Hongos asociados a semillas de Phaseolus vulgaris L. cultivadas en Cuba

Common bean (Phaseolus vulgaris L.), is the most important legume specie for Cuba, 123 434 ha were harvested for a production of 127 100 t during 2012. Most of phytopathogenic fungi associated to beans used seeds to move their inoculum to new areas, which under favorable condition can cause considerable yield losses. The objective of the present study was to identify fungi associated with bean seeds, their frequency and incidence for bean variety. 102 seed bean lots of 16 varieties for Pinar del Río, Mayabeque and Artemisa provinces were studied. For each seed lot 400 seed were analyzed by blotter test. 679 fungal isolates belonging to 34 species of 20 genera were detected. Penicillium sp. (78.4%), Rhizoctonia solani (77.5%), Aspergillus niger (68.6%) and Fusarium solani (51.0%) were the predominant species. Nine Fusarium species and six Aspergillus species were identified. Sclerotinia sclerotiorum was detected in BAT-58, BAT-93 and Delicia-365 varieties, on which higher infected seed percent was detected in BAT-93. This paper is the first report of S. sclerotiorum incidence on Cuban seed bean. Key words: Aspergillus, Fusarium, mycobiota, Phaseolus, SclerotiniaEl frijol común (Phaseolus vulgaris L.), es la especie de leguminosa más importante para Cuba, durante el 2012 se cosecharon en el país 123 434 ha para una producción de 127 100 toneladas del grano. La mayoría de los hongos fitopatógenos asociados al frijol emplean las semillas como vehículos de introducción en nuevas áreas donde bajo condiciones favorables pueden causar pérdidas considerables en el cultivo. El objetivo del presente trabajo fue identificar los hongos asociados a diferentes variedades de semillas de frijol así como determinarsu frecuencia y grado de infección por variedad. Fueron estudiados 102 lotes de semilla de frijol, de 16 variedades provenientes de las provincias de Pinar del Río, Mayabeque y Artemisa. De cada lote se analizaron 400 semillas mediante el método de ensayo biológico de crecimiento en cámara húmeda. Se identificaron 679 aislados fúngicos pertenecientes a 34 especies de 20 géneros. Las especies de mayor frecuencia de aparición fueron Penicillium sp. (78.4%), Rhizoctonia solani (77.5%), Aspergillus niger (68.6%) y Fusarium solani (51.0%). Además, se identificaron nueve especies de Fusarium y seis de Aspergillus. Se detectó la presencia de Sclerotinia sclerotiorum en las variedades `BAT-58', `BAT-93' y `Delicia-365. De estas `BAT-93' fue en la que se detectó mayor porciento de semillas infectadas (3%). Este trabajo constituye el primer informe de la incidencia de S. sclerotiorum en semillas cubanas de frijol.  Palabras clave: Aspergillus, Fusarium, micobiota, Phaseolus, Sclerotini

Incidencia de enfermedades fúngicas en plantaciones de cacao de las provincias orientales de Cuba

