Dating and functional characterization of duplicated genes in the apple (Malus domestica Borkh.) by analyzing EST data

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Gene duplication is central to genome evolution. In plants, genes can be duplicated through small-scale events and large-scale duplications often involving polyploidy. The apple belongs to the subtribe Pyrinae (Rosaceae), a diverse lineage that originated via allopolyploidization. Both small-scale duplications and polyploidy may have been important mechanisms shaping the genome of this species.</p> <p>Results</p> <p>This study evaluates the gene duplication and polyploidy history of the apple by characterizing duplicated genes in this species using EST data. Overall, 68% of the apple genes were clustered into families with a mean copy-number of 4.6. Analysis of the age distribution of gene duplications supported a continuous mode of small-scale duplications, plus two episodes of large-scale duplicates of vastly different ages. The youngest was consistent with the polyploid origin of the Pyrinae 37-48 MYBP, whereas the older may be related to γ-triplication; an ancient hexapolyploidization previously characterized in the four sequenced eurosid genomes and basal to the eurosid-asterid divergence. Duplicated genes were studied for functional diversification with an emphasis on young paralogs; those originated during or after the formation of the Pyrinae lineage. Unequal assignment of single-copy genes and gene families to Gene Ontology categories suggested functional bias in the pattern of gene retention of paralogs. Young paralogs related to signal transduction, metabolism, and energy pathways have been preferentially retained. Non-random retention of duplicated genes seems to have mediated the expansion of gene families, some of which may have substantially increased their members after the origin of the Pyrinae. The joint analysis of over-duplicated functional categories and phylogenies, allowed evaluation of the role of both polyploidy and small-scale duplications during this process. Finally, gene expression analysis indicated that 82% of duplicated genes, including 80% of young paralogs, showed uncorrelated expression profiles, suggesting extensive subfunctionalization and a role of gene duplication in the acquisition of novel patterns of gene expression.</p> <p>Conclusions</p> <p>This study reports a genome-wide analysis of the mode of gene duplication in the apple, and provides evidence for its role in genome functional diversification by characterising three major processes: selective retention of paralogs, amplification of gene families, and changes in gene expression.</p

El Espacio arquitectónico dual confortable-eficiente del hábitat contemporáneo

Para el espacio arquitectónico contemporáneo de la tercera década del siglo XXI se enuncia una doble cualidad simultánea formada por lo que denominaremos el espacio confortable y el espacio eficiente. El espacio confortable nos permite medir los parámetros de confort ambiental dentro de los umbrales del beneficio a la salud física y mental de sus habitantes. El espacio eficiente nos permite medir la eficiencia en el intercambio energético con el entorno a través de la forma arquitectónica de la envolvente separadora interior-exterior. Así, el espacio arquitectónico se adjetiva como dual confortable-eficiente. Esta caracterización dual del espacio aporta un nuevo enfoque a la visión cultural de la arquitectura, sobre la cual permite un renovado análisis, así como acompaña al proyecto arquitectónico y su formalización física en la búsqueda del hábitat contemporáneo.Peer ReviewedObjectius de Desenvolupament Sostenible::7 - Energia Assequible i No ContaminantObjectius de Desenvolupament Sostenible::7 - Energia Assequible i No Contaminant::7.3 - Per a 2030, duplicar la taxa mundial de millora de l’eficiència energèticaObjectius de Desenvolupament Sostenible::11 - Ciutats i Comunitats SosteniblesObjectius de Desenvolupament Sostenible::11 - Ciutats i Comunitats Sostenibles::11.1 - Per a 2030, assegurar l’accés de totes les persones a habitatges i a serveis bàsics adequats, segurs i assequibles, i millorar els barris marginalObjectius de Desenvolupament Sostenible::11 - Ciutats i Comunitats Sostenibles::11.4 - Redoblar els esforços per a protegir i salvaguardar el patrimoni cultural i natural del mónObjectius de Desenvolupament Sostenible::11 - Ciutats i Comunitats Sostenibles::11.6 - Per a 2030, reduir l’impacte ambiental negatiu per capita de les ciutats, amb especial atenció a la qualitat de l’aire, així com a la gestió dels residus municipals i d’altre tipusObjectius de Desenvolupament Sostenible::12 - Producció i Consum ResponsablesObjectius de Desenvolupament Sostenible::12 - Producció i Consum Responsables::12.2 - Per a 2030, assolir la gestió sostenible i l’ús eficient dels recursos naturalsPostprint (published version

Estudio de la viabilidad del uso de mezclas SMA en capa intermedia para el refuerzo de firmes. Aplicación práctica en un tramo de la autovía A-7 situado entre el P.K. 468+700 y el 468+300. T.M. de Sagunto (Valencia)

