Comprehensive characterization of Mycobacterium tuberculosis strains after acquisition of isoniazid resistance

Includes bibliographical references.2016 Fall.Despite the global efforts to reduce tuberculosis (TB) rates, the emergence of drug resistant TB has not allowed effective control of this disease. In the last decade, there were roughly 10 million new TB cases per year and isoniazid resistant (INHr) TB accounted for 9.5% of these cases around the world. In 2012, United States had an interruption in the supply of isoniazid (INH), which increased the likelihood of INH resistance rates. Although INH resistance in Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is multigenic, mutations in the catalase-peroxidase (katG) gene predominate amongst INHr Mtb strains. The characterization of the Mtb proteome before and after acquiring INH resistance remains understudied. Additionally, the effect of these drug-resistance-conferring mutations on Mtb fitness and virulence is variable. The purpose of this work is to describe a complete biochemical and immunological characterization of the INHr acquisition in Mtb. In this way, a global exploration of the protein and mycolic acids differences in Mtb cultures, as well as differences in the immune response and bacterial virulence in the mouse model comparing clonal susceptible and INHr pairs of Mtb were evaluated. After this, common trends were analyzed and the findings were interpreted in the context of bacterial metabolism and host-interaction. For this work, two clonal clinical Mtb strains and one laboratory clonal pair of the H37Rv strain with different susceptibility profiles to INH were studied. The H37Rv INHr strain was isolated from a mouse that was exposed to INH in the lab and developed the same katG mutation that one of the clinical INHr strain has (V1A). In all cases, the first strain was susceptible to all tested drugs (mostly known as the INHs strain in this dissertation) while the second strain was resistant only to INH (named INHr throughout this work). The clinical pairs were confirmed as clonal pairs of the Beijing and T genotype respectively by spoligotyping and restriction fragment polymorphism analysis that uses the patterns given by the distribution of the insertion sequence (IS)-6110. Previous whole genome sequencing analysis of the clinical clonal pairs showed a katG mutation and the presence of some additional non-synonymous polymorphisms in the INHr strains. After the proteomic analysis, a katG PCR sequencing confirmed two mutations in katG for the T INHr pair (V1A and E3V) while the L101R mutation previously identified for the Beijing INHr was not confirmed. This mutation was highly unstable and the Beijing INHr might have reversed its phenotype after the absence of INH during in vitro growth. Therefore, the analysis with the Beijing clonal pair is only presented in chapter II. Protein comparison of secreted and cellular fractions (membrane, cytosol and cell wall) between clinical and lab clonal pairs of Mtb before and after acquisition of INH resistance revealed at least 25 commonly altered proteins looking at the same cellular fractions. These proteins were involved in ATP synthase machinery, lipid metabolism, regulatory events, virulence, detoxification and adaptation processes. Western blot analysis supported some of our findings, particularly the lower level of bacterial enzyme KatG in the INHr strains. Mycolic acid (MA) analysis in these clonal pairs did not reveal a common trend in these molecules for INHr strains but generated supporting information about an alternative fatty acid biosynthetic pathway in the clinical INHr strain. These analyses are further described in chapter III. Additionally, differences in bacterial growth, immune response and pathology induced by Mtb strains harboring mutations at the N-terminus of KatG were evaluated in the C57BL/6 mouse model. The results in the mouse study support the idea of the individual effect of specific located mutations in the katG gene together with the associated changes in the bacterial proteome induce differences in the Mtb virulence and pathogenicity. In addition, the in vivo results also suggest the contribution of innate immune response via TLR-2 in the clearance of the INHr-attenuated Mtb strains. Further details of this work are described in chapter IV. This work provides a better understanding of new compensatory mechanisms in Mtb after INH resistance acquisition providing novel information that could be used to address alternative combined therapies as well as the identification of new drug targets in INHr strains. The results presented here also contribute to the generation of new hypothesis regarding RNA decay in Mtb and the need to evaluate if the observed biochemical differences are also associated with the bacterial exposure to the first line drug therapy that occurred in the patient. After the results obtained in this study, a subsequent biochemical analysis of Mtb strains obtained from patients before and after drug treatment is proposed to improve the description of the evolution of the acquired drug resistant phenomena observed in TB cases that limit the global disease control and hence its eradication (chapter V)

