Characterizing the Orbital Eccentricities of Transiting Extrasolar Planets with Photometric Observations

The discovery of over 200 extrasolar planets with the radial velocity (RV) technique has revealed that many giant planets have large eccentricities, in striking contrast with most of the planets in the solar system and prior theories of planet formation. The realization that many giant planets have large eccentricities raises a fundamental question: ``Do terrestrial-size planets of other stars typically have significantly eccentric orbits or nearly circular orbits like the Earth?'' Here, we demonstrate that photometric observations of transiting planets could be used to characterize the orbital eccentricities for individual transiting planets, as well the eccentricity distribution for various populations of transiting planets (e.g., those with a certain range of orbital periods or physical sizes). Such characterizations can provide valuable constraints on theories for the excitation of eccentricities and tidal dissipation. We outline the future prospects of the technique given the exciting prospects for future transit searches, such as those to be carried out by the CoRoT and Kepler missions.Comment: 32 pages, 10 figures, accepted to Ap

Heterogeneous impacts of mobility restrictions on air quality in the State of Sao Paulo during the COVID-19 pandemic

Air quality in the State of Sao Paulo was evaluated during the first general State plan of mobility restrictions due to the COVID-19 pandemic (24th March to May 31, 2020). Nitrogen dioxide (NO2), ozone (O-3), particulate matter PM10 and PM2.5 and sulphur dioxide (SO2) concentrations were assessed in cities of the Sao Paulo State with a monitoring station and compared to historical data. Linear regression models were built to investigate the relationship between the isolation of the population - determined using mobile phone monitoring data - and the concentration of each pollutant during the studied period. Although the reduction of pollutants such as NO2, SO2 and PM2.5 is very clear, the economic and climatic characteristics of each region were decisive in the general behaviour of O-3 and PM10. It was not possible to establish a correlation between the pollutants and the isolation index, partly due to the lack of data, partly due to the compliance of the population to those measurements, which was variable over time. Another important limitation factor was the absence of data related to the pollutants of interest in many of the stations. However, the isolation measures carried out in the State opened the opportunity to individually assess the air quality measurements in each of the stations, enabling an understanding that will allow in the future the design of air quality policies together with local sanitary policies

Padronização das técnicas de processamento e extração de RNA viral de amostras de líquido sinovial.

O LS se mostrou uma amostra adequada para a detecção de RNA genômico do vírus da artrite-encefalite caprina. A centrifugação refrigerada por 30 minutos das amostras de LS se mostrou adequada para a sedimentação e isolamento de células caprinas e RNA livre do vírus, não acarretando em degradação significativa do último por Rnases

Utilization of metabolic flux analysis for metabolome data validation of xylose-fermenting yeasts.

Made available in DSpace on 2019-12-21T00:36:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Metabolicfluxanalysis.pdf: 2466512 bytes, checksum: 556ba9be15e8bcd17f6197378aee60d9 (MD5) Previous issue date: 2019bitstream/item/207742/1/Metabolic-flux-analysis.pd

Detecção de RNA genômico do vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV) por amplificação do gene estrutural gag em amostras sangüíneas e de líquido sinovial após injúria tecidual.

A artrite-encefalite caprina (CAE) é uma doença viral que acomete os caprinos provocando artrite, encefalite, mamite e pneumonia, acarretando perdas econômicas. A RT-nested PCR é uma técnica de diagnóstico molecular sensível e específica que foi aplicada em amostras sangüíneas e de líquido sinovial coletadas de animais infectados pelo CAEV e submetidos a uma injúria tecidual nas articulações carpo-metacárpicas uma semana antes da coleta. O RNA foi extraído das amostras, convertido a cDNA e então submetido a duas rodadas de amplificação com iniciadores externos e internos direcionados para o gene estrutural viral gag. Das 17 fêmeas analisadas, 12 apresentaram resultados positivos no sangue e 14 foram positivas (sendo 2 positivos fracos) no líquido sinovial. Estes resultados mostram que estas amostras podem ser utilizadas para o diagnóstico da CAE, não havendo diferenças estatísticas entre elas

Detecção do vírus da Artrite Encefalite Caprina por nested PCR e nested RT-PCR em ovócitos e fluido uterino.

