Disruption of SF3B1 results in deregulated expression and splicing of key genes and pathways in myelodysplastic syndrome hematopoietic stem and progenitor cells

The splicing factor SF3B1 is the most commonly mutated gene in the myelodysplastic syndrome (MDS), particularly in patients with refractory anemia with ring sideroblasts (RARS). We investigated the functional effects of SF3B1 disruption in myeloid cell lines: SF3B1 knockdown resulted in growth inhibition, cell cycle arrest and impaired erythroid differentiation and deregulation of many genes and pathways, including cell cycle regulation and RNA processing. MDS is a disorder of the hematopoietic stem cell and we thus studied the transcriptome of CD34(+) cells from MDS patients with SF3B1 mutations using RNA sequencing. Genes significantly differentially expressed at the transcript and/or exon level in SF3B1 mutant compared with wild-type cases include genes that are involved in MDS pathogenesis (ASXL1 and CBL), iron homeostasis and mitochondrial metabolism (ALAS2, ABCB7 and SLC25A37) and RNA splicing/processing (PRPF8 and HNRNPD). Many genes regulated by a DNA damage-induced BRCA1-BCLAF1-SF3B1 protein complex showed differential expression/splicing in SF3B1 mutant cases. This is the first study to determine the target genes of SF3B1 mutation in MDS CD34(+) cells. Our data indicate that SF3B1 has a critical role in MDS by affecting the expression and splicing of genes involved in specific cellular processes/pathways, many of which are relevant to the known RARS pathophysiology, suggesting a causal link

Workshop Tunisie

Mahdia, ville millénaire tunisienne à l’âme marine, s’interroge sur le devenir de sa pierre. Son développement urbain côtoie aujourd’hui un nouvel horizon : la ligne de crête d’un ancien cordon littoral où se situent ses carrières. Exploitées, appropriées comme jardin nourricier et également délaissées, celles-ci s’intègrent au devenir de la ville. À peine visible de l’espace urbain, ces carrières ne sont pas des lieux communs. Elles font partie de son histoire. Le défi actuel est qu’elles contribuent aux desseins de cette ville, à son renouveau. Fruit d’une expérience internationale originale qui réunit étudiants, professeurs et experts en architecture de paysage, en architecture, en urbanisme et en études touristiques, ce livre raconte le travail d’expérimentation sur la réhabilitation paysagère des carrières de Mahdia. Misant sur l’apport créatif d’un arrimage culturel entre le Maghreb, le Moyen-Orient, l’Europe et l’Amérique du Nord, le workshop ravive les natures bien singulières des carrières et de leurs contextes. Et surtout, il expose un ensemble d’intentions en vue de leur mise en valeur et de leur développement. Véritable legs pour les citoyens de cette ville méditerranéenne, l’invention paysagère des carrières de Mahdia livre des solutions d’aménagement inédites en quête d’un lendemain