Ecological and epidemiological aspects of flavivirus and its vectors in Paraguay

Presentación del proyecto en el Mosticaw workshop.CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Búsqueda de flavivirus en individuos con sospecha clínica de dengue y con resultado negativo para el antígeno NS1, provenientes del área metropolitana de Asunción, periodo 2011-2013

Los flavivirus son responsables de una considerable morbi-mortalidad a nivel mundial, constituyendo un gran problema de salud pública. Entre los de mayor impacto se encuentran el virus del dengue (DENV), el virus de la fiebre amarilla (YFV), el virus de la encefalitis de San Luis (SLEV) y el virus del Nilo Occidental (WNV). El objetivo del presente estudio fue buscar flavivirus en individuos con sospecha clínica de dengue con resultado negativo para el antígeno NS1 (método inmunocromatográfico), provenientes del área metropolitana de Asunción, período 2011-2013. Se incluyeron 195 individuos, la búsqueda de flavivirus se realizó mediante la reacción en cadena de la polimerasa-anidada previa retrotranscripción (RT-nested PCR) dirigida a una región que codifica para la proteína NS5. Se determinó la especie de flavivirus mediante reacciones de RT-nested PCR que amplifican fragmentos específicos de la región NS5 para los tipos de DENV y SLEV, y/o secuenciación nucleotídica. Del total de muestras estudiadas: 43/195 (22,1%) fueron positivas para flavivirus, de las cuales 40 correspondieron a DENV (6 DENV-1, 32 DENV-2 y 2 DENV3), 2 muestras (4,6%) fueron positivas para SLEV y en 1 muestra no pudo determinarse la especie del flavivirus. La detección de DENV en las muestras estudiadas indica el subreporte de la infección por el virus basando el diagnóstico en la detección del antígeno NS1 por el método inmunocromatográfico. Con respecto a SLEV, es necesario estudiar otras regiones del genoma viral para confirmar este hallazgo, ya que podría sugerir el primer indicio de circulación del virus en el país.CONACYT - Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Ecological and epidemiological aspects of flaviviruses and their vectors in urban and rural areas of Paraguay

Objective of this study: Contribute to the knowledge of ecological and epidemiological aspects of flavivirus and its vectors in urban and rural areas of Paraguay.CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Aspectos ecológicos y epidemiológicos de flavivirus y sus vectores en zona urbana y rural del Paraguay

El objetivo del proyecto fue contribuir al conocimiento de aspectos ecológicos y epidemiológicos de flavivirus y sus vectores en una zona urbana y rural del Paraguay.CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Estandarización de una técnica de RT-PCR anidada para detección de alfavirus

El género Alphavirus está constituido por virus de ARN de los cuales, varias especies son causantes de enfermedades humanas y animales como los virus chikungunya, Mayaro y los virus de encefalitis equinas, por lo que son considerados un problema de salud pública a nivel regional. En Paraguay han sido reportadas infecciones humanas por chikungunya pero son necesarios más estudios para ampliar conocimientos sobre circulación y ecoepidemiología de los alfavirus. La transcripción reversa de ARN seguida de una reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) anidada es de gran utilidad como herramienta diagnóstica y en la vigilancia epidemiológica. El objetivo de este estudio fue definir las condiciones óptimas de reacción y determinar el límite de detección para una RT-PCR anidada para la detección genérica de alfavirus. El límite de detección obtenido, de 0,47 UFP/mL, indica una alta sensibilidad, pudiéndose aplicar la técnica a muestras humanas y animales de suero, líquido cefalorraquídeo, órganos y a pooles de mosquitos. Este trabajo servirá de base a otros estudios de detección e identificación de especies de alfavirus circulantes en nuestro país, lo que contribuiría a fortalecer su vigilancia y prevención

Workshop “Desafío de las infecciones virales con impacto en la salud: un enfoque multidisciplinario”.

El objetivo del evento fue capacitar a profesionales y estudiantes biomédicos en temas relacionados con las infecciones virales de importancia en salud pública, brindando información actualizada sobre la etiopatogenia, epidemiología, diagnóstico y prevención. Durante el workshop se presentaron actualizaciones sobre prevención, detección (incorporación de nuevas tecnologías), así como de estrategias para el control de virus con impacto en salud animal y humana. Los ejes temáticos desarrollados incluyeron; virus transmitidos por artrópodos arbovirus, virus de animales (zoonosis), virus oncogénicos, SARS CoV-2 y virus ambientales, que afectan grandemente al crecimiento económico y social a nivel regional y mundial, ya que causan elevadas tasas de incidencia y mortalidad en mujeres/hombres en edad fértil/laboral, así como en niños.CONACYT - Consejo Nacional de Ciencias y TecnologíaPROCIENCI

Búsqueda de flavivirus en individuos con sospecha clínica de dengue y resultado negativo para el antígeno NS1 en Paraguay

