Assessment of genetic structure in Mexican charolais herds using microsatellite markers

Knowledge of livestock genetic diversity is an essential step to respond to commercial demands and reach production objectives in different environments and production systems. The evaluation of animal genetic diversity is achieved by using molecular markers. Microsatellites are the most used markers for studies of this type. Eleven microsatellites were used to evaluate the genetic variation from three populations of Charolais cattle located in northeast Mexico. The studied populations exhibited a high allelic variability with a mean heterozygosity of 0.5. A moderate genetic differentiation between the Charolais populations (FST = 0.079; P < 0.001) was observed. This suggests subdivisions in Charolais breed established in Mexico, due to genetic material origin, reproductive and selective management and local isolation

Información climática asociada a estaciones productivas para el ajuste de modelos estadísticos de sistemas bovinos bajo condiciones extensivas

Artículo de investigación publicado en revista internacional indizada.El objeto de este estudio fue desarrollar una metodología para clasificar épocas de nacimiento (EN) y evaluar su impacto en indicadores productivos al compararlas con un método tradicional de clasificación. Con información meteorológica, se generó un índice de aridez para clasificar las EN. Las EN propuesta y tradicional se compararon, incluyéndolas como grupo contemporáneo (GC= hato, sexo, año y EN) a modelos de evaluación genética de caracteres de peso vivo. Fueron estimados los componentes de varianza y valores genéticos (DEP) con sus exactitudes. La clasifica- ción propuesta explicó mayor variabilidad que la clasificación tradicional (≥9,8%). Los parámetros genéticos mostraron cambios importantes, siendo los más evidentes en peso al destete. Los modelos fueron diferentes de acuerdo a la prueba de razón de verosimilitudes (P<0,01). Se observó una mejora de estructura en los GC. Para los dos caracteres evaluados las correlaciones entre los valores genéticos de los animales fueron diferentes, lo que indica cambio en la jerarquización. Este método de clasificación de EN puede ayudar a mejorar el ajuste de modelos estadísticos en condiciones en las que exista la información climática necesaria para su implementación.Los autores agradecen al Consejo Nacional de Cien- cia y Tecnología por el financiamiento del proyecto CB168207 y al Instituto Politécnico Nacional a través del proyecto SIP20150746

Produção de carne nos trópicos secos de Tamaulipas, México: cruzamento de Bos taurus e Bos indicus

