Détection de souches multi-résistantes d’Escherichia coli d’origine aviaire dans la région de Rabat-Salé-Zemmour-Zaer

Antimicrobial resistance surveillance is a standard measure in the sanitary policies. In order to monitor multi-resistance within APEC strains, a study was conducted on 370 broiler chickens farms from the Rabat-Salé-Zemmour-Zaer region in Morocco. The isolation of Escherichia coli was made from lesions of avian colibacillosis. Biochemical identification, serotyping and antimicrobial susceptibility tests as well as phenotypic identifications on lactamases resistance were carried out on the isolates. Serogrouping showed that 66.7 % of the isolates belong to the dominant serotypes O78, O2 and O1. Drug sensitivity tests showed extremely high levels of resistance to oxytetracyclin (100 %), amoxicillin (90.9%), trimethoprim + sulphamethoxazol (82.2 %), enrofloxacin (75.9 %) and florfenicol (61.5 %). Low frequencies of resistances were noted for gentamicin (24.8 %), fosfomycin (16.1 %) and colistin (2%). In parallel, tests for the determination of the phenotype of resistance to beta-lactamases and cephalosporinases on 250 strains revealed that 66.1% of the strains were classified as class A penicillinases; 14.8% were class C cephalosporinases. The ESBL class A was found in 11.1% of the tested stains and only 3.7% were classified as wild-type strains. The multi-resistance is very high since 97.4% and 55.1% of the strains were respectively resistant to three and five antibacterial drugs. Keywords: Antibio-resitance, antibiotics, Escherichia coli, colibacillosis, poultry, Morocco.  La surveillance de l’antibio-résistance de germes spécifiques comme E. coli, Salmonella spp., Staph. aureus ou Campylobacter requiert une importance particulière dans la politique sanitaire humaine et vétérinaire des pays. Dans cette optique, une étude rétrospective sur l’antibio-résistance de 370 cultures d’Escherichia coli a été réalisée dans les élevages avicoles de la région de Rabat-Salé -Zemmour-Zaer. Les bactéries ont été identifiées par les mini galeries API et sérotypées par les immunsérums aviaires O1, O2 et O78. Les tests de sensibilité aux antibiotiques ont permis de distinguer entre antibiotiques connaissant de forts taux de résistance à savoir: l’oxytétracycline (100 %), l’amoxicilline (90,9 %), trimethoprim + sulphamethoxazole (82,2 %), l’enrofloxacine (75,9 %) et le florfénicol (61,5 %) et des molécules à faibles taux de résistance comme la gentamicine (24,8 %), la fosfomycine à (16,1 %) et la colistine (2,94 %). En parallèle, des tests de détermination du phénotype de résistance aux béta-lactamases et aux céphalosporinases sur 250 souches ont permis de mettre en évidence que 66,1 % des souches testées étaient classées parmi les pénicillinases classe A; 14,8 % étaient parmi les céphalosporinases C, les BLSE classe A comptaient 11,1 % et seulement 3,7 % des souches testées étaient classées phénotype sauvage. La multi-résistance reste très élevée avec une fréquence des souches résistantes à trois molécules d’antibactériens de l’ordre de 97 % et 55 % des souches sont résistantes à cinq antibiotiques. Ces résultats sont utiles aux vétérinaires praticiens, pour éviter les échecs thérapeutiques, et constituent une base de données importante en matière de pharmaco-vigilance et de l’épidémio-surveillance de l’antibio-résistance dans notre pays. Mots-clés: Antibio-résistance, antibiotiques, E. coli, BLSE, colibacillose, maladies aviaires, Maroc

Highly virulent strains of the avian infectious bursal disease virus: Literature review and epidemiological situation

