Structural basis for the Pr-Pfr long-range signaling mechanism of a full-length bacterial phytochrome at the atomic level.

Phytochromes constitute a widespread photoreceptor family that typically interconverts between two photostates called Pr (red light–absorbing) and Pfr (far-red light–absorbing). The lack of full-length structures solved at the (near-)atomic level in both pure Pr and Pfr states leaves gaps in the structural mechanisms involved in the signal transmission pathways during the photoconversion. Here, we present the crystallographic structures of three versions from the plant pathogen Xanthomonas campestris virulence regulator XccBphP bacteriophytochrome, including two full-length proteins, in the Pr and Pfr states. The structures show a reorganization of the interaction networks within and around the chromophore-binding pocket, an α-helix/β-sheet tongue transition, and specific domain reorientations, along with interchanging kinks and breaks at the helical spine as a result of the photoswitching, which subsequently affect the quaternary assembly. These structural findings, combined with multidisciplinary studies, allow us to describe the signaling mechanism of a full-length bacterial phytochrome at the atomic level

Desarrollo de un suero equino hiperinmune para el tratamiento de COVID-19 en Argentina

La enfermedad denominada COVID-19 es causada por el coronavirus SARS-CoV-2 y es actualmente considerada una pandemia a nivel global. El desarrollo de vacunas es sin duda la mejor estrategia a largo plazo, pero debido a la emergencia sanitaria, existe una necesidad urgente de encontrar soluciones rápidas y efectivas para el tratamiento de la enfermedad. Hasta la fecha, el uso de plasma de convalecientes es la única inmunoterapia disponible para pacientes hospitalizados con COVID-19. El uso de anticuerpos policlonales equinos (EpAbs) es otra alternativa terapéutica interesante. La nueva generación de EpAbs incluyen el procesamiento y purificación de los mismos y la obtención de fragmentos F(ab’)2 con alta pureza y un excelente perfil de seguridad en humanos. Los EpAbs son fáciles de producir, lo cual permite el desarrollo rápido y la elaboración a gran escala de un producto terapéutico. En este trabajo mostramos el desarrollo de un suero terapéutico obtenido luego de la inmunización de caballos utilizando el receptor-binding domain de la glicoproteína Spike del virus. Nuestro producto mostró ser alrededor de 50 veces más potente en ensayos de seroneutralización in vitro que el promedio de los plasmas de convalecientes. Estos resultados nos permitirían testear la seguridad y eficacia de nuestro producto en ensayos clínicos de fase 2/3 a realizarse a partir de julio de 2020 en la zona metropolitana de Buenos Aires, Argentina.The disease named COVID-19, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is currently generating a global pandemic. Vaccine development is no doubt the best long-term immunological approach, but in the current epidemiologic and health emergency there is a need for rapid and effective solutions. Convalescent plasma is the only antibody-based therapy available for COVID-19 patients to date. Equine polyclonal antibodies (EpAbs) put forward a sound alternative. The new generation of processed and purified EpAbs containing highly purified F(ab’)2 fragments demonstrated to be safe and well tolerated. EpAbs are easy to manufacture allowing a fast development and scaling up for a treatment. Based on these ideas, we present a new therapeutic product obtained after immunization of horses with the receptor-binding domain of the viral Spike glycoprotein. Our product shows around 50 times more potency in in vitro seroneutralization assays than the average of convalescent plasma. This result may allow us to test the safety and efficacy of this product in a phase 2/3 clinical trial to be conducted in July 2020 in the metropolitan area of Buenos Aires, Argentina.Fil: Zylberman, Vanesa. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sanguineti, Santiago. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pontoriero, Andrea. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Higa, Sandra V.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Cerutti, Maria Laura. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingeniería de Proteínas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Morrone Seijo, Susana María. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pardo, Romina Paola. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Muñoz, Luciana. Inmunova; ArgentinaFil: Acuña Intieri, María Eugenia. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingeniería de Proteínas; ArgentinaFil: Alzogaray, Vanina Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Avaro, Martín M.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Benedetti, Estefanía. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Berguer, Paula Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Bocanera, Laura. mAbxience; ArgentinaFil: Bukata, Lucas. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bustelo, Marina S.. Inmunova; ArgentinaFil: Campos, Ana M.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Colonna, Mariana. Inmunova; ArgentinaFil: Correa, Elisa. mAbxience; ArgentinaFil: Cragnaz, Lucí­a. mAbxience; ArgentinaFil: Dattero, María E.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Dellafiore, María Andrea. mAbxience; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Foscaldi, Sabrina Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: González, Joaquí­n V.. Inmunova; ArgentinaFil: Guerra, Luciano Lucas. mAbxience; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Klinke, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Labanda, María Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Lauché, Constanza Elena. Inmunova; ArgentinaFil: López, Juan C.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Martínez, Anabela M.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Otero, Lisandro Horacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Peyric, Elías H.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Ponziani, Pablo F.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Ramondino, Romina. Inmunova; ArgentinaFil: Rinaldi, Jimena Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Rodrí­guez, Santiago. mAbxience; ArgentinaFil: Russo, Javier E.. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Russo, Mara Laura. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Saavedra, Soledad Lorena. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Seigelchifer, Mauricio. mAbxience; ArgentinaFil: Sosa, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Vilariño, Claudio. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingeniería de Proteínas; ArgentinaFil: López Biscayart, Patricia. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; ArgentinaFil: Corley, Esteban. mAbxience; ArgentinaFil: Spatz, Linus. Inmunova; ArgentinaFil: Baumeister, Elsa. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Goldbaum, Fernando Alberto. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingeniería de Proteínas; Argentina. Inmunova; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