[EN] The present document shows the experimental work undertaken on SMA-16 bituminous mixtures (Stone Mastic Asphalt), an uncommon bituminous mixture in Spain. These mixtures are characterized by having a large amount of course aggregate, a high proportion of binder and mineral dust, along with a low amount of medium-size aggregate (2-4 mm), giving rise to an adequate mineral skeleton and to high proportion of filler rich in mastic. These features make the mixture a possible solution to the difficulties surrounding fatigue failures of the mixture, as well as the appearance of breaks in the pavement, since it can be used as intermediate coat. In order to analyse the mechanical response of SMA mixtures, some experimental tests have been carried out at the laboratory of the construction company PAVASAL. Mixtures containing two different types of bitumen and have been evaluated: on the one hand, conventional 35/50 bitumen and, on the other hand, PMB 45/80-65 polymeric (elastomer) bitumen. Different percentages of binder have been used: 5,1%, 5,6% and 6,1% of bitumen in the mixture. Throughout the entire study we have carried out a comparison between the features of the innovative SMA 16 mixture and those of the most common AC 22 mixture, showing the following properties: void content, resistence to fatigue, stiffness and crack resistance. These properties are essential requirements to use the mixture as an intermediate coat of the pavement. Among the conclusions drawn we can underline the fact that SMA mixtures must be treated with polymer bitumens in order to improve their response to high standards, and to provide the mixture with greater cohesion, tenacity, fatigue strength and resistant to plastic deformation. Besides, this study has proved that SMA 16 45/80-65 mixture responds best to the fatigue strength and the crack growth of these type of mixtures.[CA] En el present document es mostra el treball desenvolupat al voltant de les mescles bituminoses tipus SMA (Stone Mastic Asphalt), una mescla bituminosa poc comú en Espanya. Aquestes mescles es caracteritzen per tindre una gran quantitat de àrid gros, una elevada proporció de lligant i de pols mineral, i una baixa quantitat de tamany intermig (entre 2 i 4 mm), obtenint un bon esquelet mineral i una alta proporció de màstic ric en filler. Aquestes característiques conferixen a la mescla com una possible solució a la problemàtica existent de fallada per fatiga de la mescla i aparició de fissures en el ferm, mediant el us com a capa intermitja. Amb el fí de coneixer la resposta mecànica de les mescles SMA, es van realitzat assatjos experimentals en el laboratori de la empresa constructora PAVASALL. S¿¿han evaluat les mescla amb dos tipus de betum, uno convencional 35/50 i altre modificat amb polímers elastomèrics PMB 45/80-65, i per a diferents percentatges de lligant, 5.1%, 5.6% i 6.1% de betum en mescla. Durnat tot el estudi es comparen les característiques de la novedosa SMA 16 amb la més comuntment utilitzada AC 22, mostrant propietats com: contingut en vuits, resistència a la deformació permanent, resistencia al aigua, resistencia a la fatiga, mòduls de rigidesa i resistencia a la fissuració. Propietats requerides per al us de capa intermitja en el ferm. Entre les conclusions cal destacar que, les mescles SMA deuen ser tractades amb betums modificats amb polímers que milloren la seus resposta a altes exigencies, proporcionant una major cohesió i tenacitat a la mescla i per tant una major resistència a la fatiga i a les deformacions plàstiques. Ademés, es va comprovar la millor resposta de les SMA 16 45/80-65 front a la resistencia a fatiga i propagació de fissures[ES] En el presente documento se muestra el trabajo experimental desarrollado en torno a las mezclas bituminosas tipo SMA 16 (Stone Mastic Asphalt), una mezcla bituminosa poco común en España. Estas mezclas se caracterizan por poseer una gran cantidad de árido grueso, una elevada proporción de ligante y de polvo mineral, y una baja cantidad de árido de tamaño intermedio (entre 2 y 4 mm), surgiendo así un buen esqueleto mineral y una alta proporción de mastic rico en filler. Estas características confieren a la mezcla como una posible solución a la problemática existente de fallo por fatiga de la mezcla y aparición de fisuras en el firme, mediante su uso como capa intermedia. Con el fin de conocer la respuesta mecánica de las mezclas SMA, se han realizado ensayos experimentales en el laboratorio de la empresa constructora PAVASAL. Se ha evaluado la mezcla para dos tipos de betún, uno convencional 35/50 y otro modificado con polímeros elastoméricos PMB 45/80-65; y para distintos porcentajes de ligante: 5,1%, 5,6% y 6,1% de betún en mezcla. Durante todo el estudio se comparan las características de la novedosa SMA 16 con la más comúnmente empleada AC 22, mostrando propiedades como: contenido de huecos, resistencia a la deformación permanente, resistencia al agua, resistencia a la fatiga de la mezcla, módulos de rigidez y resistencia a la fisuración. Propiedades requeridas para su uso como capa intermedia en el firme. Entre las conclusiones destaca que, las mezclas SMA deben ser tratadas con betunes modificados con polímeros que mejoren su respuesta a las altas exigencias, proporcionando una mayor cohesión y tenacidad a la mezcla y por tanto una mayor resistencia a la fatiga y a las deformaciones plásticas. Además, se comprobó la mejor respuesta de la mezcla SMA 16 45/80-65 ante la resistencia a la fatiga de la mezcla y la propagación de las fisuras.Esteban Sanzol, N. (2017). Estudio de la viabilidad del uso de mezclas SMA en capa intermedia para el refuerzo de firmes. Aplicación práctica en un tramo de la autovía A-7 situado entre el P.K. 468+700 y el 468+300. T.M. de Sagunto (Valencia). http://hdl.handle.net/10251/90027Archivo delegad