Cette revue se focalise sur le virus très virulent de la bursite infectieuse aviaire (vvIBDV). Ce virus est présent dans le monde entier, causant des pertes économiques considérables représentant une menace pour l'industrie de la volaille. L’émergence des formes aiguës de la maladie a radicalement changé l’épidémiologie de l’IBD. Bien que leur origine soit encore à l’étude, les vvIBDV se sont répandus dans le monde entier de manière explosive mais conservée. Cela pose la question de l’origine des vvIBDV, de la possibilité d’existence de réservoirs et de l'émergence possible de nouvelles lignées distinctes dans l’avenir. Il est devenu évident que les acides aminés dans la région hyper-variable de la protéine virale VP2 constitue une base moléculaire de la variation antigénique, mais aucune mutation qui détermine la pathogénicité n’a été identifiée. Ces marqueurs moléculaires des souches vvIBDV doivent être considérés davantage comme une évolution commune plutôt que marqueurs de virulence. Le seul critère valable pour la classification des souches d’IBDV en tant que «pathotype» doit faire référence à leur virulence clinique. Cet article présente une synthèse des caractéristiques moléculaires, phylogénétiques, épidémiologiques, antigéniques et pathotypiques des souches très virulentes du virus de la bursite infectieuse aviaire. Mots clés: Revue bibliographique, vvIBDV, moléculaire, épidémiologie, phylogénie, pathotypeThis review focuses on the very virulent viral avian infectious bursal disease virus (vvIBDV). This virus was first described in the United States about 30 years ago, it quickly spread around the world, causing considerable economic losses; after three decades, it still poses a threat to the poultry industry. The emergence of acute forms of the disease has radically changed the epidemiology of IBD. Although their origin is still under study, vvIBDV has spread throughout the world in an explosive but conservative manner. This raises the question of the origin of vvIBDV, the possibility of existence of reservoirs and the possible emergence of new distinct lineages in the future. It has become clear that the amino acids in the hyper-variable region of the VP2 viral protein constitute a molecular basis for antigenic variation, but no mutation that determines pathogenicity has been identified. These molecular markers of the vvIBDV strains should be considered more as a common evolution than as markers of virulence. This article presents a synthesis of the molecular, phylogenetic, epidemiological, antigenic and pathotypic characteristics of the very virulent strains of IBDV. Keywords: Review, vvIBDV, molecular, phylogeny, epidemiology, pathotype

Profil moléculaire et épidémiologique du virus de la bursite infectieuse aviaire circulant au Maroc entre 2013 et 2016

Gumboro disease or infectious bursal disease (IBD) is associated with the infectious bursal disease virus (IBDV), which causes considerable economic losses. This virus belongs to the family Birnaviridae (Avibirnavirus). This infection continues to be prevalent in poultry farms in Morocco, particularly in broiler farms, despite the various vaccination programs applied. Thus, the objective of the present work is the epidemiological and pathotypic characterization of IBDV in Morocco. The study involved 102 suspect broiler farms throughout Morocco surveyed between 2013 and 2016. As well as Fabricius Bursa (FB) samples (pool of 5 BF per flock) were taken from affected chickens for molecular investigations by real-time RT-PCR. The RT-PCR used allowed both detection and discrimination between highly virulent IBDV (vvIBDV) and non-vvIBDV strains using allelic discrimination probes. The epidemiological investigation revealed the suspicion of IBDV in poultry farms due to the very characteristic clinical and necroptic signs caused by IBDV (apathy, ruffled feathers, prostration, watery whitish diarrhea, and the necrotic triad (hypertrophy and hemorrhage of the Fabricius bursa; kidney congestion and petechiae in the muscles). The suspicion was confirmed by the results of RT-PCR in all regions of the kingdom with a prevalence of overall IBDV infection of 81% of which 60% for classical strains (non-vvIBDV) and 40% for highly virulent strains (vvIBDV). Keywords: Infectious bursal disease, IBDV, RT-PCR, Epidemiology, MoroccoLa maladie de Gumboro ou bursite infectieuse aviaire (IBD) est associée au virus de la bursite infectieuse (IBDV), qui cause des pertes économiques considérables. Ce virus appartient à la famille des Birnaviridae (Avibirnavirus). Cette infection continue à sévir au sein des élevages avicoles au Maroc particulièrement ceux de poulets de chair malgré les différents programmes de vaccination appliqués. Ainsi, l’objectif du présent travail est la caractérisation épidémiologique et pathotypique de l’IBDV au Maroc102 élevages de poulets de chair suspects à travers tout le Maroc enquêtés entre les années 2013 et 2016. Ainsi que les bourses de Fabricius (BF) (pool de 5 BF par élevage) ont été prélevés à partir de poulets affectés pour des investigations moléculaires par RT-PCR en temps réel. La RT-PCR utilisée permettait aussi bien la détection que la discrimination entre les souches très virulentes de l’IBDV (vvIBDV) et les non-vvIBDV en utilisant des sondes de discrimination allélique. L'enquête épidémiologique révèle la suspicion de l’atteinte des élevages avicoles par l’IBDV vu les signes cliniques et nécropsiques très caractéristiques causés par l’IBDV (apathie, plumes ébouriffées, prostration, diarrhée blanchâtre aqueuse, et la triade nécrosique (hypertrophie et hémorragie de la Bourse de Fabricius ; congestion des reins et pétéchie au niveau des muscles)). La suspicion a été confirmée par les résultats de la RT-PCR dans toutes les régions du royaume avec une prévalence de l’atteinte par l’IBDV globale de 81% dont 60% pour les souches classiques (non-vvIBDV) et 40% pour les souches très virulentes (vvIBDV). Mots clés: Bursite infectieuse, IBDV, RT-PCR, épidémiologie, Maro

