13 research outputs found
Water in the Active Site of Ketosteroid Isomerase
- Author
- Ball P.
- Bayly C. I.
- Brooks C. L. I.
- Cao Y.
- Case D. A.
- Chakravorty D. K.
- Chakravorty D. K.
- Cho H.-S.
- Choi G.
- Cornell W. D.
- Čuma M.
- Darden T.
- Dunning T. H.
- Fafarman A. T.
- Feierberg I.
- Frey P. A.
- Frisch M. J.
- García A. E.
- Gordon J. C.
- Guillot B.
- Ha N.-C.
- Hanoian P.
- Hawkinson D. C.
- Hoover W. G.
- Hornak V.
- Jang D. S.
- Jeffrey J.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Kamerlin S. C. L.
- Kim D.-H.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Luzar A.
- Martyna G. J.
- Maupin C. M.
- Mazumder D.
- Meinhold L.
- Mildvan A. S.
- Nam G. H.
- Nose S.
- Petrounia I. P.
- Petrounia I. P.
- Philip Hanoian
- Pollack R. M.
- Rasaiah J. C.
- Schwans J. P.
- Sharon Hammes-Schiffer
- Sigala P. A.
- Sigala P. A.
- Wang J.
- Warshel A.
- Xiang J. Z.
- Xue L.
- Zeng B.
- Zhao Q.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textEnantiocontrolled Synthesis of Spirooxindoles Based on the [5 + 2] Cycloaddition of a Tp(CO) 2
- Author
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textDecomposition of Vibrational Shifts of Nitriles into Electrostatic and Hydrogen-Bonding Effects
- Author
- Aaron T. Fafarman
- Abraham M. H.
- Andrews S. S.
- Andrews S. S.
- Aschaffenburg D. J.
- Bjørseth A.
- Chattopadhyay A.
- Choi O.
- Daniel Herschlag
- Decatur S. M.
- Doherty G. M.
- Eaton G.
- Fafarman A. T.
- Feierberg I.
- Getahun Z.
- Kim S. W.
- Li T.
- Lindquist B. A.
- McMahon H. A.
- Nyquist R. A.
- Onsager L.
- Park E. S.
- Park K. D.
- Paul A. Sigala
- Petrounia I. P.
- Purcell K. F.
- Reimers J. R.
- Sigala P. A.
- Sigala P. A.
- Steven G. Boxer
- Suydam I.
- Suydam I. T.
- Thielges M.
- Waegele M. M.
- Ye S.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textProton Affinity of the Oxyanion Hole in the Active Site of Ketosteroid Isomerase
- Author
- Anderson S.
- Cho H. S.
- Choi G.
- Cleland W. W.
- Cleland W. W.
- Feierberg I.
- Frey P. A.
- Garcia-Viloca M.
- Gerlt J. A.
- Gerlt J. A.
- Gill S. C.
- Guthrie J. P.
- Hawkinson D. C.
- Kim D. H.
- Kim S. W.
- Kraut D. A.
- Kreevoy M. M.
- Kreevoy M. M.
- Kuliopulos A.
- Kumar G. A.
- Li Y. K.
- Pan Y.
- Petrounia I. P.
- Pollack R. M.
- Pollack R. M.
- Shan S. O.
- Sigala P. A.
- Steiner T.
- Warshel A.
- Xue L.
- Yamaguchi S.
- Zeng B.
- Zhao Q.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textEvaluation of the Energetics of the Concerted Acid–Base Mechanism in Enzymatic Catalysis: The Case of Ketosteroid Isomerase
- Author
- Blake C. C. F.
- Childs W.
- Chivers P. T.
- Dewar M. S. J.
- Engel C. K.
- Findlay D.
- Fogle E. J.
- Gerlt J. A.
- Gerlt J. A.
- Guthrie J. P.
- Hand E. S.
- Hawkinson D. C.
- Hegarty A. F.
- Hunkapiller M. W.
- Jencks W. P.
- Jencks W. P.
- Kim S. W
- Kirsch J. F.
- Kraut D. A.
- Kukic P.
- Kuliopolis A.
- Kuliopolis A.
- Malhorta S. K.
- McIntosh L. P.
- Miller C. S.
- Petrounia I. P.
- Pollack R.
- Pollack R. M.
- Röthlisberger D.
- Schmeing T. M.
- Schwans J. P.
- Seebeck F.
- Sondek J.
- Stephen D. Fried
- Steven G. Boxer
- Suydam I.
- Tsybovsky Y.
- Weinkam P.
- Winkler A.
- Xue L.
- Xue L.
- Yun Y. S.
- Zeng B.
- Zeng B.
- Zierkiewicz W.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textBinding of 2-Naphthols to D38E Mutants of 3-Oxo-Δ 5
- Author
- Abbreviations ADA
- Anderson J. R. A.
- Benisek W. F.
- Brothers P. N.
- Cleland W. W.
- Cohen A.
- Davenport L.
- Eames T. C. M.
- Galvez N.
- Gerlt J. A.
