Sextant : A spatial data infrastructure for marine environments

Access to ocean and marine data is a major issue both for marine related research and for marine environment management in application of Water Framework Directive (WFD) and Marine Strategy Framework Directive (MSFD). In the framework of these initiatives, advances have been achieved both in national and European cooperation: data policies, sharing of environmental data and technical implementation of distributed spatial data systems. Ifremer has developed a spatial data infrastructure for marine environments, called Sextant, in order to manage, share and retrieve geographical marine information. Sextant is a support for marine studies and decision-making in environmental issues such as biodiversity, marine renewable energy, integrated management of coastal areas, fishing, coastal and deep-sea environments, exploration and exploitation of the seabed. This data can be collected and processed both by Ifremer as well as its partners. The various technologies used are compliant to Inspire Directive regarding metadata discovery, data access and data visualization. Standardization has always been considered as a key point in achieving the integration of very large partnerships in data management. The discovery service of Sextant is based on the metadata catalogue, using Geonetwok. It allows end-users to search for metadata according to different criteria (localization, theme, producer,…). The data description is normalized according to ISO 19115 standard and Inspire recommendations, the XML encoding follows the ISO 19139 standard. Geonetwork provides an ISO and Inspire validating tool, in order to ensure metadata compliance. Access to the catalogue is provided by the standard OGC service, Catalogue Service for the Web (CSW 2.0.2). Data visualization and data dowloading are available through standard OGC services, Web Map Services (WMS) and Web Feature Services (WFS). Several WMS et WFS services have been implemented within Sextant, according to marine themes, regions and projects. Each service has its own metadata described, according to Inspire recommendations. This allows metadata to be harvested by the French national Geocatalogue and to be directly visualized and downloaded. Moreover, the national Geocatalogue is the entry portal for the French Inspire reporting and for the Inspire harvesting. Therefore, Sextant metadata and data are available on the European Inspire portal

Sextant, infrastructure de données géographiques marines et littorales, pour la diffusion et la valorisation des données marines

Depuis 2001, l’Ifremer a développé une infrastructure de données géographiques marines et littorales, appelée Sextant, dont l’objectif est de documenter, diffuser et promouvoir un catalogue de données relevant du milieu marin, à destination des laboratoires et des partenaires de l’Ifremer, ainsi que des acteurs œuvrant dans le domaine marin et littoral. Les données géographiques présentes sur Sextant sont issues des travaux de recherche et des programmes scientifiques des laboratoires de l'Ifremer et de ses partenaires. Les évolutions successives de Sextant et les technologies utilisées se sont toujours inscrites dans le cadre de la mise en œuvre de la Directive INSPIRE. Ainsi, répondant aux normes de l'ISO et aux standards de l'OGC, Sextant est un système interopérable avec les systèmes d’informations nationaux et internationaux. Sextant apporte différents éléments favorisant et facilitant l’échange, le partage et la mise à disposition des données marines et littorales. Des catalogues thématiques sont constitués à partir des informations géographiques, permettant une diffusion et utilisation pouvant être restreintes à une communauté d’utilisateurs définie et identifiée. Les fonctions de catalogue et de visualisation peuvent être adossées à un ou plusieurs catalogues thématiques et être intégrées dans un site web dédié favorisant ainsi l’accès aux données géographiques issues des projets de recherche et d’études liés à la gestion de l’environnement marin. Ainsi, à titre d’exemple, Sextant est utilisé pour le catalogage des données issues des projets européens Emodnet, ou pour la diffusion des données produites dans le cadre de l’Evaluation Initiale de la DCSMM (http://www.ifremer.fr/dcsmm). De par son interopérabilité, les métadonnées de Sextant sont visibles sur le Géocatalogue national, portail de mise en œuvre de la Directive européenne INSPIRE pour la France, permettant ainsi à l’Ifremer d’être conforme à la Directive, en rendant accessibles au public ses données entrant dans le périmètre concerné. De même, les standards et protocoles utilisés par Sextant permettent une quasi automatisation du processus d’intégration des données sur la plateforme interministériel data.gouv.fr, pilotée par la mission Etalab

Les nouveaux outils au service de la diffusion des photographies anciennes du littoral