En torno a una octava hernandiana de Perito de lunas

This work pretends to offer a ned discodification of the eighth verse, number XLI of the hernandian poetry of Perito en Lwws. Although it has bccn studied by othcr researchers, it slill raises many qucstions. This brief poetic composition is a good example of the complexity and difliculty that Perito en Lunas encloses and of the use that Miguel Hcrnández made of the gongorian codex

Propuesta para el diseño del plan de recuperación de desastres. Caso Unidad Administrativa de Catastro Distrital UAECD

Software inteligente y convergencia tecnológicaEste proyecto tiene como objetivo principal la elaboración de la propuesta para el diseño del plan de recuperación ante desastres DRP, de la Unidad Administrativa Especial de Catastro Distrital UAECD, esto debido a la gran cantidad de riesgos a los que está expuesta una organización y al cambio de infraestructura tecnológica que vivió la UAECD. Se centró principalmente en la identificación de activos que conforman el DRP, el equipo de trabajo con sus roles y responsabilidades, el análisis de riesgos y de impacto al negocio, efectuado a los procesos críticos contemplados dentro del DRP y las estrategias que permitan la recuperación de niveles de servicios y la continuidad del negocio.INTRODUCCIÓN 1. GENERALIDADES 2. MARCOS DE REFERENCIA 3. DESARROLLO DE LOS OBJETIVOS ESPECÍFICOS DEL PROYECTO 4. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES BIBLIOGRAFÍA ANEXOSEspecializaciónEspecialista en Seguridad de la Informació

Caracterización de agua cruda y tratada para el proceso de fabricación de H2SO4 en la empresa Industrias Básicas de Caldas

El agua es el compuesto más común en la superficie de la tierra, hace parte de lo que se conoce como hidrosfera ocupando las dos terceras partes del globo terráqueo. Su volumen se estima en 1370 millones de Km. cúbicos distribuidos en su mayor parte en el agua de mar, la cantidad restante en los ríos, lagos, aguas subterráneas, en la atmosfera y el volumen de agua fresca que representa el hielo de los polos. La fuente original del agua es la lluvia, aunque su composición es variable, tiene elementos en común representados básicamente por bicarbonatos, carbonatos, cloruros, sulfatos, nitratos de calcio y magnesio, también pueden estar presentes otros metales como hierro, manganeso y silicio, además contiene gases disueltos (CO2 y O2) y cuerpos en suspensión de origen orgánico e inorgánico. Es indispensable conocer algunas de las propiedades del agua como son: · Estructura física: solido, liquido, gaseoso · Formula molecular: H2O · Peso molecular: 18 g/mol · Densidad: 0,99828 g/L (a 20 grados centígrados) · Calor especifico: 0,9986 cal/g (a 35 grados centígrados) · Punto de ebullición: 98 grados centígrados · Índice de refracción: 1,333 El agua es la sustancia imprescindible para todos los seres vivos, es vector de vida y actividad humana. Para el hombre las necesidades del agua y energía son indiscutibles, por ello se idearon diferentes sistemas de aprovechamiento y tratamiento de las aguas, tanto en su aspecto energético como bajo el punto de vista de su uso (consumo humano, agricultura, transporte, industria, etc). El tratamiento de aguas industriales ha adquirido una creciente importancia porvarias razones. En primer lugar la demanda de calidad en nuevas y también 7 antiguas aplicaciones (industria electrónica, industria farmacéutica, generación de vapor, etc.) ha ido en aumento, exigiendo tratamientos más completos. En segundo, lugar la calidad de varios suministros ha ido empeorando con el paso del tiempo. En tercer lugar la presión creciente de la legislación en cuestiones del medio ambiente obliga a replantear procesos industriales disminuyendo los consumos de agua, analizando las posibilidades de recuperación de agua y tratando las aguas residuales contaminadas antes de su vertido

The Physiology of Mycobacterium tuberculosis in the Context of Drug Resistance: A System Biology Perspective

