VOC for large-scale evaluation of potentially decreasing vaccine effectiveness.publishedVersio

SARS-CoV-2 specific immune responses in overweight and obese COVID-19 patients

Obesity is a known risk factor for severe respiratory tract infections. In this prospective study, we assessed the impact of being obese or overweight on longitudinal SARS-CoV-2 humoral and cellular responses up to 18 months after infection. 274 patients provided blood samples at regular time intervals up to 18 months including obese (BMI ≥30, n=32), overweight (BMI 25-29.9, n=103) and normal body weight (BMI 18.5-24.9, n=134) SARS-CoV-2 patients. We determined SARS-CoV-2 spike-specific IgG, IgA, IgM levels by ELISA and neutralising antibody titres by neutralisation assay. RBD- and spike-specific memory B cells were investigated by ELISpot, spike- and non-spike-specific IFN-γ, IL-2 and IFN-γ/IL-2 secreting T cells by FluoroSpot and T cell receptor (TCR) sequencing was performed. Higher BMI correlated with increased COVID-19 severity. Humoral and cellular responses were stronger in overweight and obese patients than normal weight patients and associated with higher spike-specific IgG binding titres relative to neutralising antibody titres. Linear regression models demonstrated that BMI, age and COVID-19 severity correlated independently with higher SARS-CoV-2 immune responses. We found an increased proportion of unique SARS-CoV-2 specific T cell clonotypes after infection in overweight and obese patients. COVID-19 vaccination boosted humoral and cellular responses irrespective of BMI, although stronger immune boosting was observed in normal weight patients. Overall, our results highlight more severe disease and an over-reactivity of the immune system in overweight and obese patients after SARS-CoV-2 infection, underscoring the importance of recognizing overweight/obese individuals as a risk group for prioritisation for COVID-19 vaccination

Structural studies and in vivo characterisation of Oct4:PORE and Oct4/Sox2:UTF1 complexes

Monikykyiset kantasolut pystyvät erilaistumaan alkion kehityksen aikana miksi tahansa kehittyvän eläimen kudokseksi. Alkion kehitystä on tutkittu vuosikymmeniä ja ensimmäisen kerran kantasoluja viljeltiin 1980-luvulla. Noin vuosikymmen myöhemmin kloonattiin ensimmäinen nisäkäs, Dolly-lammas, mikä oli läpimurto perimän kloonauksessa. Vajaa kymmenen vuotta sitten japanilaiset tutkijat pystyivät ensimmäisen kerran tuottamaan indusoituja monikykyisiä kantasoluja. Nämä kantasolut tuotettiin ilmentämällä neljää geeniä, jotka uudelleenohjelmoivat erilaistuneet solut takaisin kantasoluiksi. Geenien ilmentymistä säätelevä ja DNA:han sitoutuvan proteiinin Oct4:n on todettu olevan tärkeä tekijä uudelleenohjelmissa. Oct4 kuuluu transkriptiotekijäperheeseen, joka säätelee geenien ilmentymistä kantasoluissa. Tässä työssä kiteytin Oct4-proteiinin sen kohde-DNA:n kanssa sekä tutkin sen sitoutumista ja atomitason rakennetta röntgensädekristallografian avulla. Tutkimuksessamme paljastui useita Oct4:n atomitason rakenteellisia ominaisuuksia, jotka selittävät sen säätelymekanismeja kantasoluissa.

Opiskelija - rikka vai rikkaus?: kyselytutkimus optikoille ohjattua harjoittelua suorittavista opiskelijoista