Application du système de scoring lésionnel pour contribuer à l’étude de la pathogénicité du virus de l’influenza aviaire faiblement pathogène H9N2 chez le poulet de chair infecté expérimentalement

Following the introduction of the low pathogenic avian influenza virus H9N2 in Morocco in 2016, a study of the pathogenicity of the virus was carried out, to fully understand the pathophysiology of the disease and its role in the damage observed in the field. . The study was carried out under controlled conditions so that the true impact of the H9N2 virus alone could be demonstrated by limiting concomitant infections. To do this, 110 day-old broilers vaccinated to one day of age against the low pathogenic avian influenza virus H9N2 were reared and maintained in isolators. At 21 days, the chicks were divided into three batches, two batches (vC, nvC) were inoculated with the Moroccan strain of the H9N2 virus (GenBank accession number: LT 598532) and an uncontested control batch (vNC). The results of clinical examinations revealed only respiratory discomfort and no mortality. Two autopsies were scheduled for 5 and 12 days post-challenge. Lesionally, tracheitis, thickening of the air sacs, and pulmonary congestion were observed during the first autopsy, during the second, only the thickening of the air sacs persisted. The histopathological study carried out on the organs removed during the autopsies, revealed lymphohistiocytic tracheitis, severe bronchitis, mild lymphocytic nephritis and lymphocyte depletion in the spleen at 5 days post challenge, 12 days post-challenge , the lesions regressed and only a few cases of tracheitis were detected. The present study is the first to have investigated the pathogenic effect of the virus alone under controlled conditions, the results indicate that infection with the virus alone does not reproduce the disease as reported in the field and that of other factors (concomitant infections, breeding conditions and environmental stress, etc.) may be at the origin of the seriousness of the damage reported, the team also concluded that the Moroccan strain of the H9N2 AI virus has an essentially respiratory tropism and a weak nephropathogenic effect. Keywords: Avian influenza, experimental infection, broiler chickens, H9N2, histopathologySuite à l’introduction du virus de l’influenza aviaire faiblement pathogène H9N2 au Maroc en 2016, une étude de la pathogénicité du virus a été effectuée, pour bien comprendre la pathophysiologie de la maladie et son rôle dans les dégâts observés au niveau du terrain. L’étude a été effectuée dans des conditions contrôlées pour pouvoir ressortir le véritable impact du virus H9N2  seul en limitant les infections concomitantes. Pour ce faire, 110 poulets de chair d’un jour vaccinés à un jour d’âge,  contre le virus de l’influenza aviaire faiblement pathogène H9N2, ont été élevés et entretenus dans des isolateurs. A 21 jours, les poussins ont été répartis en trois lots,  deux  lots (vC, nvC) ont été inoculé par la souche marocaine du virus H9N2 (GenBank  accession number : LT 598532)  et un lot témoin non challengé (vNC). Les résultats des examens cliniques ont révélé une gêne respiratoire seulement et  aucune mortalité. Deux autopsies ont été programmées à 5 et à 12 jours post-challenge. Sur le plan lésionnel, une trachéite, un épaississement des sacs aériens, et une congestion pulmonaire ont été observés pendant la première autopsie, lors de la deuxième, seulement l’épaississement des sacs aériens a persisté. L’étude histopathologique réalisée sur les organes prélevés lors des autopsies, a révélé une trachéite lympho-histiocytaire, une bronchite sévère, une néphrite lymphocytaire légère  et une déplétion lymphocytaire au niveau de la rate à 5 jours post challenge, à 12 jours post-challenge, les lésions ont régressé et seulement quelques cas de trachéite ont été détectés. La présente étude est la première à avoir étudié l’effet pathogène du virus seul dans des conditions contrôlées, les résultats  indiquent que l’infection par le virus seul ne reproduit pas la maladie telle qu’elle est rapportée dans le terrain et que d’autres facteurs (infections concomitantes, conditions d’élevage et stress environnemental…) peuvent être à l’origine de la gravité des dégâts rapportés,  l’équipe a aussi conclu que  la souche marocaine du virus de l’IA  H9N2  a un tropisme essentiellement  respiratoire et un effet néphropathogène faible. Mots-clés : Influenza aviaire, infection expérimentale, poulet de chair, H9N2, histopathologie   &nbsp

