Spectrofiltre adapté à la séparation de sources cohérentes et entrelacées dans le plan temps-fréquences

Cette étude montre formellement et numériquement que le spectrofiltre peut séparer des sources cohérentes qui se chevauchent en temps et en fréquences. Pour en être capable, le spectrofiltre nécessite seulement d'être calculé à partir de la partie non déterministe des signaux connus. Son application au bruit du moteur Diesel est donc envisageable pour séparer le bruit de combustion des bruits mécaniques et notamment du bruit de basculement de piston

Genome sequencing of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli CFBP4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads.

Xanthomonads are plant-associated bacteria that establish neutral, commensal or pathogenic relationships with plants. The list of common characteristics shared by all members of the genus Xanthomonas is now well established based on the entire genome sequences that are currently available and that represent various species, numerous pathovars of X. axonopodis (sensu Vauterin et al., 2000), X. oryzae and X. campestris, and many strains within some pathovars. These ?-proteobacteria are motile by a single polar flagellum. Motility is an important feature involved in biofilm formation, plant colonization and hence considered as a pathogenicity factor. X. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans (Xapf) is one of the causal agents of common bacterial blight of bean and 4834-R is a highly aggressive strain of this pathogen that was isolated from a seed-borne epidemic in France in 1998. We obtained a high quality assembled sequence of the genome of this strain with 454-Solexa and 2X Sanger sequencing. Housekeeping functions are conserved in this genome that shares core characteristics with genomes of other xanthomonads: the six secretion systems which have been described so far in Gram negative bacteria are all present, as well as their ubiquitous substrates or effectors and a rather usual number of mobile elements. Elements devoted to the adaptation to the environment constitute an important part of the genome with a chemotaxis island and dispersed MCPs, numerous two-component systems, and numerous TonB dependent transporters. Furthermore, numerous multidrug efflux systems and functions dedicated to biofilm formation that confer resistance to stresses are also present. An intriguing feature revealed by genome analysis is a long deletion of 35 genes (33 kbp) involved in flagellar biosynthesis. This deletion is replaced by an insertion sequence called ISXapf2. Genes such as flgB to flgL and fliC to fleQ which are involved in the flagellar structure (rod, P- and L-ring, hook, cap and filament) are absent in the genome of strain 4834-R that is not motile. Primers were designed to detect this deletion by PCR in a collection of more than 300 strains representing different species and pathovars of Xanthomonas, and less than 5% of the tested xanthomonads strains were found nonmotile because of a deletion in the flagellum gene cluster. We observed that half of the Xapf strains isolated from the same epidemic than strain 4834-R was non-motile and that this ratio was conserved in the strains colonizing the next bean seed generation. Isolation of such variants in a natural epidemic reveals that either flagellar motility is not a key function for fitness or that some complementation occurs within the bacterial population. (Résumé d'auteur

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads

Abstract\ud \ud \ud \ud Background\ud Xanthomonads are plant-associated bacteria responsible for diseases on economically important crops. Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff) is one of the causal agents of common bacterial blight of bean. In this study, the complete genome sequence of strain Xff 4834-R was determined and compared to other Xanthomonas genome sequences.\ud \ud \ud \ud Results\ud Comparative genomics analyses revealed core characteristics shared between Xff 4834-R and other xanthomonads including chemotaxis elements, two-component systems, TonB-dependent transporters, secretion systems (from T1SS to T6SS) and multiple effectors. For instance a repertoire of 29 Type 3 Effectors (T3Es) with two Transcription Activator-Like Effectors was predicted. Mobile elements were associated with major modifications in the genome structure and gene content in comparison to other Xanthomonas genomes. Notably, a deletion of 33 kbp affects flagellum biosynthesis in Xff 4834-R. The presence of a complete flagellar cluster was assessed in a collection of more than 300 strains representing different species and pathovars of Xanthomonas. Five percent of the tested strains presented a deletion in the flagellar cluster and were non-motile. Moreover, half of the Xff strains isolated from the same epidemic than 4834-R was non-motile and this ratio was conserved in the strains colonizing the next bean seed generations.\ud \ud \ud \ud Conclusions\ud This work describes the first genome of a Xanthomonas strain pathogenic on bean and reports the existence of non-motile xanthomonads belonging to different species and pathovars. Isolation of such Xff variants from a natural epidemic may suggest that flagellar motility is not a key function for in planta fitness.AI is funded by a PhD grant from INRA-SPE and region Pays de la Loire, France. EG was funded by a PhD grant from the French Ministry of National Education and Research and French Guyana. SC, EG, MA, EL and LDN are funded by the LABEX TULIP (ANR-10-LABX-41), LSG is funded by ANR-2010-GENM-013 Xanthomix