Ohjattu harjoittelu työelämässä on merkittävä osa optometrian opintoja. Ohjatut harjoittelujaksot antavat opiskelijalle mahdollisuuden tutustua tulevaan ammattiinsa ja saada kokonaisvaltaisen käsityksen omasta alastaan. Ohjattu harjoittelu on tärkeä tekijä asiantuntijuuden kasvussa, sillä suurin osa työelämässä tarvittavasta tietotaidosta saadaan juuri työelämästä. Ohjatusta harjoittelusta on hyötyä myös yrityksen näkökulmasta, sillä opiskelijoiden kanssa työskentely antaa mahdollisuuden henkilöstön ammatilliseen kasvuun ja helpottaa esimerkiksi yrityksen rekrytointia. Tutkimuksemme tarkoituksena oli kuvailla, millaisena optikot kokevat optometristiopiskelijan ohjatun harjoittelun optikkoliikkeessä ja millaisia harjoittelussa olevan opiskelijan taitoja he arvostavat sekä miten optikot kokevat työelämän muutosten vaikuttaneen opiskelijan ohjatun harjoittelun onnistumiseen. Tutkimuksemme tavoitteena on, että opiskelijat osaavat painottaa opinnoissaan työelämän kannalta tärkeitä osa-alueita. Myös opettajamme saavat tietoa, joka auttaa heitä ohjeistamaan harjoitteluun valmistautuvia opiskelijoita sekä toisaalta optikot saavat työpaikalleen taidoiltaan hyvin työelämään soveltuvia opiskelijoita. Tutkimuksemme oli kvantitatiivinen kyselytutkimus kaikille Suomen Optikoiden Ammattiliittoon kuuluville optikoille. Aineisto kerättiin sähköisesti Webropol-kyselynä. Kyselylomakkeemme sisälsi pääosin monivalintakysymyksiä, mutta mukana oli myös muutamia kysymyksiä, joissa oli yksi tai useampi avoin vastausvaihtoehto. Vastaajia oli yhteensä 145. Analysoimme aineiston käyttämällä Webropol 2.0 –sovellusta ja loimme tuloksiamme selkeyttävät kuviot ja taulukot Excel-ohjelmalla. Tutkimustuloksista ilmeni, että opiskelijoiden läsnäolo koetaan yleisesti ottaen myönteisenä. Opiskelijat tuovat työpaikoille ajankohtaista tietoa sekä auttavat kyseenalaistamaan työpaikan käytänteitä ollessaan ohjatussa harjoittelussa. Vastaajat arvostivat eniten opiskelijoiden asiakaspalvelu- ja vuorovaikutustaitoja. Opiskelijan tärkeimmiksi ominaisuuksiksi optikot valitsivat halun oppia, oma-aloitteisuuden ja myönteisen asenteen. Lisäksi tutkimustuloksista selvisi, että etenkin opiskelijan opastamiseen käytettävä aika sekä opiskelijoiden mahdollisuudet harjoitella pajataitoja ovat viime vuosina vähentyneet.Practical training is a significant part of studies in optometry. In practical training students have an opportunity to familiarise themselves with their future profession. Practical training is an important factor in the development of expertise because most of the knowledge needed in working life is obtained from the working life itself. Practical training is beneficial also from a company’s point of view, because working with students gives the employees an opportunity to professional development and makes, for example, recruiting new employees easier. The purpose of our study was to describe how optometrists experienced the practical training of optometry students in an optical store and what kind of skills were appreciated by opticians in trainees duing practical training. We also studied how the opticians experienced the changes in working life in relation to the practical training. We used a quantitative method in our study. A questionaire was sent to all opticians who are members of The National Union of Opthalmic Opticians. We used Webropol application to collect our data electronically. The questionnaire consisted mostly of multiple choice questions, but there were also some open-ended questions. We got in total 145 replys. We analyzed our data using Webropol 2.0 Online Survey and Analysis Software and created the figures and tables with Excel program to clarify the results. The results revealed that opticians felt the presence of students mostly in a positive way. Opticians experienced that the students brought current information to their workplace, and they could question the practices. Opticians appreciated the students’ customer service and communication skills the most. The most important qualities of students were desire to learn, initiative and a positive attitude. In addition, the results showed that the time used to instruct the student and students’ possibilities to practice craft skills have diminished particularly over the last few years

Accurate solution structures of proteins from X-ray data and a minimal set of NMR data: calmodulin-peptide complexes as examples

A strategy for the accurate determination of protein solution structures starting from X-ray data and a minimal set of NMR data is proposed and successfully applied to two complexes of calmodulin (CaM) with target peptides not previously described. Its implementation in the present case is based on the use of lanthanide ions as substitutes for calcium in one of the four calcium binding sites of CaM and the collection of pseudocontact shift (pcs) and residual dipolar coupling (rdc) restraints induced by the paramagnetic metals. Starting from the crystal structures, new structural models are calculated that are in excellent agreement with the paramagnetic restraints and differ significantly from the starting crystal structures. In particular, in both complexes, a change in orientation of the first helix of the N-terminal CaM domain and of the whole C-terminal domain is observed. The simultaneous use of paramagnetic pcs and rdc restraints has the following crucial advantages: (i) it allows one to assess the possible presence of interdomain conformational freedom, which cannot be detected if the rdc values are derived from external orienting media; (ii) in the absence of significant conformational freedom, the global orientation tensor can be independently and precisely determined from pcs values, which are less sensitive than rdc values to the presence of local structural inaccuracies, and therefore (iii) the relative rearrangement of a domain or a secondary structure element with respect to the metal-bearing domain can be detected