Catalogue illustré des images d’un set d'apprentissage réalisé à l'aide de l’outil FlowCAM – ZooPhytoImage utilisé dans le cadre du REPHY. Images issues de numérisations de phytoplancton au grossissement 4X, d'échantillons d'eau, pour le set d’apprentissage global Manche-Atlantique

). L’ordre de présentation des classes intégrées au set correspond à l’ordre d’apparition de ces classes dans l’outil ZooPhytoImage, qui correspond à l’ordre des classes dans l’arborescence des répertoires contenant les vignettes

Observation et dénombrement du phytoplancton marin par microscopie optique photonique - Spécifications techniques et méthodologiques appliquées au REPHY. Document de méthode.

Cette nouvelle version remanie et s'inspire du document de référence d'origine dont certains paragraphes sont repris intégralement. Elle précise les méthodes appliquées dans le cadre du REPHY. Des précisions au sujet du matériel, de la métrologie et des consignes de sécurité sont ajoutées, ainsi que des informations concernant les limites pour les identifications. Le texte en bleu matérialise les ajouts ou modifications par rapport au document d'origine. Ce manuel vise à décrire les protocoles usuellement appliqués par les équipes de l'Ifremer dans le cadre du Réseau d'observation et de surveillance du Phytoplancton et des Phycotoxines (REPHY), pour l'estimation de l'abondance et de la composition taxinomique du phytoplancton marin, en nombre de cellule par litre, dans un échantillon d'eau fixée au lugol, à l'aide d'un microscope inversé et de chambres de sédimentation. Les résultats de ces analyses attendus dans le cadre des objectifs du REPHY cités en introduction sont bancarisés dans la base de données Quadrige. Les protocoles appliqués s'inspirent des lignes directrices de la norme NF EN 15204 fondée sur la technique de sédimentation classique telle que définie par Utermöhl en 1958. La méthodologie décrite dans ce document n'interdit pas l'application d'autres recommandations inscrites dans la norme NF EN 15204. Ce manuel ne concerne pas : la collecte d'échantillon sur le terrain, l'analyse du picoplancton, l'analyse quantitative d'amas flottant de cyanobactéries, ni l'estimation de biovolume. Les recommandations inscrites dans ce manuel visent à optimiser la durée d'une analyse tout en conservant un bon niveau de qualité du résultat. L'incertitude qualitative relative à l'erreur d'identification est réduite au maximum en n'identifiant pas un taxon à un niveau de précision supérieur à celui maîtrisé par l'analyste, ou en sollicitant l'avis d'un expert cité dans ce document. Toutefois, distinguer certaines espèces pose d'énormes difficultés. Afin de conserver un maximum d'information sur la morphologie caractéristique de l'objet algal observé, dans certains cas, il est conseillé de saisir le résultat sur un nom d'espèce qui représente le groupe ou complexe de cette espèce (voir exemples en ANNEXE III). L'incertitude quantitative concerne le résultat de dénombrement de chaque taxon et est évaluée, selon l'0), en fonction du nombre de cellules observées. Les éléments nécessaires à l'évaluation de l'incertitude sont tracés et conservés par le laboratoire analyste. La validation des résultats repose sur le système qualité du laboratoire incluant la traçabilité, la métrologie, la participation à des essais d'inter-comparaisons intra et inter laboratoires

Lieux et périodes à risque 2023 pour les toxines lipophiles. Complément aux prescriptions REPHYTOX

Ce document met à jour le modèle en annexe de la PROCEDURE NATIONALE DE LA SURVEILLANCE SANITAIRE DES PHYCOTOXINES REGLEMENTEES DANS LES ZONES DE PRODUCTION DE COQUILLAGES – Prescriptions du REPHYTOX – Version en vigueur. https://doi.org/10.13155/56600 Il définit les lieux et les périodes à risque concernant les toxines lipohiles produites par les Dinophysis et pouvant être accumulées par les coquillages. Sur ces lieux, en période à risque, le suivi hebdomadaire systématique est mis en oeuvre

Lieux et périodes à risque 2022 pour les toxines lipophiles. Complément aux prescriptions REPHYTOX

