Production de juvéniles de bar (Dicentrarchus labrax) en marais. Etude de trois séquences alimentaires de sevrage

Trials on the seabass weaning in atlantic marshes (Roux, 1993), have shown that the use of frozen prey improved this step and reduced his resulting stress. During the present study, which must confirmed these preliminary results, three alimentary sequences were tested. 1) natural zooplankton, weaning pellets, as control, 2) natural zooplankton, inert artemia (intensively produced), weaning pellets, 3) natural zooplankton, natural frozen zooplankton (harvested), weaning pellets. The achieved results show that weaning with intermediary phases (sequences 2 or 3) yield best results. Furthermore the phase with artemia yields, systematically, better results than with harvested zooplankton ; then artemia seems a excellent substitute food representing a sustainable nutritional input. A sufficient duration weaning (8 days) is preferable than a fast weaning. The multiplication of the food distribution points improve the final weaning performances.Les essais sur le sevrage du bar en marais atlantiques (Roux, 1993) ont montré que l 'utilisation de proies congelées améliorait cette étape et en minimisait le stress. Au cours de la présente étude qui devait confirmer ces premiers résultats, trois séquences alimentaires ont été testées: 1) zooplancton naturel, aliment inerte ; elle sert de témoin, 2) zooplancton naturel, artémias congelées (obtenues de façon intensive), aliment inerte, 3) zooplancton naturel, zooplancton naturel congelé ( pêché), aliment inerte. Les résultats obtenus montrent que le sevrage avec phase intermédiaire (séquences 2 ou 3) donne de bons résultats. De plus, la phase utilisant les artémias donne des résultats toujours supérieurs à celle basée sur le zooplancton de pêche ; les artémias apparaissent alors comme une excellente source de remplacement du zooplancton grâce à un apport nutritif sûr. Une durée de sevrage suffisamment longue (8 jours) est préférable à un sevrage rapide. Et la multiplication des points de distribution de nourriture favorise les performances finales du sevrage

Influence du taux de renouvellement et de la qualité de l'eau sur l'affinage contrôlé de Crassostrea gigas

Les expériences antérieures de prégrossissement d'huître creuse en système contrôlé ont montré qu'il était possible d'obtenir un engraissement significatif en poids de chair des huîtres lorsque celles-ci étaient affinées à une température comprise entre 10°C et 14°C et pour une ration alimentaire de 2.109 cell/animal/jour (Mornet, 1997). Pour des raisons économiques et afin de répondre à une demande forte au niveau des consommateurs, la période privilégiée de l'affinage annuel se situe en automne à partir du mois de septembre jusqu'en mars avec un pic de production avant les fêtes de Noël. En fonction des années, le climat varie et les caractéristiques physico-chimiques de l'eau de mer (température, salinité et turbidité) fluctuent et provoquent des cinétiques variables d'engraissement de Crassostrea gigas. Pour éviter ces fluctuations préjudiciables sur le plan biologique et économique et tester la faisabilité de l'affinage contrôlé avec l'eau salée souterraine traitée, une expérience de 35 jours a été mise en place et à pour objectifs de : - mettre en évidence l'influence du débit de l'eau sur l'évolution de l'affinage des huîtres creuses pour une température constante de 14°C et une ration alimentaire identique, - mettre en évidence l'influence de deux qualités d'eau, une eau de mer et une eau salée souterraine traitée, sur l'évolution de l'affinage des huîtres

Comparaison, en eau de mer et en eau de forage enrichies, du prégrossissement intensif de jeunes huîtres creuses

L'optimisation des paramètres d'élevage du prégrossissement contrôlé de juvéniles d'huîtres creuses Crassostrea gigas a été réalisée en nurserie (Bacher et Baud, 1988) à partir de la maîtrise de la production en grands volumes de la diatomée Skeletonema costatum sur eau salée souterraine dans les pays de la Loire, (Baud, 1988). L'analyse économique de cette filière s'est avérée positive, (Baud et al., 1988) et a permis le transfert de cette technologie à une quinzaine d'entreprises conchylicoles situées dans le polder aquacole de la baie de Bourgneuf

Traitement de l'eau salée souterraine pour un meilleur contrôle des élevages de coquillages

Dans le cadre d'un programme de prospection, mené par la Direction Départementale de l'Agriculture de la Vendée, des forages exploratoires, réalisés en divers point du littoral de la baie de Bourgneuf, ont mis à jour une quantité importante d'eau salée souterraine tant sur l'île de Noirmoutier que sur le continent (Bresson, 1982)

