Implications of molecular characters for the phylogeny of the Microbotryaceae (Basidiomycota: Urediniomycetes)

BACKGROUND: Anther smuts of the basidiomycetous genus Microbotryum on Caryophyllaceae are important model organisms for many biological disciplines. Members of Microbotryum are most commonly found parasitizing the anthers of host plants in the family Caryophyllaceae, however they can also be found on the anthers of members of the Dipsacaceae, Lamiaceae, Lentibulariaceae, and Portulacaceae. Additionally, some members of Microbotryum can be found infecting other organs of mainly Polygonaceae hosts. Based on ITS nrDNA sequences of members of almost all genera in Microbotryaceae, this study aims to resolve the phylogeny of the anther smuts and their relationship to the other members of the family of plant parasites. A multiple analysis strategy was used to correct for the effects of different equally possible ITS sequence alignments on the phylogenetic outcome, which appears to have been neglected in previous studies. RESULTS: The genera of Microbotryaceae were not clearly resolved, but alignment-independent moderate bootstrap support was achieved for a clade containing the majority of the Microbotryum species. The anther parasites appeared in two different well-supported lineages whose interrelationship remained unresolved. Whereas bootstrap support values for some clades were highly vulnerable to alignment conditions, other clades were more robustly supported. The differences in support between the different alignments were much larger than between the phylogenetic optimality criteria applied (maximum parsimony and maximum likelihood). CONCLUSION: The study confirmed, based on a larger dataset than previous work, that the anther smuts on Caryophyllaceae are monophyletic and that there exists a native North American group that diverged from the European clade before the radiation of the European species. Also a second group of anther smuts was revealed, containing parasites on Dipsacaceae, Lamiaceae, and Lentibulariaceae. At least the majority of the parasites of Asteraceae appeared as a monophylum, but delimitations of some species in this group should be reconsidered. Parasitism on Polygonaceae is likely to be the ancestral state for the Microbotryaceae on Eudicot hosts

Ein phytoparasitisches Pilzexkursionswochenende im mittleren Elbetal anlässlich des 65. Geburtstages von Horst Jage

Anlässlich des 65. Geburtstages von Horst Jage, den er am 30. September 2000 beging, fand ein phytoparasitisches Pilzexkursionswochenende statt. Für den überaus engagierten Botaniker und Mykologen ist es typisch, dass er dieses Ereignis zum Anlass nahm, Freunde mit gleichen Interessen vom 29.9 bis 1.10.2000 ins mittlere Elbetal einzuladen. Besonderes Augenmerk wurde bei der Exkursion auf die Brandpilze gelegt, gewissermaßen nebenbei wurde aber auch eine Fülle weiterer phytoparasitischer Kleinpilze nachgewiesen

Adiciones a los carbones de la Península Ibérica

After examination of specimens, mainly from the herbarium (MA) and the mycological collection (MA-Fungi) of the Royal Botanic Garden of Madrid, we report several novelties on smut fungi within Europe. Two species of smut fungi, Sporisorium egyptiacum and Tilletia viennotii, are reported for the first time from Europe. A finding of Sphacelotheca polygoni-serrulati represents a second record for Europe. Six species of smut fungi, Moreaua kochiana, Schizonella elynae, Sporisorium egyptiacum, Thecaphora thlaspeos, Tilletia viennotii, and Ustanciosporium majus, are recorded for the first time from the Iberian Peninsula. Five species of smut fungi, Moreaua kochiana, Schizonella elynae, Sporisorium egyptiacum, Thecaphora thlaspeos, and Ustanciosporium majus, are newly recorded from Spain. Three species, Moreaua kochiana, Sphacelotheca polygoni-serrulati, and Tilletia viennotii, are new for Portugal. A specimen of Moreaua kochiana represents a new record for France. Arabis serpillifolia is reported as a new host of Thecaphora thlaspeos. New distribution records from the Iberian Peninsula are given for Anthracoidea arenariae, Microbotryum minuartiae, M. silenes-saxifragae, and Tranzscheliella sparti. We also include a phylogenetic analysis of DNA sequences of Moreaua kochiana, generated in this study, to understand this species’ relationships within its genus.Tras examinar especímenes principalmente del herbario (MA) y de la colección de hongos (MA-Fungi) del Real Jardín Botánico de Madrid reportamos varias novedades de carboneros dentro de Europa. Dos especies de carbones, Sporisorium egyptiacum y Tilletia viennotii, se citan por primera vez para Europa. Reportamos también la segunda cita de Sphacelotheca polygoni-serrulati para Europa. Seis especies, Moreaua kochiana, Schizonella elynae, Sporisorium egyptiacum, Thecaphora thlaspeos, Tilletia viennotii, y Ustanciosporium majus, se citan por primera vez para la Península Ibérica; cinco especies, Moreaua kochiana, Schizonella elynae, Sporisorium egyptiacum, Thecaphora thlaspeos, y Ustanciosporium majus, son nuevas citas para España; tres especies, Moreaua kochiana, Sphacelotheca polygoni-serrulati, y Tilletia viennotii, son nuevas citas para Portugal. Una colección de Moreaua kochiana representa una nueva cita para Francia. Arabis serpillifolia se menciona por primera vez como un hospedante para Thecaphora thlaspeos. Se registran nuevas localidades en la Península Ibérica para Anthracoidea arenariae, Microbotryum minuartiae, M. silenes-saxifragae y Tranzscheliella sparti. Incluimos también un análisis filogenético de secuencias de ADN de dos especímenes de Moreaua kochiana, generadas en este estudio, para entender las relaciones filogenéticas de esta especie dentro su género