The objective of this study was evaluated the productive performance in Charolais (CH), Simmental (SM) and Braunvieh (BR) sires and Zebu, (ZE), Suiss (SU) x ZE and CH x ZE dams, among birth and weaning calves weights. The environment is dry tropical with summer rains. The livestock grassing in a introducing grasses Star grass (Cynodon nlemfuensis) y Guinea (Panicum maximun). The reproduction was artificial insemination with CH, SM and BR semen and natural insemination with CH sires after insemination. The calves were identificated at birth with the mother number and were weighted in the first 24 ours. The data were analyzed with minimum squares method to determinate, season (SE), calf sex (SX) and dam age (DE). The average for birth weight (BW) was 34.6 kg and only the SE were statistical significant (P &lt; 0.05) for this characteristic. For weaning weight (WW) the mean was 165.7 kg and SE and DE and were statistical significant (P &lt; 0.05). The conclusion is that the environmental effects in this study was more important than genetics effects both BW and WW variables.El objetivo del presente estudio fue evaluar la productividad de toros Charoláis (CH), Simmental (SM) y Pardo Suizo (PS) con vacas Cebú (CE), PS x CE y CH x CE a través del peso al nacimiento y al destete de los becerros. El rancho contaba con praderas de Estrella de África (Cynodon nlemfuensis) y Guinea (Panicum maximun), utilizadas con pastoreo rotacional. La reproducción de las vacas fue a través de inseminación artificial con semen de SM, CH y PS y fueron repasadas por toros CH. Los becerros fueron tatuados en la oreja con el número de la madre y se pesaron en las primeras 24 h después del nacimiento. Los datos fueron analizados por el método de cuadrados mínimos para determinar los efectos de año (AN) y estación de nacimiento (EN), sexo de la cría (SX) y edad de la vaca (EV). La media general para peso al nacimiento fue 34.6 kg, solo los efectos de AN y EN influenciaron (P &lt; 0.05) el peso al nacimiento. El mayor peso se observó en los becerros nacidos en 1994 durante la época de lluvias. Para el caso del PD la media fue de 165.7 kg, los efectos de AN, EN, EV y la correlación de AN x EN fueron estadísticamente significativos (P &lt; 0.05), donde los mayores pesos fueron de los becerros nacidos en el año 1994 durante la época de sequía. Se puede concluir que en este trabajo los factores medioambientales fueron más importantes que los factores genéticos para ambas variables.Resumo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a produtividade de touros Charolês (CH), Simental (SM) e Pardo Suíço (PS) com vacas Zebu (CE), PS x CE e CH x CE através dos pesos ao nascimento e à desmama dos bezerros. A fazenda possuía pastagens African Star (Cynodon nlemfuensis) e Guinea (Panicum maximun), utilizadas com pastejo rotacionado. As vacas foram cruzadas por inseminação artificial com sêmen de SM, CH e PS e foram cruzadas com touros CH. Os bezerros foram tatuados na orelha com o número da mãe e pesados nas primeiras 24 horas após o nascimento. Os dados foram analisados pelo método dos mínimos quadrados para determinar os efeitos da estação de nascimento (EN), sexo do bezerro (SX) e idade da vaca (EV). A média geral para os pesos ao desmame dos bezerros foi de 34,6 kg, apenas os efeitos da EN influenciaram (P &lt; 0,05) o peso ao nascer. Os maiores pesos foram observados nos bezerros nascidos na estação chuvosa. Para PD a média foi de 165,7 kg, os efeitos de EN e EV foram estatisticamente significativos (P &lt; 0,05), onde os maiores pesos foram dos bezerros nascidos na estação seca. Pode-se concluir que neste trabalho os fatores ambientais foram mais importantes que os fatores genéticos para ambas as variáveis

Polimorfismos en genes candidatos a la composición de ácidos grasos y su efecto en carne Wagyu-Cross

Objetivo. Comparar la composición de ácidos grasos (FA) en la carne Wagyu y sus cruzas con Angus, Beefmaster, Brangus y Hereford, y analizar su relación con marcadores genéticos del metabolismo lipídico. Materiales y metodos. Se colectaron 111 muestras de Longissimus dorsi, las cuales se agruparon por grupo genético, se cuantificaron los FA (cromatografía de gases líquidos) y se tipificaron marcadores de ADN asociados teóricamente a FA. Se examinó el equilibrio de Hardy-Weinberg y desequilibrio de ligamiento de los marcadores y se estimó el efecto de las cruzas y el efecto de los genotipos. Resultados. Las cruzas no mostraron diferencias substanciales en la composición de FA con respecto a Wagyu. Nueve SNPs mostraron asociación con la composición de FA, y se encontró un efecto importante en el marcador SLC2A4 ss62538460, el cual influyó sobre SFA, MUFA y MUFA/SFA. Los marcadores, PLTP ss77832104 y IGF2R ss77831885 influyeron sobre C16:0, MYOZ1 ss77832104 sobre C17:1 y PPARGC1A c.1892+19 sobre C18:2. Además, se comprobaron efectos previamente descritos de MEF2C ss38329156 y SCD c.878. Conclusiones. Los presentes resultados representan una de las primeras evidencias sobre la deposición de FA en ganado Wagyu y sus cruzas y propone algunos loci en genes candidatos con posibilidad de implementación en estrategias de mejoramiento asistido

Diversity and effective population size of four horse breeds from micro satellite DNA markers in South-Central Mexico

