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MULTIPLEX SYBR® GREEN-REAL TIME PCR (qPCR) ASSAY FOR THE DETECTION AND DIFFERENTIATION OF Bartonella henselae AND Bartonella clarridgeiae IN CATS
A novel SYBR® green-real time polymerase chain reaction (qPCR) was developed to detect two Bartonella species, B. henselae and B. clarridgeiae, directly from blood samples. The test was used in blood samples obtained from cats living in animal shelters in Southern Brazil. Results were compared with those obtained by conventional PCR targeting Bartonella spp. Among the 47 samples analyzed, eight were positive using the conventional PCR and 12 were positive using qPCR. Importantly, the new qPCR detected the presence of both B. henselae and B. clarridgeiae in two samples. The results show that the qPCR described here may be a reliable tool for the screening and differentiation of two important Bartonella species.Um novo teste baseado na reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) com SYBR ® Green foi desenvolvido para detectar duas espécies de Bartonella, B. henselae e B. clarridgeiae, diretamente em amostras de sangue. Este teste foi utilizado em amostras de sangue obtidas de gatos que vivem em abrigos de animais do sul do Brasil. Os resultados foram comparados aos obtidos pelo PCR convencional utilizado para a detecção de Bartonella spp. Das 47 amostras analisadas, oito foram positivas no PCR convencional e 12 foram positivas para qPCR. A reação de qPCR, permitiu a detecção da presença simultânea de B. henselae e B. clarridgeiae em duas destas amostras. Os resultados mostram que a qPCR aqui descrita pode ser uma ferramenta confiável para a detecção e diferenciação de duas espécies importantes de Bartonella spp
Low occurrence of Hepatitis A virus in water samples from an urban area of Southern Brazil
Hepatitis A virus (HAV), a member of Picornaviridae family, is the main causative agent of acute viral hepatitis in the world, mainly in developing countries. HAV may be present in contaminated water and food and its presence is often associated to a lesser extent with socioeconomic factors and environmental quality. The main goals in the present study were to standardize a cell culture combined to a polymerase chain reaction protocol for the detection and quantification of viral viability and analyze whether the virus could be found in water samples collected in four urban streams of Sinos River watershed. Virus recovery was assayed from known virus concentrations measured in experimentally contaminated raw and ultrapure water (MilliQ®). Recovery rates ranged from 270% in raw water to 15,000% in ultrapure water. In a second step, a qPCR coupled to a previous passage in cells, demonstrated more analytical sensitivity when compared to samples assayed without a previous passage in cell cultures. HAV genome was detected in only 1 of 84 samples analyzed, pointing to a very low occurrence of HAV in water samples in the studied region. These findings are remarkable, since no more than 5% of the domestic sewage in this area is treated pointing to a low occurrence of HAV in the population living nearby during the study period
Degradação e inativação de adenovírus na água por fotoeletrooxidação
The present study analyzed the efficiency of the photo-electro-oxidation process as a method for degradation and inactivation of adenovirus in water. The experimental design employed a solution prepared from sterile water containing 5.107 genomic copies/L (gc/L) of a standard strain of human adenovirus type 5 (HAdV-5) divided into two equal parts, one to serve as control and one treated by photo-electro-oxidation (PEO) for 3 hours and with a 5A current. Samples collected throughout the exposure process were analyzed by real-time polymerase chain reaction (qPCR) for viral genome identification and quantitation. Prior to gene extraction, a parallel DNAse treatment step was carried out to assess the integrity of viral particles. Integrated cell culture (ICC) analyses assessed the viability of infection in a cell culture. The tested process proved effective for viral degradation, with a 7 log10 reduction in viral load after 60 minutes