Resumo: A Artrite Encefalite Caprina (CAE) é uma enfermidade infectocontagiosa causada por um vírus pertencente ao gênero lentivírus, denominado de vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV). O CAEV é encontrado em vários tecidos, como o nervoso, o pulmonar, o da glândula mamária e do trato genital masculino e feminino. Desta forma, objetivou-se com este trabalho identificar a presença do CAEV, pelas técnicas de diagnóstico moleculares, em ovócitos e fluido uterino, visando avaliar a possibilidade de transmissão do CAEV pela reprodução. Foram selecionadas 13 cabras comprovadamente infectadas, as quais foram submetidas à eutanásia para coleta do aparelho reprodutor, aspiração do fluido uterino e dissecção dos ovários para coleta de ovócitos. Para identificação do CAEV nas amostras coletadas, na forma de provírus e na forma livre, foram realizadas as técnicas de PCRn e RT-PCRn, respectivamente. Observaram-se que 53,8% dos ovócitos foram positivos à técnica de RT-PCRn, enquanto apenas 9,1% foram positivos à PCRn. A técnica de RT-PCRn também identificou o vírus no fluido uterino de 46,1% das fêmeas testadas. Embora as 13 cabras em experimento fossem portadoras do CAEV, 30,8% apresentaram resultados negativos na PCRn e RT-PCRn em todas as amostras analisadas (ovócito e fluido uterino). Conclui-se que a PCRn e a RT-PCRn podem ser utilizadas no diagnóstico da CAE tendo os ovócitos e o fluido uterino como materiais de análise, e que a presença do CAEV nestes materiais aponta para o risco da transmissão do CAEV através das tecnologias reprodutivas aplicadas às fêmeas. [Caprine Arthritis Encephalitis virus is detected in oocytes and uterine fluid by nested PCR and nested RT-PCR]. Abstract: Caprine arthritis-encephalitis (CAE) is an infectious disease caused by the caprine arthritis-encephalitis virus (CAEV), belonging to the lentivirus genus. The presence of the virus has been observed in the nervous system, respiratory tract and mammary gland, and also in the male and female genital tract. The objective of this study is to identify the virus in oocyte and uterine fluid of infected goats by molecular diagnostic techniques, in order to assess the possibility of CAEV transmission with reproduction. Thirteen infected goats were selected and submitted to euthanasia for the collection of the reproductive system, aspiration of the uterine fluid and dissection of ovaries for oocyte collection. In order to identify the CAEV in the collected material, in the protovirus and free forms, it was submitted to the nRT-PCR and nPCR techniques, respectively. As a result, it was observed that 53.8% of oocytes were positive to nRT-PCR, while only 9.1% were positive to nPCR. The nRT-PCR also identified the virus in the uterine fluid of 46.1% of the tested females. Even though the 13 goats had CAEV, 30.8% presented negative results in nPCR and nRTPCR in all of the analyzed samples (oocyte and uterine fluid). This work concludes that nRT-PCR and nPCR can be used in the diagnosis of CAE for the analysis with oocytes and uterine fluid, and that the presence of CAEV in these materials points out to the risk of CAEV transmission through reproductive technologies used in females

Processamento de amostras provenientes do trato reprodutivo feminino para extração de RNA genômico do vírus da artrite-encefalite caprina e diagnóstico molecular por RT-nested PCR.

Este trabalho descreve os procedimentos necessários para a coleta e processamento de amostras provenientes ou recuperadas do trato reprodutivo feminino de cabras infectadas pelo CAEV para posterior extração do RNA viral por meio de um método baseado em centrifugação em coluna de sílica. A avaliação da presença do RNA nestas amostras é feita diretamente por meio da reação de RT-nested PCR, potencial método de diagnóstico molecular da CAE.bitstream/item/31705/1/UMT-Cot-117.pdfMetodologia Cientifica