This study assesses genetic diversity and population structure of Quarter Horse, Azteca, Thoroughbred and Creole horses, frequently used for horse dancing competitions in traditional regional festivities. Since most animals in the studied area are used as breeders, the results support the improvement of management strategies, including periodical assessment of these populations to ensure acceptable population sizes and breed integrity, and documenting genetic flow and reproductive management.The South-Central region of Mexico has experienced a sizeable introduction of purebred horses for recreational aims. A study was designed to assess effective population sizes and genetic diversity and to verify the genetic integrity of four horse breeds. Using a 12-microsatellite panel, Quarter Horse, Azteca, Thoroughbred and Creole (CRL) horses were sampled and analysed for diversity and genetic structure. Genetic diversity parameters showed high numbers of heterozygous horses but small effective population sizes in all breeds. Population structure results suggested some degree of admixture of CRL with the other reference breeds. The highly informative microsatellite panel allowed the verification of diversity in introduced horse populations and the confirmation of small effective population sizes, which suggests a risk for future breed integrity

Épocas de nacimiento basadas en un índice climático para el ajuste de modelos estadísticos para peso vivo de ganado bovino en México

Artículo de investigación científica publicado en revista indizada.El objetivo fue comparar los efectos de una metodología para la clasificación de épocas climáticas, que tradicionalmente son utilizadas para establecer épocas de nacimiento (EN) en estudios y experimentos estadísticos. Esta metodología se basa en un índice de aridez (IA) para clasificar las EN utilizando información meteorológica histórica. Se trabajó una base de datos con un pedigrí de 7,460 animales, se ajustaron dos modelos para peso al nacimiento y peso al destete en bovinos Charolais manejados en pastoreo extensivo. Los modelos incluyeron el efecto fijo de grupo contemporáneo (GC= subclase de hato, sexo, año y EN) y edad de la madre. Los mismos modelos se compararon utilizando una clasificación tradicional de estaciones del año para clasificar las EN. Al estimar los componentes de varianza y valores genéticos (DEP) con sus exactitudes, los modelos fueron diferentes de acuerdo a la prueba de razón de verosimilitudes (P<0.01). El número de GC se redujo en 25 % para la EN basada en el IA, con GC con mayor número de individuos. El principal efecto observado en los modelos analizados fue el cambio en la jerarquización de las DEP para ambas características. Este método de clasificación de épocas de nacimiento, puede ayudar a mejorar el ajuste de modelos estadísticos en los sistemas ganaderos manejados en pastoreo extensivo

Comportamiento productivo de corderas de diferente genotipo bajo un sistema de engorda intensivo