Death and the Societies of Late Antiquity

Ce volume bilingue, comprenant un ensemble de 28 contributions disponibles en français et en anglais (dans leur version longue ou abrégée), propose d’établir un état des lieux des réflexions, recherches et études conduites sur le fait funéraire à l’époque tardo-antique au sein des provinces de l’Empire romain et sur leurs régions limitrophes, afin d’ouvrir de nouvelles perspectives sur ses évolutions possibles. Au cours des trois dernières décennies, les transformations considérables des méthodologies déployées sur le terrain et en laboratoire ont permis un renouveau des questionnements sur les populations et les pratiques funéraires de l’Antiquité tardive, période marquée par de multiples changements politiques, sociaux, démographiques et culturels. L’apparition de ce qui a été initialement désigné comme une « Anthropologie de terrain », qui fut le début de la démarche archéothanatologique, puis le récent développement d’approches collaboratives entre des domaines scientifiques divers (archéothanatologie, biochimie et géochimie, génétique, histoire, épigraphie par exemple) ont été décisives pour le renouvellement des problématiques d’étude : révision d’anciens concepts comme apparition d’axes d’analyse inédits. Les recherches rassemblées dans cet ouvrage sont articulées autour de quatre grands thèmes : l’évolution des pratiques funéraires dans le temps, l’identité sociale dans la mort, les ensembles funéraires en transformation (organisation et topographie) et les territoires de l’empire (du cœur aux marges). Ces études proposent un réexamen et une révision des données, tant anthropologiques qu’archéologiques ou historiques sur l’Antiquité tardive, et révèlent, à cet égard, une mosaïque de paysages politiques, sociaux et culturels singulièrement riches et complexes. Elles accroissent nos connaissances sur le traitement des défunts, l’emplacement des aires funéraires ou encore la structure des sépultures, en révélant une diversité de pratiques, et permettent au final de relancer la réflexion sur la manière dont les sociétés tardo-antiques envisagent la mort et sur les éléments permettant d’identifier et de définir la diversité des groupes qui les composent. Elles démontrent ce faisant que nous pouvons véritablement appréhender les structures culturelles et sociales des communautés anciennes et leurs potentielles transformations, à partir de l’étude des pratiques funéraires.This bilingual volume proposes to draw up an assessment of the recent research conducted on funerary behavior during Late Antiquity in the provinces of the Roman Empire and on their borders, in order to open new perspectives on its possible developments. The considerable transformations of the methodologies have raised the need for a renewal of the questions on the funerary practices during Late Antiquity, a period marked by multiple political, social, demographic and cultural changes. The emergence field anthropology, which was the beginning of archaeothanatology, and then the recent development of collaborative approaches between various scientific fields (archaeothanatology, biochemistry and geochemistry, genetics, history, epigraphy, for example), have been decisive. The research collected in this book is structured around four main themes: Evolution of funerary practices over time; Social identity through death; Changing burial grounds (organisation and topography); Territories of the Empire (from the heart to the margins). These studies propose a review and a revision of the data, both anthropological and archaeological or historical on Late Antiquity, and reveal a mosaic of political, social, and cultural landscapes singularly rich and complex. In doing so, they demonstrate that we can truly understand the cultural and social structures of ancient communities and their potential transformations, based on the study of funerary practices

Extraction du bruit de combustion d\u27un moteur Diesel. Validation et application d\u27un spectrofiltre

Cette thèse porte sur la validation et l\u27application d\u27un spectrofiltre pour séparer le bruit de combustion et le bruit mécanique d\u27un moteur Diesel. Le spectrofiltre est un estimateur de fonction de transfert. Dans le contexte de notre étude, il estime les transferts vibroacoustiques des forces de combustion entre les cylindres du moteur et le point d\u27écoute. Le spectrofiltre s\u27obtient à partir des pressions-cylindre et du bruit rayonné par le moteur. La méthode que nous examinons est une application de la théorie de la cyclostationnarité. Elle consiste à calculer le spectrofiltre à partir de la partie aléatoire des signaux. L\u27intérêt de cette méthode est de fortement réduire une erreur provenant de la cohérence entre la combustion et les sources de bruit mécanique. Cette méthode est d\u27abord justifiée sur la base d\u27arguments théoriques, et formalisée de façon à mettre en évidence ses avantages et ses inconvénients. Elle est ensuite validée par deux expériences numériques et une expérience en conditions réelles. Elle est finalement appliquée à l\u27étude des transferts vibroacoustiques des forces de combustion, et de la composition du bruit du moteur, relativement au point de fonctionnement (régime, charge, et teneur en GTL du carburant)

Extraction du bruit de combustion d'un moteur Diesel. Développement et application d'un spectrofiltre

Cette thèse porte sur la validation et l'application d'un spectrofiltre pour séparer le bruit de combustion et le bruit mécanique d'un moteur Diesel. Le spectrofiltre est un estimateur de fonction de transfert. Dans le contexte de notre étude, il estime les transferts vibroacoustiques des forces de combustion entre les cylindres du moteur et le point d'écoute. Le spectrofiltre s'obtient à partir des pressions-cylindre et du bruit rayonné par le moteur. La méthode que nous examinons est une application de la théorie de la cyclostationnarité. Elle consiste à calculer le spectrofiltre à partir de la partie aléatoire des signaux. L'intérêt de cette méthode est de fortement réduire une erreur provenant de la cohérence entre la combustion et les sources de bruit mécanique. Cette méthode est d'abord justifiée sur la base d'arguments théoriques, et formalisée de façon à mettre en évidence ses avantages et ses inconvénients. Elle est ensuite validée par deux expériences numériques et une expérience en conditions réelles. Elle est finalement appliquée à l'étude des transferts vibroacoustiques des forces de combustion, et de la composition du bruit du moteur, relativement au point de fonctionnement (régime, charge, et teneur en GTL du carburant).VILLEURBANNE-DOC'INSA LYON (692662301) / SudocSudocFranceF