of treatment. The DNAse-treated samples exhibited complete reduction of viral load after a 75 minute exposure to the process, and ICC analyses showed completely non-viable viral particles at 30 minutes of treatment.O presente estudo analisou a eficiência do processo de fotoeletrooxidação como metodologia para a degradação e inativação de adenovírus em água. A concepção experimental emprega uma solução preparada a partir de água estéril contendo 5,107 cópias genômicas/L (gc/L) de uma amostra padrão de adenovírus humano tipo 5 (HAdV-5), dividida em duas partes iguais, uma para servir como controle e outra tratada por fotoeletrooxidação (PEO) durante 3 horas e com uma corrente de 5A. As amostras recolhidas durante o processo de exposição foram analisadas por PCR quantitativo em tempo real (qPCR) para identificação e quantificação do genoma viral. Antes da extração de ácidos nucleicos, um passo de tratamento com DNAse paralelo foi realizado para avaliar a integridade das partículas virais. Um ensaio de qPCR integrado à cultura de células (ICC-qPCR) permitiu analisar a viabilidade de infecção em uma cultura de células. O processo mostrou-se eficaz testada para a degradação viral, com uma redução de 7 log10 da carga viral após 60 minutos de tratamento. As amostras tratadas com DNAse exibiram redução completa da carga viral após uma exposição de 75 minutos ao processo, e a análise de ICC-qPCR mostrou partículas virais completamente não-viáveis em 30 minutos de tratamento
VIROSES ENTÉRICAS: PRINCIPAIS PATOLOGIAS DE VEICULAÇÃO HÍDRICA E SUAS MANIFESTAÇÕES CLÍNICAS
Vírus entéricos podem causar diversas infecções que acometem os seres humanos e são disseminados pelos meios hídricos, sendo o esgoto doméstico um dos principais contaminantes. A relação ambiente-saúde é de extrema importância uma vez que tais microrganismos podem permanecer viáveis no ambiente e serem disseminados em meio hídrico devido à falta de saneamento básico. O objetivo deste artigo foi abordar temas relacionados aos vírus entéricos, tais como Enterovírus (EV), Rotavírus (RV), Astrovírus (AstV), Mastadenovirus (AdVH) e Norovírus (NoV), elencando as principais doenças que acometem ao homem, transmitidas através da água sem tratamento adequado. Este estudo é um artigo de revisão que utilizou plataformas como Scielo, Pubmed, Medline e Science Direct para pesquisas de diversos trabalhos relacionados. É imprescindível o conhecimento científico sobre a relação hídrica/ambiente com a saúde humana, uma vez que os vírus são responsáveis por diversas enfermidades e atingem a população a qual carece de uma melhor qualidade hídrica.Palavras-chave: Gastroenterites. Vírus Entéricos. Água.ABSTRACTEnteric viruses can cause various infections affecting humans and are spread by water, being the domestic sewage a major contaminants. The environment-health relationship is of extreme importance since such micro-organisms can remain viable in the environment and be disseminated in water because of lack of basic sanitation. The objective of this article was to address issues related to enteric viruses, such asEnterovirus (EV), Rotavirus (RV), Astrovirus (AstV), Mastadenovirus (AdVH) e Norovirus (NoV), by listing their major diseases that affect humans, transmitted through water without adequate treatment. This study is a review article that used platforms such as Scielo, Pubmed, Medline and Science Direct for research on several related works. Scientific knowledge about the relationship between water and the environment with human health is essential, since viruses are responsible for several diseases and reach the population which lacks a better water quality.Keywords: Gastroenteritis. Enteric Viruses. Water
PETRÓLEO E GÁS NATURAL – FONTE DE ENERGIA E RENDA, PROCESSOS LICITATÓRIOS DA ÉTICA A PRÁTICA