Durante una encuesta fitopatológica, se visitaron 20 fincas cacaoteras en la región oriental de Cuba, cuatro en la provincia Granma y 16 en Baracoa, donde se muestrearon mazorcas y hojas enfermas, chancros del tronco, agallas y otras manifestaciones de enfermedad. Las muestras se desinfectaron (NaOCl, 3%), se lavaron con agua destilada estéril, montadas en cámaras húmedas y/o sembradas en agar agua + vancomicina (200 ug/ml) o medio selectivo para Phytophthora spp. Los hongos que con mayor frecuencia se encontraron fueron Lasiodiplodia theobromae Griffiths & Maubl. (90%), Phytophthora palmivora (E.J. Butler) (85%) y Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. (70%). No se hallaron aislamientos típicos de P. tropicalis. Las enfermedades de mayor incidencia fueron las pudriciones de la mazorca por P. palmivora (65%), por L. theobromae (55%) y antracnosis por C. gloeosporioides (55%). Se detectaron, además, mancha foliar por Cercospora sp. (20%) y por Phomopsis sp. (10%), chancros del tallo por P. palmivora (15%), muerte regresiva por L. theobromae (10%) y agallas causadas por Fusarium decemcellulare (10%). Este último hongo se asoció, en Baracoa, a agallas tipo abanico similares a pequeñas escobas de bruja. Se descartó la presencia de Moniliophthora perniciosa en Cuba asociada a esta sintomatología.Palabras clave: agallas, Colletotrichum, Fusarium, Lasiodiplodia, Phytophthora.Incidence of fungal diseases in cocoa plantations of cuban western provincesABSTRACT: During a phytopathological survey in twenty cacao farms in the western region of Cuba, four farms in Granma and sixteen in Guantanamo provinces were visited and samples of symptomatic pods, leaves, stem cankers, galls and other diseases symptoms. were taken. The samples were disinfected (NaOCl, 3%), rinsed with sterile distilled water and placed in humid chambers or cultured in plates with water agar + vancomicin (200 ug/ml) and on PDA supplemented with benomyl (50 ppm) and streptomycin (100 ppm). The most frequent species detected were Lasiodiplodia theobromae Griffiths & Maubl. (90%), Phytophthora palmivora (E.J. Butler) (85%), and Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. (70%). Typical isolations of P. tropicalis were not found. P. palmivora black pod disease (65%), Lasiodiplodia pod rot caused by L. theobromae (55%), and anthracnose by C. gloeosporioides (55%) were the diseases with higher incidence. Cercospora sp. (20%) and Phomopsis sp.(10%) leaf spots, Phytophthora stem canker (15%), dieback by L. theobromae (10%) and cushion gall (green-point gall, flowered cushion gall and fan gall) (10%) by F. decemcellulare were also detected. This latter fungus was associated with fan gall with offshoots growth resembling tiny witches’ brooms in Baracoa province. The presence in Cuba of Moniliophthora perniciosa associated with this symptomatology was discarded.Key words: buba, Colletotrichum, Fusarium, Lasiodiplodia, Phytophthora

Incidencia de enfermedades fúngicas en plantaciones de cacao de las provincias orientales de Cuba

Durante una encuesta fitopatológica, se visitaron 20 fincas cacaoteras en la región oriental de Cuba, cuatro en la provincia Granma y 16 en Baracoa, donde se muestrearon mazorcas y hojas enfermas, chancros del tronco, agallas y otras manifestaciones de enfermedad. Las muestras se desinfectaron (NaOCl, 3%), se lavaron con agua destilada estéril, montadas en cámaras húmedas y/o sembradas en agar agua + vancomicina (200 ug/ml) o medio selectivo para Phytophthora spp. Los hongos que con mayor frecuencia se encontraron fueron Lasiodiplodia theobromae Griffiths & Maubl. (90%), Phytophthora palmivora (E.J. Butler) (85%) y Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. (70%). No se hallaron aislamientos típicos de P. tropicalis. Las enfermedades de mayor incidencia fueron las pudriciones de la mazorca por P. palmivora (65%), por L. theobromae (55%) y antracnosis por C. gloeosporioides (55%). Se detectaron, además, mancha foliar por Cercospora sp. (20%) y por Phomopsis sp. (10%), chancros del tallo por P. palmivora (15%), muerte regresiva por L. theobromae (10%) y agallas causadas por Fusarium decemcellulare (10%). Este último hongo se asoció, en Baracoa, a agallas tipo abanico similares a pequeñas escobas de bruja. Se descartó la presencia de Moniliophthora perniciosa en Cuba asociada a esta sintomatología.Palabras clave: agallas, Colletotrichum, Fusarium, Lasiodiplodia, Phytophthora.Incidence of fungal diseases in cocoa plantations of cuban western provincesABSTRACT: During a phytopathological survey in twenty cacao farms in the western region of Cuba, four farms in Granma and sixteen in Guantanamo provinces were visited and samples of symptomatic pods, leaves, stem cankers, galls and other diseases symptoms. were taken. The samples were disinfected (NaOCl, 3%), rinsed with sterile distilled water and placed in humid chambers or cultured in plates with water agar + vancomicin (200 ug/ml) and on PDA supplemented with benomyl (50 ppm) and streptomycin (100 ppm). The most frequent species detected were Lasiodiplodia theobromae Griffiths & Maubl. (90%), Phytophthora palmivora (E.J. Butler) (85%), and Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc. (70%). Typical isolations of P. tropicalis were not found. P. palmivora black pod disease (65%), Lasiodiplodia pod rot caused by L. theobromae (55%), and anthracnose by C. gloeosporioides (55%) were the diseases with higher incidence. Cercospora sp. (20%) and Phomopsis sp.(10%) leaf spots, Phytophthora stem canker (15%), dieback by L. theobromae (10%) and cushion gall (green-point gall, flowered cushion gall and fan gall) (10%) by F. decemcellulare were also detected. This latter fungus was associated with fan gall with offshoots growth resembling tiny witches’ brooms in Baracoa province. The presence in Cuba of Moniliophthora perniciosa associated with this symptomatology was discarded.Key words: buba, Colletotrichum, Fusarium, Lasiodiplodia, Phytophthora

