BIRC6 Is Associated with Vulnerability of Carotid Atherosclerotic Plaque

Carotid atherosclerotic plaque rupture can lead to cerebrovascular accident (CVA). By comparing RNA-Seq data from vascular smooth muscle cells (VSMC) extracted from carotid atheroma surgically excised from a group of asymptomatic and symptomatic subjects, we identified more than 700 genomic variants associated with symptomatology (p < 0.05). From these, twelve single nucleotide polymorphisms (SNPs) were selected for further validation. Comparing genotypes of a hospital-based cohort of asymptomatic with symptomatic patients, an exonic SNP in the BIRC6 (BRUCE/Apollon) gene, rs35286811, emerged as significantly associated with CVA symptomatology (p = 0.002; OR = 2.24). Moreover, BIRC6 mRNA levels were significantly higher in symptomatic than asymptomatic subjects upon measurement by qPCR in excised carotid atherosclerotic tissue (p < 0.0001), and significantly higher in carriers of the rs35286811 risk allele (p < 0.0001). rs35286811 is a proxy of a GWAS SNP reported to be associated with red cell distribution width (RDW); RDW was increased in symptomatic patients (p < 0.03), but was not influenced by the rs35286811 genotype in our cohort. BIRC6 is a negative regulator of both apoptosis and autophagy. This work introduces BIRC6 as a novel genetic risk factor for stroke, and identifies autophagy as a genetically regulated mechanism of carotid plaque vulnerability.This work was financially supported by grants from the Departments of Education (Ref. PIBA2018-67) and Health (Ref. RIS3-2019222038) of the Basque Government, Vitoria-Gasteiz, Spain; by the Spanish Neurovascular Network (INVICTUSplus) (Ref. RD16/0019/0007) funded by the Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación, Madrid, Spain; and by the research project grant (IKERIKTUS) funded by the RefbioII Trans-Pyrenean Cooperation Network for Biomedical Research financed by Horizon 2020. I.A. is supported by the Maratón EiTB 2017 for Funding of Research into Stroke, Bilbao, Spain (Ref. BIO18/IC/005); R.T.N. is the recipient of a fellowship from the Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología e Innovación (SENACYT; Convocatoria Doctorado de Investigación Ronda III, 2018; Ref. BIDP-III-2018-12) of the Gobierno Nacional, República de Panamá

Libro: Las Ciencias Políticas y Sociales ante Contingencias de Amplio Impacto. Incógnitas y Propuestas

Ciencia Política, Administración Pública, Política y Gobierno, y Políticas Públicas. Licencia Creative Commons License 3.0 Reconocimiento-No Comercial-Sin Obras Derivadas. Usted es libre de copiar, distribuir y comunicar públicamente la obra bajo las condiciones siguientes: Reconocimiento - Debe reconocer los créditos de la obra de la manera especificada por el autor o el licenciador (pero no de una manera que sugiera que tiene su apoyo o apoyan el uso que hace de su obra). No comercial - No puede utilizar esta obra para fines comerciales. Sin obras derivadas - No se puede alterar, transformar o generar una obra derivada a partir de esta obra.Se analizan desde una perspectiva internacional a interdisciplinaria las vertientes, problemas, incógnitas y propuestas ante una nueva realidad o normalidad, resultado y consecuencia de la pandemia que se vive de manera contemporánea, de tal manera que la problematización abordada realimente propuestas, acciones y rutas adecuadas y satisfactorias que permitan la construcción de futuros promisorios.Academia Internacional de Ciencias Político-Administrativas y Estudios de Futuro, A.C. (IAPAS por sus siglas en inglés)

Línea de investigación en Helicobacter pylori para la formación de recurso humano en ciencia, tecnología e innovación en el programa de microbiología

