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Seleção de primers RAPD para a caracterização molecular de germoplasma de tucumã-do-amazonas (Astro-caryum tucuma Mart.).
O tucumã-do-amazonas é pal-meira perene, oleaginosa, monocaule e que vem sendo indicada como uma das alternativas de matéria prima ao mercado de biodiesel, mas pouco se conhece sobre essa espécie. Marca-dores RAPD são úteis em análises genéticas de espécies pouco estuda-das. Desta forma, buscou-se selecio-nar primers RAPD polimórficos para a caracterização de germoplasma dessa palmeira. Foram testados 113 primers RAPD em cinco amostras oriundas de Urucará, Amazonas, Brasil. A matriz binária foi utilizada para análises do número ótimo de bandas e dissimilari-dade genética. Foram selecionados 21 primers que amplificaram 102 bandas nítidas e polimórficas e permitiu a se-paração dos genótipos em cinco gru-pos. O número de bandas adequado para a genotipagem foi de 100
Divergência genética entre genótipos de espécies do gênero Astrocaryum baseada em marcadores RAPD.
Quantificou-se a divergência genética entre genótipos de duas espécies do gênero Astrocaryum por marcadores RAPD. Para tanto foram selecionadas ao acaso quinze amostras de DNA total de A. aculeatum, coletadas em Maués, AM, e quinze amostras de A. vulgare, coletadas em Salvaterra, PA e, conservadas no banco de DNA da Embrapa Amazônia Oriental. As 30 amostras foram quantificadas em gel de agarose e, em seguida em reações PCR-RAPD com a utilização de 16 primers selecionados para cada espécie. A contagem dos produtos amplificados foi feita nos primers coincidentes e que geraram polimorfismo nas duas espécies. A matriz binária obtida foi utilizada na quantificação das similaridades genéticas no programa NTSYS utilizando o coeficiente de DICE, sendo agrupadas em dendrograma pelo método UPGMA. Cinco primers foram coincidentes entre as espécies e amplificaram 58 bandas, com média de 11,6 bandas por primer, sendo 100% polimórficas. As similaridades variaram de 0, 216 a 0, 964 com média de 0,61 demonstrando boa divergência entre os pares de genótipos. O dendograma separou dois grupos com vários subgrupos, de alta confiabilidade (r = 0,82). Os genótipos das espécies de Astrocaryum analisados apresentam considerável divergência dentro das espécies
Similaridade genética entre indivíduos de açaizeiro (Euterpe oleracea Mart.) de uma população de São Sebastião da Boa Vista, PA por marcadores RAPD.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar a similaridade genética entre indivíduos de açaizeiro de uma população de São Sebastião da Boa Vista, PA por marcadores RAPD. Foram extraídos DNA's de 25 indivíduos para a aplicação 22 primers. Após a eletroforese, os géis foram fotografados. Foi construída a matriz binária com fragmentos amplificados. Foi estimado o número ótimo de bandas polimórficas e gerado o dendrograma pelo método UPGMA utilizando o coeficiente Jaccard. Foram amplificadas 108 bandas polimórficas. O número ideal de bandas pode ser considerado a partir de 90 bandas. A similaridade genética média entre os indivíduos foi de 50% (Sgm= 0,50), possibilitando a formação de quatro grupos. Quatro indivíduos tiveram alta similaridade (cima de 80%). Os indivíduos da população estudada, mesmo sob a ação antrópica, ainda apresentem consideráveis níveis de variação
Variabilidade genética em germoplasma de tucumã-do-pará procedente de Salvaterra, PA por marcadores RAPD.
Quantificou-se a variabilidade genética entre germoplasma de tucumã-do-pará (A. vulgare Mart.) procedente de Salvaterra, PA por marcadores RAPD. Para tanto foram selecionadas ao acaso quinze amostras de DNA total das 30 coletadas em Salvaterra, PA e conservadas no banco de DNA da Embrapa Amazônia Oriental. As amostras foram quantificadas em gel de agarose e diluídas para serem utilizadas em reações PCR-RAPD com 16 primers selecionados para a espécie. Os produtos amplificados foram usados na formação da matriz binária para o cálculo das estimativas das similaridades genéticas pelo coeficiente de Jaccard e agrupadas em dendrograma pelo método UPGMA. Foram amplificadas 105 bandas, sendo 89,52% polimórficas e com média de 6,56 bandas por primer. As similaridades variaram de 0,34 a 0,82, demonstrando ampla variabilidade genética entre o germoplasma avaliado, com média de 0,57. O dendrograma permitiu a formação de três grupos com vários subgrupos de alta confiabilidade (r =0.87). Assim, considera se que o germoplasma de tucumã-do-pará analisado seja detentor de ampla variabilidade, a qual pode ser explorada em programas de melhoramento dessa palmeira
Variabilidade e divergência genética entre genótipos de tucumanzeiro-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.) promissores para a produção de frutos por marcadores rapd.
O objetivo deste trabalho foi estimar a variabilidade e a divergência genética entre genótipos de tucumanzeiro-do-pará promissores para a produção de frutos por marcadores de RAPD. Foram coletadas amostras de folhas de 29 plantas-matrizes selecionadas no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, com base na produção de frutos por planta, mas com pronunciadas variações para outras características. As amostras de DNA foram amplificadas por 24 iniciadores RAPD e analisadas por três métodos multivariados, usando a matriz de dissimilaridades genéticas obtidas pelo complemento aritmético do coeficiente de Jaccard. Foram gerados 332 marcadores moleculares que expressaram 98,5% de polimorfismo. Os marcadores RAPD apresentaram poder de discriminação eficiente entre os 29 genótipos avaliados, constatando-se distância genética média entre os genótipos de 51,7%, variando entre 26,9% e 71,5%. A maior média de distância ocorreu entre o genótipo 22 e os demais, com 66,8%. Os genótipos formaram oito e quinze grupos distintos, possivelmente grupos heteróticos, pelos métodos de agrupamentos UPGMA e Tocher, respectivamente. As análises das coordenadas principais confirmaram a alta variabilidade entre os genótipos. Os marcadores moleculares utilizados permitiram a identificação de ampla variabilidade e forte divergência genética entre os genótipos com ausência de duplicatas, o que possibilita a indicação desses materiais para compor programa de melhoramento genético para a produção de frutos
Seleção de marcadores RAPD para análise genética em germoplasma de tucumã-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.).
O tucumã-do-pará é palmeira perene, oleaginosa, de caule múltiplo, indicada como uma das alternativas de matéria prima ao mercado de biodiesel. Marcadores RAPD são úteis em análises genéticas de espécies pouco estudadas, como o tucumã. O objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores RAPD polimórficos para análises genéticas dessa palmeira. Foram testados 116 primers RAPD em cinco genótipos do Banco de Germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, Belém-PA. Foram selecionados 24 primers que amplificaram bandas nítidas e polimórficas. A matriz binária foi gerada para análises do número ótimo de bandas, pelo método bootstrap e da similaridade genética. O número de bandas adequado para a genotipagem foi de 130. Logo, os 24 marcadores são úteis para expressar a variabilidade e a divergência genética em germoplasma dessa espécie
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