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Die Überwachung des Hepatitis-E-Virus in Abwässern kann klinisch relevante Varianten identifizieren
Das Hepatitis-E-Virus (HEV) ist weltweit verbreitet und kann zu persistierenden Infektionen mit schweren Krankheitsverläufen führen. Antivirale Behandlungsansätze können zudem zum Auftreten von Virusvarianten führen, von denen einzelne die virale Clearance behindern. In dieser Studie wurde die HEV-Prävalenz und die Vielfalt der zirkulierenden Varianten in Umweltproben (Abwasser und Flusswasser) aus Nordrhein-Westfalen Westfalen untersucht. HEV-RNA konnte mittels qRT-PCR bei 73 % der Proben nachgewiesen werden. Mittels Hochdurchsatz-Sequenzierung konnte die genetische Vielfalt ausgewählter Proben bewertet und das Vorkommen von klinisch relevanten Varianten, die mit Arzneimittelresistenz assoziiert sind, analysiert werden. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass die Überwachung von Umweltprobenproben wertvolle Erkenntnisse zur Abschätzung der HEV-Prävalenz liefert und zur Identifizierung von zirkulierenden therapierelevanten Varianten genutzt werden kann
Monitoring of hepatitis E virus in wastewater can identify clinically relevant variants
Hepatitis E virus (HEV) is prevalent worldwide and can cause persistent infection with severe morbidity. Antiviral treatment approaches can lead to the emergence of viral variants encoding escape mutations that may impede viral clearance. The frequency of these variants remains unknown in the human population as well as environment due to limited comprehensive data on HEV diversity. In this study, we investigated the HEV prevalence and diversity of circulating variants in environmental samples, that is, wastewater and rivers from North-Rhine Westphalia, Germany. HEV prevalence could be determined with 73% of samples tested positive for viral RNA via qRT-PCR. Using high-throughput sequencing, we were able to assess the overall genetic diversity in these samples and identified the presence of clinically relevant variants associated with drug resistance. In summary, monitoring variants from environmental samples could provide valuable insights into estimating HEV prevalence and identifying circulating variants that can impact treatment outcome