SARS-CoV-2 outbreaks in hospitals and long-term care facilities in Germany: a national observational study

Background: Outbreaks of coronavirus disease (COVID-19) in hospitals and long-term care facilities (LTCFs) pose serious public health threats. We analysed how frequency and size of SARS-CoV-2 outbreaks in hospitals and LTCFs have altered since the beginning of the pandemic, in particular since the start of the vaccination campaign. Methods: We used mandatory notification data on SARS-CoV-2 cases in Germany and stratified by outbreak cases in hospitals and LTCFs. German vaccination coverage data were analysed. We studied the association of the occurrence of SARS-CoV-2 outbreaks and outbreak cases with SARS-CoV-2 cases in Germany throughout the four pandemic waves. We built also counterfactual scenarios with the first pandemic wave as the baseline. Findings: By 21 September 2021, there were 4,147,387 SARS-CoV-2 notified cases since March 2020. About 20% of these cases were reported as being related to an outbreak, with 1% of the cases in hospitals and 4% in LTCFs. The median number of outbreak cases in the different phases was smaller (≤5) in hospitals than in LTCFs (>10). In the first and second pandemic waves, we observed strong associations in both facility types between SARS-CoV-2 outbreak cases and total number of notified SARS-CoV-2 cases. However, during the third pandemic wave we observed a decline in outbreak cases in both facility types and only a weak association between outbreak cases and all cases. Interpretation: The vaccination campaign and non-pharmaceutical interventions have been able to protect vulnerable risk groups in hospitals and LTCFs. Funding: No specific fundingPeer Reviewe

Occurrence and Clinical Relevance of Mycobacterium chimaera sp. nov., Germany

Retrospective molecular genetic analysis of 166 Mycobacterium intracellulare isolates showed that 143 (86%) strains could be assigned to Mycobacterium chimaera sp. nov. Of 97 patients from whom M. chimaera sp. nov. was isolated, only 3.3% exhibited mycobacterial lung disease, whereas all M. intracellulare isolates caused severe pulmonary infections

The MRSA-import in ICUs is an important predictor for the occurrence of nosocomial MRSA cases

Nosocomial infections with methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) account for increased morbidity, mortality and healthcare costs in critically ill patients worldwide. The intensive care unit (ICU) component of the German surveillance system for nosocomial infections (Krankenhaus-Infektions-Surveillance-System, KISS) has been supplemented with a module targeting the surveillance of multiresistant pathogens [Multiresistente Erreger (MRE)-KISS] in order to account for the increasing burden of antibiotic-resistant bacteria. The aim of this study was to assess the association between structural and organizational characteristics of ICUs and the number of nosocomial MRSA cases. Data were derived from routine data collected in the frame of the national surveillance system of nosocomial infections (ICU- and MRE-KISS) from January 2007 to December 2008 and from a questionnaire inquiring about structure and process parameters. One hundred and forty ICUs performing active screening have been included. Process parameters such as isolation of MRSA patients, decolonization procedures and introduction of MRSA alert systems have been implemented by the majority of the ICUs, whereas the application mode of screening procedures and pre-emptive isolation measures is heterogeneous. Multivariable analysis using negative binominal regression models shows that a stay on a medical ICU has a protective effect (incidence rate ratio, 0.42; 95% confidence interval, 0.24–0.74; p = 0.003), whereas the imported MRSA incidence is significantly associated with the number of nosocomial MRSA cases (incidence rate ratio, 1.74; 95% confidence interval, 1.23–2.45; p = 0.002). Structure and process parameters do not show any effect. ICU type and imported MRSA incidence should be considered for benchmarking between hospitals

