9 research outputs found
Epigenome-450K-wide methylation signatures of active cigarette smoking : The Young Finns Study
Smoking as a major risk factor for morbidity affects numerous regulatory systems of the human body including DNA methylation. Most of the previous studies with genome-wide methylation data are based on conventional association analysis and earliest threshold-based gene set analysis that lacks sensitivity to be able to reveal all the relevant effects of smoking. The aim of the present study was to investigate the impact of active smoking on DNA methylation at three biological levels: 5'-C-phosphate-G-3' (CpG) sites, genes and functionally related genes (gene sets). Gene set analysis was done with mGSZ, a modern threshold-free method previously developed by us that utilizes all the genes in the experiment and their differential methylation scores. Application of such method in DNA methylation study is novel. Epigenome-wide methylation levels were profiled from Young Finns Study (YFS) participants' whole blood from 2011 follow-up using Illumina Infinium Hu-manMethylation450 BeadChips. We identified three novel smoking related CpG sites and replicated 57 of the previously identified ones. We found that smoking is associated with hypomethylation in shore (genomic regions 0-2 kilobases from CpG island). We identified smoking related methylation changes in 13 gene sets with false discovery rate (FDR)Peer reviewe
Inflammatory Bowel Disease in Patients with Congenital Chloride Diarrhoea
Publisher Copyright: © 2021 The Author(s) 2021. Published by Oxford University Press on behalf of European Crohn's and Colitis Organisation. All rights reserved. For permissions, please email: [email protected]: Congenital chloride diarrhoea [CLD] is a rare autosomal recessive disease caused by mutations in the solute family carrier 26 member 3 [SLC26A3] gene. Patients suffer from life-long watery diarrhoea and chloride loss. Inflammatory bowel disease [IBD] has been reported in individual patients with CLD and in scl26a3-deficient mice. Methods: We performed an international multicentre analysis to build a CLD cohort and to identify cases with IBD. We assessed clinical and genetic characteristics of subjects and studied the cumulative incidence of CLD-associated IBD. Results: In a cohort of 72 patients with CLD caused by 17 different SLC26A3 mutations, we identified 12 patients [17%] diagnosed with IBD. Nine patients had Crohn's disease, two ulcerative colitis and one IBD-unclassified [IBD-U]. The prevalence of IBD in our cohort of CLD was higher than the highest prevalence of IBD in Europe [p < 0.0001]. The age of onset was variable [13.5 years, interquartile range: 8.5-23.5 years]. Patients with CLD and IBD had lower z-score for height than those without IBD. Four of 12 patients had required surgery [ileostomy formation n = 2, ileocaecal resection due to ileocaecal valve stenosis n = 1 and colectomy due to stage II transverse colon cancer n = 1]. At last follow-up, 5/12 were on biologics [adalimumab, infliximab or vedolizumab], 5/12 on immunosuppressants [azathioprine or mercaptopurine], one on 5-ASA and one off-treatment. Conclusions: A substantial proportion of patients with CLD develop IBD. This suggests the potential involvement of SL26A3-mediated anion transport in IBD pathogenesis. Patients with CLD-associated IBD may require surgery for treatment failure or colon cancer.Peer reviewe
Päihdekasvatus yläkoululaisille : poliisin ennalta estävä työ – toiminnallinen opinnäytetyö toteutettu kouluvierailuna Petäjäveden yläasteella
Päihdekokeilut ovat nuorilla yleisiä. Päihdehäiriöt alkavat kehittyä yleisimmin 14-15-vuotiaana. Usein poliisi kohtaa nuoria silloin, kun tilanne vaatii puuttumista. Tällaiset tilanteet ovat usein negatiivissävytteisiä ja nuorille jää helposti negatiivinen kuva poliisista, joka tulee paikalle vain silloin, kun nuoret ovat tehneet jotakin väärin. Tällaisia nuorten ja poliisin välisiä kohtaamisia ovat etenkin alaikäisten nuorten päihteisiin liittyvät tilanteet, joihin poliisi joutuu puuttumaan.
Poliisin ennalta estävässä strategiassa vuosille 2019-2023 on säädetty, että ennalta estävän toiminnan yksi teema on se, että poliisi kohtaisia nuoria positiivisissa merkeissä. Tämän opinnäytetyön tarkoitus on luoda opetusmateriaali, jonka kanssa poliisi voi mennä yläasteelle tekemään ennalta estävää työtä ja pitämään päihdekasvatusta. Toiminnalla vahvistetaan myös nuorten luottamusta poliisin, kun he saavat positiivisen kohtaamisen poliisin kanssa.
