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Correlación de prueba de antígeno de histoplasma en orina y recuento de linfocitos T CD4+ en pacientes adultos positivos para VIH
Objective: To correlate the urine histoplasma antigen test with the CD4+ T lymphocyte count in HIV-positive adult patients. Methodology: Retrospective analytical cross-sectional study. The clinical and demographic characteristics were described through frequencies and percentages. The Chi-square test with 95% CI was calculated to establish the association between the CD4+ T lymphocyte count and the positivity of histoplasma antigen test in urine. Results: The positivity of the test was 4.3% (21/490), 12 were newly diagnosed for HIV and 9 were abandoning antiretroviral treatment; Of the 21 positive patients, 71.4% were male, 90.5% had a CD4+ T-lymphocyte count less than 100 cells/µL. 42.9% also presented at least one AIDS-defining disease, the most frequent being Pneumocystis Jiroveci pneumonia. Conclusion: It is important to perform the urine histoplasma antigen test in all patients recently diagnosed with HIV and in patients who have resumed their HIV follow-up after stopping antiretroviral treatment, who have a CD4+ T lymphocyte count less than 100 cells/ µL; and regardless of the count of these cells, in the presence of clinical suspicion.Objetivo: Correlacionar la prueba de antígeno de histoplasma en orina con el recuento de linfocitos T CD4+, en pacientes adultos VIH positivo. Metodología: Estudio transversal, analítico, retrospectivo. Las características clínicas y demográficas se describieron a través de frecuencias y porcentajes. Se calculó la prueba Chi cuadrado con IC 95% para establecer la asociación entre el recuento de linfocitos T CD4+ y positividad de prueba de antígeno de histoplasma en orina. Resultados: La positividad de la prueba fue de 4.3% (21/490), 12 eran de reciente diagnóstico para VIH y 9 se encontraban en abandono de tratamiento antirretroviral; de los 21 pacientes positivos, 71.4% era de sexo masculino, 90.5% tuvo un recuento de Linfocitos T CD4+ menor a 100 cel/µL. El 42.9% presentó además, al menos una enfermedad definitoria de SIDA, siendo la más frecuente la neumonía por Pneumocistis Jiroveci. Conclusión: Es importante realizar la prueba del antígeno de histoplasma en orina a todos los pacientes de reciente diagnóstico de VIH y a pacientes que han retomado su seguimiento de VIH tras abandonar el tratamiento antirretroviral, que tengan un recuento de linfocitos T CD4+ menor a 100 cel/µL; e independientemente del recuento de estas células, en presencia de sospecha clínica
Detección molecular de Chlamydia trachomatis y Neisseria gonorrhoeae en muestras de orina de pacientes adultos VIH positivo. Hospital Roosevelt 2019 al 2021
Objectives To determine the positivity of C. trachomatis and N. gonorrheae by molecular testing in urine samples from HIV-positive adult patients, in the Comprehensive Care and Chronic Infections Unit of the Roosevelt Hospital from 2019 to 2021. Methodology Descriptive, non-probabilistic cross-sectional study of consecutive cases in 810 HIV-positive patients with medical indication or baseline screening study for CT/NG molecular testing, from 2019 to 2021. Data analysis was performed in the Jamovi statistical software V 2.3.21 The results are presented in frequencies and percentages. For the association between variables, chi square was applied with a significance of 5%. Results C. trachomatis was detected in 4.7% and N. gonorrheae; at 1.6%. The highest C. trachomatis positivity was detected in men in the age range of 40 to 49 years, while N. gonorrhoeae was more prevalent in men in the age range of 20 to 29. The male sex presented a higher frequency of positivity with 27 and 13 cases of each infection, respectively. C. trachomatis occurred in 13 