Proyecto de ampliación del puerto deportivo del Perello (T.M. Sueca). Servicios

[EN] The aim of the essay entitled 'Proyecto de Ampliación del Puerto Deportivo del Perelló. (T.M. Sueca). Servicios' (Expansion Project for Perelló Marina. (T.M. Sueca). Services) is to define and evaluate the works needed to carry out the expansion and conditioning of the marina facilities. In order to do this, preliminary studies on location have been made as a group and later on the dimensions of every part have been analyzed individually. The future works considered in this essay are based on: the setting up of a drinking water supply network in order to supply and provide services to both boats and buildings; the implementation of a sewerage and drainage network to correctly drain off waste water and rainwater; as well as the setting up of a fuel supply and other services directly linked to boats, such as: shore ramp, crane, dry-dock and dockyard.[ES] El objeto del estudio que responde al titulo 'Proyecto de Ampliación del Puerto Deportivo del Perelló. (T.M. Sueca). Servicios' es definir y valorar las obras necesarias para llevar a cabo la ampliación y acondicionamiento de las instalaciones del citado puerto, para ello se realizaron unos estudios previos del emplazamiento, de manera conjunta, para posteriormente proceder al dimensionamiento de manera individualizada de cada una de las partes. Las futuras obras que contemplará este estudio se basan en la instalación de una red de abastecimiento de agua potable, con el fin de abastecer y dar servicio tanto a las edificaciones como a las embarcaciones; la realización de una red de saneamiento y alcantarillado para la correcta evacuación de las aguas residuales y pluviales; además de una instalación de suministro de combustible y los servicios directamente relacionados con las embarcaciones, como son : rampa de varada, grúa, marina seca y talleres.[CA] L'objectiu de l'estudi que respon al títol 'Proyecto de Ampliación del Puerto Deportivo del Perelló. (T.M. Sueca). Servicios' (Projecte d'Ampliació del Port Esportiu del Perelló. (T.M. Sueca). Serveis) és definir i valorar les obres necessàries per a dur a terme l'ampliació i condicionament de les instal·lacions del citat port. Per a això, es van realitzar uns estudis previs sobre l'emplaçament, de manera conjunta, per a posteriorment procedir al dimensionament individualment de cadascuna de les parts. Les futures obres que contemplarà aquest estudi es basen en: la instal·lació d'una xarxa de proveïment d'aigua potable, amb la finalitat de proveir i donar servei tant a les edificacions com a les embarcacions; la realització d'una xarxa de sanejament i clavegueram per a la correcta evacuació de les aigües residuals i pluvials; a més d'una instal·lació de subministrament de combustible i els serveis directament relacionats amb les embarcacions, com són : rampa d'encallada, grua, marina seca i tallers.Esteban Sanzol, N. (2014). Proyecto de ampliación del puerto deportivo del Perello (T.M. Sueca). Servicios. http://hdl.handle.net/10251/38923.Archivo delegad

Proyecto transversal para Educación Primaria: Campeonato de sumo con robots Lego programables (I)

El objetivo principal de este trabajo, junto con la segunda parte del mismo, es elaborar un proyecto interdisciplinar basado en la idea de la robótica educativa y que está enmarcado en el currículo de Educación Primaria. Pretendemos utilizar la robótica educativa no sólo como un fin, sino como un medio para la adquisición de otros objetivos. El proyecto en sí consiste en la organización y planificación de un campeonato de sumo con robots programables LEGO para tercer ciclo. Este propósito es el que hace surgir la necesidad de resolver ciertos problemas y diferentes fases del proyecto, donde la investigación en línea, la experimentación, la toma de decisiones en equipo y las tecnologías de la información y la comunicación, pretenden ser el motor para conseguir un aprendizaje significativo de los estudiantes y que les ayude a desarrollar las competencias básicas.The main purpose of this work, with the second part of it, is to develop an interdisciplinary project, based on the idea of educational robotics and it comes defined by the primary school curriculum. We expect to use the educational robotics not only as a result but as a way to acquire other targets. The project itself consists on the organization and planning of a sumo’s championship with programmable robots for children at 5th and 6th grade. This purpose causes the necessity of resolving some problems and different phases of the project, where the on line research, the experimentation, the team taking decisions and the information and communication technologies, pretend to be the motor in order to achieve the student’s significant learning and help them to develop basic skills.Graduado o Graduada en Maestro en Educación Primaria por la Universidad Pública de NavarraLehen Hezkuntzako Irakasletzan Graduatua Nafarroako Unibertsitate Publikoa