Opinnäytetyö on toiminnallinen. Toiminnallinen osio on suoritettu Petäjäveden yläastella. Opinnäytetyön produktina toimii päihdekasvatuksen tueksi tehty powerpoint- opetusmateriaali. Teoriapohja koostuu päihdesanastosta, nuorten päihteiden käytön tutkimisesta, poliisin ennalta estävästä toiminnasta ja lain säädännöstä
Trade-offs and win-wins between carbon and biodiversity outcomes in Peru
Trooppiset metsät, jotka varastoivat merkittäviä hiilivarantoja pääasiassa maaperässä ja puustossa, ovat jatkuvan maankäytön muutospaineen alla. Tällä hetkellä vallitsee suuri tarve hiilinieluille, kun ilmakehän hiilidioksidipitoisuus jatkaa kasvuaan. Hiilinielujen suojelu on tärkeää, mikäli ilmakehän lämpeneminen halutaan pysäyttää. Trooppiset metsät ovat myös avainalueita biodiversiteetin kannalta. Biodiversiteetin suojelu on tärkeää elinvoimaisten eläin- ja kasvipopulaatioiden turvaamiseksi tulevaisuudessa. Lisäksi, mitä enemmän lajeja maapallolla on, sitä enemmän on ilmastonmuutokseen mahdollisesti sopeutuvia lajeja.
Tämä Pro Gradu -tutkielma tutkii hiilen ja biodiversiteetin suhdetta kahdella Perun Madre de Diosin ja San Martínin alueilla sijaitsevalla tutkimusalueella, ja arvioi tulevaisuuden Biodiversiteettisuojeluarvon tulevaisuuden eri maankäyttöskenaarioille. Tutkimusalueet sijaitsevat Trooppisten Andien ja Amazonin sademetsän alueilla, jotka ovat biodiversiteetin avainalueita globaalissa mittakaavassa.
Tässä tutkielmassa pohditaan lisäksi tutkimusalueiden biodiversiteettiin vaikuttavia ympäristöongelmia, kuten laiton kullankaivuu Madre de Diosissa, valikoivat hakkuut, öljynetsintä, elinympäristöjen pirstaloituminen sekä maatalouden laajeneminen.
Tutkielmassa käytetty aineisto kerättiin 26 biodiversiteettiasiantuntijan henkilökohtaisella haastattelulla Perussa. Aineisto syötettiin Excel-pohjaiseen työkaluun nimeltä CarboScen, joka laati arvioita tulevaisuuden Biodiversiteettisuojeluarvoista tutkimusalueilla. Maankäyttöskenaariot, joille Biodiversiteettisuojeluarvot luodaan, perustuvat Larjavaaran ym. (2018) tutkimukseen ekosysteemihiilen lisäyksestä ja sen kustannuksista eri puolilla maailmaa.
Tämän tutkielman merkittävimmät tulokset olivat, että ekosysteemeihin sidotuista lisähiilitonneista maksetut kannustimet nostaisivat Perun tutkimusalueiden Biodiversiteettisuojeluarvoa, ja siten hyödyttäisivät alueiden biodiversiteettiä.
Ympäristöongelmien, kuten laittomien metsänhakkuiden ja kullankaivuun sekä elohopean käytön vähentäminen kullan erottelussa, vaativat muutoksia lainsäädäntöön sekä tarkkailua ja läpinäkyvyyttä. Maatalouden laajentumisen pysäyttäminen vaatii globaaleja toimenpiteitä kulutustottumuksien pienentämisessä.Tropical forests, which hold significant carbon reserves mostly in the soil and trees, are under constant land-use change pressure. At the same time, there is an increasing demand for carbon sinks, as atmospheric CO2 levels keep increasing. Protecting the carbon sinks is crucial in curbing the further heating of the atmosphere. Tropical forests are also the mayor biodiversity hotspots. Conservation of biodiversity is important for keeping the flora and fauna populations viable. More species on Earth equals to more possibly adapting species in the changing climate.
This Master’s thesis investigates the relation between the terrestrial carbon and biodiversity in two study areas in Peruvian regions Madre de Dios and San Martín and estimates the Biodiversity Conservation Value (BCV) for different land-use scenarios for future. The studied areas are located in the Tropical Andes and the Amazon rainforest and are therefore key biodiversity hotspots on a global scale.
This thesis also discusses other environmental issues threatening the biodiversity in the studied areas. These environmental issues include illegal gold mining in Madre de Dios, impacts of selective logging, oil exploration, illegal logging, habitat fragmentation and agricultural expansion.
The data was collected in 26 face-to-face interviews with biodiversity experts in Peru. The data was then entered into an Excel-based tool called CarboScen, which created estimations of the future BCV values in the studied landscapes. The land-use scenarios used in this study are based on the research of Larjavaara et. al. (2018) about the cost of increasing ecosystem carbon in different locations around the world.
