Influence des bois rameaux fragmentés (BRF) de Guiera senegalensis J.F. Gmel et de Piliostigma reticulatum (Dc) Hochst sur la productivité du mil, Pennisetum glaucum (L.)

La mise à profit d’espèces ligneuses buissonnantes présentes dans les systèmes agroforestiers comme sources d’engrais verts, peut contribuer à rehausser le statut organique des sols agricoles, augmenter leur productivité et assurer leur exploitation durable. L’objectif de la présente étude est d’évaluer l’influence des bois raméaux fragmentés (BRF) de G. senegalensis et de P. reticulatum sur la productivité du mil, Pennisetumglaucum (L.) en station. Un dispositif expérimental a été mis en place avec dix traitements composés de deux doses de chaque type de BRF (4 et 6 Tha-1) combinées ou non à 75 kgha-1 d’urée, d’urée à 75 kgha-1 et dutémoin. Le diamètre au collet, la hauteur, le nombre de feuilles et d’épis des plants de mil n’ont pas montré de différence significative par rapport au témoin contrairement au nombre de talles et aux biomasses aérienne et racinaire. Utilisés seuls et à dose croissante, les BRF de G. senegalensis ont eu un effet stimulant sur la productivité du mil contrairement à ceux de P. reticulatum qui ont eu un effet dépressif. L’étude a ainsi démontré que l’utilisation des BRF de ces espèces ligneuses constitue une bonne  stratégie pour la restauration durable des terres dégradées et  l’amélioration des rendements des cultures.Mots clés : BRF, Guiera senegalensis, Piliostigma reticulatum, Pennisetum glaucum, productivité, mil

Caractéristiques morphologiques et croissance de jeunes plants de Jatropha curcas L.

Une étude sur le développement de jeunes plants de Jatropha curcas (L) provenant de boutures et de semis a été menée dans le Jardin botanique du Département de Biologie végétale de l’Université Cheikh Anta Diop de Dakar en comparant différents paramètres liés à leur croissance et à leur morphologie racinaire. Une culture de boutures et de semis en pots remplis de sol sablo-argileux et disposés en bloc complètement randomisé puis un essai de semis direct sur une parcelle de 100 m2 du même substrat ont été réalisés. Les résultats ont montré que les segments de rameau proches de la tige débourrent mieux (80%) que les segments apicaux (50%). Par ailleurs, aucune différence significative n’a été notée sur la germination entre les graines décortiquées (87%) et les graines non décortiquées (73,3%). Le rapport « longueur racine / longueur tige » est plus élevé chez les boutures que chez les plants issus de semis. Les boutures ont émis des racines adventives dont l’une évolue en pivot avec beaucoup de ramifications tandis que les autres racines disparaissent. Les semis en pot ont présenté un enracinement dense avec plus de ramifications latérales en forme d’échasse que les semis directs dont les ramifications ont, par ailleurs, été superficielles. Les mensurations effectuées sur la partie aérienne ont montré une croissance en diamètre chez les plants issus de semis direct et de semis en pot de 17,5 mm et de 13,08 mm chez les boutures.Mots clés: Semis, bouture, tige, racin

Effet du chlorure de sodium sur la germination de graines de Ricinus communis L.

Ricinus communis L (ricin) figure parmi les espèces du Programme biocarburant au  Sénégal. Sa culture sur des terrains incultes (terres salées) constitue une alternative pour éviter une concurrence sur les terres à vocation agricole. C’est pourquoi le taux de germination (TG) de sept accessions de graines de ricin a été étudié pendant 15 jours sous des concentrations croissantes de NaCl (0; 20; 50; 80; 100; 150 et 200 mM). Les résultats ont montré une large variabilité de tolérance au sel au stade de la germination. Les accessions 3 et 8 ont été très sensibles avec des TG réduits seulement à la concentration 20 mM NaCl. Les accessions 1, 6 et 7 n’ont pas toléré la concentration 50 mM. L’accession 5 n’a toléré que les teneurs < 80 mM. L’accession 4 a germé dans les milieux ≤ 100 mM NaCl. Elle n’a manifesté une perte significative de TG qu’en présence de 150 mM NaCl. Elle a été la moins affectée par l’effet ralentisseur du sel sur la vitesse de germination. Ces résultats permettent de dire que le mode d’action de NaCl sur la germination est de nature osmotique et/ou toxique.Mots clés : Ricin, espèce, biocarburant, tolérance au sel, teneur en sel, Sénégal