Este libro nace de la unión de un maestro altamente calificado y alumnos dedicados con unas creatividades activas y dispuestas a trabajar por resolver los problemas que trae una bacteria a la humanidad. Las investigaciones aquí consignadas son producto de los trabajos de grado de los estudiantes del programa de Microbiología, quienes además fueron miembros del semillero de investigación, MICROORGANISMOS DE IMPORTANCIA EN SALUD HUMANA Y ANIMAL “OBVIO-MICROBIO”. Apoyados y dirigidos por la doctora Adalucy Alvarez-Aldana, quien gracias a su amplio conocimiento en el microorganismo supo sembrar curiosidad sobre el mismo durante las sesiones del semillero, incentivando a muchos de sus alumnos a dedicar su trabajo de grado a resolver alguna pregunta que les surgiera en torno a este microorganismo. Aunque diferentes son las investigaciones, todas fueron trazadas con un fin común, entregarle a la humanidad un poco más de conocimiento sobre Helicobacter pylori, por esto la unión de estas investigaciones en una sola consigna, son importantes para entender más sobre todo lo que rodea esta bacteria y pretenden resolver muchos misterios que aún aquejan la epidemiología detrás de la misma. Estos trabajos son fruto de muchos esfuerzos, materiales y académicos, de personas grandiosas, de la unión de universidades, doctores y docentes de diferentes disciplinas, razón que demuestra una vez más que la unión hace la fuerza, porque solo llegarás más rápido, pero en compañía llegarás más lejos. Además, contamos con la fortuna de tener un capitulo invitado, cuyo tema no es sobre Helicobacter pylori, pero si un sobre un tópico de gran interes en la actualidad como es la resistencia bacteriana. Capitulo titulado: “Caracterización epidemiológica y microbiológica de las bacteriemias y su perfil de resistencia durante el periodo junio 2011 a junio 2015”

Expression regulation and comparative interactome study of ANKRD55, a multiple sclerosis risk modulator

215 p.La esclerosis múltiple (EM) es una enfermedad neurodegenerativa y autoinmune que a día de hoy no tiene cura. Se trata de una patología compleja que surge por una combinación de factores genéticos y ambientales. El objetivo de esta tesis es el estudio del gen ANKRD55, considerado de riesgo para la EM, así como de su correspondiente proteína. En el estudio genético se analizó el efecto de varios polimorfismos (SNPs) de ANKRD55 sobre la expresión génica. Se observaron efectos opuestos en linfocitos T CD4+ y células dendríticas derivadas de monocitos de pacientes y donantes sanos. Por otro lado, se caracterizó el interactoma proteico de ANKRD55 en cuatro líneas celulares, inmunes y neurológicas, de importancia en la patología de la EM. Entre los resultados, se identificaron proteínas de la familia 14-3-3 unidas a ANKRD55 en todos los tipos celulares analizados, y proteínas del transporte intraflagelar en la línea de microglía. Los posteriores análisis bioinformáticos, basados en los resultados experimentales, revelaron la potencial implicación de ANKRD55 en diversos mecanismos biológicos y moleculares como la sinapsis neuroinmune y la regulación del ciclo celular. Los resultados de estas tesis aumentan el conocimiento sobre el locus genético de ANKRD55 asociado a la EM y su posible función.bioCruces Bizkai

