Combining machine learning and deep learning approaches to detect cervical cancer in cytology images

This dissertation is centred around the implementation and optimization of a hybrid pipeline for the identification and stratification of abnormal cell regions in cytology images, combining state of the art deep learning (DL) approaches and conventional machine learning (ML) models.Cervical cancer is the fourth most common cancer in women. When diagnosed early on, it is one of the most successfully treatable types of cancer. As such, screening tests are very effective as a prevention measure. These tests involve the analysis of microscopic fields of cytology samples which, when performed manually, is a very demanding task, requiring highly specialized laboratory technologists (cytotechs). Due to this, there has been a great interest in automating the overall screening process. Most of these computer-aided diagnosis systems subject the images from each sample to a set of steps, more notably focus and adequacy assessment, region of interest identification and respective classification. This work is focused on the last two stages, more specifically, the detection of abnormal regions and the classification of their abnormality level. The main approaches can be divided into two types: deep learning architectures and conventional machine learning models, both presenting their own set of advantages and disadvantages. This work explores the combination of both of these approaches in hybrid pipelines to minimize the problems of each one whilst taking advantage of the best they have to offer, ultimately contributing to a decision support system for cervical cancer diagnosis. More specifically, it is proposed a deep-learning approach for the detection of the regions of interest and respective bounding-box generation, followed by a simpler machine-learning model for their classification. Furthermore, a comparative analysis of different hybrid pipelines and algorithms will also be performed, aiming to support future research of similar solutions

Estudo analítico de juntas adesivas tubulares sujeitas a esforços de tração

As ligações adesivas têm cada vez mais preponderância na conceção de estruturas mecânicas, devido às vantagens significativas desta técnica em comparação com as ligações tradicionais. O facto de as ligações adesivas terem uma boa relação desempenho-peso, bem como a boa capacidade de unir diferentes materiais sem danificar as estruturas a ligar, são vantagens destacadas deste tipo de ligações. Os adesivos comerciais variam desde resistentes e frágeis (por exemplo o Araldite® AV138) a menos resistentes e dúcteis (por exemplo o Araldite® 2015). Uma nova família de adesivos de poliuretano combina elevada resistência e ductilidade (por exemplo o Sikaforce® 7752). A presente dissertação compara o desempenho à tração dos três adesivos supracitados, em juntas tubulares de alumínio (AW6082-T651), em função de diferentes comprimentos de sobreposição (LO). Nesta comparação, é efetuada uma análise analítica cujos resultados são, numa fase posterior, comparados com uma análise numérica por meio de modelos de dano coesivo (MDC) e com a resistência da junta obtida experimentalmente. A análise analítica foi realizada por intermédio de três modelos analíticos, a partir de uma formulação mais simples e direta, na qual são analisadas as tensões de arrancamento (σy) e as de corte (τxy), e posteriormente utilizados critérios da mecânica dos meios contínuos para inferir a resistência das juntas. Este estudo permitiu verificar que os métodos analíticos preveem um comportamento ligeiramente diferente, em termos de distribuições de tensões de corte, relativamente aos obtidos numericamente. No entanto, as previsões da resistência obtidas analiticamente, aplicando os critérios da mecânica dos meios contínuos, são semelhantes aos resultados obtidos pelo MEF, mas distintas dos resultados obtidos experimentalmenteAdhesive joints are increasingly prevalent in the design of mechanical structures, due to the significant advantages of this technique compared to traditional joints. The fact that adhesive joints have a good performance-to-weight ratio, as well as the good ability to join different materials without damaging the structures to be bonded, are outstanding advantages of this type of joints. Commercial adhesives range from strong and brittle (e.g., the Araldite® AV138) to less strong and ductile (e.g., the Araldite® 2015). A new family of polyurethane adhesives combines high strength and ductility (e.g., the Sikaforce® 7752). This dissertation compares the tensile performance of the three above mentioned adhesives, in aluminum tubular joints (AW6082-T651), as a function of different overlap lengths (LO). In this comparison, an analytical analysis is carried out, the results of which are, at a later stage, compared with a numerical analysis using cohesive zone models (CZM) and with the experimentally obtained joint strength. The analytical analysis was carried out using three analytical methods, from a simpler and more direct formulation, in which peel (σy) and shear stresses (τxy) are analyzed, and subsequently continuum mechanics criteria are used to infer the joint strength. This study allowed to verify that the analytical methods predict a slightly different behavior, in terms of shear stress distributions, compared to those obtained numerically. However, the strength predictions obtained analytically, applying the continuum mechanics criteria, are similar to the results obtained by FEM, but distinct from the results obtained experimentall