L'amélioration de la qualité des huîtres à échelle professionnelle: intégration de l'eau salée souterraine traitée comme milieu d'élevage

Les travaux menés au LCPL depuis plusieurs année sur l'engraissement contrôlé de l'huître creuse Crassostrea gigas ont permis, à l'échelle expérimentale de définir les différents paramètres d'élevage: Température: 14°C ration alimentaire: 2.109 cell/ind/j de la diatomée Skeletonema costatum indice AFNOR initial sans incidence débit d'eau: 3 lIind/h eau de mer ou eau salée souterraine Dans ces conditions et après 30 jours d'engraissement, le poids total des huîtres a progressé de 10%, le poids sec de 230%, l'indice AFNOR de 80% et la concentration en glycogène de 450%. Le travail réalisé ici a pour but de transposer de l'échelle expérimentale à une échelle significative pour les professionnels, la technique d'engraissement contrôlé en utilisant l'eau salée souterraine pour la production de phytoplancton d'une part et comme vecteur de régulation thermique d'autre part. En effet, un des intérêts de l'utilisation de l'eau salée souterraine réside dans sa température constante de 14°C permettant un engraissement des huîtres en toute saison sans risque de déclenchement de la gamétogenèse. Afin de vérifier cette possibilité, l'étude a été réalisée au cours de deux saisons: printemps et automne. Pour l'eassai automnal, trois bassins de 8 m2 ont été utilisés, alimentés respectivement en eau de mer naturelle, eau de mer régulé en température par échange thermique avec de l'eau salée souterraine et eau salée souterraine traitée. Dans chaque bassin, 330 kg d'huîtres ont été disposées en 7 ruches de 4 clayettes. Pour l'essai printanier, seuls deux bassins ont été utilisés, alimentés en eau de mer thermorégulée à deux débits différents: 0.61/h et 3 lIh. L'étude a été conduite pour chaque saison sur une période de 35 jours. En automne 2000, l'indice de qualité de chair de 8.2 initialement, a atteint 12.5 en eau salée souterraine, 13.8 en eau de mer thermorégulée et 14.2 en eau de mer naturelle. Le poids de chair sèche passe de 0.9 g initialement à respectivement 2.32g, 2.39g et 2.37g. Les dosages de Pb, Cd, Hg, Mn et As ne montent pas d'évolution entre le début et la fin de l'élevage, par contre le Fe augmente sensiblement dans les huîtres sur eau salée souterraine traitée. En fin d'élevage, une période de stockage de 4 semaines des huîtres sans nourriture, n'a pas montré de perte de qualité. Au printemps 2001, un deuxième essai sera conduit pour vérifier les résultats obtenus à l'automne 2000, confirmer le choix du milieu d'élevage et proposer les éléments permettant d'approcher les coûts de production

Estimation des stocks d’huîtres sauvages sur les zones concédées de la partie vendéenne de la Baie de Bourgneuf en 2003

Au cours des dernières années, les résultats du réseau REMORA montrent un déficit de croissance des huîtres en baie de Bourgneuf par rapport à la moyenne nationale. Ce déficit de croissance s’accentue particulièrement en 2000 et se poursuit en 2002. L’une des hypothèses pouvant être mise en avant pour expliquer les causes de ce manque de croissance est la biomasse accrue des organismes filtreurs cultivés ou non : huîtres, moules, crépidules. Afin d'avoir une vision globale du fonctionnement de l’écosystème de la baie, il est nécessaire d’étudier l’importance relative de ces différents stocks de coquillages. Plusieurs études ont été réalisées en 2002 : - Creocean et le Crema ont estimé la biomasse de crépidules dans la partie subtidal de la baie à environ 90 000 tonnes dont 57% de vivantes. - le LCPL a estimé le stock d’huîtres en élevage dans la baie à 46 000 tonnes. - Isomer a estimé le stock d’huîtres sauvages pour la partie nord de la baie (L.A.) à 7 500 tonnes. Afin de compléter ces différentes études, le LCPL a entrepris l’estimation du stock d’huîtres sauvages de la partie vendéenne de la baie. Dans une première phase (2003) seules les zones concédées du DPM ont été prises en compte. Cette étude se poursuivra en 2004 sur les zones de roches intertidales. Le protocole d’échantillonnage s’est appuyé sur l’étude « Etat des lieux » de Sogreah en identifiant au sein des 3 strates déjà définies au cours des précédentes études de stock, un deuxième niveau de stratification distinguant les parcelles « exploitées » et « non exploitées ». L’effort d’échantillonnage a été de 170 stations, soit 10% des zones répertoriées par Sogreah. Pour chaque station, les huîtres récoltées sur 1 m2 ont été pesées en distinguant les différents supports dont les longueurs ont été mesurées. Une campagne de photographies aériennes au 1/5000 réalisée à l’étale de basse mer le 25/10 (coefficient = 102) permettra de calculer les surfaces réellement occupées et le taux d’occupation. Le stock global d’huîtres sauvages pour cette partie de la baie de Bourgneuf s’élève à 14 820 tonnes. Les 2/3 de ce stock se trouve dans les zones non exploitées et pour plus de la moitié fixé sur les tables vides. Ces résultats montrent toute l’importance des travaux entrepris par la SRC Pays de Loire pour nettoyer et restructurer le DPM concédé