Semi-quantitative scoring system for the evaluation of microscopic lesions in the trachea of turkeys following experimental infection with LPAI H9N2

Dans le cadre de l’étude de la pathogénicité et de l’évaluation de la vaccination du virus de l’Influenza Aviaire faiblement pathogène H9N2 chez la dinde ; une étude histopathologique des lésions engendrées par ce virus suite à l’infection expérimentale de la dinde a été réalisée.  Ainsi, 80 dindonneaux ont été mis en essai, et vaccinés contre H9N2 à 8 jours d’âge et le challenge à 26 jours. Un monitoring clinique a été effectué après le challenge, avec la réalisation de deux autopsies à 5 jours et à 10 jours post-challenge. Les dindonneaux ont manifesté des signes respiratoires avec des râles trachéaux, la toux, une sinusite avec des écoulements nasaux et oculaires mousseux, associés à des symptômes généralisés y compris l’entassement, la léthargie et un plumage ébouriffé. Des taux de mortalité de 50 et 20% ont été relevés respectivement chez le groupe de dindonneaux non vaccinés et vaccinés. Sur le plan lésionnel, une sinusite fibrineuse, une trachéite, et une aérosacculite fibrineuse ont été notés chez les deux groupes challengés, à moindre degré chez les vaccinés, avec une pneumonie fibrineuse détectée seulement chez les non vaccinés. L’étude histpathologique a révélé des lésions similaires à la fois chez les groupes vaccinés et non vaccinés à 5 et à 10 jours post-challenge, qui ne différent que par leur gravité. Ainsi un système de scoring de 4 grades (de 0 à 3) a été adopté pour évaluer les lésions trachéales chez les lots d’oiseaux étudiés, la comparaison de ceux-ci s’est basée principalement, sur l’évolution des grades et la précocité de retour à la normale (grade 0). Les lésions ont été plus sévères pendant l’autopsie de 5 JPC, une différence entre les groupes a été relevée, mais aucune différence statistique n’a été démontrée. En conclusion, le système de scoring procure des résultats cohérents ce qui prouve sa fiabilité en tant qu’outil supplémentaire dans les études expérimentales en pathologie aviaire.  Mots-clés: Lésions Histopathologiques, scoring lésionnel, dinde, H9N2, infection expérimentaleThe present study has been designed to contribute both in the evaluation of the pathogenicity of the Moroccan strain of low pathogenic avian influenza virus (LPAI) H9N2 in turkeys and vaccine efficacy against it. For this purpose, clinical monitoring and examination of gross and hitopathological lesions following vaccination at 8 days and a challenge at 26 days of age were carried out. The study was conducted on 80 turkeys, which were divided into 4 groups (A: vaccinated and challenged, B: vaccinated and unchallenged, C: unvaccinated and challenged, and D: unvaccinated and unchallenged). Birds were observed daily for 15 days after the challenge for clinical signs. 10 poults from each group were euthanized and autopsied 5 days post-challenge (DPC) and at 10 DPC. Gross lesions were evaluated during necropsy, and trachea samples were collected, and placed in a 10% neutral buffered formalin solution for histopathological examination. All challenged birds exhibited respiratory signs during the observation period which consisted of rales, coughing, sinusitis and ocular and nasal discharges, with lethargy and ruffled feathers. Mortalities of 20 % and 50 % starting 7 DPC were recorded in group A and B respectively. Necropsy revealed fibrinous sinusitis, tracheitis, and fibrinous aerosacculitis in groups A and B with pneumonia only in group B at 5 DPC.  