Petróleo e gás natural são hidrocarbonetos provenientes das camadas profundas da Terra que representaram uma grande mudança para a indústria petrolífera nacional desde 1995. Através das descobertas ocorridas o homem tem alcançado de maneira surpreendente sua satisfação e sobrevivência. Seguindo políticas transformadoras de um novo mundo as indústrias energéticas tomaram novos caminhos. Portanto fez-se necessário um planejamento político para orientar o Estado e definir investimentos para o mercado. Leis foram criadas para regulamentar as licitações e contratações, delimitando critérios de exploração e pesquisa. Tais debates conduzirão a aprovação da Lei nº 9.478/97 que aborda a licitação da exploração e produção de gás natural e petróleo dos blocos controlados pela ANP (Agência Nacional de Petróleo). Os hidrocarbonetos fascinam pesquisadores e deixa muitas duvidas que cercam o imaginário humano. A metodologia constitui-se em uma pesquisa de revisão bibliográfica. Os resultados indicam um alto nível de preocupação por parte dos autores no que se refere à ética, manuseio e extração, entre outras problemáticas ambientais. Nota-se ainda uma ênfase dos autores, sobre os direitos dos proprietários das terras. Os hidrocarbonetos são uma conquista da humanidade, mas que devem ser tratados cautelosamente, verificando-se sempre, direitos e deveres de ambas as partes
AVALIAÇÃO DA ÁGUA ATRAVÉS DE PARÂMETROS MICROBIOLÓGICOS E FÍSICO-QUÍMICOS EM ÁREAS POPULACIONAIS DO ARROIO LUIZ RAU, AFLUENTE DO RIO DOS SINOS, MUNICÍPIO DE NOVO HAMBURGO, RS.
O Arroio Luiz Rau é um dos principais arroios do município de Novo Hamburgo, Rio Grande do Sul (RS) com sua foz no trecho inferior da Bacia Hidrográfica do Rio dos Sinos. O aumento populacional nos grandes centros urbanos gera problemas sanitários devido à falta de saneamento, afetando o ecossistema hídrico. A fim de analisar os poluentes fecais e físico-químicos do presente arroio, afluente do Rio dos Sinos, foi avaliada a qualidade da água do córrego através da pesquisa de adenovírus humano gastroentérico (HAdV-F), adenovírus respiratório (HAdV-C), adenovírus animal, parâmetros microbiológicos e físico-químicos, bem como avaliação da cafeína, marcador de contaminação antrópica. Dois pontos demarcados por concentração populacional no município de Novo Hamburgo foram alvos do presente estudo, contribuindo na caracterização do impacto antrópico e ambiental até o Rio dos Sinos. Índices de contaminação foram observados nos dois pontos analisados, sendo o ponto 2 com os maiores índices de contaminação fecal e ambiental, acompanhado de análises físico-químicas. A análise de cafeína revelou que este é um bom marcador de contaminação antrópica, entretanto apontou índices maiores no Ponto 1. O Arroio Luiz Rau revelou uma forte contaminação de origem antrópica, colaborando na disseminação de microrganismos, os quais afetam a qualidade das águas do Rio dos Sinos, utilizado para abastecimento público na região.
Palavras-chave: Qualidade da água. Esgotamento Sanitário. Monitoramento ambiental. Microrganismos. Saúde Pública.
ABSTRACT
Luiz Rau stream is one of the main streams of the municipality of Novo Hamburgo, Rio Grande do Sul (RS) with its mouth in the lower stretch of the Rio dos Sinos Watershed. The increase in population in large urban centers causes sanitary problems due to lack of sanitation, affecting the water ecosystem. In order to analyze fecal and physicochemical pollutants of the present stream, affluent of the Rio dos Sinos, the water quality of the stream was evaluated through the research of gastroenterical human adenovirus (HAdV-F), respiratory adenovirus (HAdV-C), animal adenovirus, microbiological and physicochemical parameters, as well as evaluation of caffeine, a marker of anthropogenic contamination. Two points demarcated by population concentration in the municipality of Novo Hamburgo were the targets of the present study, contributing to the characterization of the anthropic and environmental impact up to the Rio dos Sinos. Contamination indices were observed in the two analyzed points, being the point 2 with the highest indexes of fecal and environmental contamination, accompanied by physicochemical analyzes. The analysis of caffeine revealed that this is a good marker of anthropic contamination, however it indicated higher indexes in Point 1. Luiz Rau stream revealed a strong contamination of anthropic origin, collaborating in the dissemination of microorganisms, which affect the water quality of the Rio dos Sinos, used for public supply in the region.
