Variabilidade genética de variedades locais de arroz determinada por marcadores SSR

The objective of this study was to evaluate the genetic variability of rice (Oryza sativa) landraces collected in Brazilian small farms. Twelve simple sequence repeat (SSR) markers characterized 417 landraces collected in 1986, 1987 and 2003, in the state of Goiás, Brazil. The number of landraces with long and thin grain type increased in the evaluated period, probably due to market demand. Based on the molecular data, the genetic variability increased during this period and, as per to the factorial correspondence analysis, most of the accessions were grouped according to the year of collection. The incorporation of modern rice cultivars in landrace cultivation areas and the selection carried out by small farmers are the most probable factors responsible for increasing landrace genetic variability, during the evaluated period. Genotype exchange between farmers, selection practice and local environmental adaptation are able to generate novel adapted allele combinations, which can be used by breeding programs, to reinitiate the process.O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de variedades locais de arroz (Oryza sativa), coletadas em pequenas propriedades rurais. Doze marcadores microssatélites (SSR) caracterizaram 417 variedades locais, coletadas em 1986, 1987 e 2003, no Estado de Goiás. O número de variedades locais com tipo de grão longo e fino aumentou no intervalo de tempo avaliado, provavelmente em razão da demanda de mercado. Conforme os dados moleculares, houve aumento na variabilidade genética e, por meio da análise fatorial de correspondência, observou-se que a maior parte dos acessos foi agrupada de acordo com o ano de coleta. A incorporação de cultivares modernas de arroz às áreas de cultivo das variedades locais e a seleção realizada pelos pequenos agricultores são, provavelmente, os fatores responsáveis pelo aumento observado na variabilidade genética, ao longo do período avaliado. O intercâmbio de genótipos entre fazendeiros, a prática da seleção e a adaptação ambiental ao local de cultivo são capazes de gerar novas combinações alélicas adaptadas que, por sua vez, podem ser usadas pelos programas de melhoramento, para reiniciar o processo

GENE FLOW BETWEEN RED RICE AND CULTIVATED RICE ESTIMATED BY MICROSATELLITE MARKERS FLUXO GÊNICO ENTRE ARROZ VERMELHO E ARROZ CULTIVADO ESTIMADO POR MEIO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES

&lt;!-- @page { margin: 2cm } --&gt; &lt;p class="western" align="justify"&gt;The study aimed to evaluate the capacity of SSR markers to detect the gene flow between the red rice (RR) and the cultivated rice (CR). SSR is currently used in plant genomic analysis due to the high information content, to be co-dominant, and based on the PCR reaction. The field experiment was organized in ten concentric circles, 5 m to 50 m apart from a central red rice plant, assumed as the pollen donor. One hundred twenty rice CR plants, cv. BR-Irga 409, were planted in the intersections of the concentric circles and the twelve radii. From 51 SSR markers, four were selected due to their capacity to detect the polymorphism between RR and CR, aiming to identify RR alleles in seeds produced by BR-Irga 409 plants. The maximum distance found for gene flow between RR and CR plants was 10 m from the RR plant. In theory, at 0.1% cross pollination rate, this distance can generate 4,710 hybrids between RR and CR. In the next generation, about 3,532 plants would produce exclusively rice grains with red color. The SSR markers were able to identify the gene flow between RR and CR; therefore, they can be useful to increase the precision of cross pollination rate estimates in rice, mainly if used with other methodologies (e.g., herbicide tolerant plants).&lt;/p&gt; &lt;p class="western"&gt;KEY WORDS: Cross pollination; microsatellite markers; Oryza sativa.&lt;/p&gt;<br>&lt;!-- @page { margin: 2cm } --&gt; &lt;!-- @page { margin: 2cm } --&gt; &lt;p class="western" align="justify"&gt;Este trabalho objetivou avaliar a capacidade de marcadores SSR em detectar a ocorrência de fluxo gênico entre o arroz vermelho (AV) e o arroz cultivado (AC). Marcadores SSR são utilizados em análise genômica de plantas devido ao alto conteúdo informativo, serem co-dominantes e baseados na reação de PCR. O ensaio de campo foi realizado em dez círculos concêntricos de 5 m a 50 m de distância, a partir de uma planta AV central, que foi a fonte doadora de pólen. Foram semeadas 120 plantas de arroz da cultivar BR-Irga 409, distribuídas nas interseções entre os círculos e doze raios. A partir de 51 marcadores SSR, foram selecionados quatro marcadores que detectaram polimorfismo entre o AV e AC, para identificar os alelos de AV em sementes produzidas pelas plantas da cultivar BR-Irga 409. A distância máxima encontrada entre a planta AV doadora de pólen e uma planta AC que produziu sementes híbridas (AV x AC) foi de 10 m. Teoricamente, sob 0,1% de taxa de cruzamento, esta distância de polinização pode dar origem a 4.710 sementes híbridas entre AC e AV, o que, na geração seguinte, resultará em 3.532 plantas produzindo grãos vermelhos. Marcadores SSR foram capazes de identificar fluxo gênico entre AR e AC; e, portanto, podem ser empregados em associação com outras metodologias (ex. plantas tolerantes a herbicidas) para melhorar a precisão das estimativas de polinização cruzada em arroz.&lt;/p&gt; &lt;p class="western" align="justify"&gt;PALAVRAS-CHAVE: Oryza sativa; polinização cruzada; marcadores microssatélites.&lt;/p&gt

On the distinctiveness of Amapasaurus, its relationship with Loxopholis Cope 1869, and description of a new genus for L. guianensis and L. hoogmoedi (Gymnophthalmoidea/Ecpleopodini: Squamata)

Pellegrino, Katia Cristina Machado, Brunes, Tuliana Oliveira, Souza, Sergio Marques, Laguna, Marcia Maria, Avila-Pires, Teresa Cristina Sauer, Hoogmoed, Marinus Steven, Rodrigues, Miguel Trefaut (2018): On the distinctiveness of Amapasaurus, its relationship with Loxopholis Cope 1869, and description of a new genus for L. guianensis and L. hoogmoedi (Gymnophthalmoidea/Ecpleopodini: Squamata). Zootaxa 4441 (2): 332-346, DOI: https://doi.org/10.11646/zootaxa.4441.2.