patients aged 13 to 49 years and gonorrhea in 6 patients aged 20 to 29 years. Conclusion The findings of this study demonstrate the importance of performing molecular testing for detection of CT/NG as part of the annual control in asymptomatic HIV-positive patients, as part of STI screening in patients with a recent diagnosis of HIV, and for clinical indication including the sites anatomical according to risk.El objetivo de este trabajo es determinar la positividad de C. trachomatis y N. gonorrhoeae por prueba molecular en muestras de orina de pacientes adultos VIH positivo, en la Unidad de Atención Integral e Infecciones Crónicas del Hospital Roosevelt del 2019 al 2021. Este es un estudio transversal descriptivo, no probabilístico de casos consecutivos en 810 pacientes VIH positivo con indicación médica o por estudio basal de tamizaje para prueba molecular de CT/NG, del 2019 al 2021. El análisis de datos se realizó en el software estadístico Jamovi V 2.3.21. Los resultados se presentan en frecuencias y porcentajes, para la asociación entre variables se aplicó chi cuadrado con significancia del 5%. C. trachomatis se detectó en 4.7% y N. gonorrhoeae; en 1.6%. La mayor positividad de C. trachomatis se detectó en hombres y en el rango de 40 a 49 años, en tanto que N. gonorrhoeae fue más prevalente en hombres y en el rango etario de 20 a 29. El sexo masculino quien presentó mayor frecuencia de positividad con 27 y 13 casos de cada infección, respectivamente. C. trachomatis se presentó en 13 pacientes de 13 a 49 años y gonorrea en 6 pacientes de 20 a 29 años. Los hallazgos de este estudio demuestran la importancia de realizar la prueba molecular para detección de CT/NG como parte del control anual en pacientes VIH positivo asintomáticos, como parte del tamizaje de ITS en pacientes con reciente diagnóstico de VIH y por indicación clínica incluyendo los sitios anatómicos según el riesgo
Correlación de prueba rápida y automatizada para detección de antígeno de superficie de hepatitis B
Objective: To correlate rapid tests for the detection of HBsAg with an ECLIA, used in two periods. Methodology: The positive results for HBsAg of 934 samples processed from October 21 to December 20, 2021 were analyzed, using the rapid test SD HBsAg WB (Multi) (01FK11W) BIOLINE (group A) and 990 samples processed from October 21 to December 20, 2021. December 2021 to February 21, 2022 using the rapid HBsAg 01FK1, 01FK11 Bioline™ test (RAPID DIAGNOSTIC TEST Abbott), compared with an ECLIA. Results: The results of the rapid tests of group A presented a better correlation with the ECLIA, compared to the tests of group B; the latter presented a higher percentage of false positives and a lower positive predictive value. Conclusion: The rapid tests for the detection of HBsAg used from the brand (SD HBsAg WB (Multi) (01FK11W) BIOLINE) had a complete correlation with the automated test, unlike the rapid tests of the HBsAg brand 01FK1, 01FK11 Bioline™ (RAPID DIAGNOSTIC TEST Abbott), which had an impact on the total cost of diagnosis due to the need to perform other serological markers to establish the final diagnosis.Objetivo: Correlacionar pruebas rápidas para la detección de HBsAg con un ECLIA, utilizadas en dos periodos y conocer los costos adicionales derivados de los falsos positivos. Metodología: Se analizaron los resultados positivos a HBsAg de 934 muestras procesadas del 21 de octubre al 20 de diciembre del año 2021, utilizando la prueba rápida SD HBsAg WB (Multi) (01FK11W) BIOLINE (grupo A) y 990 muestras procesadas del 21 de diciembre del año 2021 al 21 de febrero del año 2022 utilizando la prueba rápida HBsAg 01FK1, 01FK11 Bioline™ (RAPID DIAGNOSTIC TEST Abbott), comparando con un ECLIA. Resultados: Los resultados de pruebas rápidas del grupo A presentaron mejor correlación con el ECLIA, en comparación