Eternizar-e: a arte na prevenção

VII Seminário de Extensão Universitária da UNILA (SEUNI); VIII Encontro de Iniciação Científica e IV Encontro de Iniciação em Desenvolvimento Tecnológico e Inovação (EICTI 2019) e Seminário de Atividades Formativas da UNILA (SAFOR)O projeto de Extensão Eternizar-te atua, desde 2015, com ações de promoção e prevenção de saúde em Foz do Iguaçu e região. A proposta de uma equipe multiprofissional, interdisciplinar e intersetorial, permite que a abordagem em saúde seja entendida em toda a sua complexidade. O uso do clown amplia possibilidades na educação em saúde, visando desenvolver e motivar a autonomia dos sujeitos sobre sua condição de saúde, garantindo a humanização das relações entre extensionistas e comunidade. A conscientização por meio da metodologia lúdica se debruça sobre determinantes modificáveis de saúde e objetivo específico para 2019 é a atuação na promoção de saúde mental. A pretensão de transformação social e de mudança de perfil epidemiológico da população da fronteira é a peça chave para a afinação do produto técnico-científico acadêmico na forma do Projeto de Extensão Eternizar-teÀ equipe do projeto que se dedica à comunidade, ao professor Fernando Mesquita de Faria, por compartilhar seus saberes teatrais conosco, à Associação Fraternidade Aliança, escolas, Prefeituras e outras instituições, que nos acolheram e possibilitam o trabalho conjunto. E, finalmente, à Pró Reitoria de Extensão da UNILA pelo incentivo e apoio, permitindo que o projeto seja concretizad

Sensoriamento remoto aplicado à análise chuva-vegetação na Amazônia Central

Studies indicate that deforestation in the Amazon implies a reduction in the sup- ply of moisture to the atmosphere and consequently the precipitation. This paper presents the results of applying remote sensing techniques to compare trends in precipitation and Cloud Top Brightness Temperature (TBTN) in nine areas ranging from heavy clearing forest cover virtually unchanged. The precipitation data were obtained from the TRMM satellite - 3B43, the TBTN were obtained from the Goes satellite and the data were obtained from deforestation of Inpe (2011). The results indicate possible changes in rainfall patterns, the patterns of formation of deep convective clouds and negative trends in precipitation for the area with deforestation.Estudos indicam que o desmatamento da Amazônia pode influenciar a redução do fornecimento de umidade para atmosfera e, consequentemente, a precipita- ção. Este artigo apresenta os resultados da aplicação de técnicas de sensoriamen- to remoto para verificar o comportamento da precipitação e da temperatura de brilho do topo de nuvens (TBTN) em nove áreas, com cobertura variando entre desmatamento intenso a floresta praticamente inalterada. Os dados de precipita- ção foram obtidos do satélite TRMM 3B43, os de TBTN, do satélite Goes e os dados do desflorestamento, de Inpe (2011). Os resultados indicaram possíveis al- terações nos padrões de chuva e de formação de nuvens de convecção profunda e tendências negativas de precipitação na área desmatada

Microarray gene expression analysis of neutrophils from elderly septic patients

Sepsis is an especially common affliction in the elderly and despite its increased prevalence and mortality in older people, the immune response of the elderly during septic shock appears similar to that of younger patients. In the original study we conducted a global gene expression analysis of circulating neutrophils from elderly and young septic patients, as well as from age-matched healthy controls, to better understand how elder individuals respond to severe infectious insult (Pellegrina et al., 2015). Here we provide additional details pertaining processing and statistical analysis of the microarray data. Raw and normalized datasets linked to this project have been deposited in the Gene Expression Omnibus (GEO) database under accession number GSE67652

LEIS AMBIENTAIS E IMAGENS DE ALTA RESOLUÇÃO DO SATÉLITE QUICKBIRD APLICADAS À ANÁLISE DE UMA ÁREA DA MATA ATLÂNTICA, RS

In 1994, the Center for Research and Nature Conservation PRÓ-MATA was created to develop studies and actions for the protection and recovery of the ecosystems from a sector of Atlantic Forest in Rio Grande do Sul, Brazil. PRÓ-MATA was conceived in the frame of a cooperation between the Catholic University of Rio Grande do Sul (PUCRS) and the University of Tübingen (Germany). This paper presents results of a research developed in the PRÓ-MATA area, using high-resolution image of QuickBird satellite and GIS techniques. The integration of GIS with Brazilian environmental rules was used to provide the basis for the inherent proposals of this study. The geographic analysis allowed the identification of permanent preservation areas, the study of neighborhood areas and those areas vulnerable to human action. The QuickBird images are ideally suited for this research. In the region under study 46,05% are permanent preservation areas, the main activities in the surrounding of the preservation area agriculture and livestock. Key words: Atlantic Forest; Environment Rules; QuickBird image, GIS.Em 1994, o Centro de Pesquisas e Conservação da Natureza PRÓ-MATA foi criado para desenvolver estudos e ações visando proteger e recuperar os ecossistemas de um setor da Mata Atlântica no Rio Grande do Sul. O Projeto foi concebido no âmbito de uma cooperação entre a Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) e a Universidade alemã de Tübingen. Este trabalho apresenta os resultados de uma pesquisa realizada no área do PRÓ-MATA, na qual foram utilizadas imagens com alta resolução do satélite QuickBird. Para realizar o estudo foi utilizada a ferramenta SIG associada às leis ambientais brasileiras. A análise geográfica consistiu no mapeamento das áreas de preservação permanente (APP), estudo do entorno e determinação das áreas com vulnerabilidade à ação antrópica. As imagens QuickBird permitiram uma análise detalhada da área estudada. Na área mapeada 46,05% são considerados APP, as principais atividades no entorno são a agricultura de subsistência e a pecuária. Palavras-chave: Mata Atlântica; Leis ambientais; QuickBird, SIG

