Sequenciamento dos transcritos de Piper nigrum L. infectada com Fusarium solani f.sp.piperis utilizando Plataforma de nova geração.

Neste trabalho nós extraímos o RNA total e isolamos o mRNA de raízes de Piper nigrum L. infectada com o fungo Fusarium solani f.sp. piperis na fase mais severa da infecção, para construção de uma biblioteca de fragmentos utilizando o método RNA-Seq. A biblioteca gerada foi sequenciada utilizando a plataforma de nova geração ?SOLiDTM 3 Plus System? (Applied Biosystems, EUA) produzindo 67.452.415 leituras com 50 pb. As leituras obtidas foram pré-processadas com softwares de Bioinformática para obtenção de leituras de alta qualidade. Para avaliar os dados pré-processados estatisticamente, foi utilizado o software FASTQC. Os resultados obtidos foram leituras com alta qualidade que serão usadas no processo de montagem, a fim de obter uma lista de transcritos de Planta expressos em resposta a infecção pelo patógeno

Compared to mycophenolate mofetil, rapamycin induces significant changes on growth factors and growth factor receptors in the early days post‐kidney transplantation

We found 1 article: Transplantation. 2002 Mar 27;73(6):915-20. Compared to mycophenolate mofetil, rapamycin induces significant changes on growth factors and growth factor receptors in the early days post-kidney transplantation. Oliveira JG, Xavier P, Sampaio SM, Henriques C, Tavares I, Mendes AA, Pestana M. Renal Department, Hospital S. João, Porto, Portugal. Abstract BACKGROUND: The new immunosuppressive drug Rapamycin (Rapa) is endowed with a mechanism of action that is distinct from that of calcineurin inhibitors. It has been claimed that Rapa does not significantly modulate either the cytokine expression or the transcription of several growth factors in mitogen-activated T cells. Previously, we reported that fine-needle aspiration biopsy (FNAB) sample cultures synthesize a large array of cytokines, and some of them may be powerful predictors of acute rejection in renal transplants. We hypothesized that Rapa may induce significant changes on cytokine production by FNAB sample cultures and on serum cytokine receptors when compared to other immunosuppressive drugs. METHODS: Kidney transplants treated with CsA-Rapa-Pred (Rapa group) were compared with transplants treated with CsA-mycophenolate mofetil-Pred (MMF group). They were studied on day 7 posttransplantation, and they remained rejection free for at least the first 6 months. FNAB samples were cultured and the supernatants were collected at 48 hr of incubation and analyzed by ELISA for interleukin 1 receptor antagonist (IL-1ra), IL-2, IL-6, IL-10, IL-18, monocyte chemotactic protein 1 (MCP-1), soluble tumor necrosis factor I, and transforming growth factor (TGF)-beta(1). The soluble receptors for IL-1, IL-2, IL-6, and tumor necrosis factor alpha, together with IL-2 and IL-18 were also measured in serum. RESULTS: Significant differences were observed when comparing Rapa with the MMF group. IL-18 and TGF-beta(1) synthesis were up-regulated, whereas IL-6 and MCP-1 were down-regulated in FNAB sample cultures. The Rapa group showed a significant down-regulation of each cytokine receptor and of IL-2 in serum. CONCLUSIONS: Rapa was associated with a decreased synthesis of primarily monocyte-derived cytokines and enhanced production of TGF-beta(1), which in an appropriate cytokine milieu may promote allograft tolerance. The down-regulation of cytokine receptors and IL-2 may be associated with a depressed immune response towards the kidney allograft. PMID: 11923692 [PubMed - indexed for MEDLINE

Estabelecimento de padrão genético molecular para sete cultivares de pimenteira-do-reino Piper nigrum L. (Piperaceae) utilizando microssatélite.

O Brasil, juntamente com países Asiáticos, compõe o grupo dos maiores exportadores de pimenta-do-reino, Piper nigrum L., especiaria mais consumida mundialmente. No Pará, estado com maior produção do país, cultiva-se em torno de quatro cultivares nas áreas de produção. Atualmente a identificação das cultivares plantadas é feita utilizando caracteres morfo-agronômicos. Contudo, há dificuldade de identificação das cultivares utilizadas comercialmente pelos produtores que recebem nomes diversos em áreas de produção. O objetivo desse trabalho foi estabelecer o padrão genético de cultivares de Piper nigrum L. utilizando marcadores moleculares microssatélites. A metodologia utilizada foi extração de DNA de plantas de sete cultivares conservadas no banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, amplificação de fragmentos utilizando nove loci microssatelites polimorficos e a genotipagem em gel desnaturante de poliacrilamida corado com prata, Os resultados mostraram diferenças entre as cultivares analisadas com nítidos agrupamentos distintos, sendo o método eficiente para estabelecer padrão genético molecular das cultivares de pimenteira-do-reino