a las pruebas del grupo B; las últimas, presentaron mayor porcentaje de falsos positivos y un valor predictivo positivo menor. Conclusión: Las pruebas rápidas para la detección del HBsAg utilizadas de la marca (SD HBsAg WB (Multi) (01FK11W) BIOLINE) tuvieron una completa correlación con la prueba automatizada, a diferencia de las pruebas rápidas de la marca HBsAg 01FK1, 01FK11 Bioline™ (RAPID DIAGNOSTIC TEST Abbott), lo cual tuvo impacto en el costo total del diagnóstico debido a la necesidad de realizar otros marcadores serológicos para establecer el diagnóstico final
Primary Resistance to Antiretroviral Therapy, Roosevelt Hospital, Guatemala. 2018 – 2020
Objetivo. Describir el perfil de resistencia primaria a la terapia antirretroviral. Metodología. Se incluyó 243 de pacientes de reciente diagnóstico de VIH-1 sin antecedente de uso de TAR, con prueba de genotipo de VIH-1, de enero del 2018 a junio del 2020. El análisis se realizó en el software DeepChek® v2.0, los niveles de resistencia se clasificaron siguiendo el algoritmo de Stanford HIVdb (v9.4 - 17/12/2022). Resultados. El 17.3% (IC 95% 12.8 - 22.6%) presentó resistencia general a alguna familia de ARVs. La resistencia por familia fue de 13.6% (IC 95% 9.5 - 18.5%) para INNTR afectando principalmente a NVP y EFV; 1.6% (IC 95% 0.5 - 4.2%) para INTR, mayormente en FTC/3TC y 4.5% (IC 95% 2.3 - 8.0%) para IP, siendo NFV el más afectado. Las mutaciones más frecuentemente encontradas fueron la K103N en 38.1%, M41L, K70R, M184V en 4.8% cada una, M46I/L y V82A en 11.9% cada mutación. Conclusión. La elevada resistencia al VIH-1 en pacientes de reciente diagnóstico sin previa exposición a TAR, evidencia la estrecha relación entre el historial de ARVs disponibles en el país, la resistencia adquirida del VIH y la transmisión de la resistencia, por lo que es necesario realizar acciones e intervenciones oportunas y costo-efectivas.Objective. To describe the drug resistance profile in newly HIV-1 patients. Methodology. A total of 243 newly HIV-1 diagnosed patients with no record of Antiretroviral -ART- intake were included. They all underwent HIV-1 genotype testing from January 2018 to June 2020. The analysis was performed in the DeepChek® v2.0 software. Resistance levels were classified following the Stanford HIVdb algorithm (v9.4 - 12/17/2022). Results Overall resistance to any ART family was found in 17.3% (95% CI 12.8 - 22.6%). Resistance NNRTIs was found in 13.6% (95% CI 9.5 - 18.5%), mainly affecting NVP and EFV meanwhile the NRTIs showed 1.6% (95% CI 0.5 - 4.2%), mostly in FTC/3TC. For PIs it was 4.5% (95% CI 2.3 - 8.0%), with NFV being the most affected. The most frequently found mutations were K103N in 38.1%, M46I/L and V82A in 11.9% each and M41L, K70R, M184V with 4.8% each mutation. Conclusion. The high HIV-1 resistance in newly diagnosed patients without prior ART exposure shows the close relationship between the availability of ART throughout the time in Guatemala and the acquired and transmission of HIV resistance. Therefore, timely and cost-effective actions and interventions are needed
Resistencia adquirida del VIH-1 en adultos atendidos en Unidades de Atención Integral de Guatemala
Introduction. The use of medications to treat HIV-1 has been linked to acquired drug resistance, which has been increasing in recent years. Objective. Describe the levels acquired resistance of HIV-1 among adult patients, treated in 9 Comprehensive HIV Care Units in Guatemala. Methodology. A total of 61 records of HIV-positive adult patients were analyzed, 41 in first failure and 20 in multiple failure, all of them underwent genotype testing during January 2020 and June 2021. The analysis was performed in DeepChek® v2.0 software, and the Stanford HIVdb algorithm (v9.4 - 12/17/2022) was used to classify the resistance. Results. Overall