First steps towards a rational use of african rice, Oryza glaberrima, in rice breeding through a "contig line" concept

Autrefois, l'utilisation du riz cultivé africain, #O. glaberrima pour l'amélioration d'#O. sativa était gêné par la très forte stérélité chez les hybrides interspécifiques F1 et les premières générations. Le développement récent des marqueurs moléculaires cartographiés donne l'opportunité de rationaliser et de piloter les introgressions entre les deux espèces de riz cultivé. Le développement de lignées introgressées à partir d'hybridation interspécifique et de recroisement représente un potentiel élevé pour créer une nouvelle variabilité génétique et des transgressions. Nous avons commencé un programme original de recroisement assisté par marqueurs avec l'objectif de produire un jeu de 100 lignées "contig" chacune portant un fragment chromosomique d'#O. glaberrima d'environ 20cM dans le fong génétique d'#O. sativa. Dans une première étape, nous développons actuellement une carte de liaison génétique basée sur des marqueurs STS et RAPD en utilisant un recroisement entre # sativa et #O. glaberrima. Les plantes BC1 seront sélectionnées pour accélérer la production de lignées "contig" présentant uniquement le fragment cible. Il est escompté que le polymorphisme interspécifique sera suffisamment large pour rendre possible cette méthodologie. De nombreux avantages sont attendus dans cette approche tel que : i) la caractérisation systématique des ressources génétiques utiles apportées par #O. glaberrima , ii) la simplification et l'amélioration de la détection des QTL et iii) l'analyse comparée de l'organisation génomique d'#O. glaberrima vis à vis d'#O. sativa$. Le travail en cours sur l'évaluation du polymorphisme entre les parents pour les STS et les RAPDSs et le développement de la population BC1 est présenté. (Résumé d'auteur