Interactome of the Autoimmune Risk Protein ANKRD55

The ankyrin repeat domain-55 (ANKRD55) gene contains intronic single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with risk to contract multiple sclerosis, rheumatoid arthritis or other autoimmune disorders. Risk alleles of these SNPs are associated with higher levels of ANKRD55 in CD4(+) T cells. The biological function of ANKRD55 is unknown, but given that ankyrin repeat domains constitute one of the most common protein-protein interaction platforms in nature, it is likely to function in complex with other proteins. Thus, identification of its protein interactomes may provide clues. We identified ANKRD55 interactomes via recombinant overexpression in HEK293 or HeLa cells and mass spectrometry. One hundred forty-eight specifically interacting proteins were found in total protein extracts and 22 in extracts of sucrose gradient-purified nuclei. Bioinformatic analysis suggested that the ANKRD55-protein partners from total protein extracts were related to nucleotide and ATP binding, enriched in nuclear transport terms and associated with cell cycle and RNA, lipid and amino acid metabolism. The enrichment analysis of the ANKRD55-protein partners from nuclear extracts is related to sumoylation, RNA binding, processes associated with cell cycle, RNA transport, nucleotide and ATP binding. The interaction between overexpressed ANKRD55 isoform 001 and endogenous RPS3, the cohesins SMC1A and SMC3, CLTC, PRKDC, VIM, beta-tubulin isoforms, and 14-3-3 isoforms were validated by western blot, reverse immunoprecipitaton and/or confocal microscopy. We also identified three phosphorylation sites in ANKRD55, with S436 exhibiting the highest score as likely 14-3-3 binding phosphosite. Our study suggests that ANKRD55 may exert function(s) in the formation or architecture of multiple protein complexes, and is regulated by (de)phosphorylation reactions. Based on interactome and subcellular localization analysis, ANKRD55 is likely transported into the nucleus by the classical nuclear import pathway and is involved in mitosis, probably via effects associated with mitotic spindle dynamics.This work was supported by the following grants to KV: Grupos de Investigacion (IT512-10, PPG17/44) and MINECO (SAF2016-74891R). NU is recipient of a predoctoral studentship from the Gobierno Vasco (Reference PRE-2013-1-891). CIC bioGUNE is accredited with the Severo Ochoa Excellence award by the Spanish Ministerio de Econom i a y Competitividad, MINECO (SEV-2016-0644)

NewsHub Space

A lo largo de varias ediciones, el proyecto de innovación docente Espacio NEWSHUB ha tratado de ser un punto de encuentro académico y profesional. En entregas anteriores, se presentó como una solución para cubrir necesidades específicas de formación tanto para el profesorado como para el alumnado en materia de comunicación. En ese sentido, ha servido para diseñar actividades de aprendizaje basadas en proyectos orientadas a generar productos comunicativos de calidad profesional, que sirvan a un tiempo como herramienta eficiente de aprendizaje en el entorno académico además de recurso destacado en el portfolio del alumnado para la búsqueda de empleo o la formalización de proyectos emprendedores Ha funcionado igualmente como incubadora de proyectos. Con esta orientación, ha buscado rediseñar las actividades y prácticas de clase para que se ajusten a una aplicación eficaz de la metodología de aprendizaje basado en proyectos. Al tiempo, se ha ofrecido asesoría y acompañamiento a docentes y estudiantes para que desarrollen su actividad académica integrando estrategias y procesos de calidad propios del ámbito profesional. En todo momento, se ha buscado compartir con la comunidad educativa contenidos formativos sobre comunicación, gracias a recursos abiertos, como una web que agrupa materiales del proyecto. Por otro lado, este proyecto de innovación docente tiene una vertiente tecnológica muy importante. Se ha tratado de ir construyendo un notable arsenal de materiales y herramientas para edición de contenidos audiovisuales y digitales. Todo ese material, incluyendo un espacio físico dotado de un pequeño plató de grabación, está a disposición de la comunidad educativa. Así, en esta edición del proyecto, se ha querido ampliar esta dimensión física, ampliando la dotación tecnológica y ofreciendo mejores herramientas a profesores y estudiantes. Aunque no se ha logrado la ayuda económica solicitada, se han hecho avances en este sentido y, hoy, el Espacio NewsHub es una referencia para la comunidad educativa de nuestra facultad, que sabe que tiene a su disposición un espacio de creación muy singular y bien equipado, un entorno donde poder crear materiales de todo tipo, desde videoclases, a trabajos escolares complejos, como los que se han llevado a cabo a lo largo del curso en varias de las asignaturas que se vinculan con este proyecto de innovación docente. Finalmente, desde el Espacio NEWSHUB pensamos que se han logrado objetivos importantes, especialmente a la hora de ayudar a compañeros y estudiantes en su formación tecnológica. Un buen número de seminarios, talleres y cursos han contribuido a esta tarea, además de la gran cantidad de prácticas y técnicas innovadoras que se han aplicado en las clases. Espacio NEWSHUB ha seguido conectando asignaturas, docentes y estudiantes para lograr que los distintos procesos de enseñanza-aprendizaje se optimicen y produzcan resultados óptimos en el cumplimiento de los objetivos clave del proyecto: aplicar eficazmente metodologías abiertas en el aula; alimentar el porfolio y el currículum en la búsqueda de empleo y el fomento del emprendimiento; y generar recursos educativos y modelos de buenas prácticas para formar en una comunicación eficiente.Depto. de Periodismo y Nuevos MediosFac. de Ciencias de la InformaciónFALSEsubmitte

