Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers.

Duplicatas costumam ocorrer em bancos de germoplasma e a sua identificação é necessária para facilitar o manejo dos bancos ativos de germoplasma (BAGs) e diminuir custos de manutenção. O objetivo deste trabalho foi identificar duplicatas de mandioca determinadas previamente pela caracterização morfo-agronômica, em um BAG da Amazônia Oriental. Foram selecionados 36 acessos que se agrupavam em 13 grupos de similaridade morfo-agronômica para serem genotipados com 15 locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, sendo obtidos 75 alelos, com média de cinco alelos por loco e HE = 0,66. Foram encontrados 34 pares de genótipos que apresentaram perfis multilocos idênticos e a probabilidade de identidade genética foi de 1,1x10-12 com probabilidade de exclusão de 99,9999%. Entre essas duplicatas, estão materiais coletados em épocas e locais diferentes, e com diferentes denominações e acessos com o mesmo nome coletados em diferentes locais e anos. O estudo identificou genótipos que vem sendo cultivados em diferentes locais e que vêm sendo mantidos pelos agricultores ao longo dos anos

Avaliação do valor nutritivo do bagaço de cana-de-açúcar amonizado com uréia.

Resumo: O trabalho foi desenvolvido objetivando-se avaliar o efeito da adição de uréia em doses crescentes, na presença ou ausência de urease, sobre o valor nutritivo do bagaço de cana-de-açúcar. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado em arranjo fatorial (4 x 2) + 1 (controle), com quatro repetições. Os fatores avaliados foram níveis de uréia (2,0; 4,0; 6,0; e 8,0% da matéria seca), níveis de urease (presença, 20,0% da matéria fresca da uréia, e ausência) e um tratamento controle (0,0% de uréia e ausência de urease). Houve efeito da adição de uréia (63,3%) em relação ao controle (69,6%) e efeito da presença de urease (64,4%) em relação à sua ausência (62,1%), para o teor de matéria seca (MS). O menor teor de MS (62,5%) foi observado no nível de 6,2% de uréia. O teor de proteína bruta (PB) cresceu linearmente com a adição de uréia (12,0%) em relação ao controle (1,2%), sem urease. O teor de fibra em detergente neutro (FDN) dos materiais amonizados (81,4%) foi menor que o controle (84,7%), com efeito linear negativo das doses crescentes de uréia. Houve teores mais elevados de FDN nos tratamentos com presença de urease (82,1%) em relação aos tratamentos sem a mesma (80,8%). A digestibilidade in vitro da matéria seca (DIVMS) média do tratamento controle (23,2%) foi inferior à DIVMS média dos tratamentos com uréia (28,5%), com efeito linear positivo dos níveis crescentes de uréia. Não houve efeito da urease sobre a DIVMS do bagaço. A amonização com uréia melhorou o valor nutritivo do bagaço de cana-de-açúcar, sem a necessidade de adição de urease. [Evaluation of the Nutritive Value of Sugarcane Bagasse Ammoniated with Urea]. Abstract: The objective of this work was to evaluate the effect of the addition of crescent levels of urea, with or without urease, on sugarcane bagasse nutritive value. The experimental design was a completely randomized design in a factorial arrangement (4 x 2) + 1 (control), with four replicates. The evaluated factors were urea levels (2.0, 4.0, 6.0 and 8.0% DM), urease levels (presence - 20% of urea fresh matter - and absence) and a control treatment (0.0% urea and without urease). There was an effect of urea addition (63.3%) on the control (69.6%) and effect of urease presence (64.4%) on its absence (62.1%) for the dry matter (DM) content. The smallest estimated DM content (62.5%) was observed at 6.2% urea level. The crude protein (CP) content linearly increased with the addition of crescentlevels of urea (12.0%) as compared to the control (1.2%), without urease effect. The neutral detergent fiber (NDF) content of ammoniated materials (81.4%) was smaller than the control (84.7%), with a negative linear effect of the crescent levels of urea. There was higher NDF content in the treatments with the presence of urease (82.1%) than on the treatments without urease (80.8%). The average in vitro dry matter disappearance (IVDMD) of the control treatment (23.2%) was lower than average urea addition treatments (28.5%), with positive linear effect by the crescent addition of the urea levels. There was no urease effect on IVDMD. The ammoniation with urea improved the sugar cane bagasse nutritive value, without necessity to add urease