Tuberculosis (TB), a disease caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb), is the main cause of death due to an infectious disease. After more than 100 years of the discovery of Mtb, clinicians still face difficulties finding an effective treatment for the increasing number of drug-resistant cases. The difficulties in the clinical setting can be related to the slow pace at which the understanding of the physiology of this bacterium has occurred. Mtb is distinct from other microorganisms not only due to its slow growth and difficulties to study in the laboratory, but also due to its inherent physiology such as its complex cell envelope and its metabolic pathways. Understanding the physiology of drug susceptible and resistant Mtb strains is crucial for the design of an effective chemotherapy against TB. This chapter will review the mycobacterial cell envelope and major physiological pathways together with recent discoveries in Mtb drug resistance through different “omics” disciplines

La evaluación de la calidad docente en el nuevo marco del EEES : un estudio sobre la encuesta de opinión del Programa DOCENTIA-ANDALUCÍA

La adaptación de los Títulos al nuevo marco del Espacio Europeo de Educación Superior (EEES) requiere la optimización de la calidad de las actividades desarrolladas por el profesorado. La evaluación de la actividad docente se convierte así en un pilar fundamental en el ámbito de los nuevos Sistemas de Garantía de Calidad (SGC). Por ello, y en este contexto de cambios, la necesidad de emprender la evaluación de la labor docente de forma integral constituye una de las demandas más urgentes para las universidades españolas. A pesar de la importancia de contextualizar la evaluación, la utilización de indicadores específicos permite detectar problemáticas educativas e implementar medidas de mejora continua. Asimismo, posibilita el uso de un lenguaje común entre instituciones académicas, fortaleciéndose el sentido de la evaluación de la labor docente como sistema integral de calidad. En este sentido, el mantenimiento de indicadores depende de la implantación de procedimientos validados por la comunidad universitaria. Un ejemplo de ello es el uso de herramientas fiables como la Encuesta de Opinión de los Estudiantes sobre la Labor Docente del Profesorado Universitario, originaria del programa DOCENTIA-ANDALUCIA, y que representa una muestra de la utilidad de este tipo de instrumentos. El estudio que se presenta se enmarca en las nuevas formas de docencia universitaria y supone un cambio en la concepción de la evaluación docente._________________________________________Adjustment of Degrees to the new framework of the European Space for Higher Education needs optimization of the quality of the activities developed by the teaching staff. So, the assessment of the teaching activity becomes a mainstay in the field of new Quality Assurance Systems. In this context of changes, the need to undertake an integral evaluation of the academic job represents one of the most urgent demands for the Spanish universities. In spite of importance of the context of evaluation, utilization of specific indicators allows to detect educational problems and to implement measures of constant improvement. Likewise, it makes possible the use of a common language among academic institutions and it strengthens the sense of evaluation of the teaching labour as integral system of quality. In this respect, maintenance of indicators depends on implementation of validated procedures by the university community. An example of it is the use of trustworthy tools such as the Opinion polls of the Students about Teaching Activity of University Professor. This survey comes from program DOCENTIA-ANDALUCIA and it represents a sample of utility of this type of instruments. The study presented places in the new forms of university teaching and it means a change in the conception of the academic/educational/teaching process evaluation

Return premiums of sustainable companies listed on the Spanish stock market

The purpose of this paper is to analyze whether companies with a greater commitment to corporate social responsibility (SRI companies) perform differently on the stock market compared to companies that disregard SRI. Over recent years, this relationship has been taken up at both a theoretical and practical level, and has led to extensive scientific research of an empirical nature involving the examination of the relationships existing between the financial and social, environmental and corporate governance performance of a company and the relationship between SRI and investment decisions in the financial market. More specifically, this work provides empirical evidence for the Spanish market as to whether or not belonging to a group of companies the market classes as sustainable results in return premiums that set them apart from companies classed as conventional, and finds no differences in the stock market performance of companies considered to be SRI or conventional

La improcedencia de cuestionar el laudo por vicios de fondo en Colombia

The purpose of this article is to analyze the scope of the seventh cause of appeal for annulment of the arbitration award and the limits established to the tutelage action against this decision to determine whether they allow Colombian judges to analyze substantive issues of the arbitration award, given its frequent use in practice for these purposes. Likewise, it is intended to critically study the relevance, necessity, and convenience of the legislative establishment of grounds for annulment that allows the parties and Colombian judges to interfere in substantive matters of the arbitral award.El presente artículo tiene como finalidad analizar el alcance de la causal séptima de procedencia del recurso de anulación del laudo arbitral y los límites establecidos a la acción de tutela en contra de este fallo, con el propósito de determinar si permiten al juez colombiano analizar asuntos de fondo del laudo arbitral, habida cuenta de su frecuente utilización en la práctica con estos fines. Así mismo, se pretende estudiar de forma crítica la pertinencia, necesidad y conveniencia de la consagración legislativa de una causal de anulación que permita a las partes y al juez colombiano inmiscuirse en asuntos sustanciales del laudo arbitral