Keywords: Water Quality. Sewage System. Environmental monitoring. Microorganisms. Public Health
CLONAGEM E USO DE CÉLULAS – TRONCO EM SERES HUMANOS: APLICAÇÕES CIENTÍFICAS E IMPLICAÇÕES ÉTICAS
Clones são células ou organismos originados de uma única célula, são idênticos à original. Através do primeiro clone em 1997, a ovelha Dolly, muito se tem falado sobre clonagem humana com fins reprodutivos e terapêuticos. A clonagem reprodutiva tem como objetivo a geração de um individuo completo a partir de uma célula somática. Já a clonagem terapêutica, visa à melhoria da qualidade de vida do ser humano. Existem muitas duvidas e questões éticas em relação aos procedimentos de clonagem e uso de células-tronco. A metodologia, uma pesquisa de campo com coleta de dados através de um questionário com perguntas abertas e fechadas. A população, Universitários da URI – Santo Ângelo teve como amostra 35 alunos dos cursos: Ciências Biológicas, Direito, Enfermagem e Psicologia. A escolha dos cursos foi motivada pelas relações que estabelecem com a legislação, saúde e outros aspectos humanos. Os resultados indicam certo conhecimento da população entrevistada sobre clonagem e células-tronco. Ficou evidente, em relação à posição ética, que a população entrevistada preocupa-se quanto aos meios e formas que serão empregadas as técnicas. Há ênfase dos universitários para que a prática deva ser tratada com cautela, verificando-se sempre a moral e a ética
PETRÓLEO E GÁS NATURAL – FONTE DE ENERGIA E RENDA, PROCESSOS LICITATÓRIOS DA ÉTICA A PRÁTICA
Petróleo e gás natural são hidrocarbonetos provenientes das camadas profundas da Terra que representaram uma grande mudança para a indústria petrolífera nacional desde 1995. Através das descobertas ocorridas o homem tem alcançado de maneira surpreendente sua satisfação e sobrevivência. Seguindo políticas transformadoras de um novo mundo as indústrias energéticas tomaram novos caminhos. Portanto fez-se necessário um planejamento político para orientar o Estado e definir investimentos para o mercado. Leis foram criadas para regulamentar as licitações e contratações, delimitando critérios de exploração e pesquisa. Tais debates conduzirão a aprovação da Lei nº 9.478/97 que aborda a licitação da exploração e produção de gás natural e petróleo dos blocos controlados pela ANP (Agência Nacional de Petróleo). Os hidrocarbonetos fascinam pesquisadores e deixa muitas duvidas que cercam o imaginário humano. A metodologia constitui-se em uma pesquisa de revisão bibliográfica. Os resultados indicam um alto nível de preocupação por parte dos autores no que se refere à ética, manuseio e extração, entre outras problemáticas ambientais. Nota-se ainda uma ênfase dos autores, sobre os direitos dos proprietários das terras. Os hidrocarbonetos são uma conquista da humanidade, mas que devem ser tratados cautelosamente, verificando-se sempre, direitos e deveres de ambas as partes
AVALIAÇÃO DA ÁGUA ATRAVÉS DE PARÂMETROS MICROBIOLÓGICOS E FÍSICO-QUÍMICOS EM ÁREAS POPULACIONAIS DO ARROIO LUIZ RAU, AFLUENTE DO RIO DOS SINOS, MUNICÍPIO DE NOVO HAMBURGO, RS.