Histopathology of the trachea in all the infected birds revealed a lympho-plasmocytic tracheitis with mononuclear cell infiltrates, hyperplasia of epithelial cells, metaplasia, and loss of cilia and mucous glands. Lesions exhibited a varying range of severity depending on days post challenge and groups. Thus a scoring system of 4 grades was created to evaluate and compare groups. Score 0 corresponds to normal tracheal structure, histologic scores of 1 and 2 are characterized mainly by congested blood vessels, depletion of specialized cells, and mononuclear infiltrates, while score 3 corresponds to a histologic pattern of notable thickening of mucosal lining by hyperplasia of epithelial cells, severely congested blood vessels, and metaplasia of surface epithelial cells. Lesions were significantly more severe at 5 DPC, and a visual but non-statistical difference between groups at the same necropsy was noted. The scoring system showed consistent results and helped broaden the perspectives of the present study, and proved to be a reliable tool in the setting of experimental studies in avian pathology.  Keywords: Histopathologic lesions, scoring system, Turkey, H9N2, experimental infectio

Zootechnical performance study and susceptibility to Avian Influenza virus H9N2 in a breed of crossbred chicken with intermediate growth

La viande de volaille constitue la protéine d’origine animale la plus consommée en raison de son prix abordable par rapport aux autres denrées animales. De ce fait, le secteur avicole connait constamment des progrès améliorant la productivité et la qualité organoleptique des viandes de volaille.  Pour satisfaire aux enjeux de la sécurité alimentaire et l’exigence des citoyens et consommateurs, le présent travail consiste à étudier et comparer les performances zootechniques ainsi que la sensibilité au virus H9N2 de poulet croisé à croissance intermédiaire (I), par rapport à deux races de poulets à croissance rapide (R) et à croissance lente (L). Les résultats de l’étude ont montré des performances zootechniques de la race I à croissance intermédiaire similaire à celles du poulet à croissance rapide R. En effet, le lot témoin I a enregistré un GMH significativement élevé à celui du lot témoin L. L’indice de consommation du lot R et I est 50% plus bas que celui du poulet L. Concernant l’infection expérimentale par le virus H9N2, le groupe de poulet I et R ont présenté les signes cliniques et les lésions macroscopiques les plus sévères et accentués par rapport aux poulets du lot L à croissance lente. Mots clés : infection H9N2, croissance rapide, croissance intermédiaire, performance zootechniquePoultry meat is the most widely consumed animal protein due to its low price compared to other animal products. However, the poultry sector is constantly experiencing progress improving the productivity and organoleptic quality of poultry meat. To responds the challenges of food security and the requirements of citizens and consumers, the present work consists to study the zootechnical performances as well as the sensitivity to the H9N2 virus of cross-breed chicken with intermediate growth (I), compared to two breeds fast growing (R) and slow growing (L) chickens. The results of the study showed zootechnical performances of race I with intermediate growth similar to those of fast growing chicken R. Indeed, the control group I recorded a GMH significantly elevated to that of the control group L. The index consumption of lot R and I is 50% lower than that of chicken L. Concerning the experimental infection with the H9N2 virus, the group of chicken I and R presented the most severe and accentuated clinical signs and gross lesions compared to chickens of the slow breed L. Keywords: infection, H9N2, rapid growth, intermediate growth, slow growth, zootechnical performanc