Passeig Lluís Companys: un salón de ciudad

El documento ha estado concebido para ser interpretado en pliegos a doble cara, por lo que se recomienda para la edición digital de UPCommons su visualización con las siguientes opciones del menú Ver del documento PDF: Presentación de página_Dos en una_Mostrar portada en modo de dos en una.El caso de estudio de esta tesina es el Passeig Lluís Companys. El objetivo de esta tesina era adentrarse en la complejidad de este lugar urbano, visto como objeto arquitectónico, para poder descifrar la "condiciones que originan un proyecto"

Basic learning of form

“Form is ‘what’, Design is ‘how’” (Kahn, 1960). Learning about the formal universe and the wide range of possibilities it offers should be one of the purposes of the early subjects in architectural studies. This article aims to explain the contents of a first course of architectural design and demonstrate how, using a methodology based on precise theoretical-practical tools and an active pedagogical dynamic, results are obtained that, on average, are very satisfactory. It shows that in twelve weeks’ time, students have acquired the tools they need to approach any design problem from its formPeer Reviewe

Cloning and mapping multiple S-locus F-box genes in European pear (Pyrus communis L.).

European pear, as well as its close relatives Japanese pear and apple, exhibits S-RNase-based gametophytic self-incompatibility. The male determinant of this self-incompatibility mechanism is a pollen-expressed protein containing an F-box domain; in the genera Petunia (Solanaceae), Antirrhinum (Plantaginaceae), and Prunus (Rosaceae), a single F-box gene determines the pollen S. In apple and Japanese pear, however, multiple S-locus F-box genes were recently identified as candidates for the pollen S, and they were named S-locus F-Box Brothers. These genes were considered good candidates for the pollen S determinant since they exhibit S-haplotype-specific polymorphisms, pollen-specific expression, and linkage to the S-RNase. In the present study, S-locus F-Box Brothers homologs have been cloned from two of the most agronomically important European pear varieties, "Abbé Fétel" (S104-2/S105) and“Max Red Bartlett" (S101/S102), and they have been mapped on a genetic linkage map developed on their progeny. Our results suggest that the number of Fbox genes linked to the S-locus of the European pear is higher than expected according with previous reports for apple and Japanese pear, since up to five genes were found to be linked to a single S-haplotype. Moreover, two of these genes exhibited an incomplete linkage to the S-RNase, allowing the identification of low-frequency recombinant haplotypes, generated by a crossing-over event between the two genes. These F-box genes are most likely placed in close proximity of the S-locus but do not belong to it, and they can thus be excluded from being responsible for the determination of pollen S function

Bases per al Projecte II

Descripció del recurs: 31 de gener de 2018L’espai és l’ambient en què es desenvolupa l’activitat humana, l’extensió del cos en la seva existència orgànica, funcional, perceptiva i emocional. L’arquitectura és l’organització de l’espai per fer-lo habitable. El coneixement de l’espai a la mida de l’home és necessari per aplicar-lo en el projecte arquitectònic. Si a l’assignatura Bases per al Projecte I es va incidir en el necessari domini del llenguatge de les Formes per resoldre qualsevol problema de disseny, a Bases per al Projecte II abordem els mecanismes de percepció, materialització i organització de l’Espai com a instruments necessaris per al projecte arquitectònic. Forma i Espai conflueixen novament en aquesta assignatura: l’Espai no pot ser entès sense la Forma i, a la vegada, les Formes no poden entrar en relació sense l’Espai. L’Espai Arquitectònic apareix quan l’arquitecte dóna Forma i Escala a una part de la superfície lliure: l’espai és el mitjà gràcies al qual és possible la disposició de les coses. L’Espai també sorgeix quan es genera un interior habitable, creant una Forma envoltant que conté un volum d’espai buit. I finalment, l’Espai és el camp que incorpora el Temps en la seva experimentació i recorregut. L’arquitectura és la visualització simultània d’aquestes tres idees d’Espai: el Lloc, l’Interior i l’Experimentació Temporal.Primera edici