Los flavivirus son responsables de una considerable morbi-mortalidad a nivel mundial. Entre ellos, el virus del dengue (DENV) es causante de graves problemas de salud pública en Paraguay. El objetivo del estudio fue detectar infecciones por flavivirus a través de una reacción de RT-nested PCR genérica para flavivirus en 195 muestras de individuos con sospecha de dengue, negativos por el test inmunocromatográfico (antígeno NS1 – DENV), provenientes del área metropolitana de Asunción entre 2011 y 2013. Las muestras positivas para flavivirus fueron sometidas a dos reacciones de RT-nested PCRs específicas para DENV. El límite de detección (LD) para flavivirus fue de 0,2 UFP/reacción. En total 43/195 muestras fueron positivas para flavivirus. De estas, 38/43 (88,4%) correspondieron a DENV (6 DENV-1, 30 DENV-2 y 2 DENV-3). Además, 5/43 casos (11,6%) positivos para flavivirus fueron negativos para DENV por ambas reacciones específicas, pudiendo deberse a infecciones por otros flavivirus. Los resultados sugieren que la utilización de una reacción genérica seguida de otras reacciones específicas para DENV en casos febriles negativos para NS1 por el método inmunocromatográfico permitiría detectar más casos de infecciones por DENV y además, podría contribuir a la identificación de casos debido a infecciones por otros flavivirus

Characterization of dengue cases among patients with an acute illness, Central Department, Paraguay

Corresponding authors: Alejandra Rojas, [email protected]; Jesse Waggoner, [email protected]. In 2018, Paraguay experienced a large dengue virus (DENV) outbreak. The primary objective of this study was to characterize dengue cases in the Central Department, where the majority of cases occur, and identify factors associated with DENV infection. Methods. Patients were enrolled from January-May 2018 if they presented with a suspected arboviral illness. Acute-phase specimens (≤8 days after symptom onset) were tested using rRT-PCR, a rapid diagnostic test for DENV nonstructural protein 1 (NS1) and anti-DENV IgM and IgG, and ELISA for IgG against NS1 from Zika virus (ZIKV). Results. A total of 231 patients were enrolled (95.2% adults) at two sites: emergency care and an outpatient clinical site. Patients included 119 (51.5%) dengue cases confirmed by rRT-PCR (n = 115, 96.6%) and/or the detection of NS1 and anti-DENV IgM (n = 4, 3.4%). DENV-1 was the predominant serotype (109/115, 94.8%). Epidemiologically, dengue cases and non-dengue cases were similar, though dengue cases were less likely to reside in a house/apartment or report a previous dengue case. Clinical and laboratory findings associated with dengue included red eyes, absence of sore throat, leucopenia and thrombocytopenia. At an emergency care site, 26% of dengue cases (26/100) required hospitalization. In univariate analysis, hospitalization was associated with increased viral load, anti-DENV IgG, and thrombocytopenia. Among dengue cases that tested positive for IgG against ZIKV NS1, the odds of DENV NS1 detection in the acute phase were decreased 10-fold (OR 0.1, 0.0–0.3). Conclusions. Findings from a predominantly adult population demonstrate clinical and laboratory factors associated with DENV infections and the potential severity of dengue in this group. The combination of viral load and specific IgG antibodies warrant further study as a prognostic to identify patients at risk for severe disease.Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPrograma Paraguayo para el Desarrollo de la Ciencia y Tecnología. Financiamiento para la vinculación de científicos y tecnólogo

Búsqueda de los virus del nilo occidental, de la encefalitis de san Luis y de la encefalitis equina venezolana en mosquitos de Paraguay – resultados preliminares.

El objetivo general del proyecto fue determinar la presencia de arbovirus encefalíticos (VEEV, WNV y SLEV) en poblaciones humanas y de mosquitos de Paraguay.CONACYT - Consejo Nacional de Ciencias y TecnologíaPROCIENCI

Búsqueda de virus encefalíticos (wnv, slev y veev) en sueros de pacientes con sospecha de síndrome febril agudo y trastornos neurológicos.

Los virus del Nilo Occidental (WNV), de la Encefalitis de San Luis (SLEV) y de la Encefalitis Equina Venezolana (VEEV) pueden producir enfermedades febriles agudas que podrían ser confundidas con el dengue u otras patologías; también pueden causar trastornos neurológicos graves. Estos virus todavía no han sido detectados en nuestro país, sin embargo, existen reportes de circulación de los mismos en países limítrofes. El Paraguay cuenta con las condiciones favorables para propiciar el mantenimiento del ciclo de transmisión de estos virus, por lo que se considera de suma importancia el estudio de ellos en pacientes con afecciones previamente mencionadas.CONACYT - Consejo Nacional de Ciencias y TecnologíaPROCIENCI