Antibiotikaverbrauch und Antibiotikaresistenz in der Human- und Veterinärmedizin

Die Deutsche Antibiotika-Resistenzstrategie (DART) weist dem Auf- und Ausbau von Monitoring- und Surveillance-Systemen zu Antibiotikaresistenzen und zum Antibiotikaverbrauch eine zentrale Rolle bei der Begrenzung der weiteren Entstehung und Verbreitung von Antibiotikaresistenzen zu. Dabei wird der „One-Health-Ansatz“ verfolgt, der Human- und Veterinärmedizin gleichermaßen in den Blick nimmt. Mit der kontinuierlichen Erhebung von geeigneten Daten zu Antibiotikaresistenz und Antibiotikaverbrauch, deren räumlichen Verteilung und zeitlichen Entwicklung soll die Grundlage geschaffen werden, um Probleme zu erkennen, Interventionsmöglichkeiten abzuleiten und Interventionen in ihrer Wirksamkeit zu evaluieren. Der vorliegende Beitrag gibt einen Überblick über die etablierten nationalen Surveillance-Systeme in den Sektoren Human- und Veterinärmedizin, mit denen Deutschland auch seinen Verpflichtungen im Rahmen der europäischen und internationalen Aktionspläne sowie rechtlichen Verpflichtungen nachkommt.Peer Reviewe

Surveillance des Antibiotikaverbrauchs in Krankenhäusern

Durch das „Gesetz zur Änderung des Infektionsschutzgesetzes und anderer Gesetze“ vom 28. Juli 2011 (BGBL. I S. 1622) wurde die Verpflichtung von Leitern von Krankenhäusern und von Einrichtungen für ambulantes Operieren zur Überwachung von Erregern mit besonderen Resistenzen und von Krankenhausinfektionen auf das kontinuierliche Monitoring des Antibiotikaverbrauchs ausgeweitet (§ 23 Abs. 4 Satz 2 des Infektionsschutzgesetzes). Hiermit wurde der Bedeutung des umsichtigen Einsatzes von Antibiotika zur Verhütung und Bekämpfung von resistenten Krankheitserregern Rechnung getragen. Das Gesundheitsamt kann zur Überwachung der Einhaltung der gesetzlichen Bestimmungen Einsicht in die betreffenden Unterlagen verlangen. Ein Anliegen des vorliegenden Beitrages ist es, die Gesundheitsämter in dieser Aufgabe zu unterstützen. Es werden Hintergrundinformationen zur Antibiotika-Verbrauchs-Surveillance (AVS) und deren Bedeutung insbesondere im Rahmen der Umsetzung einer rationalen Antibiotikatherapie gegeben und Kriterien vorgestellt, die für eine Überwachung der Implementierung der AVS im Krankenhaus zweckmäßig erscheinen. Darüber hinaus werden Vorschläge zur konkreten Vorgehensweise gemacht und Möglichkeiten und Grenzen der Tätigkeit des Gesundheitsamtes im Bereich AVS angesprochen.According to the German Protection Against Infection Act (IfSG; section 23 paragraph 4, July 2011), hospitals and clinics for ambulatory surgery are obliged to establish a continuous monitoring of antibiotic consumption in their institute. The introduction of the surveillance of antibiotic consumption aims to contribute to an optimization of antibiotic prescription practices in order to confine the development and spread of resistant pathogens. The local public health authority is entitled to supervise the implementation of legal requirements in the hospital setting. The main aim of this article is to support local public health authorities in coping with this task by providing background information on the surveillance of antibiotic consumption and its role as a key component of antibiotic stewardship programs. Furthermore, criteria suitable for assessing the implementation of a functioning surveillance system are proposed. The possibilities and limitations of the activities of public health authorities in this context are addressed