Ebenseer Krippen

"Eine Krippe ist jedenfalls stets der Versuch einer Vergegenwärtigung des von der Bibel überlieferten Heilsgeschehens Gottes mit den Menschen, die bildhafte Darstellung in einer symbolischen Landschaft, eine Erzählung mit der Hilfe von Figuren, die Versetzung historischer Dinge in die eigene Gegenwart und der Wunsch nach Übersetzung des christlichen Glaubens in schaubare Wirklichkeit."* Dies ist die christliche Grundlage und diese gilt natürlich auch als Beweggrund für die Schaffung der Ebenseer Weihnachtskrippen. In Ebensee kommen aber noch andere Faktoren hinzu, die zu einer so eigenständigen und starken Tradition und zu einer so großen Anzahl von Krippen mit hoher Figurenanzahl im Gemeinde-gebiet geführt haben. Bis in die 60er Jahre des 19. Jahrhunderts, als erst die Straße zwischen Ebensee und Traunkirchen fertiggestellt wurde, lag Ebensee relativ isoliert im Salzkammergut, gegen Norden, in Richtung Alpenvorland, durch den Traunsee abgeschlossen. Man lebte von der 1607 eröffneten Saline und den sich in deren Umfeld ergebenden Arbeitsplätzen. Die Bevölkerung war arm, oft dem Hunger-tod nahe. In der spärlichen Freizeit entstand über die Jahre ein vielfältiges unverwechselbares Brauchtum. In der Weihnachtszeit wurden Krippenspiele aufgeführt und eine eigene starke Liedtradition gepflegt. Im 19. Jahrhundert kam das "Schnegern", das Schnitzen mit einfachen Messern, vermehrt hinzu. Dies nahm bei den Pfannhausern und Holzknechten seinen Anfang und weitete sich immer mehr aus: Die Lust am Schnitzen, Lust am Malen, Lust am Aufstellen der zahlreichen Figuren bekam eine Eigendynamik. Es entstand ein spielerischer Wettbewerb - der Wunsch, andere in Anzahl der Figuren, großartiger Landschaftsbauerei, Einbringung neuer Figurengruppen und neuer Gestaltungsideen zu übertreffen. Einen gewissen Einbruch gab es erst zur Zeit des Nationalsozialismus, als das Schnitzen von Krippen verboten worden war, und in den darauffolgenden Jahrzehnten, als beim Wiederaufbau nach dem Zweiten Weltkrieg "Altes" an Wert verlor und eine Orientierung Richtung USA und Modernität immer mehr an Boden gewann. In dieser Zeit ging viel verloren - sowohl an Krippen als auch und an Wissen um die "alten" Schnitzer. Ab den 80er Jahren des 20. Jahrhunderts war jedoch wieder ein Aufwärtstrend zu verspüren - das Brauchtum war nie ganz abgebrochen, nur zurückgegangen. Immer mehr Ebenseer begannen Krippenschnitzkurse zu besuchen und wieder selber zu schnitzen, immer mehr Ebenseer begannen sich neue im Ort geschnitzte Krippen zuzulegen oder die alten von den Dachböden zu holen. Eine Reihe von Krippenbesitzern zeigten bis heute Jahr für Jahr voll stolz ihr Werk privaten Interessenten, oder sogar der Öffentlichkeit. "Krippöschaungehen" ist zwischen Stefanitag und Lichtmess eine weitverbreitete Freizeitbeschäftigung der Ebenseer Bevölkerung. Aber es ist nicht nur Stolz, sondern eben die Mischung aus Liebe zum Hobby und ehrfürchtiger christlicher Andacht vor dem Heilsgeschehen in Miniatur. In Ebensee wird mit der Krippe noch gelebt, es ist nicht zu vergleichen mit der z.B. relativ gedankenlos stattfindenden Aufstellung eines Christbaumes oder auch von Krippen und anderer weihnachtlicher Ausschmückungen der Wohnungen an vielen anderen Orten. Es handelt sich hier noch um lebendiges Brauchtum, nicht nur um Brauchtum, das zu bestimmten Zeiten, oft für Touristen, oft aus wirtschaftlichen Gründen motiviert, hervorgekramt wird. * Zitat: Bogner, Das neue Krippenlexikon, S. 2

