Accurate Vertical Excitation Energies of BODIPY/Aza-BODIPY Derivatives from Excited-State Mean-Field Calculations

We report a benchmark study of vertical excitation energies and oscillator strengths for the HOMO -> LUMO transitions of 17 boron-dipyrromethene (BODIPY) structures, showing a large variety of ring sizes and substituents. Results obtained at the time-dependent density functional theory (TDDFT) and at the delta-self-consistent-field (Delta SCF) by using 13 different exchange correlation kernels (within LDA, GGA, hybrid, and range-separated approximations) are benchmarked against the experimental excitation energies when available. It is found that the time-independent Delta SCF DFT method, when used in combination with hybrid PBE0 and B3LYP functionals, largely outperforms TDDFT and can be quite competitive, in terms of accuracy, with computationally more costly wave function based methods such as CC2 and CASPT2

Transcriptome analysis of seed development in apomictic Paspalum notatum

The seed developmental process involves various tissues with several ploidy levels and different genetic origins. Therefore, its characterisation at the transcriptome level is certainly a challenge. The hypothesis of endosperm balance number (EBN) postulates that each species has an effective number that is important for normal endosperm and seed development to occur. Understanding endosperm formation in apomictic plants is crucial for the perspective of transferring apomixis to sexual species of agronomic interest. Since sexual tetraploid Paspalum plants fit the EBN premise, the EBN insensitivity observed in apomictic plants might be a requirement for the spread of pseudogamous apomixis. Crosses using several cytotypes of Paspalum notatum were made in order to induce the development of seeds with different maternal/paternal genomic ratios in the endosperm. A transcriptome characterisation of ovaries 3 h after pollination was performed using cDNA-AFLP methodology. Forty-six of the 100 differentially expressed transcript-derived fragments (DETDFs) were specifically found in crosses in which apomictic plants were used as the female parent and presented a predicted m : p ratio in the endosperm that was different to the 2:1 requirement of the EBN. Moreover, 12 of the DETDFs presented identity with proteins that were differentially expressed in response to changes in the levels of extracellular ATP (eATP) in Arabidopsis cell suspension cultures. eATP is an important molecular switch in plants that tightly controls organellar energy metabolism and activates gene expression controlling specific growth and developmental programmes. The results suggest that eATP-mediated signalling could be involved in the regulation of endosperm development.Fil: Felitti, Silvina Andrea. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnológico Rosario; ArgentinaFil: Acuña, Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Quarin, Camilo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentin

Genetic transfer from several apomictic tetraploid Paspalum species to an elite group of sexual plants

Basic findings from classical genetic studies are available for exploiting apomixis in the breeding of several forage grass genera. Most Paspalum species are multiploid with a sexual diploid cytotype and conspecific apomictic polyploid (mainly tetraploid) cytotypes. Experimental tetraploidized diploids reproduce sexually and, when crossed with natural apomictic tetraploids, yield hybrid populations that segregate for reproductive mode. Genetic studies indicated that apomixis is inherited as a monogenic dominant factor. We recombined 50 selected sexual hybrids obtained from crosses between a tetraploidized sexual genotype of P. plicatulum and 9 natural apomictic tetraploid accessions of 6 species of the Plicatula group. A synthetic sexual tetraploid population (SSTP) of 600 individuals from mixed seed of the 50 intercrossed hybrids was space-planted in the field. Based on evaluations of plant vigor, seed set, ergot tolerance, regrowth after flowering, and cold tolerance, 31 plants were selected. Crosses between most selected plants and two testers, which belonged to P. guenoarum, were performed, and the generated progeny was planted into the field following a randomized block design with 3 replications. The progeny test was evaluated for seed fertility, biomass yield, and cold tolerance. This procedure allowed selection of 10 elite plants from the SSTP. These plants should contain genes recombined from six apomictic species, without the genetic determinants for apomixis. They may be polycrossed to generate an improved sexual population, or crossed with other apomictic genotypes to obtain improved apomictic hybrids.Fil: Novo, Patricia Elda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Acuña, Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Urbani, Mario Hugo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Galdeano, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Quarin, Camilo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

A Core AFLP Map of Aposporic Tetraploid \u3cem\u3ePaspalum Notatum\u3c/em\u3e (Bahiagrass)

Paspalum notatum (Bahiagrass) is a perennial rhizomatous species that reproduces by aposporous apomixis. Tetraploid races (2n=4x=40) are widely distributed from Central to South America and constitute one of the most valuable natural forage grasses for the subtropical areas of Paraguay, southern Brazil and north-eastern Argentina. Apospory in the species is controlled by a single locus, which exhibits a distorted segregation ratio. The objectives of this work were to develop a core genetic linkage map of the species by using AFLP markers and characterize the genomic region related to apospory

Genetic characterization of Paspalum notatum accessions by AFLP markers

Paspalum notatum Flügge is a warm-season forage grass with sexual diploid and apomictic tetraploid races. Genetic improvement was achieved in out-breeding diploids. The acquisition of artificial sexual tetraploids has raised the possibility of performing crosses and plant improvement at the tetraploid level. The objective of our study was to obtain a genetic and cytoembryological characterization of a germplasm collection of P. notatum, including 31 accessions from seven countries of America and 11 experimentally obtained genotypes. Morphology of mature gametophytes was observed to assess the mode of reproduction of the accessions. A total of 1342 AFLP fragments were generated across the 42 genotypes and from two reference taxa: P. urvillei and P. procurrens. AFLP data were converted into a binary matrix and similarity relationships were established. The genetic distance among all the accessions showed a maximum value of 0.36. In addition, eleven AFLP fragments were observed exclusively in apomictic plants, which could be linked to genomic regions implicated in the control of aposporyFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Daurelio, Lucas Damian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Valle, Estela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Quarin, Camilo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Construction of AFLP-based cosegregation groups of tetraploid Plicatula species and identification of markers linked to apomixis