Revisitando el modelo de Markowitz: modelos de optimización y aplicaciones

Hace ya 70 años que Markowitz (1952) propuso el modelo tradicional y clásico de selección de carteras de inversión, el Modelo Media Varianza (MV). Parte de la hipótesis del comportamiento del inversor racional que pretende maximizar la rentabilidad de su cartera al íınimo riesgo. El problema de optimización de Markowitz determina para una cartera de N activos (n = 1, . . . ,N), los pesos óptimos de los activos en cartera w1, . . . ,wN (ΣN n=1wn = 1), utilizando como inputs la rentabilidad estimada con la esperanza matemática (μn) de la serie temporal de precios de los activos, y el riesgo con su varianza (σnm) y covarianza (σnm). Se construye la frontera eficiente formada por la combinación de todas aquellas carteras que consiguen la máxima rentabilidad con el mínimo riesgo. El inversor selecciona una cartera dentro de la frontera eficiente según su perfil de riesgo (λ). El Modelo Media Varianza es el paradigma teórico de todo el desarrollo de la Teoría de Carteras moderna pero sufre una serie de limitaciones prácticas que han permitido generar un universo de investigación sobre el mismo. A continuación, se detallan las principales limitaciones detectadas: • Los estimadores de los dos parámetros del modelo están en diferentes unidades. La rentabilidad está estimada en unidades con la esperanza matemática (μn), mientras que el riesgo está estimado en unidades al cuadrado, (σnm). Por tanto, los resultados obtenidos como inputs del problema están en diferentes escalas generando soluciones ´optimas diferentes a las deseadas. • Existe una gran sensibilidad de los pesos de los activos en cartera (w1, . . . ,wN) ante pequeños cambios en las estimaciones de rentabilidad y riesgo. Como consecuencia, las carteras no son estables en el largo plazo y cambian su composición con facilidad ante cambios en las estimaciones. Esta limitación no es más que una confirmación del problema anterior, y es que los estimadores de rentabilidad y riesgo parecen no ser los adecuados para una correcta resolución del problema de optimización. • Las carteras generadas con el Modelo Media Varianza (MV) están muy concentradas en pocos activos de gran rentabilidad, provocando que las carteras no estén diversificadas. Está comúnmente aceptado que la diversificación de las carteras mejora su rendimiento en el largo plazo. Al estar distribuido el riesgo entre diferentes activos, la cartera no es tan sensible ante cambios de rentabilidad inesperados de los mismos. • Gran rigidez del modelo al establecer a priori las ponderaciones de los dos objetivos en la función de optimización a través del hiperparámetro de aversión al riesgo (λ). Diferentes valores del hiperparámetro λ generan diferentes soluciones óptimas del problema. Por este motivo es muy importante que estos estén bien fijados. Adicionalmente, en el mundo académico se entiende que el valor de este hiperparámetro define la aversión al riesgo del inversor. Lógicamente, para ponderar el riesgo en la función objetivo, inversores más arriesgados darán un valor más bajo a este hiperparámetro pero inversores más conservadores darán un valor más alto. Desde 1952, cuando Markowitz propuso el Modelo Media Varianza; se han desarrollado en la investigación varias alternativas a este, se han propuesto nuevos estimadores de rentabilidad y riesgo, y se han introducido nuevos objetivos al problema. Todas estas aportaciones han tenido el objetivo común de mejorar los resultados empíricos o prácticos del Modelo Media Varianza. En esta tesis por compendio, se realizan varias aportaciones científicas que tienen por objetivo común contribuir a la mejora del Modelo Media Varianza. Seguidamente, se exponen dichas aportaciones estrechamente relacionadas con cada una de las limitaciones detectadas en dicho modelo: • Con el propósito de superar las dos primeras deficiencias del modelo expuestas anteriormente, se propone el Modelo Media Cuadrado Varianza o Mean Squared Variance (MSV), que iguala las unidades de los estimadores de ambos parámetros elevando al cuadrado la esperanza matemática (ΣNn=1wnμn) para la rentabilidad. Está formulado igual que el Modelo Media Varianza salvo en el estimador