HCV genotypes in western Sicily: any evidence for a shift?

Background: The relative prevalence of each HCV strain in a specific country is characterized by a predominant genotype and a number of other sub-prevalent types. Over the last decade a shift away from the prevalent HCV G1 towards G3 and G4 has been reported in some countries, and might affect the global management of HCV disease. Aim: In order to assess any possible variation in the prevalence of HCV genotypes in Sicily, we surveyed an hospital based cohort of subjects with chronic HCV infection observed over the last ten years. Patient and methods: 3209 Italian patients resident in Western Sicily, 1842/1367 M/F, between 1 and 89 years of age, presented at our tertiary referral Laboratory between 1997 to 2007 and genotyped by Line Probe Assay (INNOLIPA HCV III). We compared the distribution of the HCV genotypes in two consecutive periods, from 1997 to 2002 and from 2003 to 2007, according to age. Results and conclusion: The prevalent genotypes was 1 in all age groups, but the rate of subtype 1b decrease between 1997 and 2007 from 80.7 to 63.0% with a proportional low increase of the other genotypes. In the first period genotype 1 and 2 were more prevalent in the persons aged 46-65 years but in the second period the rates were very high in the elderly (>56 years), suggesting a cohort effect. Genotype 3a was more frequent among younger people (<35 years) and we observed a 10% increase of this genotype in the subject younger than 25 years and in the subject aged 46-55 years among the two period. Genotype 4 was the most constant in the time but increase in the last period in the subject aged 36-45 years from 1.8 to 9.1% and genotype 5 was found only in two patients

Effetto del genotipo al locus della alfas1-caseina e della dieta sulle proprietà di coagulazione del latte di capre di razza Derivata di Siria

Il polimorfismo genetico al locus s1-caseina (CSN1S1) influenza il contenuto di caseina nel latte di capra inoltre, influenza il contenuto di grasso, di urea e i parametri di coagulazione del latte. Anche la nutrizione dell’animale produce variazioni nella composizione del latte e nella sua attitudine alla coagulazione. La relazione tra la nutrizione e il genotipo al locus CSN1S1 sulle caratteristiche del latte di capra è stata affrontata, solo di recente, in animali alimentati ad libitum con crescente apporto di fieno (Pagano et al., 2010), con diverso tenore proteico e al pascolo. Il presente studio ha valutato l’effetto del genotipo al locus CSN1S1 e della dieta, a diversa copertura dei fabbisogni nutritivi, sulle proprietà di coagulazione del latte di capre di razza Derivata di Siria. termini di proteina e caseina, del latte ottenuto (dati non riportati). I risultati hanno messo in luce l’interazione tra il genotipo al locus CSN1S1 e la dieta utilizzata dagli animali. Il genotipo e la dieta hanno influenzato in maniera significativa (P0,05) verso valori più elevati per i soggetti AA alimentati con la dieta M rispetto a quelli con la dieta H. Il pH e il tempo di coagulazione (r) non hanno manifestato differenze tra le diete. In media il gruppo di capre FF alimentate con la dieta H ha presentato un tempo di coagulazione (r) significativamente più elevato (P<0.01) del gruppo alimentato con la dieta L, mentre quello che ha ricevuto la dieta M ha mostrato un valore intermedio e non statisticamente diverso dai primi due. La velocità di formazione del coagulo (k20) è stata maggiore (P<0.01) per il gruppo FF con dieta H rispetto alle diete M e L. Non sono state rilevate differenze per il pH e la consistenza del coagulo (a30). I risultati ottenuti sono da mettere in relazione alla produzione e alla composizione, in termini di proteina e caseina, del latte ottenuto (dati non riportati). Da questa prima indagine è emerso che i parametri indicatori delle proprietà di coagulazione del latte manifestano un comportamento che risente del genotipo animale in funzione della copertura dei fabbisogni, energetici e proteici, realizzata con la dieta. Si potrebbe ipotizzare una gestione dell’alimentazione in funzione del genotipo

EVALUATING THE RISK OF HEPATITIS B REACTIVATION IN PATIENTS WITH HAEMATOLOGICAL MALIGNANCIES: IS THE SERUM HEPATITIS B PROFILE RELIABLE?

Background/Aim: Patients with an occult hepatitis B virus (HBV) infection undergoing deep immunosuppression are potentially at risk of HBV reactivation. In order to assess whether a polymerase chain reaction (PCR) assay for HBV DNA in serum could be used to predict the reactivation of an occult HBV infection, we performed a retrospective study in a cohort of Sicilian patients with oncohaematological diseases. Methods: We studied by a highly sensitive ad hoc nested PCR for serum HBV DNA 75 HBsAg-negative oncohaematological patients requiring chemotherapy. Results: Thirty-three patients (44%) were HBV seronegative (anti-HBc and anti-HBs negative) and 42 patients (56%) were HBV seropositive (anti-HBc and/or anti-HBs positive). Baseline serum HBV DNA was positive in nine out of 33 HBV-seronegative patients and in nine out of 42 HBV-seropositive patients (27.3 vs. 21.4%; P=NS). HBsAg seroconversion was observed in five out of 33 seronegative vs. six out of 42 seropositive patients (15 vs. 14%, P=0.9), and in five out of 18 HBV DNA-positive vs. six out of 57 HBV DNA-negative patients (27.7 vs. 10.6%P=0.11). Hepatitis C virus infection was found in 18 patients (24.3%), although with no correlation to HBV serological status, presence of serum HBV DNA or frequency of HBsAg seroconversion. Conclusions: In oncohaematological patients undergoing chemotherapy, highly sensitive serum HBV DNA testing at baseline has a 28% predictive ability to forecast HBsAg seroconversion in HBV DNA-positive patients, and a 90% ability to forecast persistent HBsAg negativity in HBV DNA-negative patients, a better performance than serological tests