Suivi de l'émission de larves et de la fixation du naissain des huîtres creuses Crassostrea gigas en baie de Bourgneuf durant l'été 2004

L'ostréiculture en baie de Bourgneuf connaît depuis quelques années des difficultés qui sont liées à de mauvaises performances de croissance des huîtres mais aussi à une augmentation significative du captage naturel de naissain qui recouvre non seulement les zones de roches mais aussi les infrastructures d'élevage et le cheptel proprement dit. Les études menées depuis 2001 (Haure et al., 2002 ; Barillé et al., 2003 ; Martin et al., 2003 ; Martin et al, sous presse) sur les estimations de stocks d'huîtres dans la baie de Bourgneuf montrent l'importance quantitative des huîtres sauvages par rapport aux huîtres cultivées : le stock d'huîtres sauvages représente plus de la moitié des huîtres cultivées. Il est à la fois la conséquence de la recrudescence du captage depuis quelques années et de l'abandon et du manque d'entretien d'un certain nombre de parcs comme l'a montré l'étude Sogreah sur l'état des lieux (Sogreah, 2004). La présente étude se propose de définir le potentiel de reproduction des huîtres dans la baie de Bourgneuf de deux façons indépendantes mais complémentaires : Evaluation de l'effort de reproduction par le comptage de larves d'huîtres présentes dans la colonne d'eau. Evaluation du captage d'huîtres sur collecteurs traditionnels (tubes plastiques). Cette étude est une première étape de travaux futurs qui viseront à modéliser l'effort de reproduction et la croissance des huîtres en baie de Bourgneuf. Elle n'est pas destinée à aider les ostréiculteurs pour des opérations de captage d'huîtres, mais à terme à leur apporter des éléments pour affiner les pratiques culturales afin d'éviter au mieux le surcaptage de galli sur les huîtres de petite taill

Estimation du stock de coques (Cerastoderma edule) élevé dans le Traict du Croisic en 2001.

Le Traict du Croisic représente une surface de 650 hectares dont 180 hectares sont dédiés à la conchyliculture. Bien que divers types d’élevage soient pratiqués (huîtres creuses Crassostrea gigas, moules Mytilus edulis, palourdes Venerupis spp.), l’élevage de la coque Cerastoderma edule représente, à lui seul, 140 hectares de concessions soit 76 % de la surface allouée à l’exploitation conchylicole. La production de coques est de 1200 à 2000 tonnes par an, ce qui fait du Traict le premier centre d’élevage et le deuxième producteur français après la baie de Somme où 2500 tonnes par an sont extraites de l’exploitation des gisements naturels (Bonnel, 1986). Il existe peu d’études scientifiques sur l'élevage de la coque dans le Traict du Croisic. Les techniques d'élevage utilisées ont été toutefois abordées (Bonnel, 1986), et un état des pathologies liées à cette espèce a pu être dressé (Thebault, 2001). Des travaux, issus d'actions ponctuelles, ont été réalisés pour apprécier l'état général du cheptel de coques après les fortes mortalités de 1997 (Fleury et al., 1999), ainsi qu'une étude sur l’optimisation du captage naturel local (Glize et Ponthoreau, 1997). Au regard de l’activité conchylicole du Traict du Croisic il semble aujourd'hui indispensable d'engager des études de fond pour approcher la capacité trophique de cet écosystème complexe comme cela a déjà été réalisé dans d'autres bassins de production français tels que Marennes Oléron (Héral et al., 1988), Arcachon (Maurer, 1989) ou la baie de Bourgneuf (Haure et Baud, 1995). Les informations recueillies devraient, à terme, constituer une base de réflexions à l'usage des professionnels pour la bonne gestion de leur site de production. Cette étude repose sur des travaux réalisés précédemment sur l’optimisation de l’échantillonnage de la coque dans le Traict du Croisic (Haure et al., 2002) et propose de suivre l’évolution du stock de coques en élevage à trois périodes clef de l’année : - Juin 2001 : Stock avant les mortalités estivales, - Septembre 2001 : Stock après les mortalités estivales, - Janvier 2002 : Stock après récoltes et semi de novembre. La stratification définie lors de la précédente étude (Haure et al., 2002) en fonction de la nature du sédiment (sableux et sablo-vaseux) et de la pratique culturale (semé et non semé) a été conservée. Les premières campagnes d’évaluation de la quantité de coques Cerastoderma edule élevée dans le Traict du Croisic ont été réalisées en juin et septembre 2001 puis en janvier 2002. Les résultats montrent que le stock peut varier rapidement dans le temps puisque à ces trois périodes de l’année il était respectivement de 2700, 2200 et 3600 tonnes. Dans cette étude, il est apparu que l’essaimage local pouvait être très important selon la saison puisqu’en janvier, le nombre de coques au m² était identique sur les strates semées ou non semées (sauf strate A semée). Les données obtenues étaient, en janvier 2002, de 1200 à 1300 coques / m² soit 2 à 4 kg / m². La distribution en classe de taille des effectifs en élevage laisse penser que peu d’individus dépassent 30 mm (1 à 2 %). D’autre part, les résidus de coquilles à la surface du sédiment témoignent de pertes non négligeables mais il est difficile d’en déterminer l’origine

