The transcribed pseudogene RPSAP52 enhances the oncofetal HMGA2-IGF2BP2-RAS axis through LIN28B-dependent and independent let-7 inhibition

Altres ajuts: We thank CERCA Program/Generalitat de Catalunya for their institutional support. This work was also supported by the Fundació La Marató de TV3, grant number #20131610 (S.G.), the AECC-Junta de Barcelona (S.G.), the Fundación Científica de la AECC under grant GCB13131578DEÁ (O.M.T.), the Health and Science Departments of the Catalan Government (Gen-eralitat de Catalunya). C.O.-M. is a pre-doctoral fellow funded by the Basque Government (PRE_2013_1_1009).One largely unknown question in cell biology is the discrimination between inconsequential and functional transcriptional events with relevant regulatory functions. Here, we find that the oncofetal HMGA2 gene is aberrantly reexpressed in many tumor types together with its antisense transcribed pseudogene RPSAP52. RPSAP52 is abundantly present in the cytoplasm, where it interacts with the RNA binding protein IGF2BP2/IMP2, facilitating its binding to mRNA targets, promoting their translation by mediating their recruitment on polysomes and enhancing proliferative and self-renewal pathways. Notably, downregulation of RPSAP52 impairs the balance between the oncogene LIN28B and the tumor suppressor let-7 family of miRNAs, inhibits cellular proliferation and migration in vitro and slows down tumor growth in vivo. In addition, high levels of RPSAP52 in patient samples associate with a worse prognosis in sarcomas. Overall, we reveal the roles of a transcribed pseudogene that may display properties of an oncofetal master regulator in human cancers

The transcribed ultraconserved region uc.160+ enhances processing and A-to-I editing of the miR-376 cluster : hypermethylation improves glioma prognosis

Altres ajuts:We thank the CERCA program (Generalitat de Catalunya) and the Josep Carreras Foundation for institutional support. This work was supported by the Ministerio de Ciencia e Innovación (MCI)-Agencia Estatal de Investigación (AEI) and the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), cofinanced by the European Development Regional Fund, 'A way to achieve Europe' ERDF, under grant numbers PID2019-111658RB-I00 (SG), RTI2018-094049-B-I00 'EPIRNA' (ME), and the Health and Science Departments of the Catalan Government (Generalitat de Catalunya).Transcribed ultraconserved regions (T-UCRs) are noncoding RNAs derived from DNA sequences that are entirely conserved across species. Their expression is altered in many tumor types, and, although a role for T-UCRs as regulators of gene expression has been proposed, their functions remain largely unknown. Herein, we describe the epigenetic silencing of the uc.160+ T-UCR in gliomas and mechanistically define a novel RNA-RNA regulatory network in which uc.160+ modulates the biogenesis of several members of the miR-376 cluster. This includes the positive regulation of primary microRNA (pri-miRNA) cleavage and an enhanced A-to-I editing on its mature sequence. As a consequence, the expression of uc.160+ affects the downstream, miR-376-regulated genes, including the transcriptional coregulators RING1 and YY1-binding protein (RYBP) and forkhead box P2 (FOXP2). Finally, we elucidate the clinical impact of our findings, showing that hypermethylation of the uc.160+ CpG island is an independent prognostic factor associated with better overall survival in lower-grade gliomas, highlighting the importance of T-UCRs in cancer pathophysiology

Primer congreso científico UNACHI 2015.

La Universidad Autónoma de Chiriquí (UNACHI), a través de la Vicerrectoría de Investigación y Postgrado (VIP), en cumplimiento de su misión, visión y objetivos estratégicos, realiza el Primer Congreso Científico del 5 al 9 de octubre de 2015, con el lema: “Impulsando la cultura, la ciencia y la humanidad”. En atención al Plan Estratégico del Gobierno de la República de Panamá 2015-2019; al Plan Estratégico Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (PENCYT) 2015-2019 de la Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (SENACYT); al Plan Estratégico Institucional 2013-2018 de la Universidad Autónoma de Chiriquí y a las Políticas de Investigación e Innovación de la Universidad, se presenta a la consideración de la comunidad científica universitaria y a la sociedad panameña, los resultados de las investigaciones correspondientes al período académico 2014-2015. Las investigaciones que hoy se presentan, corresponden a trabajos realizados por investigadores procedentes de nuestra institución, de universidades y centros de investigación del país y de investigadores procedentes de países hermanos, quienes comparten con nosotros los productos de sus muchas horas de trabajo realizadas en sus laboratorios, redes temáticas y giras de campo. El Congreso tiene sus antecedentes en los seis encuentros científicos realizados, anualmente en la universidad, desde el año 2009 hasta el año 2014. No obstante, dado el impulso y decidido respaldo de la Magnífica Rectora, Etelvina Medianero de Bonagas, al eje de investigación e innovación y al trabajo realizado por nuestros investigadores, se presentó ante el Consejo Académico N° 11-2015, del 16 de junio de 2015, la propuesta para elevar los encuentros a congreso científico, y que fue aprobada por unanimidad. Se convierte este evento académico, en un reto para la institución y a la vez en una gran oportunidad para el fortalecimiento de la investigación e innovación, al servicio de la sociedad y de los grandes temas de interés nacional. Con mucho agrado se puede señalar que en el Congreso se exponen conferencias magistrales, conferencias cortas, ponencias, mesas redondas, videoconferencias y dos exposiciones fotográficas tituladas: “Nuestros ríos, nuestro futuro” y “La luz en las ciencias”. Por segundo año consecutivo se realiza el reconocimiento al investigador del año; en esta oportunidad se honrará al connotado ambientalista Demetrio Miranda Miranda. Se presentan investigadores nacionales de la Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación; de la Universidad Tecnológica de Panamá; del Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología; de la Universidad de Panamá; del Ministerio de Salud y de la Universidad Autónoma de Chiriquí. También se cuenta con investigadores internacionales procedentes de Estados Unidos, Honduras, Costa Rica y de República Dominicana. Los registros de los participantes, en la página web de la universidad, nos indican que durante el congreso se tendrá la participación de investigadores procedentes de las áreas de las ciencias económicas administrativas, de las ciencias de la salud, de las ciencias sociales y humanidades y de las ciencias naturales y exactas, estos últimos en un mayor porcentaje. Atendiendo a sus políticas institucionales, la UNACHI está cimentando las bases de un sistema de investigación e innovación, a través de acciones muy puntuales, las cuales aspiran a convertir a la Institución, en un centro de educación superior de excelencia y a disponer de un conjunto de investigadores de alto nivel. Con este propósito, se ha aprobado en el Consejo Académico, el Reglamento de Investigación e Innovación, donde se establece por primera vez, la figura del investigador a tiempo completo, a fin de impulsar la investigación en todas las áreas del conocimiento humano; se ha firmado un convenio con SENACYT para la reinserción de talentos en el nivel doctoral, a partir del año 2015, con miras a fortalecer la investigación científica y se han incrementado, significativamente, los fondos destinados a los subsidios de las investigaciones de las tesis de licenciatura, de las tesis de maestrías, de las tesis de doctorados y de los docentes investigadores, con proyectos que se encuentran en este momento en revisión por los evaluadores externos