- Gerlt J. A.
- Gerlt J. A.
- Guthrie J. P.
- Guthrie J. P.
- Hartman W. W.
- Hawkinson D. C.
- Hawkinson D. C.
- Hodgson H. H.
- Karpusas M.
- Knowles J. R.
- Kuliopulos A.
- Leo A. J.
- Li Y.-K.
- Parkanyi C.
- Penning T. M.
- Petrounia I. P.
- Pollack R. M.
- Qi L.
- Saunders C. R.
- Thornburg L. D.
- Vesely V.
- Weintraub H.
- Weintraub H.
- Whitman C. P.
- Wu Z. R.
- Xue L.
- Xue L.
- Zawrotny M. E.
- Zawrotny M. E.
- Zeng B.
- Zeng B.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textUsing Unnatural Amino Acids to Probe the Energetics of Oxyanion Hole Hydrogen Bonds in the Ketosteroid Isomerase Active Site
- Author
- Abraham M. H.
- Aditya Natarajan
- Bagno A.
- Blow D.
- Bowers P. M.
- Brooks B.
- Chakraborty D. K.
- Childs W.
- Cho H. S.
- Choi G.
- Cleland W. W.
- Cleland W. W.
- Cleland W. W.
- Corey E. J.
- Daniel Herschlag
- Danielson M. A.
- Davis L.
- Feierberg I.
- Feierberg I.
- Frey P. A.
- Gao J.
- Gerlt J. A.
- Gerlt J. A.
- Gill S. C.
- Gilson M. K.
- Ha N. C.
- Ha N.-C.
- Hanoian P.
- Hedstrom L.
- Herschlag D.
- Hine J.
- Hur O.
- Jason P. Schwans
- Jencks W. P.
- Jencks W. P.
- Kim K.
- Kim S. W.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Kresge A. J.
- Larson J. W.
- Loh S. N.
- Messmore J. M.
- Mitra B.
- Oh K. S.
- Page M. I.
- Pauling L.
- Petrounia I. P.
- Pollack R. M.
- Pollack R. M.
- Pollack R. M.
- Pollack R. M.
- Ringold H. J.
- Robertus J. D.
- Robillard G.
- Ruben E. A.
- Schnölzer M.
- Schowen K. B.
- Schwans J. P.
- Schwans J. P.
- Schwans J. P.
- Seyedsayamdost M.
- Shan S.-O.
- Shan S.-O.
- Sigala P. A.
- Stahl N.
- Stratton J. R.
- Thornburg L. D.
- Thorson J. S.
- Tong H.
- Usher K. C.
- Wang Z.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Wenthold P. G.
- Wilde T. C.
- Yun Y. S.
- Zeng B.
- Zhao Q.
- Zhao Q.
- Zhong W.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textStructural Perturbation and Compensation by Directed Evolution at Physiological Temperature Leads to Thermostabilization of β-Lactamase
- Author
- Abbreviations
- Akasako A.
- Ambler R. P.
- Arnold F. H.
- Barrick D.
- Bowie J. U.
- Cortez-Retamozo V.
- Daggett V.
- Doucet N.
- Filikov A. V.
- Frech C.
- Galarneau A.
- Gill S.
- Guex N.
- Haruki M.
- Hennig M.
- Herzberg O.
- Huang W.
- Huang W.
- Huang W.
- Iwai H.
- Jaenicke R.
- Jelsch C.
- Kannan N.
- Karshikoff A.
- Kotsuka T.
- Krebber A.
- Ladenstein R.
- Lehmann M.
- Lehmann M.
- Lei S. P.
- Malakauskas S. M.
- Mansfeld J.
- Martin A.
- Matsumura M.
- Matthews B. W.
- Meinnel T.
- Moews P. C.
- Ohmura T.
- Olins P. O.
- Orencia M. C.
- Osuna J.
- Otzen D. E.
- Pace C. N.
- Pace C. N.
- Petrounia I. P.
- Petsko G. A.
- Plückthun A.
- Querol E.
- Rodrigues M. L.
- Santoro M. M.
- Santos J.
- Sayle R. A.
- Serrano L.
- Sherwood L. M.
- Shindyalov I. N.
- Sideraki V.
- Sigal I. S.
- Steipe B.
- Stemmer W. P.
- Stemmer W. P.
- Sterner R.
- Strynadka N. C.
- Szilagyi A.
- Thomas M. R.
- Thompson M. J.
- Trevino R. J.
- Trevino R. J.
- Vainshtein I.
- Van den Burg B.
- Van der Schueren J.
- Vanhove M.
- Vanhove M.
- Vieille C.
- Vlassi M.
- Vogt G.
- Vriend G.
- Wang X.
- Wehrman T.
- Whitney M.
- Wray J. W.
- Wörn A.
- Yang F.
- Yanisch-Perron C.
- Zahn R.
- Zlokarnik G.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textExperimental and Computational Mutagenesis To Investigate the Positioning of a General Base within an Enzyme Active Site
- Author
- Altschul S. F.