Depuis 2003 et la découverte dans une salle d’archives d’albums contenant plus de 10.000 photos anciennes du littoral, un important travail de géoréférencement et de mise à disposition de ces photos a été fait. Cela fait plus de 10 ans maintenant que l’Ifremer, au travers de son IDG Sextant, diffuse ces photographies anciennes datant de 1919 à 1958. De nombreux financeurs ont ainsi participé aux traitements de ces données permettant aujourd’hui d’avoir une couverture quasi exhaustive de la métropole (hors Corse) et de nombreuses iles françaises dans les Antilles, l’Océan Indien, et le Pacifique. Ces données anciennes, comparées avec les ortho-photographies actuelles, permettent d’appréhender des thématiques environnementales liées à la gestion du littoral, comme l’érosion du trait de côte, l’urbanisation « terrestre » et « maritime ». Des études s’appuyant sur ces photos commencent à fleurir sur le territoire métropolitain : - problématique de l’érosion du trait de côte, - évolution des ports français. L’évolution des outils de diffusion permet aujourd’hui des performances améliorées quant au temps d’affichage de ces données (services WMS tuilés). Dans ce sens, le site web dédié à la diffusion de ces photos offre notamment la possibilité de visualiser toutes les photos anciennes présentes sur un département mais également de comparer directement des photos de plusieurs années sur un même lieu

Rapport d'activités Sextant 2016

Sextant est l'infrastructure de données géographiques marines et littorales de l'Ifremer, dont l’objectif est de gérer, diffuser et partager un catalogue de données relevant du milieu marin. Les données géographiques présentes sur Sextant sont issues des travaux de recherche et des programmes scientifiques des laboratoires de l'Ifremer et de ses partenaires. Répondant aux normes de l'ISO et aux standards de l'OGC, Sextant est un système interopérable avec les portails de diffusion de données géographiques nationaux et internationaux. Sextant propose trois services d’accès aux données : un service de recherche, un service de visualisation et un service de téléchargement. Ce rapport présente le bilan annuel des activités de Sextant, en matière de données, projets, formations et communications

Sextant. A spatial data infrastructure for marine environments

At national and European levels, in various projects, data products are developed to provide end-users and stakeholders with homogeneously qualified observation compilation or analysis. Ifremer has developed a spatial data infrastructure for marine environment, called Sextant, in order to manage, share and retrieve these products for its partners and the general public. Thanks to the OGC and ISO standard and INSPIRE compliance, the infrastructure provides a unique framework to federate homogeneous descriptions and access to marine data products processed in various contexts, at national level or European level for DG research (SeaDataNet), DG Mare (EMODNET) and DG Growth (Copernicus MEMS). The discovery service of Sextant is based on the metadata catalogue. The data description is normalized according to ISO 191XX series standards and Inspire recommendations. Access to the catalogue is provided by the standard OGC service, Catalogue Service for the Web (CSW 2.0.2). Data visualization and data downloading are available through standard OGC services, Web Map Services (WMS) and Web Feature Services (WFS). Several OGC services are provided within Sextant, according to marine themes, regions and projects. Depending on the file format, WMTS services are used for large images, such as hyperspectral images, or NcWMS services for gridded data, such as climatology models. New functions are developped to improve the visualization, analyse and access to data, eg : data filtering, online spatial processing with WPS services and acces to sensor data with SOS services

Rapport d'activités Sextant 2018

Sextant est l'infrastructure de données géographiques marines et littorales de l'Ifremer, dont l’objectif est de gérer, diffuser et partager un catalogue de données relevant du milieu marin. Les données géographiques présentes sur Sextant sont issues des travaux de recherche et des programmes scientifiques des laboratoires de l'Ifremer et de ses partenaires. Répondant aux normes de l'ISO et aux standards de l'OGC, Sextant est un système interopérable avec les portails de diffusion de données géographiques nationaux et internationaux. Sextant propose trois services d’accès aux données : un service de recherche, un service de visualisation et un service de téléchargement. Ce rapport présente le bilan annuel des activités de Sextant, en matière de données, projets, formations et communications

Rapport d'activités Sextant 2015

Sextant est l'infrastructure de données géographiques marines et littorales de l'Ifremer, dont l’objectif est de gérer, diffuser et partager un catalogue de données relevant du milieu marin. Les données géographiques présentes sur Sextant sont issues des travaux de recherche et des programmes scientifiques des laboratoires de l'Ifremer et de ses partenaires. Répondant aux normes de l'ISO et aux standards de l'OGC, Sextant est un système interopérable avec les portails de diffusion de données géographiques nationaux et internationaux. Sextant propose trois services d’accès aux données : un service de recherche, un service de visualisation et un service de téléchargement. Ce rapport présente le bilan annuel des activités de Sextant, en matière de données, projets, formations et communications

