Biophysikalische Untersuchungen an GTPasen und ihren Interaktionspartnern

GTPasen sind molekulare Schalterproteine, welche diverse Prozesse in der Zelle steuern. Diese Arbeit setzt sich aus drei Projekten zusammen, wobei in jedem Projekt eine GTPase im Mittelpunkt steht. Das erste Projekt beschäftigt sich mit der Protein-Protein-Interaktion zwischen Ras und seinem GEF SOS. Über die Methode der ATR-FTIR-Spektroskopie soll hier ein neuer Ansatz zur Untersuchung der Wechselwirkungen gefunden werden. Projekt zwei betrachtet den GEF VAV3. Dieser beschleunigt den Austausch verschiedener Rho-GTPasen. Ziel war es hier VAV3 biochemisch und biophysikalisch zu charakterisieren. Der Fokus lag hierbei auf der Identifizierung von Interaktionspartnern und der Kristallisation für folgende Röntgenstrukturanalyse. Im letzten Projekt wird die Nukleotidkoordination in den GTPasen Ras, Ran, Rho und Rab bis ins atomare Detail betrachtet. Es handelt sich um einen interdisziplinären Ansatz bestehend aus Röntgenstrukturanalyse, FTIR-Spektroskopie und MD-Simulationen