Daten zur Antibiotikaresistenzlage in Deutschland

Im Jahr 2007 wurde am Robert Koch-Institut (RKI) die Infrastruktur von ARS – „Antibiotika-Resistenz-Surveillance in Deutschland“ – entwickelt und installiert. Laboratorien, die Proben aus medizinischen Versorgungseinrichtungen mikrobiologisch untersuchen, übermitteln die in der Routinediagnostik erhobenen Resistenzergebnisse bakterieller Erreger in standardisierter Form zur zentralen Auswertung an das RKI. Die Datenbasis für die Jahre 2008 bis 2011 umfasst ca. 1,3 Mio. Proben aus der stationären Versorgung sowie Daten zu annähernd 800.000 Proben aus der ambulanten Versorgung. Auf Basis der kategorialen Bewertungen der Empfindlichkeit als sensibel (S), intermediär (I) bzw. resistent (R) werden Trends der Methicillin-Resistenz bei Staphylococcus aureus (MRSA) sowie der Cefotaxim-Nicht-Empfindlichkeit als Indikator für das mögliche Vorliegen einer Extended-Spektrum-β-Laktamase (ESBL) bei Escherichia (E.) coli und Klebsiella (K.) pneumoniae in 4 verschiedenen Versorgungsbereichen bzw. Kategorien analysiert: für die stationäre Versorgung, für die ambulante Versorgung insgesamt, für Intensivstationen sowie für Isolate aus Blutkulturen. Die Häufigkeit von MRSA in der stationären Versorgung zeigt nach stagnierenden Werten oberhalb der 20% sowohl insgesamt als auch auf Intensivstationen und bei Blutkulturen erstmals von 2010 auf 2011 eine Abnahme. Dagegen sind in der ambulanten Versorgung, soweit diese durch Routinediagnostik abgebildet wird, MRSA-Raten zwischen 11 und 13% in den Jahren 2008 bis 2011 zu beobachten. Die Nicht-Empfindlichkeit gegenüber Cefotaxim als Indikator für das mögliche Vorliegen einer ESBL bei E. coli zeigt im betrachteten Zeitraum in der stationären Versorgung ansteigende Tendenz, die auf Intensivstationen oberhalb der 10%-Marke verläuft, hingegen tritt die Cefotaxim-Nicht-Empfindlichkeit bei K. pneumoniae häufiger auf ohne eindeutige Tendenz. In der ambulanten Versorgung finden sich bei beiden Spezies von Jahr zu Jahr steigende Häufigkeiten von Cefotaxim-Nicht-Empfindlichkeit, die nahezu zu einer Verdopplung auf 6,0% führen.In 2007, the Robert Koch Institute established the infrastructure for the national Antimicrobial Resistance Surveillance (ARS) system. Laboratories submit data of routine susceptibility testing of clinical samples from hospitals as well as from outpatient care settings in a standardized format to the Robert Koch Institute for central processing. The database for the period 2008–2011 comprises data of about 1.3 million samples from patients in hospital care and almost 800,000 samples from outpatients. Based on SIR interpretations of susceptibility, the trends of methicillin resistance of Staphylococcus aureus (MRSA) and cefotaxime non-susceptibility as an indicator of extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae were analyzed for four care settings or categories: hospital care, outpatient care, intensive care units, and isolates from blood cultures. After constant high levels of above 20%, the proportion of MRSA isolates showed a decline for the first time from 2010 to 2011 in hospital care overall, in intensive care units as well as in blood cultures; in outpatient care, MRSA proportions of about 13% were observed. Within the observed period, non-susceptibility to cefotaxime as an indicator of ESBL in E. coli showed an increasing trend in hospital care at a level above 10% in intensive care units, while cefotaxime non-susceptibility in K. pneumoniae was more frequent but without any trend. In outpatient care, the proportions of cefotaxime non-susceptibility increased year by year in both species resulting in nearly a doubling to 6%

COVID-19-Ausbrüche in deutschen Alten- und Pflegeheimen

Aus einer Analyse der an das RKI übermittelten COVID-19-Meldedaten ging hervor, dass 70% der hospitalisierten und 95% der verstorbenen Patientinnen und Patienten in Deutschland ≥ 60 Jahre alt waren und Alten- und Pflegeeinrichtungen in besonderem Maße von Ausbrüchen betroffen sind. Einen wesentlichen Einfluss auf das Auftreten von Ausbrüchen hat dabei die Entwicklung der COVID-19-Inzidenzen in der Gesamtbevölkerung. Um Kenntnisse über Ausdehnung, Verlauf und Charakteristika der Ausbruchsgeschehen zu gewinnen, wurden drei verschiedene Zeitphasen des Pandemieverlaufs betrachtet und die jeweiligen Ausbruchsdaten aus diesen Phasen in den Kontext der Entwicklung des Infektionsgeschehens in der Gesamtbevölkerung gestellt. Hieraus lassen sich die Hauptstrategien zur Eindämmung von COVID-19 in Pflegeheimen ableiten