Genomic and transcriptomic analyses of Microbotryum lychnidis-dioicae provide insights into the biology of a fascinating fungal phytopathogen.

This study made use of the Silene latifolia/Microbotryum lychnidis-dioicae phytopathogen system as the focal system to establish the first reference genome for Microbotryum violaceum sensu lato. In silico analysis was performed on the genome assembly to identify various characteristics of the genome. Using RNA-Sequencing technologies on the Illumina platform, we collected transcriptomic data for both in vitro and in planta life stages of the fungus, providing the most comprehensive look at the gene expression and regulation of this fungus. Due to a lack of identifiable domains on the predicted genes, gene set enrichment analysis was done in context, by including gene sets like “secreted proteins”, “small secreted proteins” and “unique proteins”, to aid discovery of the features in the different datasets. To further research into Microbotryum species in general, we developed, for the first time, a robust and repeatable Agrobacterium-mediated transformation system. Using genomic and transcriptomic data, we were able to select native promoters that drive transcription in specific conditions, making it a highly versatile and controllable system

Rote Liste und Artenliste Sachsens - Pilze

Die Rote Liste informiert über die Gefährdungssituation der Arten und Lebensräume und stellt eine Grundlage für die Fachplanung im Naturschutz dar. In der Broschüre werden 5.360 in Sachsen vorkommende Pilzarten aufgelistet und bewertet. Eine Rote Liste für Pilze in Sachsen erschien zuletzt 1999

Notes, outline and divergence times of Basidiomycota

The Basidiomycota constitutes a major phylum of the kingdom Fungi and is second in species numbers to the Ascomycota. The present work provides an overview of all validly published, currently used basidiomycete genera to date in a single document. An outline of all genera of Basidiomycota is provided, which includes 1928 currently used genera names, with 1263 synonyms, which are distributed in 241 families, 68 orders, 18 classes and four subphyla. We provide brief notes for each accepted genus including information on classification, number of accepted species, type species, life mode, habitat, distribution, and sequence information. Furthermore, three phylogenetic analyses with combined LSU, SSU, 5.8s, rpb1, rpb2, and ef1 datasets for the subphyla Agaricomycotina, Pucciniomycotina and Ustilaginomycotina are conducted, respectively. Divergence time estimates are provided to the family level with 632 species from 62 orders, 168 families and 605 genera. Our study indicates that the divergence times of the subphyla in Basidiomycota are 406-430 Mya, classes are 211-383 Mya, and orders are 99-323 Mya, which are largely consistent with previous studies. In this study, all phylogenetically supported families were dated, with the families of Agaricomycotina diverging from 27-178 Mya, Pucciniomycotina from 85-222 Mya, and Ustilaginomycotina from 79-177 Mya. Divergence times as additional criterion in ranking provide additional evidence to resolve taxonomic problems in the Basidiomycota taxonomic system, and also provide a better understanding of their phylogeny and evolution