The recombination dynamics of Staphylococcus aureus inferred from spA gene

BACKGROUND: Given the role of spA as a pivotal virulence factor decisive for Staphylococcus aureus ability to escape from innate and adaptive immune responses, one can consider it as an object subject to adaptive evolution and that variations in spA may uncover pathogenicity variations. RESULTS: The population genetic structure was deduced from the extracellular domains of SpA gene sequence (domains A-E and the X-region) and compared to the MLST-analysis of 41 genetically diverse methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-susceptible (MSSA) S. aureus strains. Incongruence between tree topologies was noticeable and in the inferred spA tree most MSSA isolates were clustered in a distinct group. Conversely, the distribution of strains according to their spA-type was not always congruent with the tree inferred from the complete spA gene foreseeing that spA is a mosaic gene composed of different segments exhibiting different evolutionary histories. Evidences of a network-like organization were identified through several conflicting phylogenetic signals and indeed several intragenic recombination events (within subdomains of the gene) were detected within and between CC’s of MRSA strains. The alignment of SpA sequences enabled the clustering of several isoforms as a result of non-randomly distributed amino acid variations, located in two clusters of polymorphic sites in domains D to B and Xr (a). Nevertheless, evidences of cluster specific structural arrangements were detected reflecting alterations on specific residues with potential impact on S. aureus pathogenicity. CONCLUSIONS: The detection of positive selection operating on spA combined with frequent non-synonymous mutations, domain duplication and frequent intragenic recombination events represent important mechanisms acting in the evolutionary adaptive mechanism promoting spA genetic plasticity. These findings argue that crucial allelic forms correlated with pathogenicity can be identified by sequences analysis enabling the design of more robust schemes. ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL: The online version of this article (doi:10.1186/s12866-016-0757-9) contains supplementary material, which is available to authorized users

Fitorreguladores de crescimento no alongamento in vitro de Pinus greggii.

Organizado por Patricia Póvoa de Mattos, Celso Garcia Auer, Rejane Stumpf Sberze, Katia Regina Pichelli e Paulo César Botosso

Efeito da irrigação no estabelecimento de plântulas de Manduvi transplantadas Em pastagens cultivadas.

O esforço para a conservação da arara-azul no Pantanal deve enfocar a manutenção de populações viáveis de Manduvi. Caso seja diagnosticado que o recrutamento populacional de Manduvi desta árvore no Pantanal é insatisfatório para a reposição de adultos, torna-se urgente o desenvolvimento de um programa de manejo e conservação de populações de Manduvi. Neste sentido, este trabalho investigou o estabelecimento de plântulas de Manduvi, com 60 dias de semeadura, transplantadas em pastagens cultivadas, que substituíram a vegetação original na área da fazenda Nhumirim. The effort to conserve hyacinth macaws in the Pantanal should focus on the maintenance of viable populations of Manduvi. If it is diagnosed that the recruitment of this tree population in the Pantanal is unsatisfactory for the replacement of adults, it becomes urgent to develop a program management and conservation of populations of Manduvi. Thus, this study investigated the establishment of seedlings of Manduvi, with 60 days of sowing, transplanting in cultivated pastures, which replaced the original vegetation in the area of the Nhumirim Farm

An Experiment with 3 Layers Development for IoT with NodeMCU12e + Nextion

This paper presents the results of an experimental research with the development of a 3 layer solution for the Internet of Things using the NodeMCU12e controller and the Nextion touchscreen display to provide monitoring projects for individuals who require remote monitoring and special care, involving the health area, monitoring of patients, children or people who are in medical treatment who need a remote monitoring. The results demonstrated the possibilities for creating solutions that could serve as a basis for new projects with greater amplitude, contributing to more robust solutions that can meet different types of products that can collaborate with the health of the population in general

Sazonalidade na composição botânica e produção de matéria seca, sob pastejo, em pastagem nativa, Pantanal - MS.

As áreas de pastagem nativa de acordo com estudos da FAO(Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação), compreendem cerca de 70%, em todo o mundo. No Brasil, essas áreas perfazem 77%, constituindo um recurso importante na alimentação dos ruminantes domésticos e selvagens. No Pantanal, as pastagens nativas constituem a base alimentar da pecuária de corte, principal atividade econômica, cujo rebanho está estimado em 3 milhões de cabeças. Assim, a utilização correta das forrageiras nativas constitui um dos mais importantes aspectos do manejo da pastagem, e esta é obtida quando se combina a ecologia da natureza com a economia do homem, segundo Heady (1975). A vegetação é um dos componentes mais importantes do ecossistema (Araújo Filho et al., 1994), porque expõe os efeitos das condições ambientais e fatores históricos, de maneira óbivia e mensurável (Muller-Dombois e Ellenberg, 1974). O estudo da composição botânica fornece informações sobre os elementos da comunidade e poruqe esses diferem, em relação às suas exigências edáficas e climáticas. O trabalho foi desenvolvido com o objetivo de estimar a variação da vegetação, durante dois anos hidrológicos, em duas fitofisionomais, localizadas na sub-região da Nhecolândia, através da avaliação dos seguintes atributos: composição botânica, disponiblidade de matéria seca, e cobertura do solo.bitstream/item/37484/1/CT52.pd

Rendimento forrageiro da erva sal irrigada com efluentes da criação de tilápia em rejeito da dessalinização.