Evaluation of Peptide Nucleic Acid-Fluorescence In Situ Hybridization for Identification of Clinically Relevant Mycobacteria in Clinical Specimens and Tissue Sections

With fluorescently labeled PNA (peptide nucleic acid) probes targeting 16S rRNA, we established a 3-h fluorescence in situ hybridization (FISH) procedure for specific visualization of members of the Mycobacterium tuberculosis complex, M. leprae, M. avium, and M. kansasii. Probe specificity was tested against a panel of 25 Mycobacterium spp. and 10 gram-positive organisms. After validation, probes were used to identify 52 mycobacterial culture isolates. Results were compared to conventional genotypic identification with amplification-based methods. All isolates (M. tuberculosis complex, n = 24; M. avium, n = 7; M. kansasii, n = 1) were correctly identified by FISH. In addition, the technique was used successfully for visualization of mycobacteria in biopsies from infected humans or animals. In conclusion, PNA-FISH is a fast and accurate tool for species-specific identification of culture-grown mycobacteria and for direct visualization of these organisms in tissue sections. It may be used successfully for both research and clinical microbiology

Antibiotika-Verbrauchs-Surveillance

Nach der Neufassung des § 23 Abs. 4 Infektionsschutzgesetz (IfSG, Juli 2011) besteht für Krankenhäuser und Einrichtungen für ambulantes Operieren die Verpflichtung, eine kontinuierliche Überwachung des Antibiotika-Verbrauchs zu etablieren. Dies soll dazu beitragen, den Einsatz von Antibiotika zu optimieren und somit der Entwicklung und Ausbreitung von resistenten Erregern entgegenzuwirken. Das Robert Koch-Institut (RKI) hat nach § 4 Abs. 2 Nr. 2b IfSG die Aufgabe, Art und Umfang der zu erfassenden Daten festzulegen. Im vorliegenden Beitrag werden die nach Diskussion mit Vertretern verschiedener Fachgesellschaften entstandenen Vorgaben des RKI, die unter dem Titel „Festlegung der Daten zu Art und Umfang des Antibiotika-Verbrauchs in Krankenhäusern nach § 23 Abs. 4 Satz 2 IfSG“ veröffentlicht wurden, näher ausgeführt und erläutert (Robert Koch-Institut, Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz 59, 2013). Im Sinne eines möglichst einheitlichen Vorgehens folgt die Erfassung des Antibiotika-Verbrauchs methodisch dem Anatomical Therapeutic Chemical (ATC)/Defined Daily Dose (DDD)-Klassifikations-System der WHO, das in nationalen und europäischen Surveillance-Systemen standardmäßig genutzt wird. Zielgröße ist die Antibiotika-Verbrauchsdichte, d. h. die Menge des Antibiotika-Verbrauchs in definierten Tagesdosen (DDD) bezogen auf 100 Patiententage bzw. Fälle. Es wird festgelegt, welche Antiinfektiva in die Surveillance einbezogen werden sollen, für welche Krankenhausorganisationseinheiten die Verbrauchsdichten kalkuliert und in welchen zeitlichen Intervallen die Analysen durchgeführt werden sollen. Darüber hinaus werden Möglichkeiten der Bewertung von Antibiotika-Verbrauchsdaten aufgezeigt.According to § 23 paragraph 4 of the German Infection Prevention Act (IfSG; July 2011), hospitals and clinics for ambulatory surgery are obliged to establish a continuous monitoring system of antibiotic consumption. This is aimed at contributing to an optimization of antibiotic prescription practices in order to confine the development and spread of resistant pathogens. The general requirements (restricted to hospitals) on the method and extent of data collection are provided by the national public health institution after discussion with representatives of various professional societies (Robert Koch-Institut, Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz 59, 2013). The article aims to clarify these specifications and to provide background details. In agreement with national and European surveillance systems, the Anatomical Therapeutic Chemical (ATC)/Defined Daily Dose (DDD) classification system recommended by the WHO should be used as reference standard. Antibiotic consumption should be expressed as the number of DDDs per 100 patient days and per 100 admissions. The categories of antimicrobials and hospital organizational units to be monitored and the time intervals in which analyses should be conducted are determined. Furthermore, various approaches of data assessment are described