Sextant. Une infrastructure de données géographiques marines et littorales

Aux niveaux national et européen, en mode opérationnel ou recherche, des produits de données d'observations sont développés afin de qualifier, packager et synthétiser de façon homogène les données marines à destination des utilisateurs en aval des centres de données. L’unité IDM d’Ifremer a développé une infrastructure de données géographiques marines et littorales, appelée Sextant (http://sextant.ifremer.fr), qui permet de documenter, diffuser et promouvoir ces produits, à destination des partenaires de l’Ifremer et du grand public. Les technologies utilisées sont inscrites dans le cadre de la mise en œuvre de la Directive Inspire. La standardisation du système est un point clé dans l'intégration des partenariats en matière de gestion de données. Ainsi, répondant aux normes de l'ISO et aux standards de l'OGC, Sextant est un système interopérable avec les systèmes d’informations nationaux et internationaux. Sextant propose trois services d’accès aux données : - le catalogue de métadonnées utilise le logiciel Geonetwork conforme aux normes de l’ISO et aux recommandations d’Inspire. L’accès aux métadonnées est normalisé par le protocole Catalogue Service for the Web (CSW 2.0.2) de l’OGC. - le Geoviewer permet la visualisation des données via les protocoles Web Map Services (WMS, WMTS, NcWMS) de l’OGC. Les données sont réparties dans plusieurs services en fonction de leur thématique ou de leur localisation géographique. En fonction du format des fichiers, on utilise le service WMTS pour les gros volume d’image ou le NcWMS pour les données grillées. - le Panier permet de télécharger les données à travers les protocoles Web Feature Services (WFS) et Web Coverage Service (WCS). Si l'accès interopérable aux produits de synthèse est géré par des outils SIG sur étagère (par exemple, mapserver), l'accès aux collections d'observations nécessite des développements spécifiques. Dans le cadre de projets Européens (MyOcean, Emodnet et SeaDataNet), l’Ifremer a développé un logiciel pour la diffusion des données d’observation in-situ. Les modules implémentent plusieurs protocoles de diffusion (SOS, Opendap, WMS, WFS) pour différents formats de collection (netcdf, odv binary collection, ...). La prochaine étape au niveau de l’infrastructure Sextant va être d’améliorer l’interface pour permettre l’affichage, le filtrage et le téléchargement des collections d’observation in-situ

Attribution de DOI pour les données géographiques marines

Les jeux de données publics décrits dans le catalogue de l’Infrastructure de Donnée Géographique Sextant peuvent désormais bénéficier d’un Digital Object Identifier (DOI), identifiant international pérenne, au même titre qu’une publication scientifique. Un DOI fiabilise la citation de données et fournit un lien stable vers la ressource. La citation de données est une marque de reconnaissance pour les producteurs des données. Les données sont également plus simplement accessibles aux utilisateurs qui souhaitent les réutiliser pour vérifier un résultat ou poursuivre les travaux présentés dans une publication. De plus,  l'attribution de DOI à des données géographiques permet d'anticiper sur le programme Horizon 2020 qui imposera aux bénéficiaires de financements européens de déposer les données de la recherche dans une archive de données. En parallèle du mécanisme d'attribution de DOI aux données géographiques dans Sextant, il est possible de citer dans une fiche de publication scientifique enregistrée dans Archimer, les références des données qu'elle exploite. De même, les jeux de données publiés suite à une campagne océanographique sont associés à la fiche de la campagne accessible depuis le site de la flotte océanographique. Ainsi, grâce à ce processus de citation, de l’acquisition de la donnée marine durant une campagne scientifique jusqu’à la production de cartes de synthèse, les jeux de données sont identifiés et stabilisés. Par ailleurs, les mécanismes de relation entre les différents systèmes d’information permettent de prendre connaissance et d’accéder aisément aux jeux de données marines existants

Portail vitrine de l’IR ILICO

Créée en 2016, l'infrastructure de recherche littorale et côtière (ILICO) est une infrastructure nationale qui vise à observer et comprendre les milieux et les écosystèmes littoraux et côtiers dans leur globalité. Ainsi, ILICO fédère 9 réseaux nationaux d'observation répartis sur les côtes métropolitaines et celles des territoires d'outre-mer : COAST-HF, CORAIL, DYNALIT, MOOSE, PHYTOBS, ReefTEMPS, SOMLIT, SONEL et BenthOBS. Ces réseaux réalisent des mesures automatisées ou manuelles dans des domaines scientifiques variés : physique, chimie, géomorphologie, biologie, biogéochimine, etc. Les données ainsi acquises sur le long terme permettent de surveiller et détecter les événements récurrents, classiques mais aussi épisodiques (ex : événements extrêmes) des évolutions longues périodes en réponse aux forçages anthropiques et climatiques. Cela permet également de comprendre le couplage entre la physique et la biologie et de répondre aux besoins scientifiques et sociétaux. Actuellement, chaque réseau propose des visualisations à l’aide d’interfaces dédiées et un accès aux données utilisant des formats différents. Pour permettre l’exploration visuelle simultanée de données issues des SNO, et donc faciliter les intercomparaisons, un portail vitrine est en cours d’élaboration par ILICO. Ce portail se présentera sous la forme d’un tableau de bord et s’appuiera sur des services de données standardisés préconisés par le pôle de données et de services pour l’océan ODATIS de l’Infrastructure de Recherche Data Terra, avec qui ILICO travaille en étroite collaboration