Com a palavra, o usuário com deficiência e a realidade vivenciada nas bibliotecas

The user can be considered an important source of information for libraries with regard to the elaboration and direction of products and services developed for him, especially if he is a person with a disability. However, despite the recommendation and guidance in the literature, this user is still not served as expected with regard to access and accessibility in the library. From this perspective, the objective was to know, together with nine users with disabilities, the relationship between them and libraries, from childhood to the current stage, and how, in their view, library professionals could offer more inclusive services. As a library user study, the construction of this text was sought through a theoretical framework that brought together materials in portuguese, without a time frame, associated with the recording of videos carried out by the guest users themselves. The results showed two situations in the same reality: on the one hand, users who found support for their development in school libraries; on the other hand, those who only knew it in Higher Education, when they unite in pointing out that the university library offers better conditions for use and frequency, even in the midst of some difficulties. The study allowed us to conclude that this relationship can be satisfactory at several points, especially if the information user is heard and collaborates in its inclusive process in libraries.El usuario puede ser considerado una importante fuente de información para las bibliotecas en cuanto a la elaboración y dirección de los productos y servicios desarrollados para él, especialmente si se trata de una persona con discapacidad. Sin embargo, a pesar de las recomendaciones y orientaciones de la literatura, este usuario aún no recibe la atención esperada en cuanto al acceso y accesibilidad en la biblioteca. Desde esta perspectiva, el objetivo era conocer, junto a nueve usuarios con discapacidad, la relación entre ellos y las bibliotecas, desde la infancia hasta la etapa actual, y cómo, a su juicio, los profesionales bibliotecarios podrían ofrecer servicios más inclusivos. Como estudio de caso, se buscó la construcción de este texto a través de un referencial teórico que reunió materiales en portugués, sin marco temporal, asociados a la grabación de videos realizada por los propios usuarios invitados. Los resultados mostraron dos situaciones en una misma realidad: por un lado, los usuarios que encontraron apoyo para su desarrollo en las bibliotecas escolares; por otro lado, quienes sólo lo conocieron en la Educación Superior, cuando se unen en señalar que la biblioteca universitaria ofrece mejores condiciones de uso y frecuencia, aún en medio de algunas dificultades. El estudio permitió concluir que esta relación puede ser satisfactoria en varios puntos, especialmente si el usuario de la información es escuchado y colabora en su proceso inclusivo en las bibliotecas.O usuário pode ser considerado uma fonte de informação importante para as bibliotecas no que diz respeito à elaboração e ao direcionamento de produtos e serviços desenvolvidos para ele, principalmente se for uma pessoa com deficiência. No entanto, apesar da recomendação e orientação na literatura, esse usuário ainda não é atendido como esperado no que se refere ao acesso e acessibilidade na biblioteca. Sob essa perspectiva, objetivou-se conhecer, junto a nove usuários com deficiência, a relação entre eles e as bibliotecas, desde a infância até a fase atual, e como, na visão deles, os profissionais da biblioteca poderiam oferecer atendimentos mais inclusivos. Como um estudo de usuários, buscou-se a construção do presente texto por meio de um referencial teórico que reuniu materiais em língua portuguesa, sem recorte temporal, associados à gravação de vídeos realizada pelos próprios usuários convidados. Os resultados apontaram duas situações em uma mesma realidade: de um lado, usuários que encontraram, nas bibliotecas escolares, apoio para seu desenvolvimento; por outro lado, os que a conheceram apenas no Ensino Superior, momento em que se unem ao apontar que a biblioteca universitária oferece melhores condições de uso e frequência, mesmo em meio a algumas dificuldades. O estudo permitiu concluir que essa relação pode ser satisfatória em diversos pontos, principalmente se o usuário da informação for ouvido e colaborar em seu processo inclusivo nas bibliotecas