Désinfection de l’eau de mer – DESIMER Etude des sous-produits de désinfection

L'eau qui alimente des structures d’élevage ou encore des plateformes expérimentales aquacoles (et potentiellement l’eau qui en est issue) peut être contaminée par des agents pathogènes infectant les coquillages, et plus particulièrement les huîtres, ou encore par des agents pathogènes entériques représentant un risque pour les consommateurs. Par ailleurs, la production possible d'huîtres tétraploïdes dans les installations d’élevage implique l’étude de solutions de traitement adaptées pour éviter tout rejet de gamètes, larves ou naissain d’animaux polyploïdes dans l'environnement. Le projet DESIMER a donc pour objectif d’étudier et de comparer différentes techniques de désinfection de l’eau de mer : la chloration, l’ozonation et le rayonnement UV afin de définir quelles approches techniques sont les plus adaptées tout en prenant en compte la création éventuelle de sous-produits de désinfection. Ainsi, trois techniques de désinfection de l’eau ont été ciblées : - la chloration, étudiée comme solution de référence car mise en œuvre dans de nombreuses structures aquacoles pour des opérations de nettoyage et de traitement des eaux intégrant différentes installations d’élevage de l’Ifremer; - l'ozonation, mise en œuvre notamment dans quelques grands aquariums français; - l'irradiation UV, largement utilisée à plusieurs étapes des circuits d'eau de mer alimentant les installations d’élevage d’écloseries privées et de la plateforme expérimentale de Bouin. Ce procédé présente l'avantage a priori de ne pas créer de sous-produits. Les travaux ont donc porté sur l’adaptation de ces différentes techniques à l’échelle du laboratoire et sur la mise au point des méthodes d’analyses (cytométrie en flux, biologie moléculaire –qPCR) et de suivi des performances des désinfections pour inactiver les pathogènes, les gamètes et larves de l’huître creuse Crassostrea gigas. Un suivi des sous-produits de désinfection a aussi été réalisé pour les différents traitements afin de les qualifier et de les quantifier. Les doses pour les trois techniques ont été déterminées afin de satisfaire ces objectifs en faisant appel à des outils et méthodologies fiables permettant de vérifier les performances de ces techniques. De plus, la question de la création de sous-produits de désinfection a été traitée et a permis de confirmer la formation de substances telles que le bromoforme après chloration et ozonation de l’eau de mer

Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental

Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.  Dans le cadre d’une étude associée aux épisodes de mortalité des moules bleues en France, visant à décrire et comprendre les facteurs qui peuvent favoriser ces mortalités, un panel de paramètres biotiques et abiotiques ont été suivis sur différents sites entre 2015 et 2018. Ce projet a été cofinancé par Ifremer et la DPMA (étude MORBLEU, MORtalité des moules BLEUes). Parmi les facteurs biotiques évalués, une approche basée sur l’ADN environnemental de la colonne d’eau a permis de décrire dans l’espace et dans le temps l’évolution de la dynamique et de la diversité des communautés microbiennes planctoniques, procaryotes et eucaryotes (NGS, metarbarcoding). Nous détaillons la stratégie d’échantillonnage utilisée, les matériels et méthodes mis en œuvre au cours du projet, du prélèvement au séquençage ADNe et quelques résultats préliminaires.