O Arroio Luiz Rau é um dos principais arroios do município de Novo Hamburgo, Rio Grande do Sul (RS) com sua foz no trecho inferior da Bacia Hidrográfica do Rio dos Sinos. O aumento populacional nos grandes centros urbanos gera problemas sanitários devido à falta de saneamento, afetando o ecossistema hídrico. A fim de analisar os poluentes fecais e físico-químicos do presente arroio, afluente do Rio dos Sinos, foi avaliada a qualidade da água do córrego através da pesquisa de adenovírus humano gastroentérico (HAdV-F), adenovírus respiratório (HAdV-C), adenovírus animal, parâmetros microbiológicos e físico-químicos, bem como avaliação da cafeína, marcador de contaminação antrópica. Dois pontos demarcados por concentração populacional no município de Novo Hamburgo foram alvos do presente estudo, contribuindo na caracterização do impacto antrópico e ambiental até o Rio dos Sinos. Índices de contaminação foram observados nos dois pontos analisados, sendo o ponto 2 com os maiores índices de contaminação fecal e ambiental, acompanhado de análises físico-químicas. A análise de cafeína revelou que este é um bom marcador de contaminação antrópica, entretanto apontou índices maiores no Ponto 1. O Arroio Luiz Rau revelou uma forte contaminação de origem antrópica, colaborando na disseminação de microrganismos, os quais afetam a qualidade das águas do Rio dos Sinos, utilizado para abastecimento público na região.Palavras-chave: Qualidade da água. Esgotamento Sanitário. Monitoramento ambiental. Microrganismos. Saúde Pública. ABSTRACT Luiz Rau stream is one of the main streams of the municipality of Novo Hamburgo, Rio Grande do Sul (RS) with its mouth in the lower stretch of the Rio dos Sinos Watershed. The increase in population in large urban centers causes sanitary problems due to lack of sanitation, affecting the water ecosystem. In order to analyze fecal and physicochemical pollutants of the present stream, affluent of the Rio dos Sinos, the water quality of the stream was evaluated through the research of gastroenterical human adenovirus (HAdV-F), respiratory adenovirus (HAdV-C), animal adenovirus, microbiological and physicochemical parameters, as well as evaluation of caffeine, a marker of anthropogenic contamination. Two points demarcated by population concentration in the municipality of Novo Hamburgo were the targets of the present study, contributing to the characterization of the anthropic and environmental impact up to the Rio dos Sinos. Contamination indices were observed in the two analyzed points, being the point 2 with the highest indexes of fecal and environmental contamination, accompanied by physicochemical analyzes. The analysis of caffeine revealed that this is a good marker of anthropic contamination, however it indicated higher indexes in Point 1. Luiz Rau stream revealed a strong contamination of anthropic origin, collaborating in the dissemination of microorganisms, which affect the water quality of the Rio dos Sinos, used for public supply in the region.Keywords: Water Quality. Sewage System. Environmental monitoring. Microorganisms. Public Health
CLONAGEM E USO DE CÉLULAS – TRONCO EM SERES HUMANOS: APLICAÇÕES CIENTÍFICAS E IMPLICAÇÕES ÉTICAS
Clones são células ou organismos originados de uma única célula, são idênticos à original. Através do primeiro clone em 1997, a ovelha Dolly, muito se tem falado sobre clonagem humana com fins reprodutivos e terapêuticos. A clonagem reprodutiva tem como objetivo a geração de um individuo completo a partir de uma célula somática. Já a clonagem terapêutica, visa à melhoria da qualidade de vida do ser humano. Existem muitas duvidas e questões éticas em relação aos procedimentos de clonagem e uso de células-tronco. A metodologia, uma pesquisa de campo com coleta de dados através de um questionário com perguntas abertas e fechadas. A população, Universitários da URI – Santo Ângelo teve como amostra 35 alunos dos cursos: Ciências Biológicas, Direito, Enfermagem e Psicologia. A escolha dos cursos foi motivada pelas relações que estabelecem com a legislação, saúde e outros aspectos humanos. Os resultados indicam certo conhecimento da população entrevistada sobre clonagem e células-tronco. Ficou evidente, em relação à posição ética, que a população entrevistada preocupa-se quanto aos meios e formas que serão empregadas as técnicas. Há ênfase dos universitários para que a prática deva ser tratada com cautela, verificando-se sempre a moral e a ética.