resistance to any antiretroviral treatment (ART) family was 82.0% (95% CI 70.0 - 90.6%). Higher resistance to the NNRTIs family was observed, mainly EFV (94.4%) and NVP (97.2%) in in first failure patients and 92.9% for each medication in multiple failure patients. The most frequently found mutations were M184V/I (54.0%, 24.0%) and K103N/S (58.0%, 22.0%) in first ART failure and multiple failure, respectively; and I54V (6.0%) in patients with multiple failure. Conclusion. The high acquired resistance to HIV-1 in patients treated in different regions of the country shows the importance of having/expanding national coverage of HIV-1 VL tests to early identify failure to ART and optimal medications to change soon possible ARV regimen in case of confirmed treatment failure.Introducción. El uso de los medicamentos para tratar el VIH-1 ha sido relacionado con la farmacorresistencia adquirida, que ha ido en incremento durante los últimos años. Objetivo. Describir el perfil de resistencia adquirida del VIH-1 en pacientes adultos, atendidos en 9 Unidades de Atención Integral del VIH de Guatemala. Metodología. Se analizó 61 registros de pacientes adultos VIH positivo, 41 en primer fallo y 20 en fallo múltiple, a quienes se solicitó la prueba de genotipo de enero del 2020 a junio del 2021. El análisis se realizó en el software DeepChek® v2.0, para la clasificación de la resistencia se siguió el algoritmo de Stanford HIVdb (v9.4 - 17/12/2022). Resultados. El 82.0% (IC 95% 70.0 - 90.6%) presentó resistencia a alguna familia de ARVs. La mayor resistencia por familia fue para los INNTR, principalmente EFV (94.4%) y NVP (97.2%) en pacientes con fallo a primer esquema y 92.9% para cada medicamento en pacientes con fallo a múltiples esquemas. Las mutaciones más frecuentes fueron M184V/I (54.0%, 24.0%) y K103N/S (58.0%, 22.0%) en fallo a primer esquema y fallo múltiple, respectivamente; y la I54V (6.0%) en pacientes con fallo múltiple. Conclusión. La elevada resistencia adquirida al VIH-1 en pacientes atendidos en distintas regiones del país, muestra la importancia de disponer/ampliar la cobertura a nivel nacional de pruebas de CV de VIH-1 para identificar tempranamente fallo a TAR y medicamentos óptimos para cambiar lo más pronto posible el esquema de ARVs en caso de fracaso confirmado del tratamiento
Resistencia adquirida del VIH-1 en adultos atendidos en Unidades de Atención Integral de Guatemala
Introduction. The use of medications to treat HIV-1 has been linked to acquired drug resistance, which has been increasing in recent years. Objective. Describe the levels acquired resistance of HIV-1 among adult patients, treated in 9 Comprehensive HIV Care Units in Guatemala. Methodology. A total of 61 records of HIV-positive adult patients were analyzed, 41 in first failure and 20 in multiple failure, all of them underwent genotype testing during January 2020 and June 2021. The analysis was performed in DeepChek® v2.0 software, and the Stanford HIVdb algorithm (v9.4 - 12/17/2022) was used to classify the resistance. Results. Overall resistance to any antiretroviral treatment (ART) family was 82.0% (95% CI 70.0 - 90.6%). Higher resistance to the NNRTIs family was observed, mainly EFV (94.4%) and NVP (97.2%) in in first failure patients and 92.9% for each medication in multiple failure patients. The most frequently found mutations were M184V/I (54.0%, 24.0%) and K103N/S (58.0%, 22.0%) in first ART failure and multiple failure, respectively; and I54V (6.0%) in patients with multiple failure. Conclusion. The high acquired resistance to HIV-1 in patients treated in different regions of the country shows the importance of having/expanding national coverage of HIV-1 VL tests to early identify failure to ART and optimal medications to change soon possible ARV regimen in case of confirmed treatment failure.Introducción. El