Prévalence de la maladie de la bronchite infectieuse aviaire au Maroc entre Juin 2018 et Avril 2019

Avian infectious bronchitis (IB) is mainly an upper respiratory tract infection caused by infectious bronchitisvirus (IBV) belonging to the Coronaviridae family. This work aims to assess the prevalence of IBV in different regions of Morocco using real-time RT-PCR, in order to better understand the epidemiological situation of the disease in these regions. Epidemiological analyses have shown that the IBV circulates with a high prevalence of 61% between 2018 and 2019, thus, the results obtained were valued and evaluated by a statistical study using the SPSS version 13 (Statistical Package for the Social Sciences). IB circulated with distinct prevalence’s in the different regions of Morocco, but this difference was not statistically significant. A peak of positivity was found in the BeniMellal-Khenifra, Draa-Tafilalet, and Souss-Massa regions. On the other hand, a very high vaccination rate against IB (90% of farms) in Morocco has been observed. Keywords: Avian infectious bronchitis, real-time RT-PCR, Prevalence, MoroccoLa bronchite infectieuse aviaire (BI) est principalement une infection des voies respiratoires supérieures causée par le virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV) appartenant à la famille des Coronaviridae. Le présent travail a pour objectif d’évaluer la prévalence de l’IBVdans sept différentes régions du Maroc en utilisant la RT-PCR en temps réel, afin de mieux connaitre la situation épidémiologique de la maladie dans ces régions. L’analyse épidémiologique a montré que l’IBV a circulé avec une forte prévalence de 61% entre 2018 et 2019, ainsi, les résultats obtenues ont été valorisées et évaluées par une étude statistique via la version 13 du logiciel SPSS (Statistical Package for the Social Sciences). L’infection à l’IBV a circulé avec des prévalences distinctes dans les différentes régions du Maroc, mais cette différence n’était pas statistiquement significative. Un pic de positivité a été mis en évidence dans les régions BeniMellal-Khenifra, Draa-Tafilalet, et Souss-Massa. D’autre part, un taux de vaccination très élevé contre la BI (90% des élevages) au Maroc a été constaté. Mots clés: Bronchite infectieuse aviaire, RT-PCR en temps réel, Prévalence, Maro

Low Pathogenic Avian Influenza: A Permanent Threat to Poultry Farming in Africa

Initially isolated from turkey flocks in Wisconsin in America in 1966, the avian influenza virus H9N2 has become a serious threat not only to the avian industry but also to human health. Since the 90s, the virus spread in chicken flocks in several countries, starting with China in 1992, then in many parts of Asia, the Middle East, and North Africa. Actually, the LPAI H9N2 subtype is believed to be one of the main causes of chicken respiratory diseases in Africa. Since the first introduction of AIV H9N2 in Morocco in 2016, the virus became enzootic and causes outbreaks in different parts of the country. The intensive uses of inactivated vaccines were insufficient to eradicate the disease, which affects intermittently poultry flocks in different parts of the country at different periods with different degrees of severities, depending on concomitant diseases, management, and other environmental factors. The objective of this chapter will be to explain the H9N2 infection with regard to both animal and human health in Africa and to highlight the assessment of African strategies for control of LPAI in poultry