27 research outputs found
Is the Folded-chain Structure Possible in Cellulose Molecule?
- Author
- Publication venue
- 'Society of Fiber Science and Technology Japan'
- Publication date
- 01/01/2000
- Field of study
Docking Ligands into Flexible and Solvated Macromolecules. 5. Force-Field-Based Prediction of Binding Affinities of Ligands to Proteins
- Author
- Aqvist J.
- Berman H. M.
- Böhm H. J.
- Case D. A.
- Clark M.
- Corbeil C. R.
- Corbeil C. R.
- Corbeil C. R.
- Cornell W. D.
- Eldridge M. D.
- Englebienne P.
- Ewig C. S.
- Ewing T. J. A.
- Halgren T. A.
- Halperin I.
- Hansson T.
- Huang N.
- Jain A. N.
- Jones G.
- Jorgensen W. L.
- Klebe G.
- Kollman P.
- Lee J.
- Mayo S. L.
- Mobley D. L.
- Moitessier N.
- Moitessier N.
- Morris G. M.
- Nicolas Moitessier
- Pablo Englebienne
- Qiu D.
- Rarey M.
- Venkatachalam C. M.
- Wang R.
- Wang R.
- Weiner S. J.
- Weiner S. J.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Evaluation of PMF Scoring in Docking Weak Ligands to the FK506 Binding Protein
- Author
- Aqvist J.
- Bernstein F. C.
- Brown R. D.
- Böhm H.-J
- Böhm H.-J.
- CONCORD
- DeWitte R. S.
- Dixon J. S.
- Eldridge M. D.
- Ewing T.
- Gallop M. A.
- Goodford P. J
- Gordon E. M.
- Head R. D.
- Jain A. N
- Jones G.
- Kay L. E.
- Kollman P
- Kuntz I. D
- Kuntz I. D.
- Lipinski C. A.
- Lorber D. M.
- Lutz M. W.
- Makino S.
- Muegge I.
- Muegge I.
- Muegge I.
- Muegge I.
- Muegge I.
- Rarey M.
- Shuker S. B.
- Verkhivker G.
- Wallqvist A.
- Warr W. A
- Weiner S. J.
- Weiner S. J.
- Welch W.
- Williams D. H.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Self-Guided Molecular Dynamics Simulation for Efficient Conformational Search
- Author
- Allen M. P.
- Benrendsen H. J. C.
- Brooks B. R.
- Daggett V.
- Evans D. J.
- Evans D. J.
- Hockney R. W.
- Hoover W. G.
- Hoover W. G.
- Jain A.
- Janezic D.
- Johnson M. W.
- Jorgensen W. L.
- Karplus M.
- Kirkpatrick S.
- Kollman P.
- Kumar S.
- Lattman E. E.
- MacKerell
- Marrone T. J.
- Mazur A. K.
- McCammon J. A.
- Pellegrini M.
- Potter D.
- Rapaport D. C.
- Ryckaert J. P.
- Schiffer C. A.
- Schmidt A. B.
- Scholtz J. M.
- Scholtz J. M.
- Scholtz J. M.
- Smart L.
- Smith P. E.
- Straatsma T. P.
- Sung S.-S.
- Swindoll R. D.
- Teleman O.
- Tirado-Rives J.
- Tirado-Rives J.
- Tobias D.
- Tobias D. J.
- Tuckerman M. E.
- Tuckerman M. E.
- Tuckerman M. E.
- Weiner S. J.
- Weiner S.J.
- Wesson L.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Conformation of deltorphin-II in membrane environment studied by two-dimensional NMR spectroscopy and molecular dynamics calculations
- Author
- Amiche M.
- Arlandini E.
- Balboni G.
- Blaney J. M.
- Broccardo M.
- Cavagnero S.
- Charpentier S.
- Crippen G. M.
- Doi M.
- Erspamer V.
- Fujiyoshi-Yoneda T.
- Hruby V. J.
- Hughes J.
- Ishida T.
- Kollman P. A.
- Loew G.
- Mammi N.
- Mierke D. F.
- Montecucchi P. C.
- Mosberg H. I.
- Nikiforovich G. V.
- Nikiforovich G. V.