uso de los medicamentos para tratar el VIH-1 ha sido relacionado con la farmacorresistencia adquirida, que ha ido en incremento durante los últimos años. Objetivo. Describir el perfil de resistencia adquirida del VIH-1 en pacientes adultos, atendidos en 9 Unidades de Atención Integral del VIH de Guatemala. Metodología. Se analizó 61 registros de pacientes adultos VIH positivo, 41 en primer fallo y 20 en fallo múltiple, a quienes se solicitó la prueba de genotipo de enero del 2020 a junio del 2021. El análisis se realizó en el software DeepChek® v2.0, para la clasificación de la resistencia se siguió el algoritmo de Stanford HIVdb (v9.4 - 17/12/2022). Resultados. El 82.0% (IC 95% 70.0 - 90.6%) presentó resistencia a alguna familia de ARVs. La mayor resistencia por familia fue para los INNTR, principalmente EFV (94.4%) y NVP (97.2%) en pacientes con fallo a primer esquema y 92.9% para cada medicamento en pacientes con fallo a múltiples esquemas. Las mutaciones más frecuentes fueron M184V/I (54.0%, 24.0%) y K103N/S (58.0%, 22.0%) en fallo a primer esquema y fallo múltiple, respectivamente; y la I54V (6.0%) en pacientes con fallo múltiple. Conclusión. La elevada resistencia adquirida al VIH-1 en pacientes atendidos en distintas regiones del país, muestra la importancia de disponer/ampliar la cobertura a nivel nacional de pruebas de CV de VIH-1 para identificar tempranamente fallo a TAR y medicamentos óptimos para cambiar lo más pronto posible el esquema de ARVs en caso de fracaso confirmado del tratamiento
Evolutionary history and spatiotemporal dynamics of the HIV-1 subtype B epidemic in Guatemala.
Different explanations exist on how HIV-1 subtype B spread in Central America, but the role of Guatemala, the Central American country with the highest number of people living with the virus, in this scenario is unknown. We investigated the evolutionary history and spatiotemporal dynamics of HIV-1 subtype B in Guatemala. A total of 1,047 HIV-1 subtype B pol sequences, from newly diagnosed ART-naïve, HIV-infected Guatemalan subjects enrolled between 2011 and 2013 were combined with published subtype B sequences from other Central American countries (n = 2,101) and with reference sequences representative of the BPANDEMIC and BCAR lineages from the United States (n = 465), France (n = 344) and the Caribbean (n = 238). Estimates of evolutionary, demographic, and phylogeographic parameters were obtained from sequence data using maximum likelihood and Bayesian coalescent-based methods. The majority of Guatemalan sequences (98.9%) belonged to the BPANDEMIC clade, and 75.2% of these sequences branched within 10 monophyletic clades: four also included sequences from other Central American countries (BCAM-I to BCAM-IV) and six were mostly (>99%) composed by Guatemalan sequences (BGU clades). Most clades mainly comprised sequences from heterosexual individuals. Bayesian coalescent-based analyses suggested that BGU clades originated during the 1990s and 2000s, whereas BCAM clades originated between the late 1970s and mid 1980s. The major hub of dissemination of all BGU, and of BCAM-II, and BCAM-IV clades was traced to the Department of Guatemala, while the root location of BCAM-I and BCAM-III was traced to Honduras. Most Guatemalan clades experienced initial phases of exponential growth (0.23 and 3.6 year-1), followed by recent growth declines. Our observations suggest that the Guatemalan HIV-1 subtype B epidemic is driven by dissemination of multiple BPANDEMIC founder viral strains, some restricted to Guatemala and others widely disseminated in the Central American region, with Guatemala City identified as a major hub of viral dissemination. Our results also suggest the existence of different sub-epidemics within Guatemala for which different targeted prevention efforts might be needed