El objetivo fue evaluar el efecto del genotipo de las corderas sobre la finalización en corral en las condiciones del noroeste de la provincia de Corrientes, Argentina. El experimento se realizó en la Estación Experimental Agropecuaria (EEA) del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) Corrientes, Argentina. Se utilizaron 30 corderas [12 = Santa Inés (SI = pelo); 12 cruzadas Dorper x Romney (DR = pelo-lana); y 6 = Criollas (CR = lana)], con un promedio de peso vivo de 20,1 kg, distribuidas en cinco corrales. Las corderas recibieron una dieta basada en 40% expeler de girasol – 60% grano de maíz entero y la fibra fue aportada por heno de zacate Rhodes. Además, tuvieron libre acceso al agua y sal mineral. Se utilizó un diseño completamente al azar donde el genotipo de las corderas fue la variable independiente. Se estudió la ganancia diaria de peso vivo (GDPV), la ganancia total de peso vivo (GTPV), el consumo de alimento diario por corral (CDC) y la conversión alimenticia (CAC) por corral. Los grupos raciales presentaron diferencias significativas (P<0,05) en GDPV, GTPV, CDC y CAC. Las medias generales fueron 0,14 kg.día-1, 9,62 kg, 7,19 kg MS.día-1y 8,62 kg MS.kg carne-1para GDPV, GTPV, CDC y CAC, respectivamente. Se concluye que los genotipos de pelo (SI y DR) fueron más eficientes.The objective was to evaluate the effect of the genotype of lambs on the stockyard finalization in the Northwest of the province of Corrientes, Argentina conditions. The experiment was carried out at the Experimental Station Farming (EEA) of the Institute National Agricultural Technology (INTA) Corrientes, Argentina. Used 30 lambs (Santa Inés = 12; Dorper x Romney = 12; and Creole = 6), with an average live weight of 20,1 kg, distributed in five pens. The lambs received a diet based on 40% expel sunflower -60% whole corn grain and fiber was provided by Rhodes grass hay. In addition, they had water and mineral salt ad libitum. We used a completely randomized design; we studied daily gain of live weight (GDPV), the total gain of live weight (GTPV), daily consumption by pen (CDC) and feed conversion (CAC) for pen. The genotypes were significantly different (P<0,05) in GDPV, GTPV, CDC and CAC. The average general were 0,14 kg.day-1, 9,62 kg, 7,19 kg MS-1and 8,62 kg MS.meat-1kg for GDPV, GTPV, CDC, and CAC, respectively. It is concluded that hair breeds (SI and DR) were more efficient.EEA CorrientesFil: Cardozo, Julio César. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Verdoljak, Juan Jose. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Corrientes; ArgentinaFil: Martínez-González, Juan Carlos. Universidad Autónoma de Tamaulipas. Facultad de Ingeniería y Ciencias; MéxicoFil: Castillo-Rodríguez, Sonia Patricia. Universidad Autónoma de Tamaulipas. Facultad de Ingeniería y Ciencias; MéxicoFil: Hernández-Meléndez, Javier. Universidad Autónoma de Tamaulipas. Facultad de Ingeniería y Ciencias; MéxicoFil: Parra-Bracamonte, Gaspar Manuel. Instituto Politécnico Nacional. Centro de Biotecnología Genómica; Méxic

Milk production of Suiz-Bu, a dual purpose cattle breed in the Mexican tropics

El objetivo del presente trabajo fue determinar el efecto de factores ambientales sobre la producción de leche de vacas Suiz-Bú en las condiciones del trópico mexicano. Se analizaron los registros de producción de leche de 728 vacas con información disponible de los años 2012 al 2014. Las vacas se ordeñaban dos veces al día a partir del quinto día posparto y eran alimentadas bajo condiciones de pastoreo y suplementación con concentrado comercial. Las variables producción de leche a 305 días (PL305) y media de producción diaria (MPD) fueron analizadas con un modelo mixto que incluyó efectos de número de lactancia (NL), año de parto (AP), época de parto (EP) y las interacciones simples. El año de parto fue estadísticamente significativo para PL305 y PMD que aquellas que parieron en época seca (p&lt;0.05), y las vacas de primer parto tuvieron una menor PL305 que vacas con dos o tres lactancias (p&lt;0.05). Asimismo, los efectos de las interacciones fueron significativas (p&lt;0.05).

Inbreeding evidence in a traditional channel catfish ( Ictalurus punctatus ) hatchery in Mexico

Background: Channel catfish are one of the most important aquaculture species raised for food purposes in Mexico. Two temporal samples were obtained from the largest channel catfish breeding hatchery in Mexico to identify changes in genetic diversity and inbreeding that are promoted by traditional hatchery management. Results: The genetic parameter analysis of 11 microsatellite loci showed no significant change in genetic diversity (p &gt; 0.05). However, a significant heterozygosis deficiency was detected (p &lt; 0.001), and genetic structure analysis indicated moderate differentiation between the temporally divided populations (FST = 0.08). A moderate level of inbreeding and a slight increase of the inbreeding coefficient from 0.23 to 0.27 were the result of traditional hatchery practices. To achieve an effective population size, the temporal approach resulted in a limited number of breeders to maintain genetic variability. Conclusions: Although no significant change in genetic diversity parameters was found, the heterozygote deficiency and low effective number of breeders suggest that there is a risk for increased inbreeding. Thus, we propose the need for controlled reproductive management and the establishment of genetic programs in hatcheries. Molecular tools can provide valuable information to facilitate the achievement of these goals