- Pastore A.
- Pattabiraman N.
- Portoghese P. S.
- Rapaka R. S.
- Sagan S.
- Sagan S.
- Salvadori S.
- Schwyzer R.
- Schwyzer R.
- Singh U. C.
- Smith G. D.
- Tancredi T.
- Temussi P. A.
- Weiner S. J.
- Yamazaki T.
- Publication venue
- 'Wiley'
- Publication date
- Field of study
Structural modeling of the distamycin A-d(CGCGAATTCGCG)2 complex using 2D NMR and molecular mechanics
- Author
- Berman M.
- Bremer J.
- Bugg C. E.
- Caldwell J.
- Coll M.
- Dervan P. B.
- Dewar M. J. S.
- Dickerson R. E.
- Drew H. R.
- Drobny G.
- Fratini A. V.
- Hahn F. E.
- Jeener J.
- Jeffrey G. A.
- Kalk A.
- Keepers J. W.
- Klevit R. E.
- Kollman P.
- Kopka M. L
- Kopka M. L
- Kopka M. L
- Krey A.
- Kumar A.
- Lavery R.
- Lavery R.
- Leupin W.
- Macura S.
- Nelson H. C. M.
- Olejniczak E. T.
- Patel D. J.
- Patel D. J.
- Patel D. J.
- Patel D. J.
- Pjura P. E.
- Taylor J. S.
- Wang A.
- Weiner S. J.
- Weiner S. J.
- Zakrzewska K.
- Zakrzewska K.
- Zimmer C.
- Zimmer C.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Additive and Classical Drude Polarizable Force Fields for Linear and Cyclic Ethers
- Author
- Allen F. H.
- Allen T. W.
- Allen T. W.
- Allinger N. L.
- Anisimov V. M.
- Archontis G.
- Bader R. F. W.
- Bedrov D.
- Bedrov D.
- Bedrov D.
- Bedrov D.
- Bedrov D.
- Berthier G.
- Berthier G.
- Boatz J. A.
- Borodin O.
- Borodin O.
- Borodin O.
- Briggs J. M.
- Brooks B. R.
- Cadioli B.
- CCDC.
- Chicos J. S.
- Cornell W. D.
- Darden T.
- Deng Y.
- Dixon R. W.
- Faller R.
- Foloppe N.
- Foloppe N.
- Freeman F.
- Freeman F.
- Frisch M. J.
- Gallinella E.
- Gao J. L.
- Girard S.
- Greene S.
- Halgren T. A.
- Halgren T. A.
- Harder E.
- Helfrich J.
- Huang N.
- Ionescu A. R.
- Jorgensen W. L.
- Jungwirth P.
- Kelly C. P.
- Klauda J. B.
- Kollman P. A.
- Kumar S.
- Lague P.
- Lamoureux G.
- Lamoureux G.
- Lamoureux G.
- Lii J. H.
- Lii J. H.
- Lii J. H.
- Lii J. H.
- Liu Z. Y.
- Lopes P. E. M.
- MacKerell A. D.
- MacKerell A. D.
- MacKerell A. D. Jr.
- Miller K. J.
- Obama M.
- Patel S.
- Patel S.
- Patel S.
- Rayon V. M.
- Ryckaert J. P.
- Saebo S.
- Saebo S.
- Simonson T.
- Soto P.
- Steinbach P. J.
- Strajbl M.
- Strajbl M.
- Thole B. T.
- Vorobyov I. V.
- Weiner S. J.
- Weiner S. J.
- Wiberg K. B.
- Woodcock H. L.
- Wu J. T.
- Yin D.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Trimethyl- p
- Author
- Allen M. P.
- Barone V.
- Basis
- Berthomieu C.
- Beveridge D. L.
- Boesch S. E.
- Boesch S. E.
- Born M.
- Breneman C. M.
- Burie J.-R.
- Chipman D.
- Cohen M. J.
- Dupuis M.
- Eriksson L. A.
- Fukuda E. K.
- Gordy W.
- Grafton A. K.
- Hansson
- Jayaram B.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Kollman P. A.
- Kruk J.
- Macmillan F.
- Macmillan F.