The component of Carica papaya seed toxic to A-aegypti and the identification of tegupain, the enzyme that generates it

As Aedes aegypti transmits the etiologic agents of both yellow and dengue fever; vector control is considered essential to minimise their incidence. the aim of this work was to identify the component of Carica papaya seed toxic to A. aegypti, and the identification of tegupain, the enzyme that generates it. Aqueous extracts (1%, w/v) of the seed tegument and cotyledon of C. papaya are not larvicidal isolately. However, a mixture of 17 mu g mL(-1) tegument extract and 27 mu g mL(-1) cotyledon extract caused 100% larval mortality in a bioassay. the mixture was no longer larvicidal after the tegument extract was pre-treated at 100 degrees C for 10 min. the enzyme tegupain efficiently hydrolysed the substrate Z-Phe-Arg-pNan (K-m 58.8 mu M, K-cat 28020 s(-1), K-cat/K-m 5 x 10(8) M-1 s(-1)), and its activity increased with 2 mM dithiothreitol (DTT), at 37 degrees C, pH 5.0. the chelating agent EDTA did not modify the enzyme activity. Inhibition of tegupain by cystatin (K-iapp 2.43 nM), E64 (3.64 nM, 83% inhibition), and the propeptide N-terminal sequence indicate that the toxic activity is due to a novel cysteine proteinase-like enzyme, rendered active upon the hydrolysis of a cotyledon component of C. papaya seeds. (c) 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Universidade Federal de São Paulo, Dept Bioquim, BR-04044020 São Paulo, BrazilUniv Estadual Norte Fluminense, Biotechnol Lab, Campos Dos Goytacazes, RJ, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Dept Bioquim, BR-04044020 São Paulo, BrazilFAPESP: 2009/17058-6FAPESP: 2009/53766-5Web of Scienc

The Use Of Reverse Transcription-pcr For The Diagnosis Of X-linked Chronic Granulomatous Disease.

Chronic granulomatous disease (CGD) is an inherited disorder of the innate immune system characterized by a defective oxidative burst of phagocytes and subsequent impairment of their microbicidal activity. Mutations in one of the NADPH-oxidase components affect gene expression or function of this system, leading to the phenotype of CGD. Defects in gp91-phox lead to X-linked CGD, responsible for approximately 70% of CGD cases. Investigation of the highly heterogeneous genotype of CGD patients includes mutation analysis, Northern blot or Western blot assays according to the particular case. The aim of the present study was to use reverse transcription (RT)-PCR for the analysis of molecular defects responsible for X-linked CGD in eight Brazilian patients and to assess its potential for broader application to molecular screening in CGD. Total RNA was prepared from Epstein B virus-transformed B-lymphocytes and reverse transcribed using random hexamers. The resulting cDNA was PCR-amplified by specific and overlapping pairs of primers designed to amplify three regions of the gp91-phox gene: exons 1-5, 3-9, and 7-13. This strategy detected defective gp91-phox expression in seven patients. The RT-PCR results matched clinical history, biochemical data (nitroblue tetrazolium or superoxide release assay) and available mutation analysis in four cases. In three additional cases, RT-PCR results matched clinical history and biochemical data. In another case, RT-PCR was normal despite a clinical history compatible with CGD and defective respiratory burst. We conclude that this new application of RT-PCR analysis--a simple, economical and rapid method--was appropriate for screening molecular defects in 7 of 8 X-linked CGD patients.37625-3

Histopathologic aspects of splenic fragments autotransplanted in rats

The splenic tissue autograft viability (one third of the spleen) associated to parcial splenectomy was studied to verify the evolutive kinetic of its regeneration by macroscopic and histological aspects. Twenty-eight adult male Wistar rats, weighting 300g, were distributed in four experimental groups. Each animal was submitted to parcial splenectomy and one fragment of each spleen was autotransplanted to the greater omentum, for a period of 30, 60, 90, and 120 days. After each period, the autotransplanted splenic tissues were collected and histopathologically analyzed. The results showed regeneration of the splenic capsule, blood vessels, white pulp, and red pulp. After 90 days, the microscopic architecture was similar to the normal spleen.Estudou-se a viabilidade do autotransplante de tecido esplênico, um terço do baço, associado à esplenectomia parcial, e verificou-se a cinética evolutiva de sua regeneração, sob o aspecto macroscópico e histológico. Foram utilizados 28 ratos Wistar, adultos, machos, com média de peso de 300g, distribuídos em quatro grupos experimentais. Cada animal foi submetido à esplenectomia parcial, e um fragmento de baço foi transplantado para o omento maior, por períodos de 30, 60, 90 e 120 dias. Após cada período pré-estipulado, os tecidos esplênicos autotransplantados foram coletados e analisados histologicamente. Os resultados mostraram regeneração da cápsula esplênica, dos vasos sanguíneos e das polpas branca e vermelha. Aos 90 dias, a arquitetura microscópica apresentava-se semelhante à do baço normal.UNIC Faculdade de Medicina VeterináriaUniversidade Federal Rural de PernambucoUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Escola Paulista de Medicina (EPM)UNIFESP, EPMSciEL