- Altschul S. F.
- Ana Gonzalez
- Ataie N. J.
- Bayly C. I.
- Benjamin J. Lengerich
- Benz-Moy T. L.
- Berman H. M.
- Blacklow S. C.
- Blacklow S. C.
- Carugo O.
- Chakravorty D. K.
- Chakravorty D. K.
- Cho H.-S.
- Cho H.-S.
- Choi G.
- Choi G.
- Collaborative Computational Project Number 4.
- Cornell W. D.
- Daniel Herschlag
- Darden T.
- Emsley P.
- Essman U.
- Fanny Sunden
- Feierberg I.
- Frey P. A.
- Gill S. C.
- Gordon J. C.
- Hanoian P.
- Hanoian P.
- Hawkinson D. C.
- Hawkinson D. C.
- Hedstrom L.
- Hess B.
- Hess B.
- Ho B.
- Hoover W. G.
- Hornak V.
- Hunt J. A.
- Jason P. Schwans
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Kabsch W.
- Kamerlin S. C. L.
- Kaur H.
- Kim D.-H.
- Kim D.-H.
- Kim K. S.
- Kim S. W.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Kraut D. A.
- Lassila J. K.
- Lesk A. M.
- MacArthur M. W.
- Mazumder D.
- McLaughlin R. N.
- Mildvan A. S.
- Murshudov G. N.
- Murshudov G. N.
- Nam G. H.
- Nose S.
- Oue S.
- Park H.
- Parrinello M.
- Pattern P. A.
- Petrounia I. P.
- Philip Hanoian
- Pollack R. M.
- Pollack R. M.
- Raines R. T.
- Reynolds K. A.
- Rossman M. G.
- Schwans J. P.
- Schwans J. P.
- Schwans J. P.
- Sharon Hammes-Schiffer
- Soltis S. M.
- Somarowthu S.
- Thornburg L. D.
- Trapani S.
- Wang J.
- Warshel A.
- Wilmot C. M.
- Wu Z. R.
- Xiang J. Z.
- Yingssu Tsai
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full textTesting Geometrical Discrimination within an Enzyme Active Site: Constrained Hydrogen Bonding in the Ketosteroid Isomerase Oxyanion Hole
- Author
- Alhambra C.
- Alter G. M.
- Anderson S.
- Andrea T. A.
- Artymiuk P. J.
- Auffinger P.
- Berglund B.
- Blake C. C.
- Bolon D. N.
- Bondi A.
- Brautigam C. A.
- Brycki B.
- Cachau R. E.
- Cho H. S.
- Cho H. S.
- Cleland W. W.
- Danielson M. A.
- Debler E. W.
- Dega-Szafran Z.
- Emsley P.
- Fersht A. R.
- Fersht A. R.
- Fersht A. R.
- Frauenfelder H.
- Frey P. A.
- Fuhrmann C. N.
- Fuhrmann C. N.
- Gerig J. T.
- Getzoff E. D.
- Gill S. C.
- Gilli P.
- Gilli P.
- Gross K. C.
- Gross K. C.
- Guerin D. M. A.
- Haldane J. B. S.
- Hammond S. J.
- Harris T. K.
- Hibbert F.
- Howard E. I.
- Jeffrey G. A.
- Jencks W. P.
- Jiang L.
- Johnson C. D.
- Joseph-McCarthy D.
- Kahraman A.
- Kaplan J.
- Karplus M.
- Katona G.
- Kolthoff I. M.
- Kortemme T.
- Kraut D. A.
- Kumar G. A.
- Kumar G. A.
- Kuroki R.
- Lad C.
- Ladd M. F. C.
- Ladner J. E.
- Laskowski R. A.
- Lau E. Y.
- Lawson S. L.
- Leatherbarrow R. J.
- Lienhard G. E.
- Lippow S. M.
- Lommerse J. P. M.
- Longhi S.
- Lumry R.
- Luo J.
- Lyubimov A. Y.
- Mazumder D.
- Mccoy A. J.
- Miller B. G.
- Murshudov G. N.
- Neet K. E.
- Oh K. S.
- Otwinowski Z.
- Pal P. P.
- Park Y. W.
- Pauling L.
- Petrounia I. P.
- Phillips R. S.
- Polanyi M.
- Polgar L.
- Raines R. T.
- Ringe D.
- Robertus J. D.
- Robertus J. D.
- Rohlfing C. M.
- Rupert P. B.
- Schramm V. L.
- Seebeck F. P.
- Sidhu G.
- Smallcombe S. H.
- Steiner T.
- Stevens E. D.
- Tonge P. J.
- Turner D. L.
- Valina A. L.
- Vrielink A.
- Wells T. N. C.
- Whiting A. K.
- Wilmouth R. C.
- Wilmouth R. C.
- Wishart D. S.
- Wolfenden R.
- Wolfenden R.
- Wurtele M.
- Xiao G.
- Zhang M.
- Zhang Y. L.
- Zhang Z. Y.
- Zhao Q.
- Zundel G.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
No full text