- McCammon J. A.
- Morton R. A.
- Mulliken R. S.
- O'Malley P. J.
- Pearlman D. A.
- Pulay P.
- Rashin A. A.
- Raymond K. S.
- Reynolds C. A.
- Rich P. R.
- Robinson H. H.
- Ryckaert J. P.
- Schmidt M. W.
- Staehelin L. A.
- Stephens P. J.
- Straatsma T. P.
- Swallow A.
- Trumpower B. L.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- Warshel A.
- Weil J.
- Weiner S. J.
- Weiner S. J.
- Wheeler R. A.
- Wheeler R. A.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Influence of Grid Spacing in Poisson–Boltzmann Equation Binding Energy Estimation
- Author
- Alexander H. Boschitsch
- Baginski M.
- Baker N. A.
- Berman H. M.
- Boschitsch A. H.
- Boschitsch A. H.
- Boschitsch A. H.
- Boschitsch A. H.
- Decherchi S.
- Dolinsky T. J.
- Dong F.
- Feig M.
- Fenley M. O.
- Fenley M. O.
- Grant J. A.
- Kollman P. A.
- Mackoy T.
- Marcia O. Fenley
- Nicholls A.
- Pang X.
- Reyes C. M.
- Robert C. Harris
- Sharp K. A.
- Shivakumar D.
- Simonov N. A.
- Weiner S. J.
- Word J. M.
- Yu Z.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Polarizable Empirical Force Field for Alkanes Based on the Classical Drude Oscillator Model
- Author
- Allen M. P.
- Allinger N. L.
- Allinger N. L.
- Anisimov V. M.
- Anisimov V. M.
- Becke A. D.
- Becke A. D.
- Ben-Naim A.
- Bonin K. D.
- Bordner A. J.
- Brooks B. R.
- Cao J. S.
- Chalasinski G.
- Chang J.
- Chemistry WebBook NIST
- Chen B.
- Chen B.
- Cornell W. D.
- Cui Q. Z.
- Darden T. A.
- Daura X.
- Debolt S. E.
- Delhommelle J.
- Deng Y.
- Derreumaux P.
- Dillen J. L. M.
- Dillen J. L. M.
- Drude P.
- Dunning T. H.
- Engelsen S. B.
- Ertl H.
- Feller S. E.
- Foloppe N.
- Frisch M. J.
- Frisch M. J.
- Gallicchio E.
- Giese T. J.
- Halgren T. A.
- Halgren T. A.
- Halgren T. A.
- Hoye J. S.
- Hwang M. J.
- Jeziorski B.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Kaminski G.
- Kaminski G.
- Kaminski G. A.
- Klauda J. B.
- Kollman P.
- Kumar S.
- Lado F.
- Lague P.
- Laidig K. E.
- Lamoureux G.
- Lamoureux G.
- Leach A. R.
- Lee C.
- Lee S. H.
- Lee S. H.
- Lee S. H.
- Lii J.-H.
- Lii J.-H.
- MacKerell A. D.
- MacKerell A. D.
- Madan B.
- Mancera R. L.
- Maple J. R.
- Maple J. R.
- Martin M. G.
- Martin M. G.
- McGann M. R.
- Miller K. J.
- Miwa Y.
- Morita A.
- Mundy C. J.
- Nath S. K.
- Nath S. K.
- Nath S. K.
- Neumann M.
- Nicolas J. P.
- Noskov S. Y.
- Oostenbrink C.
- Ottiger M.
- Palmo K.
- Panhuis M. P.
- Patel S.
- Pratt L. R.
- Rivera J. L.
- Ryckaert J. P.
- Schuler L. D.
- Schuler L. D.
- Shirts M. R.
- Shirts M. R.
- Siepmann J. I.
- Simonson T.
- Smith B. D.
- Smith J. C.
- Steinbach P. J.
- Stuart S. J.
- Sun H.
- Sun Y.
- Thole B. T.
- Tu Y. Q.
- Wallqvist A.
- Weeks J. D.
- Weiner S. J.
- Weiner S. P.
- Yin D.
- Yin D.
- Zhang H. Z.
- Zhang Q.
- Zhang Y. H.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study