Optimisation et application des améliorations dans l'évaluation des compétences transversales conçues à partir de la vision multidisciplinaire d'ApreRED

The specific competences are acquired by the students and certified by passing the different subjects of the study plans. However, soft skills are not systematically worked on and are not evaluated, which means that their acquisition cannot be guaranteed. However, these skills are a fundamental basis in higher education and in the future employment of university graduates. The current methodological paradigm of Higher Education shows the importance of authentic and alternative evaluation of learning, based on relevant activities or execution tasks. AprenRED's work in recent years has focused on the field of soft skills. In this case, the objective of this study is to optimize and improve the strategies and instruments for evaluating soft skills, based on the results obtained in recent years, from our multidisciplinary perspective.Las competencias específicas son adquiridas por los estudiantes y certificadas mediante la superación de las diferentes materias de los planes de estudio. Sin embargo, las competencias transversales no se trabajan sistemáticamente y no se evalúan, lo que implica que no pueda garantizarse su adquisición. Sin embargo, dichas competencias son base fundamental en la formación superior y en la futura inserción laboral de los graduados universitarios. El actual paradigma metodológico de la Educación Superior muestra la importancia de la evaluación auténtica y alternativa de los aprendizajes, a partir de actividades o tareas de ejecución relevantes. El trabajo de AprenRED durante los últimos años se ha centrado en el campo de las competencias transversales. En este caso, el objetivo de este trabajo es optimizar y mejorar las estrategias e instrumentos de evaluación de las competencias transversales, en base a los resultados obtenidos en los últimos años, desde nuestra visión multidisciplinar.Des compétences spécifiques sont acquises par les étudiants et certifiées par la réussite des différentes matières des plans d'études. Cependant, les compétences transversales ne sont pas systématiquement travaillées et ne sont pas évaluées, ce qui ne permet pas de garantir leur acquisition. Or, ces compétences constituent une base fondamentale dans l'enseignement supérieur et dans l'emploi futur des diplômés universitaires. Le paradigme méthodologique actuel de l'enseignement supérieur montre l'importance d'une évaluation authentique et alternative des apprentissages, basée sur des activités ou des tâches d'exécution pertinentes. Le travail d'ApreRED ces dernières années s'est concentré sur le domaine des compétences transversales. Dans ce cas, l'objectif de ce travail est d'optimiser et d'améliorer les stratégies et les instruments d'évaluation des compétences transversales, sur la base des résultats obtenus ces dernières années, à partir de notre vision multidisciplinaire

Optimización y aplicación de rúbricas en la evaluación de competencias transversales, diseñadas desde la visión multidisciplinar de aprenred

Las competencias específicas son adquiridas por los estudiantes y certificadas mediante la superación de las diferentes materias de los planes de estudio. Con todo, las competencias transversales no se trabajan sistemáticamente y no se evalúan, lo que implica que no pueda garantizarse su adquisición. Sin embargo, dichas competencias son base fundamental en la formación superior y en la futura inserción laboral de los graduados universitarios. El actual paradigma metodológico de la educación superior muestra la importancia de la evaluación auténtica y alternativa de los aprendizajes, a partir de actividades o tareas de ejecución relevantes. El objetivo de este trabajo es optimizar y mejorar las rúbricas de evaluación para las competencias transversales, empleadas a través de los Formularios de Google, basándose en los resultados obtenidos en los últimos años. Las rubricas diseñadas desde nuestra visión multidisciplinar, tanto para los profesores como para los alumnos, se emplearon en 16 asignaturas diferentes, incluyendo una de máster, en 11 grados distintos, obteniendo 648 formularios por parte de los alumnos. Una de las 2 REIIT, 2022, 1,162-174 conclusiones de este trabajo es que las evaluaciones realizadas por el alumnado durante el curso 2020/21 fueron en general más positivas que las del curso 2019/20