Fungi associated with <i>Phaseolus vulgaris</i> L. seeds cultivated in Cuba

Common bean (Phaseolus vulgaris L.), is the most important legume specie for Cuba, 123 434 ha were harvested for a production of 127 100 t during 2012. Most of phytopathogenic fungi associated to beans used seeds to move their inoculum to new areas, which under favorable condition can cause considerable yield losses. The objective of the present study was to identify fungi associated with bean seeds, their frequency and incidence for bean variety. 102 seed bean lots of 16 varieties for Pinar del Río, Mayabeque and Artemisa provinces were studied. For each seed lot 400 seed were analyzed by blotter test. 679 fungal isolates belonging to 34 species of 20 genera were detected. Penicillium sp. (78.4%), Rhizoctonia solani (77.5%), Aspergillus niger (68.6%) and Fusarium solani (51.0%) were the predominant species. Nine Fusarium species and six Aspergillus species were identified. Sclerotinia sclerotiorum was detected in BAT-58, BAT-93 and Delicia-365 varieties, on which higher infected seed percent was detected in BAT-93. This paper is the first report of S. sclerotiorum incidence on Cuban seed bean. Key words: Aspergillus, Fusarium, mycobiota, Phaseolus, Sclerotini

Incidencia de Alternaria spp. en semillas de cereales, vegetales, frutales y ornamentales

The aim of this work was to determine the Alternaria species associated with seeds of cereals, vegetables, fruits and ornamentals. For this purpose, 2503 seed lots from 21 countries were examined. From each lot, 400 seeds were analyzed by blotter test method. Alternaria species were identified morphologically. For each specie, the occurrence frequency and infestation index by seed type were calculated. A total of 18 species of Alternaria, of the sections Alternaria, Brassicicola, Dianthicola, Gypsophilae, Infectoriae, Japonicae, Porri, Radicina, and Sonchi, were detected. The most frequently detected species was A. alternata. This species constituted 59% of all Alternaria spp., followed by A. brassicicola (10%), T. padwickii (7%), A. tenuisima (7%), A. brassicae (2%), and A. radicina (2%). The observed infestationindexes of A. alternata and A. tagetica endanger the phytosanitary quality of the seeds and the crop health.El objetivo del trabajo fue determinar las especies de Alternaria asociadas a semillas de cereales, vegetales y ornamentales. Se examinaron 2503 lotes de semillas procedentes de 21 países. Por cada lote, se analizaron 400 semillas, mediante el método del "blotter test". Las diferentes Alternaria spp. se identificaron morfológicamente. Para cada especie se calculó la Frecuencia de Aparición por tipo de semilla y el Índice de infestación por cada lote analizado. Se detectaron 18 especies del género Alternaria, de las secciones Alternaria, Brassicicola, Dianthicola, Gypsophilae, Infectoriae, Japonicae, Porri, Radicina y Sonchi. También se detectó a Alternariaster helianthi (Hansf.) E.G. Simmons, Prathoda longissima (Deighton & MacGarvie) E.G. Simmons y Trichoconiella padwickii (Ganguly) B.L. Jain, anteriormente incluidas dentro del género. La especie con mayor frecuencia de detección fue A. alternata. Esta especie constituyó el 59 % de las detecciones de Alternaria spp., seguida por A. brassicicola (10 %), T. padwickii (7 %), A. tenuisima (7 %), A. brassicae (2 %) y A. radicina (2 %). Los índices de infestación observados de A. alternata y A. tagetica alcanzaron valores que comprometen la calidad fitosanitaria de la semilla y la sanidad del cultivo

