VPRO - um identificador de padrões de seqüências.

bitstream/CNPTIA/11542/1/ct81.pdfAcesso em: 28 maio 2008

Incorporação das propriedades rotâmeros e ocupância em métodos de análise estrutural de proteínas.

Conformação das cadeias laterais (rotâmeros); Dupla ocupância; Java Protein Dossier.bitstream/CNPTIA/9893/1/comuntec34.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Bioelectrical impedance analysis of body composition for the anesthetic induction dose of propofol in older patients

BACKGROUND: Older people are currently the fastest growing segment of the worldwide population. The present study aimed to estimate propofol dose in older patients based on size descriptors measured by bioelectrical impedance analysis (BIA). METHODS: A cross sectional study in adult and older patients with body mass index equal to or lower than 35 kg/m2 was carried out. BIA and Clinical Frail Scale scoring were performed during pre-operative evaluation. Propofol infusion was started at 2000 mg/h until loss of consciousness (LOC) which was defined by "loss of eye-lash reflex" and "loss of response to name calling". Total dose of propofol at LOC was recorded. Propofol plasma concentration was measured using gas chromatography/ion trap-mass spectrometry. RESULTS: Forty patients were enrolled in the study. Total propofol dose required to LOC was lower in Age ≥ 65 group and a higher plasma propofol concentration was measured in this group. 60% of old patients were classified as "apparently vulnerable" or "frail" and narrow phase angle values were associated with increasing vulnerability scores. In the Age ≥ 65 group, the correlation analysis showed that the relationship between propofol dose and total body weight (TBW) scaled by the corresponding phase angle value is stronger than the correlation between propofol dose and TBW or fat free mass (FFM). CONCLUSIONS: This study demonstrates that weight-based reduction of propofol is suitable in older patients; however FFM was not seen to be more effective than TBW to predict the propofol induction dose in these patients. Guiding propofol induction dose according to baseline frailty score should also be considered to estimate individualized dosage profiles. Determination of phase angle value appears to be an easy and reliable tool to assess frailty in older patients.Financial support from the “Fundo para a Investigação e Desenvolvimento do Centro Hospitalar do Porto” is gratefully acknowledge. The medical technology and services company Medtronic™ provided BIS brain monitoring sensors. Fresenius Medical Care Portugal™ made available BCM monitor during the study period. None of the funding sources participated in the design of the study, collection, analysis and interpretation of data, or in writing of the manuscript.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Curvatura da superfície de proteínas no Java Protein Dossier.

Definição de superfície. Cálculo dos valores de curvatura com SurfRace.bitstream/CNPTIA/9897/1/comuntec38.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural.

Instalação e oferta de ferramentas.Computacionais sting millennium suite. (SMS) através da interface web. Criação de novos algoritmos e programas. Para análise estrutural das proteínas. Oferta de banco de dados públicos. Estabelecimento de um ambiente para.Pesquisa e oferta de serviços na área. De bioinformática. Formação de recursos humanos. Organização de cursos e congresso. Projetos em colaboração.bitstream/CNPTIA/9951/1/doc25.pdfAcesso em: 29 maio 2008

Cálculo de área acessível por solvente utilizando SURFV - definição de interface intramolecular pelo SMS.

Definição de superfície acessível por solvente. Cálculo de AS. Utilização de SURFV para cálculo da área da AS e identificação de interface. Discussão e trabalhos futuros.bitstream/CNPTIA/9895/1/comuntec36.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Utilização do software GRASP para gerar arquivo de coordenadas com valores de potencial eletrostático.

Com o intuito de disponibilizar um banco de dados de valores de potencial eletrostático para todas as estruturas de proteínas depositadas no PDB, foi utilizado o programa GRASP (Graphical Representation and Analysis of Structural Properties) (Nicholls et al., 1991) para geração deste banco de dados.bitstream/CNPTIA/9883/1/comuntec24.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Apresentação gráfica de parâmetros protéicos utilizando o Java Protein Dossier.

Parâmetros apresentados pelo JPD. Sequência de resíduos. Contatos. Contatos internos. Contatos na interface. Estrutura secundária. Dupla ocupância. Fator de temperatura. Entropia relativa. Confiabilidade. Acessibilidade de resíduos. Ângulos de torsão. Potencial eletrostático. Curvatura na superfície. Hidrofobicidade. Analisando com maior detalhes os parâmetros apresentados.bitstream/CNPTIA/9899/1/comuntec40.pdfAcesso em: 30 maio 2008

Análise do grau de conservação de resíduos em proteínas com estrutura 3D resolvida utilizando o SMS.

HSSP e entropia relativa. Módulos do SMS para análise de conservação. Discussão e trabalhos futuros.bitstream/CNPTIA/9896/1/comuntec37.pdfAcesso em: 30 maio 2008

An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth.

In this work, we present some results that are indirect evidences of Fibonacci String model fro DNA repetitive sequences growth.X-Meeting 2007