Ce document met à jour le modèle en annexe de la PROCEDURE NATIONALE DE LA SURVEILLANCE SANITAIRE DES PHYCOTOXINES REGLEMENTEES DANS LES ZONES DE PRODUCTION DE COQUILLAGES – Prescriptions du REPHYTOX – Version en vigueur. https://doi.org/10.13155/56600 Il définit les lieux et les périodes à risque concernant les toxines lipohiles produites par les Dinophysis et pouvant être accumulées par les coquillages. Sur ces lieux, en période à risque, le suivi hebdomadaire systématique est mis en oeuvre

Quadrige² : Manuel de saisie pour les programmes REPHY et REPHYTOX. Version 4

Ce manuel implique tous les services (Ifremer et externes) chargés de la bancarisation des données acquises dans le cadre des programmes REPHY, REPHYTOX dans la base Quadrige². Cette version 4 de juin 2020 remplace la version 3-1 de septembre 2017

Observation et dénombrement du phytoplancton marin par microscopie optique. Spécifications techniques et méthodologiques appliquées au REPHY.

Ce manuel vise à décrire les protocoles usuellement appliqués par les équipes de l'Ifremer dans le cadre du Réseau d'Observation et de Surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie dans les eaux littorales (REPHY), pour l'estimation de l'abondance et de la composition taxinomique du phytoplancton marin, en nombre de cellule par litre, dans un échantillon d'eau fixée au lugol, à l'aide d'un microscope inversé. Les résultats de ces analyses attendus dans le cadre des objectifs du REPHY cités en introduction sont bancarisés dans la base de données Quadrige. Les protocoles appliqués s'inspirent des lignes directrices de la norme NF EN 15204 fondée sur la technique de sédimentation classique telle que définie par Utermöhl en 1958. Cette nouvelle version apporte en particulier des précisions sur les taxons toxiques ou nuisibles cibles en France et sur les contrôles qualité internes à mettre en oeuvre pour garantir la qualité des résultats d'analyses

Lieux et périodes à risque 2021 pour les toxines lipophiles. Complément aux prescriptions REPHYTOX.

Ce document complète la PROCEDURE NATIONALE DE LA SURVEILLANCE SANITAIRE DES PHYCOTOXINES REGLEMENTEES DANS LES ZONES DE PRODUCTION DE COQUILLAGES – Prescriptions du REPHYTOX – Version en vigueur. https://doi.org/10.13155/56600. Il définit les lieux et les périodes à risque concernant les toxines lipohiles produites par les Dinophysis et pouvant être accumulées par les coquillages pour l'année 2021. Sur ces lieux, en période à risque, le suivi hebdomadaire systématique des toxines lipophiles est mis en oeuvre

Bilan des résultats du dispositif de vigilance pour les phycotoxines lipophiles - Année 2015

L’Ifremer est chargé d’apporter à l’État et aux autres personnes morales de droit public son concours pour l’exercice de leurs responsabilités notamment pour le contrôle de la qualité des produits de la mer et du milieu marin. La mise en œuvre d’un Réseau d'Observation et de Surveillance du Phytoplancton et des Phycotoxines (REPHY) depuis sa création en 1984, répond à cette mission et le concours apporté à l’Administration Centrale se concrétise en un soutien aux autorités publiques dont la Direction Générale de l’Alimentation (DGAL) du Ministère de l’Agriculture, de l’Agroalimentaire et de la Forêt (MAAF), pour ce qui concerne l’application de la réglementation relative au suivi de la salubrité des zones de production de coquillages. Un changement majeur dans la stratégie de surveillance réglementaire des toxines lipophiles est intervenu au 1er janvier 2010, avec le remplacement du bio-essai sur souris par une analyse chimique en CL-SM/SM. Afin de mettre en évidence d’éventuelles substances toxiques non détectables via l'analyse chimique des toxines lipophiles répertoriées, la surveillance réglementaire a été complété à la même date par un dispositif de vigilance basé sur un réseau de lieux de prélèvement (points de vigilance), sur lesquels une stratégie d'échantillonnage spécifique est appliquée, avec prélèvements mensuels systématiques de mollusques qui font l’objet à la fois d’une analyse chimique des toxines lipophiles en CL-SM/SM et d’un test sur souris. Suite à la mise en place de ce dispositif de vigilance en 2010, certaines évolutions ont été appliquées les années suivantes. Ce rapport présente les évolutions apportées au dispositif, les résultats obtenus en 2015 et les évolutions proposées pour 2016