Molecular Determinants of Arenavirus Z Protein Homo-Oligomerization and L Polymerase Binding▿

The arenavirus Z is a zinc-binding RING protein that has been implicated in multiple functions during the viral life cycle. These roles of Z involve interactions with viral and cellular proteins that remain incompletely understood. In this regard, Z inhibits viral RNA transcription and replication through direct interaction with the viral L polymerase. Here, we defined the L-binding domain of Tacaribe virus (TCRV) Z protein and the structural requirements mediating Z homo-oligomerization. By using site-directed mutagenesis, coimmunoprecipitation, and functional assays, we showed that residues R37, N39, W44, L50, and Y57, located around the zinc coordination site I, play a critical role in the Z-L interaction. We also found that Z protein from either TCRV or the pathogenic Junin virus (JUNV) self-associates into oligomeric forms in mammalian cells. Importantly, mutation of the myristoylation site, the strictly conserved residue G at position 2, severely impaired the ability of both TCRV Z and JUNV Z to self-interact as well as their capacity to accumulate at the plasma membrane, strongly suggesting that Z homo-oligomerization is associated with its myristoylation and cell membrane targeting. In contrast, disruption of the RING structure or substitution of W44 or N39, which are critical for L protein recognition, did not affect Z self-binding. Overall, the data presented here indicate that homo-oligomerization is not a requirement for Z-L interaction or Z-mediated polymerase activity inhibition

Desarrollo de un suero equino hiperinmune para el tratamiento de COVID-19 en Argentina

Fil: Pontoriero, A. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Baumeister, Elsa. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Campos, Ana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Avaro, Martín. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Benedetti, Estefanía. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Dattero, María. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; ArgentinaFil: Zylberman, Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Buenos Aires, Argentina.Fil: Sanguineti, Santiago. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Higa, Sandra V. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Cerutti, María L. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingenieria de Proteínas (CRIP); Buenos Aires, Argentina.Fil: Morrone Seijo, Susana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Buenos Aires, Argentina.Fil: Pardo, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Buenos Aires, Argentina.Fil: Muñoz, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Buenos Aires, Argentina.Fil: Acuña Intrieri, María E. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingenieria de Proteínas (CRIP); Buenos Aires, Argentina.Fil: Alzogaray, Vanina A. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Berguer, Paula M. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Bocanera, Laura. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Bukata, Lucas. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Bustelo, Marina S. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Colonna, Mariana. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Correa, Elisa. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Cragnaz, Lucía. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Dellafiore, María. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Foscaldi, Sabrina. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: González, Joaquín V. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Guerra, Luciano L. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Klinke, Sebastián. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Labanda, María S. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Lauché, Constanza. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: López, Juan C. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Martínez, Anabela M. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Otero, Lisandro H. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Peyric, Elías H. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Ponziani, Pablo F. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Ramondino, Romina. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Rinaldi, Jimena. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Rodríguez, Santiago. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Russo, Javier E. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Russo, Mara L. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virología. Servicio de Virosis Respiratorias. Centro Nacional de Influenza PAHO/WHO; Argentina.Fil: Saavedra, Soledad L. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Seigelchifer, Mauricio. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Sosa, Santiago. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.Fil: Vilariño, Claudio. Universidad Nacional de San Martín. Centro de Rediseño e Ingenieria de Proteínas (CRIP); Buenos Aires, Argentina.Fil: López Biscayart, Patricia. Instituto Biológico Argentino S.A.I.C.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Corley, Esteban. mAbxience; Buenos Aires, Argentina.Fil: Spatz, Linus. INMUNOVA S.A.; Buenos Aires, Argentina.Fil: Goldbaum, Fernando A. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires (IIBA). Fundación Instituto Leloir. Laboratorio de Inmunología y Microbiología Molecular; Buenos Aires, Argentina.The disease named COVID-19, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is currently generating a global pandemic. Vaccine development is no doubt the best long-term immunological approach, but in the current epidemiologic and health emergency there is a need for rapid and effective solutions. Convalescent plasma is the only antibody-based therapy available for COVID-19 patients to date. Equine polyclonal antibodies (EpAbs) put forward a sound alternative. The new generation of processed and purified EpAbs containing highly purified F(ab')2 fragments demonstrated to be safe and well tolerated. EpAbs are easy to manufacture allowing a fast development and scaling up for a treatment. Based on these ideas, we present a new therapeutic product obtained after immunization of horses with the receptor-binding domain of the viral Spike glycoprotein. Our product shows around 50 times more potency in in vitro seroneutralization assays than the average of convalescent plasma. This result may allow us to test the safety and efficacy of this product in a phase 2/3 clinical trial to be conducted in July 2020 in the metropolitan area of Buenos Aires, Argentina