Caractérisation physico-chimique de la gomme Sterculia de trois localités de la région de Tambacounda au Sénégal

La gomme sterculia est produite par Sterculia setigera Del. en Afrique. Ses propriétés physicochimiques changent suivant divers facteurs dont l’influence sur sa qualité a été peu étudiée. C’est dans cette perspective que l’humidité, le pH, le pouvoir gonflant et la viscosité de cette gomme ont été évalués au Sénégal (Daoudi, Malem niani et Bala). Les résultats ont montré que son humidité varie en fonction du phénotype (écorce claire ou foncée). Elle a été plus élevée sur la gomme de la période sèche-chaude à Daoudi mais elle n’a pas changé suivant le site après un an de conservation. Son pH a varié en fonction de l’interaction période de saignée- couleur de l’écorce à Malem Niani alors qu’à Daoudi il a varié suivant la période de saignée seulement. A Malem, son gonflement a aussi varié suivant l’interaction période de saignée-couleur de l’écorce. Après un an de conservation (température ambiante), son pouvoir gonflant a diminué dans tous les sites. Sa viscosité a été 3,5 fois plus élevée à Bala qu’à Daoudi et Malem Niani. Ces résultats ont permis d’acquérir de nouvelles connaissances et d’identifier Bala comme ayant la meilleure qualité de gomme par rapport aux deux autres sites.Mots clés: Acidité, Humidité, pouvoir de gonflement, Sterculia setigera Del., Tambacounda, viscosit&#233

Étude des caractéristiques des peuplements et des noix de Cocos nucifera L. au Sénégal

Cocos nucifera est l’un des arbres cultivés le plus répandu. Il se propage par graine avec un long cycle biologique. Cette étude qui avait pour objectif de caractériser les populations naturelles de cocotiers des Niayes (Sénégal), notamment leur structure et leur fruit, a montré que les arbres sont âgés et leur régénération quasi inexistante. Les hauteurs variaient de 7 à 17,5 m et les circonférences à 1,30 m de 60 à 182 cm. Les arbres étaient sains et présentaient un faible taux de mortalité (2 à 5%). La morphologie des noix de coco, leur poids et celui de leurs constituants (eau, coprah), étaient variables selon les sites de récolte. Les noix avaient un poids moyen de 1,5 kg. Leur volume d’eau a varié avec le stade de maturité: 350 à 430 ml pour les «noix à eau et sans coprah» et 38 à 70 ml pour les «noix mûres». Le poids de coprah frais a varié entre les sites de 170 à 210 g. En perspective, il serait intéressant d’analyser la variabilité existante afin de l’exploiter dans un programme d’amélioration. Dans le souci de préserver le cocotier dans les Niayes, il faudrait envisager des plantations dans toute cette zone.Mots clés : Cocos nucifera, cocotier, coprah, niayes, palmie

Criblage in vitro des graines d’accessions locales de ricin (Ricinus communis L.) en conditions de stress salin