Dangerous liaisons: the ecology of private interest and common good

Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory disease of the central nervous system characterized by myelin loss and neuronal dysfunction. Although the majority of patients do not present familial aggregation, Mendelian forms have been described. We performed whole-exome sequencing analysis in 132 patients from 34 multi-incident families, which nominated likely pathogenic variants for MS in 12 genes of the innate immune system that regulate the transcription and activation of inflammatory mediators. Rare missense or nonsense variants were identified in genes of the fibrinolysis and complement pathways (PLAU, MASP1, C2), inflammasome assembly (NLRP12), Wnt signaling (UBR2, CTNNA3, NFATC2, RNF213), nuclear receptor complexes (NCOA3), and cation channels and exchangers (KCNG4, SLC24A6, SLC8B1). These genes suggest a disruption of interconnected immunological and pro-inflammatory pathways as the initial event in the pathophysiology of familial MS, and provide the molecular and biological rationale for the chronic inflammation, demyelination and neurodegeneration observed in MS patients. Author summary Although the majority of patients diagnosed with multiple sclerosis do not have a family history of disease, 13% report having a close relative also diagnosed with multiple sclerosis. In these families, the cause of multiple sclerosis can be largely attributed to a single genetic variant that is transmitted through generations. In this study we analyzed DNA from 132 patients from 34 families, resulting in the identification of 12 rare genetic variants that are largely responsible for the onset of multiple sclerosis in these families. These variants are located in genes implicated in specific immunological pathways, and suggest the biological mechanisms that trigger the onset of multiple sclerosis. These genes and variants provide the means for the generation of cellular and animal models of human disease, and highlight biological targets for the development of novel treatments.This research was undertaken thanks to funding from the Canada Research Chair program (950-228408), Michael Smith Foundation for Health Research (16827), the Canadian Institutes of Health Research (MOP-137051), the Vancouver Coastal Health Research Institute, the Milan & Maureen Ilich Foundation (11-32095000), and the Vancouver Foundation (ADV14-1597) to CVG. Additional funds were provided by "Red Espanola de Esclerosis Multiple (REEM)" (grant to KV was RD12/0032/0013; RETICS, ISCIII), Project FIS PI13/0879 Grant RETICS-REEM RD07/0060/0019; Ministerio de Economia y Competitividad-FEDER SAF2016-80595-C2-1-P to AA and FM, Junta de Andalucia-FEDER to FM, and the Ricerca Finalizzata of the Italian Ministry of Health (RF-201102350347). EU, LL, LEP, and PUR are members of the Spanish Network of Multiple Sclerosis REEM RD16/0015/0010, supported by Institute of Health "Carlos III" of the Ministry of Economy and Competitiveness (grants cofunded by European Regional Development Fund). LL holds a Nicolas Monardes contract (C-0014-2015) from the Andalusian Health Ministry. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript

Discovering HIV related information by means of association rules and machine learning

Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) is still one of the main health problems worldwide. It is therefore essential to keep making progress in improving the prognosis and quality of life of affected patients. One way to advance along this pathway is to uncover connections between other disorders associated with HIV/AIDS-so that they can be anticipated and possibly mitigated. We propose to achieve this by using Association Rules (ARs). They allow us to represent the dependencies between a number of diseases and other specific diseases. However, classical techniques systematically generate every AR meeting some minimal conditions on data frequency, hence generating a vast amount of uninteresting ARs, which need to be filtered out. The lack of manually annotated ARs has favored unsupervised filtering, even though they produce limited results. In this paper, we propose a semi-supervised system, able to identify relevant ARs among HIV-related diseases with a minimal amount of annotated training data. Our system has been able to extract a good number of relationships between HIV-related diseases that have been previously detected in the literature but are scattered and are often little known. Furthermore, a number of plausible new relationships have shown up which deserve further investigation by qualified medical experts