Most species of Plicatula are important native forages. This work aimed to build framework cosegregation groups of the apomictic tetraploid race of Paspalum guenoarum cv. Rojas and localize the locus controlling apomixis in the species. An interspecific population derived from crossing a completely sexual tetraploid plant of P. plicatulum and an apomictic tetraploid individual of P. guenoarum cv. Rojas was used. Both, disomic and tetrasomic inheritance were detected in both parental genotypes. In P. guenoarum, ten cosegregation groups were built, including 50 markers expanding for 583 cM. The estimated genome coverage was 63.95%. The apomixis locus was located in the linkage group M8, together with seven other loci (four paternal and three biparental markers). The group extended for 59 cM. The four paternal markers showed strong linkage to apomixis, and two of them mapped at 4 and 7 cM at both sides of the locus. Five female linkage groups were constructed with markers segregating from P. plicatulum. One of them (F3) being homologous to the male group carrying apomixis. The linkage groups presented here constitute the first genetic frame for species of Plicatula group. Moreover, molecular markers linked to apomixis in P. guenoarum can assist fundamental research and breeding programs.La mayoría de las especies de Plicatula son importantes forrajeras nativas. El objetivo de este trabajo fue construir grupos de cosegregación marco de la raza tetraploide apomíctica de Paspalum guenoarum cv. Rojas y localizar el locus que controla la apomixis en la especie. Se empleó una población interespecífica, derivada del cruzamiento entre una planta tetraploide completamente sexual de P. plicatulum y un individuo tetraploide apomíctico de P. guenoarum cv. Rojas. En ambos parentales se observó tanto herencia disómica como tetrasómica. En P. guenoarum se construyeron diez grupos de cosegregación, incluyendo 50 marcadores distribuidos en 583 cM. La cobertura estimada del genoma fue de 63,95 %. El locus de la apomixis se localizó en el grupo de ligamiento M8, junto a otros siete loci (cuatro marcadores paternos y tres biparentales), distribuidos en 59 cM. Los cuatro marcadores paternos mostraron fuerte ligamiento a la apomixis, y dos de ellos mapearon a 4 y 7 cM a ambos lados del locus. Se construyeron cinco grupos de ligamiento femeninos con marcadores segregantes de P. plicatulum, uno de ellos (F3) homólogo al grupo masculino que porta la apomixis. Los grupos de ligamiento que aquí se presentan constituyen el primer marco genético para especies del grupo Plicatula. Además, los marcadores moleculares ligados a la apomixis en P. guenoarum serán útiles a la investigación básica y a los programas de mejoramiento.Fil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina. Instituto de Biotecnología Misiones; ArgentinaFil: Galdeano, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Quarin, Camilo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Sistemas BIM y grafica digital en la FAU- UNNE: conocimientos previos de los estudiantes de primer año

Dentro del marco de una beca de investigación de pre-grado (Becas EVC – CIN) desarrollado a partir del Proyecto de Investigación PI C006- “Las representaciones gráficas en la formación de alumnos de la carrera de Arquitectura de la FAU- UNNE”, se exponen en este trabajo los resultados preliminares obtenidos en una investigación cuantitativa sobre los conocimientos previos de los estudiantes de primer año en relación a los sistemas BIM (Modelado de Información para la Edificación) a fin de conocer el perfil de los estudiantes en relación al manejo de las nuevas tecnologías BIM, necesarias para la representación del objeto arquitectónico. El objetivo principal del trabajo es producir nuevas estrategias pedagógicas en el proceso de enseñanza-aprendizaje de la representación y proporcionar una fuente de información del perfil del estudiante de primer año en la FAU-UNNE, relacionada a los conocimientos previos necesarios en el manejo del proceso de Modelado de la Información para la Edificación. Las contribuciones aportadas por el trabajo, ayudaron a aclarar el panorama del perfil que presentan los alumnos de primer año de la facultad de Arquitectura y Urbanismo de la UNNE en relación a los cambios indispensables para actualizar el proceso de aprendizaje en diseño arquitectónico.This paper presents the preliminary results obtained in a quantitative research on the prior knowledge of first-year students in relation to BIM systems (Information Modeling for Building) in order to know the profile of students in relation to the management of the new BIM technologies, necessary for the representation of the architectural object. The main objective of the work is to produce new pedagogical strategies in the teaching-learning process of the representation and to provide a source of information of the profile of the first-year student in the FAU-UNNE, related to the previous knowledge necessary in the handling of the process of Modeling Information for the Building.Facultad de Arquitectura y Urbanism

A Comprehensive Analysis of Gene Expression and Genomic Alterations in a Newly Formed Autotetraploid of \u3cem\u3ePaspalum Notatum\u3c/em\u3e

The proportion of angiosperms that have experienced one or more episodes of chromosome doubling is estimated to be of the order of 50-70%. This prominence of polyploidy probably implies some adaptive significance. The emergence of novel phenotypes could allow polyploids to enter new niches or enhance their chances of being selected for use in agriculture. Although the causes of novel variation in polyploids are not well understood, they could involve changes in gene expression through dosage-regulation, altered regulatory interactions and rapid genetic/epigenetic changes. The objective of this work was to carry out an extensive transcript profiling and genome analysis of a diploid genotype of the pasture grass Paspalum notatum and its tetraploid derivative obtained after colchicine treatment