A Transcriptomic Approach Provides Insights on the Mycorrhizal Symbiosis of the Mediterranean Orchid <i>Limodorum abortivum</i> in Nature

The study of orchid mycorrhizal interactions is particularly complex because of the peculiar life cycle of these plants and their diverse trophic strategies. Here, transcriptomics has been applied to investigate gene expression in the mycorrhizal roots of Limodorum abortivum, a terrestrial mixotrophic orchid that associates with ectomycorrhizal fungi in the genus Russula. Our results provide new insights into the mechanisms underlying plant–fungus interactions in adult orchids in nature and in particular into the plant responses to the mycorrhizal symbiont(s) in the roots of mixotrophic orchids. Our results indicate that amino acids may represent the main nitrogen source in mycorrhizal roots of L. abortivum, as already suggested for orchid protocorms and other orchid species. The upregulation, in mycorrhizal L. abortivum roots, of some symbiotic molecular marker genes identified in mycorrhizal roots from other orchids as well as in arbuscular mycorrhiza, may mirror a common core of plant genes involved in endomycorrhizal symbioses. Further efforts will be required to understand whether the specificities of orchid mycorrhiza depend on fine-tuned regulation of these common components, or whether specific additional genes are involved

A Transcriptomic Approach Provides Insights on the Mycorrhizal Symbiosis of the Mediterranean Orchid Limodorum abortivum in Nature

The study of orchid mycorrhizal interactions is particularly complex because of the peculiar life cycle of these plants and their diverse trophic strategies. Here, transcriptomics has been applied to investigate gene expression in the mycorrhizal roots of Limodorum abortivum, a terrestrial mixotrophic orchid that associates with ectomycorrhizal fungi in the genus Russula. Our results provide new insights into the mechanisms underlying plant&ndash;fungus interactions in adult orchids in nature and in particular into the plant responses to the mycorrhizal symbiont(s) in the roots of mixotrophic orchids. Our results indicate that amino acids may represent the main nitrogen source in mycorrhizal roots of L. abortivum, as already suggested for orchid protocorms and other orchid species. The upregulation, in mycorrhizal L. abortivum roots, of some symbiotic molecular marker genes identified in mycorrhizal roots from other orchids as well as in arbuscular mycorrhiza, may mirror a common core of plant genes involved in endomycorrhizal symbioses. Further efforts will be required to understand whether the specificities of orchid mycorrhiza depend on fine-tuned regulation of these common components, or whether specific additional genes are involved

Efeito do edta sobre o teste de redução do tetrazólio nitroazul (NBT) para avaliação do metabolismo oxidativo dos neutrófilos de equinos

O teste de redução do tetrazólio nitroazul (NBT) é um dos métodos mais utilizados para se avaliar o metabolismo oxidativo dos neutrófilos em sangue total heparinizado. O etileno-diaminotetracético (EDTA) é o anticoagulante mais utilizado na rotina hematológica e apresenta a vantagem de melhor preservar as características morfológicas dos neutrófilos do que a heparina. Estudos prévios em humanos indicam que o EDTA pode quelar o cálcio necessário para a ativação do metabolismo oxidativo enquanto que a heparina pode gerar valores de redução de NBT falsamente elevados. Objetivou-se comparar a capacidade dos neutrófilos reduzirem o NBT em amostras sangüíneas colhidas com heparina e EDTA. Para tal, sangue total de 30 eqüinos SRD sadios, adultos e de ambos os sexo foram divididas em dois tubos, um contendo heparina sódica (10U/mL) e o outro EDTA potássico (1,8mg/mL). Imediatamente após a colheita realizaram-se os testes de redução espontânea e estimulada do NBT. Em ambas as provas de redução do NBT, amostras colhidas com heparina apresentaram maior destruição celular, formação de precipitado e de agregados celulares do que as tratadas com EDTA. A média de redução espontânea do NBT em amostras com EDTA (5,93%) não diferiu das obtidas com heparina (4,2%). Na prova estimulada, a média de neutrófilos redutores de NBT em amostras com EDTA (10,43%) foi menor ( p < 0,05) do que as obtidas com heparina (36,1%). Conclui-se que o EDTA pode ser utilizado com vantagens em relação à heparina na prova de redução espontânea do NBT, entretanto, o efeito quelante deste anticoagulante compromete a produção de superóxido em neutrófilos estimulados com extrato bacteriano.O teste de redução do tetrazólio nitroazul (NBT) é um dos métodos mais utilizados para se avaliar o metabolismo oxidativo dos neutrófilos em sangue total heparinizado. O etileno-diaminotetracético (EDTA) é o anticoagulante mais utilizado na rotina hematológica e apresenta a vantagem de melhor preservar as características morfológicas dos neutrófilos do que a heparina. Estudos prévios em humanos indicam que o EDTA pode quelar o cálcio necessário para a ativação do metabolismo oxidativo enquanto que a heparina pode gerar valores de redução de NBT falsamente elevados. Objetivou-se comparar a capacidade dos neutrófilos reduzirem o NBT em amostras sangüíneas colhidas com heparina e EDTA. Para tal, sangue total de 30 eqüinos SRD sadios, adultos e de ambos os sexo foram divididas em dois tubos, um contendo heparina sódica (10U/mL) e o outro EDTA potássico (1,8mg/mL). Imediatamente após a colheita realizaram-se os testes de redução espontânea e estimulada do NBT. Em ambas as provas de redução do NBT, amostras colhidas com heparina apresentaram maior destruição celular, formação de precipitado e de agregados celulares do que as tratadas com EDTA. A média de redução espontânea do NBT em amostras com EDTA (5,93%) não diferiu das obtidas com heparina (4,2%). Na prova estimulada, a média de neutrófilos redutores de NBT em amostras com EDTA (10,43%) foi menor ( p < 0,05) do que as obtidas com heparina (36,1%). Conclui-se que o EDTA pode ser utilizado com vantagens em relação à heparina na prova de redução espontânea do NBT, entretanto, o efeito quelante deste anticoagulante compromete a produção de superóxido em neutrófilos estimulados com extrato bacteriano.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP

Proteomic and Transcriptomic Analyses Indicate Metabolic Changes and Reduced Defense Responses in Mycorrhizal Roots of Oeceoclades maculata (Orchidaceae) Collected in Nature

Orchids form endomycorrhizal associations with fungi mainly belonging to basidiomycetes. The molecular events taking place in orchid mycorrhiza are poorly understood, although the cellular changes necessary to accommodate the fungus and to control nutrient exchanges imply a modulation of gene expression. Here, we used proteomics and transcriptomics to identify changes in the steady-state levels of proteins and transcripts in the roots of the green terrestrial orchid Oeceoclades maculata. When mycorrhizal and non-mycorrhizal roots from the same individuals were compared, 94 proteins showed differential accumulation using the label-free protein quantitation approach, 86 using isobaric tagging and 60 using 2D-differential electrophoresis. After de novo assembly of transcriptomic data, 11,179 plant transcripts were found to be differentially expressed, and 2175 were successfully annotated. The annotated plant transcripts allowed the identification of up- and down-regulated metabolic pathways. Overall, proteomics and transcriptomics revealed, in mycorrhizal roots, increased levels of transcription factors and nutrient transporters, as well as ethylene-related proteins. The expression pattern of proteins and transcripts involved in plant defense responses suggested that plant defense was reduced in O. maculata mycorrhizal roots sampled in nature. These results expand our current knowledge towards a better understanding of the orchid mycorrhizal symbiosis in adult plants under natural conditions