Diagnóstico mediante qPCR de las razas 1, 2 y 4 tropical de Fusarium oxysporum f. sp. cubensis, agente causal del mal de Panamá de las musáceas

Fusarium oxysporum f. sp. cubensis (Foc), agente causal del mal de Panamá, es uno de los patógenos más nocivos que afectan las musáceas y no puede ser diferenciado morfológicamente de otros F. oxysporum. La enfermedad tiene un largo periodo de incubación que dificulta el diagnóstico temprano, los estudios epidemiológicos y de manejo. Se aisló y purificó el ADN de cuatro aislamientos de la raza 1 (R1, VCG 01210 y 0124), nueve de raza 2 (R2, VCGs 0124, 0124/0125, 0128 y 1210), cinco Nit M de raza tropical 4 (R4T, VCG 01213), uno de la raza 4 subtropical (R4S) y tres de los VCGs, 0120, 0123 y 0124/0125, así como de F. oxysporum asociados a lesiones necróticas en raíces de plátanos y F. pallidoroseum de lesiones de la pudrición de la corona. Se amplificó la región IGS del operón nuclear ribosomal utilizando los cebadores CNS1-CNL12 y se secuenciaron los amplicones obtenidos. Basado en los polimorfismos de los nucleótidos, se desarrollaron cebadores para qPCR para la identificación cuantitativa de aislamientos y tejidos infectados de bananos por Foc TR4 (qFocR4T-f y qFocR4T-r), y R1/R2 (qFocR1R2-f y qFocR1R2-r). Se desarrollaron protocolos individuales de diagnóstico por qPCR utilizando SybrGreen. Se obtuvieron altas sensibilidad y especificidad en el diagnóstico que permitió la detección de 1pg de ADN específico de R4T y R1/R2, respectivamente. Se verificó la similitud de las secuencias de los amplicones con los cebadores, lo que demostró la especificidad de las reacciones. Estos sistemas contribuirán al diagnóstico temprano y cuantitativo de Foc R4T y R1/R2, al conocimiento de la epidemiología, la interacción Foc-Musa spp., así como al desarrollo de herramientas de manejo

Diagnóstico mediante qPCR de las razas 1, 2 y 4 tropical de Fusarium oxysporum f. sp. cubensis, agente causal del mal de Panamá de las musáceas

Fusarium oxysporum f. sp. cubensis (Foc), agente causal del mal de Panamá, es uno de los patógenos más nocivos que afectan las musáceas y no puede ser diferenciado morfológicamente de otros F. oxysporum. La enfermedad tiene un largo periodo de incubación que dificulta el diagnóstico temprano, los estudios epidemiológicos y de manejo. Se aisló y purificó el ADN de cuatro aislamientos de la raza 1 (R1, VCG 01210 y 0124), nueve de raza 2 (R2, VCGs 0124, 0124/0125, 0128 y 1210), cinco Nit M de raza tropical 4 (R4T, VCG 01213), uno de la raza 4 subtropical (R4S) y tres de los VCGs, 0120, 0123 y 0124/0125, así como de F. oxysporum asociados a lesiones necróticas en raíces de plátanos y F. pallidoroseum de lesiones de la pudrición de la corona. Se amplificó la región IGS del operón nuclear ribosomal utilizando los cebadores CNS1-CNL12 y se secuenciaron los amplicones obtenidos. Basado en los polimorfismos de los nucleótidos, se desarrollaron cebadores para qPCR para la identificación cuantitativa de aislamientos y tejidos infectados de bananos por Foc TR4 (qFocR4T-f y qFocR4T-r), y R1/R2 (qFocR1R2-f y qFocR1R2-r). Se desarrollaron protocolos individuales de diagnóstico por qPCR utilizando SybrGreen. Se obtuvieron altas sensibilidad y especificidad en el diagnóstico que permitió la detección de 1pg de ADN específico de R4T y R1/R2, respectivamente. Se verificó la similitud de las secuencias de los amplicones con los cebadores, lo que demostró la especificidad de las reacciones. Estos sistemas contribuirán al diagnóstico temprano y cuantitativo de Foc R4T y R1/R2, al conocimiento de la epidemiología, la interacción Foc-Musa spp., así como al desarrollo de herramientas de manejo