Adotando-se um delineamento estatístico de blocos ao acaso, com quatro tratamentos e três repetições, procurou-se dentro da Unidade da Embrapa Semi-Árido, estudar a influência da aplicação de efluentes através da irrigação, sobre a produção de erva sal (Atriplex nummularia) e de algumas características do solo. Os tratamentos (T1, T2, T3 e T4) constaram da aplicação semanal, via irrigaçã, e de efluentes oriundos de tanques de criação de tilápias (Oreochromis sp) com rejeito da dessalinização de água salobra (salinidade média de 7,2 dS m-¹), nos volumes de 75, 150, 225 e 300 litros por semana. A salinidade média do extrato de saturação do solo na profundidade 0-90 cm, antes de iniciadas as irrigações, foi de 0,40 dS m-¹. Após a colheita, para os tratamentos T1, T2, T3 e T4, as salinidades médias dos perfis de solo na mesma profundidade ()-9 cm) foram, respectivamente, 10,87; 10,62; 6,46 e 5,73 dS m-¹ e, os rendimentos de matéria seca da erva-sal, da ordem de 8,25; 10,89; 14,39 e 15,00 t ha-¹. Os melhores rendimentos foram obtidos com os tratamentos T3 e T4, não havendo, todavia, diferença significativa entre os dois. Considerando-se que há uma economia de 25% no volume de água aplicada entre ambos, sugere-se no manejo de água, aplicar 75% da taxa evaporativa potencial medida com o tanque classe "A".1 CD-ROM

Nitrato e amônio no solo sob plantio direto.

Avaliou-se as alterações na concentração de nitrato (NO3-) e amônio (NH4+) em Latossolo Vermelho sob o sistema de plantio direto com soja (PDS), plantio direto com milho (PDM) e cerrado sentido restrito (CE). A área está localizada na Embrapa Cerrados, DF. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com três repetições em experimento de 19 anos com rotação anual soja-milho. A soja foi semeada no dia 20/10/2013 e o milho híbrido no dia 22/10/2013. Foram realizadas coletas por parcela nos dias 07, 11, 12, 13, 14, 20 e 27/11/2013, nos intervalos de profundidade de 0-5 cm e 5 -10 cm. As determinações das formas de N e do teor de água do solo foram realizadas pelos métodos Kjeldahl e gravimétrico. Nesse intervalo de sete dias de avaliação, independente do tratamento, as maiores variações ocorreram na concentração de NH4+. Nos tratamentos PDS, PDM e cerrado as concentrações de NO3- variaram de 3,86?1,36 mg kg-1, 4,04?1,72 mg kg-1 e 1,86?1,11mg kg-1, respectivamente, em termos médios e independentemente da profundidade. As maiores amplitudes de concentrações de NO3- ocorreu nos cultivos agrícolas. Esses dados são preliminares e necessitam de um maior intervalo de tempo, para que possamos sugerir um sistema mais conservativo em termos de nitrogênio

Efeito da temperatura e do oxigênio dissolvido em água salobra no cultivo de tilápia.

Este trabalho teve como objetivo analisar o efeito da temperatura e do oxigênio dissolvido no cultivo de tilápia em água salobra relacionando com a biomassa. O experimento foi realizado em dois viveiros, abastecido com água proveniente do rejeito da dessalinização.na Embrapa Semiárido, em Petrolina, PE, no período de março a maio de 2011. Foram utilizados alevinos de tilápia macho, revertidos sexualmente. Durante o período de experimento, os animais foram alimentados uma vez ao dia e pesados uma vez ao mês. Foram realizadas análises diárias, matutinas e vespertinas, da temperatura e do oxigênio dissolvido. A temperatura da água apresentou valor mínimo de 27,3 ºC no mês de maio, no período matutino e máxima de 32,0 ºC no mês de março, no período vespertino. O oxigênio dissolvido apresentou média mínima de 5,7 mg/L-1 e máxima de 15,7 mg/L-1 no período vespertino, ambos no mês de maio. A biomassa aumentou linearmente durante os meses estudados, apresentando, no início do cultivo, 5.08 Kg e ao final, 99,00 Kg. Concluiu-se que a temperatura e o oxigênio dissolvido encontraram-se dentro da faixa ideal para o conforto e a criação de tilápia, possibilitando o aumento da biomassa

Análise da condutividade elétrica e do pH em água salobra no cultivo de tilápias.

Este trabalho teve como objetivo analisar o pH e a condutividade elétrica no cultivo de tilápias em água salobra, provenientes do processo de dessalinização. O experimento foi realizado em viveiros na Embrapa Semiárido, em Petrolina, PE, durante o período de março a maio de 2011. Foram utilizados alevinos machos de tilápia, revertidos sexualmente. Os mesmos foram alimentados uma vez ao dia. Foram realizadas análises diárias, matutinas e vespertinas, do pH e da condutividade elétrica. O pH apresentou valor mínimo de 7,7 no mês de abril e máxima de 9,0 no mês de março. No período da tarde, o pH apresentou mínimo de 7,8 no mês de março e máxima de 9,4 no mês de maio. A condutividade elétrica na parte da manhã apresentou valor mínimo de 5,0 μS/cm no mês de março e máxima de 5,4 μS/cm no mês de maio. Na parte da tarde, a condutividade elétrica apresentou valor mínimo de 5,4 μS/cm no mês de março e máxima de 5,6 μS/cm nos meses de abril e maio. Conclui-se que o pH e a condutividade elétrica da água salobra do cultivo de tilápias estão dentro da faixa ideal para criação de tilápias