de rentabilidad. Es un problema cuadrático no convexo y para resolverlo es necesario reformularlo a través de un programa lineal entero mixto o Mixed-Integer Linear Programming (MILP) (Xia et al., 2020). Se pretende homogeneizar las unidades de los inputs del problema para obtener mejores resultados que en el modelo tradicional de Markowitz . • Para superar la limitación de concentración de carteras del Modelo Media Varianza (MV), se han propuesto diversos y recientes Modelos de Diversificación, que introducen este tercer objetivo en el problema de optimización. En esta tesis se ha realizado una revisión del estado del arte que tiene como resultado una categorización y clasificación de todos los Modelos de Diversificación existentes en la literatura. Con ello, se pretende que se desarrolle con éxito la inclusión de la diversificación como tercer objetivo y que sirva de síntesis de todo lo que se ha estudiado en la Teoría de Carteras Moderna. Se han categorizado en tres enfoques principales; los Enfoques de Ponderación Igualitaria, el Enfoques de Control de los Límites Superiores e Inferiores y el Enfoque de la Función de Costes. El primero se caracteriza por repartir a partes iguales la inversión inicial entre los activos o su riesgo. El segundo por introducir restricciones en el problema de optimización que limitan la inversión por cada activo o clase de activos. Y el tercero por incluir la diversificación en la función objetivo del problema de optimización. Adicionalmente, se desconoce científicamente en qué escenarios los Modelos de Diversificación son capaces de superar los resultados obtenidos por el Modelo Media Varianza (MV). Por tanto, en esta tesis de han realizado dos estudios comparativos con catorce estrategias de inversión, que incluyen Modelos de Media Varianza y Modelos de Diversificación, en treinta y cuatro bases de datos diferentes, durante periodos de estabilidad e inestabilidad financiera (COVID-19). • Se ha identificado que, tanto el Modelo Media Varianza como los Modelos de Diversificación, incluyen en sus respectivos problemas de optimización hiperparámetros de riesgo (λ) y diversificación (δ), que se fijan a priori definiendo el perfil de riesgo del inversor. En esta tesis se presenta un procedimiento de optimización Bayesiano de los hiperparámetros que selecciona los valores óptimos de cada uno de ellos en base a los rendimientos globales de la cartera. Es un algoritmo que actúa como una caja negra, probando a ciegas valores de los hiperparámetros y calculando sus soluciones óptimas. Con la evaluación continúa de los resultados obtenidos se va acercando cada vez más al valor óptimo del parámetro. La expectativa que este procedimiento de optimización de los hiperparámetros sirva para que los modelos se adapten mejor al perfil de riesgo de los activos susceptibles de formar parte de la cartera óptima, y no sólo al perfil de riesgo del inversor. Es fundamental que cada inversor seleccione la cartera que incluya activos adaptados a su perfil de riesgo. Si esto fuera posible, la optimización de los hiperparámetros no sólo serviría para flexibilizar el Modelo Media Varianza, si no también para identificar el perfil de riesgo ´optimo del inversor para cada base de datos de activos. En resumen, el Modelo Media Varianza es el paradigma teórico de la selección de carteras de inversión pero debido a sus limitaciones no ha sido muy utilizado en el mundo práctico. Con objeto de mejorar estas limitaciones, en esta tesis por compendio se realizan las siguientes aportaciones: se propone una alternativa al Modelo Media Varianza, el Modelo media cuadrado Varianza que unifica las unidades de sus estimadores, se realiza una categorización de los Modelos de Diversificación y se estudian los escenarios en los que opera mejor que el Modelo Media Varianza, y por último, se presenta y aplica un procedimiento de optimización bayesiano para la selección de los hiperparámetros incluidos en ambos tipos de modelos

Diseño y elaboración de tres manuales de buenas prácticas de manufactura para empresas productoras de cacao dentro del marco de los proyectos de cooperación de la Organización de Naciones Unidas (ONU) para Colombia

Microbiólogo (a) IndustrialPregrad