The main results of this thesis are that the payments for extra carbon ton stocked in the landscape would increase the BCV in the studied landscapes in Peru and be beneficial for the biodiversity.
The environmental issues such as tackling illegal logging and gold mining and decreasing the use of mercury in gold extraction require changes in legislation, monitoring and transparency. Curbing the agricultural expansion requires global action in decreasing the consumption
Luokanopettajien näkemyksiä kokonaisvaltaisen terveyden edistämisestä koulussa
Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää luokanopettajien näkemyksiä oppilaiden kokonaisvaltaisen terveyden edistämisestä. Tarkastelimme heidän näkemyksiään kokonaisvaltaisesta terveydestä ja terveysosaamisesta, jotka toimivat perustana terveyden edistämiselle. Pyrimme saamaan tietoa myös oppilaiden kokonaisvaltaisen terveyden sekä terveysosaamisen edistämisen keinoista.
Tutkimus toteutettiin laadullisena tutkimuksena ja siihen osallistui kahdeksan luokanopettajaa eri puolilta Suomea. puolistrukturoidun teemahaastattelun menetelmin Tutkimusaineisto analysoitiin aineistolähtöisen sisällönanalyysin periaattein.
Aineisto kerättiin syksyllä 2020. ja teoriaohjaavan
Tulokset osoittavat terveysosaamisen käsitteen olevan luokanopettajille ennestään tuntematon. Terveysosaamisen eri osa-alueiden määrittely sekä käytännön toteutus vaihtelivat osa-alueiden välillä. Keskeisimmiksi oppilaiden terveyden edistämisen keinoiksi nousivat yhteistyö kodin ja moniammatillisten tahojen kanssa, koulun terveyttä edistävä toimintakulttuuri sekä opettajan toiminta luokan arjessa.
Tutkimus osoittaa, että opettajalla on keskeinen merkitys terveyden edistämisessä. Tämän vuoksi terveysosaamisen käsitteen tunteminen ja terveyden edistämisen suunnitelman laatiminen takaisi entistä tavoitteellisempaa edistämistyötä. Tuloksia voidaan hyödyntää koulun toiminnan kehittämisessä mahdollisimman terveyttä edistäväksi. Oppilaiden terveyden edistämisellä on kauaskantoisia seurauksia, mikä tekee aiheesta yhteiskunnallisesti merkittävän
Ecosystem carbon and biodiversity in thirteen landscapes around the world
Impacts on biodiversity are considered one of the main detrimental consequences of changing climates. However, climate change mitigation is also directly influencing biodiversity if it is done by adding ecosystem carbon relative to a reference scenario. Often it has been assumed that adding ecosystem carbon relative to a reference scenario, e.g. by avoiding deforestation and forest degradation, is always beneficial for biodiversity conservation. However, this association has been shown to hold only locally, or with a specific taxonomic or functional group. Our objective was to study this relationship based on expert interviews. We interviewed 115 biodiversity experts on value for biodiversity of various land uses found in 12 landscapes in 7 countries and 5 continents around the world. The experts gave an approximate score from zero to ten on value of the land use types on conservation of the taxon in focus. We found support to the thinking that land uses containing a large amount of ecosystem carbon are associated with a high value for biodiversity conservation but with some notable exceptions. For example converting a native scrubland to an exotic tree plantation was found to have a negative impact on biodiversity. However, in general, biodiversity conservation is in most cases an important co-benefit of climate change mitigation.peerReviewe
Payments for adding ecosystem carbon are mostly beneficial to biodiversity
Biodiversity conservation is often considered to be an important co-benefit of REDD+ and other mechanisms aiming to increase carbon in biomass and soil to mitigate climate change. This reasoning is based on the assumption that the level of biodiversity and ecosystem carbon are positively correlated. Firstly, however, studies have shown both positive and negative relationships. Secondly, incentives for additional ecosystem carbon do not trigger random or all potential changes in land-use, but often concentrate on one or a few specific changes that could have an opposite effect than the general trend indicates. Therefore, it is important to study biodiversity impacts of plausible measures to increase carbon. We obtained land-use scenarios on pathways to increase carbon based on 97 face-to-face interviews of local land-use experts in twelve landscapes in seven countries and five continents. We then conducted another set of face-to-face interviews with biodiversity experts yielding 2963 estimations concerning the value of land-use classes for 264 taxa of fauna and flora in these landscapes. We found positive carbon to biodiversity relationships in ten of the twelve landscapes. The biodiversity impacts of measures to increase carbon were positive in eleven of the twelve landscapes. Our results indicate that a random land-use change that increases biodiversity is also likely to increase carbon and vice versa