Le ricin (Ricinus communis L.) est une plante peu exigeante dont la culture offre d’énormes potentialités économiques pour les exploitants agricoles sénégalais. L’identification de génotypes performants avec des rendements acceptables en conditions de stress salin constitue une des solutions pour promouvoir cette culture sur des sols inaffectés aux cultures vivrières. Quatre accessions locales de ricin ont été cultivées durant un mois sur le milieu de Murashige et Skoog (MS) modifié et additionné de 0 ; 25 ; 50 ; 100 et 150 mM de chlorure de sodium (NaCl). Les réponses des accessions ont été évaluées en conditions in vitro sur la base de paramètres morphologiques, biochimiques et de survie des vitroplants. L’effet de la salinité sur ces paramètres mesurés a permis de classer les accessions en groupe tolérant (acc1), moyennement tolérant (acc7) et sensible (acc3 et acc4). La concentration 50 mM de NaCl a été identifiée comme un seuil de tolérance critique et discriminant permettant une classification des accessions de ricin selon leur sensibilité au NaCl. La biomasse aérienne est apparue comme un critère pertinent pour classer les accessions de ricin. Les mesures des teneurs en chlorophylle des feuilles des vitroplants ont permis d’aboutir à la même classification des groupes.Mots clés: criblage, Ricinus communis, salinité, SénégalEnglish Title:  In vitro screening of local accessions of castor bean seeds (Ricinus communis l.) Under conditions of salinity stressEnglish AbstractCastor bean (Ricinus communis L.) is an undemanding plant whose cultivation has enormous economic potential for Seneg alese farmers. The identification of efficient genotypes tolerant to salt stress condition could constitute a significant result to promote ricin culture specifically in margin soils. Four local accessions of castor were cultivated, using in vitro conditions for four weeks on MS modified medium supplemented with 0, 25, 50, 100, 150 mM NaCl. In vitro plants responses to salinity were recorded in terms of morphological and biochemical parameters and the rate of plant survival. The effect of different levels of salinity on these parameters was used to classify the accessions in tolerant group (acc1), moderately tolerant (acc7) and sensitive (acc3 and acc4). The concentration 50 mM of NaCl was identified as a discriminant level for castor accessions classification and a critical level of tolerance. The in vitro plants shoot biomass, appeared a relevant parameter to be used for classification of castor accessions under in vitro conditions. The content of leaf chlorophyll for in vitro plants confirmed the classification of Castor bean accessions obtained with morphological parameters according to their sensitivity to the salinity.Keywords: screening, Ricinus communis, salinity, Senega

In vitro micrografting of Sterculia setigera Del.

An in vitro procedure micrografting of adult scions of Sterculia setigera was developed to overcome low rooting in adult shoot. Axenic micro shoots of 0.5 cm length taken from adult trees as scions were grafted on seedlings rootstocks cultured on MS medium. 100% success was obtained with micrografts using adult apex as scions. Upon three cycles of in vitro micrografting, rejuvenation capacities of S. setigera was recovered as shown by vigour, length and rooting of shoots grown from grafts cultured on MS medium compared to seedlings. Successful micrografts were transferred to plastic pots containing soil under mist house conditions before they were finally exposed to an external environment. 80% of the plantlets survived in the nursery.Keywords: Sterculia setigera, micrografting, rejuvenation, rootin

Etude de la variation de la végétation en milieux salé et acide au Sénégal

L’objectif de l’étude était de comprendre la variation de la végétation en milieux acide et salé. Larépartition de la végétation des sols sulfatés acides salés en fonction  de certains paramètres (pH, conductivité électrique ou CE, humidité du sol et texture des sols) a ainsi été étudiée dans les secteurs situés au Sud et au Nord du fleuve Saloum (Sénégal). Des relevés ont été effectués sur les différentes unités géomorphologiques (terrasses et dunes) suivant la méthode des grappes de superficies  graduelles. Au niveau de chaque surface de collecte, des échantillons de sol ont été prélevés à 6 cm de profondeur pour déterminer leur CE, pH, teneur en eau et texture. L’étude a mis en évidence la distribution de la végétation en fonction des unités géomorphologiques et des types de faciès ainsi que les changements des faciès écologiques à travers les distributions aires-espèces. L’analyse en composantes principales a montré le rôle important de la texture du sol sur le regroupement de la végétation en fonction des gammes de salinité, d’acidité et du taux d’humidité. La connaissance du mode de regroupement de la végétation en milieux acide et salé pourrait aider dans le choix du type d’aménagement pour régénérer les potentialités agronomiques de ces sols et leur  réintégration dans le système productif national.Mots clés: Acidité des sols, diversité biologique, humidité, salinité des sols, texture