Diversidade genética de acessos de mandioca do banco regional de germoplasma da Amazônia Oriental por meio de caracterização morfológica.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética entre 262 acessos de mandioca do Banco Regional de Germoplasma da Amazônia Oriental por meio de 20 descritores morfológicos qualitativos. As variáveis categóricas foram transformadas em dados de pontuação e foi aplicada a técnica de componentes principais, sem seleção de descritores. Evidenciou-se variação fenotípica entre os descritores avaliados, possível de ser utilizada em programas de melhoramento genético e na diferenciação entre acessos. Foram formados grupos de acessos mais próximos geneticamente devido à ocorrência de mesma classe fenotípica ou similaridade de classe fenotípica para alguns descritores, sendo os descritores textura externa da raiz e cor dos ramos terminais na planta adulta os que mais contribuíram para a variabilidade genética. Os 20 descritores qualitativos utilizados não foram eficientes na discriminação dos acessos de mandioca-brava ou mansa

Divergência genética entre acessos de mandioca (Manihot esculenta Crantz) da região do Tapajós, Pará, por meio de caracteres agronômicos.

O objetivo deste trabalho foi quantificar a divergência genética por meio de caracteres agronômicos entre acessos de mandioca coletados na Região do Tapajós, Pará e conservados no Banco Regional de Germoplasma da Amazônia Oriental. Os 22 acessos foram avaliados durante dois anos consecutivos por meio de seis descritores quantitativos em plantas com 12 meses de idade. Foram realizadas análises de estatística descritiva e multivariada. Foi evidenciada variação entre os descritores quantitativos avaliados. Os seis descritores quantitativos foram utilizados na técnica de agrupamento e os acessos alocados em seis grupos. A técnica de agrupamento foi eficiente na discriminação dos acessos e permitiu a identificação de acessos divergente entre si e promissores para serem utilizados em programas de melhoramento genético, visando à seleção de acessos adaptados ao local de cultivo. Os acessos Amarelinha 36 e Olho roxo 13 mostraram-se potencialmente promissores para serem usados como genitores na geração de híbridos heteróticos

The use of reverse transcription-PCR for the diagnosis of X-linked chronic granulomatous disease

Chronic granulomatous disease (CGD) is an inherited disorder of the innate immune system characterized by a defective oxidative burst of phagocytes and subsequent impairment of their microbicidal activity. Mutations in one of the NADPH-oxidase components affect gene expression or function of this system, leading to the phenotype of CGD. Defects in gp91-phox lead to X-linked CGD, responsible for approximately 70% of CGD cases. Investigation of the highly heterogeneous genotype of CGD patients includes mutation analysis, Northern blot or Western blot assays according to the particular case. The aim of the present study was to use reverse transcription (RT)-PCR for the analysis of molecular defects responsible for X-linked CGD in eight Brazilian patients and to assess its potential for broader application to molecular screening in CGD. Total RNA was prepared from Epstein B virus-transformed B-lymphocytes and reverse transcribed using random hexamers. The resulting cDNA was PCR-amplified by specific and overlapping pairs of primers designed to amplify three regions of the gp91-phox gene: exons 1-5, 3-9, and 7-13. This strategy detected defective gp91-phox expression in seven patients. The RT-PCR results matched clinical history, biochemical data (nitroblue tetrazolium or superoxide release assay) and available mutation analysis in four cases. In three additional cases, RT-PCR results matched clinical history and biochemical data. In another case, RT-PCR was normal despite a clinical history compatible with CGD and defective respiratory burst. We conclude that this new application of RT-PCR analysis - a simple, economical and rapid method - was appropriate for screening molecular defects in 7 of 8 X-linked CGD patients.62563