Etude de la productivité et de la sensibilité de diverses variétés de tomate (Lycopersicon esculentum Mill) à la virose du jaunissement et de l’enroulement en cuillère des feuilles au Sénégal

Après l’oignon, la tomate est le plus important légume au Sénégal. Elle est très sensible au virus Tomato Yellow Leaf Curl (TYLCV). Quatorze variétés de tomate ont été testées pour évaluer leur productivité et leur résistance au TYLC à différents stades phénologiques (floraison, fructification et maturité) dans un dispositif en blocs complets randomisés comptant trois répétitions. Les résultats ont montré que le nombre de fruits/grappe a varié entre les variétés. La masse unitaire des fruits était plus élevée pour Bybal, Roma VF et Lety F1. La longueur des fruits de Thoriya et Lety F1 était plus importante. Roma VF et Bybal ont présenté les plus gros fruits. TY75 et Ponchita ont produit les rendements en fruits consommables les plus élevés. Roma VF et Lety F1 ont produit les rendements non consommables les plus élevés. Globalement, TY75 et Roma VF ont été plus productives. Une résistance au virus a été observée chez douze variétés et une forte sensibilité chez deux autres (Roma VF et Xina). Ces résultats pourraient intéresser les sélectionneurs, les firmes semencières et les agriculteurs dans leur choix de variétés de tomate à cultiver.Mots clés : Tomate, Lycopersicon esculentum, TYLCV, Sénéga

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance

INTRODUCTION Investment in Africa over the past year with regard to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) sequencing has led to a massive increase in the number of sequences, which, to date, exceeds 100,000 sequences generated to track the pandemic on the continent. These sequences have profoundly affected how public health officials in Africa have navigated the COVID-19 pandemic. RATIONALE We demonstrate how the first 100,000 SARS-CoV-2 sequences from Africa have helped monitor the epidemic on the continent, how genomic surveillance expanded over the course of the pandemic, and how we adapted our sequencing methods to deal with an evolving virus. Finally, we also examine how viral lineages have spread across the continent in a phylogeographic framework to gain insights into the underlying temporal and spatial transmission dynamics for several variants of concern (VOCs). RESULTS Our results indicate that the number of countries in Africa that can sequence the virus within their own borders is growing and that this is coupled with a shorter turnaround time from the time of sampling to sequence submission. Ongoing evolution necessitated the continual updating of primer sets, and, as a result, eight primer sets were designed in tandem with viral evolution and used to ensure effective sequencing of the virus. The pandemic unfolded through multiple waves of infection that were each driven by distinct genetic lineages, with B.1-like ancestral strains associated with the first pandemic wave of infections in 2020. Successive waves on the continent were fueled by different VOCs, with Alpha and Beta cocirculating in distinct spatial patterns during the second wave and Delta and Omicron affecting the whole continent during the third and fourth waves, respectively. Phylogeographic reconstruction points toward distinct differences in viral importation and exportation patterns associated with the Alpha, Beta, Delta, and Omicron variants and subvariants, when considering both Africa versus the rest of the world and viral dissemination within the continent. Our epidemiological and phylogenetic inferences therefore underscore the heterogeneous nature of the pandemic on the continent and highlight key insights and challenges, for instance, recognizing the limitations of low testing proportions. We also highlight the early warning capacity that genomic surveillance in Africa has had for the rest of the world with the detection of new lineages and variants, the most recent being the characterization of various Omicron subvariants. CONCLUSION Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve. This is important not only to help combat SARS-CoV-2 on the continent but also because it can be used as a platform to help address the many emerging and reemerging infectious disease threats in Africa. In particular, capacity building for local sequencing within countries or within the continent should be prioritized because this is generally associated with shorter turnaround times, providing the most benefit to local public health authorities tasked with pandemic response and mitigation and allowing for the fastest reaction to localized outbreaks. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century