Polyketides isolated from Penicillim herquei

In this work we are reporting the isolation of polyketides citreoserine (1), emodin (2), janthinone (3), dihydrocitrinone (4) and citrinin H-1 (5). The compounds were isolated by chromatographic procedures and identified by spectral methods of NMR 1D and 2D and MS. The compounds 1, 2 and 3 were tested against promastigotes of Leishmania brasiliensis.Neste trabalho estamos portando o isolamento dos policetídeos citreoserina (1), emodina (2), janthinona (3), dihidrocitrinona (4) e citrinina H-1 (5). Os compostos foram isolados por procedimentos cromatográficos e identificados por métodos espectrais de RMN 1D e 2D e EM. Os compostos 1, 2 e 3 foram testados sobre promastigotas de Leishmania brasiliensis

Molecular characterization of atypical enteropathogenic Escherichia coli in wild animals captured in the Amazon Region

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.OBJETIVO: Identificar animais silvestres como reservatórios de Escherichia coli enteropatogênica atípica (aEPEC). MATERIAIS E MÉTODOS: Foram pesquisados os fatores de virulência de aEPEC (eae e bfp) em 263 amostras de E. coli isoladas de 260 animais silvestres capturados em três municípios do estado do Pará (Marabá, Parauapebas e Canaã dos Carajás), de março de 2008 a dezembro de 2009. Os métodos de pesquisa aplicados foram a reação em cadeia da polimerase, utilizando primers específicos, seguida do sequenciamento do gene eae. RESULTADOS: Dentre as 263 amostras de E. coli avaliadas, foram observadas 3,04% (8/263) como aEPEC, com 2,66% (7/263) em roedores e 0,4% (1/263) em marsupiais. Dentre as amostras analisadas, observou-se a presença de quatro variantes de intimina: β1 (amostras 574, 812 e 813), β2 (amostra 630), ζ (amostras 445 e 447) e ε (amostras 611 e 856). Após análise filogenética pelo método de agrupamento de pares não ponderados com base na média aritmética, foi obtida a árvore consenso que apresentou a formação de dois grupos: o primeiro composto por KT591282.1, ε1 intimina (611 e 856) com KT591233.1, β1 intimina (574, 812 e 813); e o segundo por KT591325.1, ζ intimina (445 e 447) com KT591333.1, β2 intimina (630). CONCLUSÃO: Os dados demonstraram que as aEPEC isoladas dos animais silvestres possuíam características genéticas semelhantes às observadas em humanos, podendo os animais analisados estarem servindo de reservatório para as aEPEC circulantes.OBJECTIVE: Identifying wild animals as reservoirs of atypical enteropathogenic Escherichia coli (aEPEC). MATERIALS AND METHODS: aEPEC virulence factors (eae and bfp) were investigated in 263 E. coli samples isolated from 260 wild animals captured in three municipalities of Pará State, Brazil (Marabá, Parauapebas and Canaã dos Carajás), from March 2008 to December 2009. The applied research methods were polymerase chain reaction, using specific primers, followed by the eae gene sequencing. RESULTS: Among the 263 E. coli samples evaluated, 3.04% (8/263) as aEPEC were observed, with 2.66% (7/263) in rodents and 0.4% (1/263) in marsupials. In the analyzed samples were observed four intimin variants: β1 (samples 574, 812, and 813), β2 (sample 630), ζ (445 and 447 samples), and ε (samples 611 and 856). After the phylogenetic analysis by the unweighted pair group method with arithmetic mean, the consensus tree was obtained presenting the formation of two groups: the first one composed by KT591282.1, intimin ε1 (611 and 856) with KT591233.1, intimin β1 (574, 812, and 813); and the second one by KT591325.1, intimin ζ (445 and 447) with KT591333.1, intimin β2 (630). CONCLUSION: Data showed that aEPEC isolated from wild animals had genetic characteristics similar to those observed in humans, and the animals analyzed may serve as reservoirs for circulating aEPEC

Molecular characterization and in silico evaluation of surfactins produced by endophytic bacteria from Phanera splendens

National Council for Scientific and Technological Development (CNPq - Grant: 308631/2021-8; Grant: 310540/2022- 4; Grant: 406269/2022-0), the Federal Agency for Support and Evaluation of Graduate Education (CAPES) and the Postgraduate Pro-Research (PROPESP/UFPA).Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Bioensaios e Química de Microrganismos. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Bioensaios e Química de Microrganismos. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Bioensaios e Química de Microrganismos. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Bioensaios e Química de Microrganismos. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. Belém, PA, Brazil.The Phanera splendens (Kunth) Vaz. is a medicinal plant that is used in traditional medicine for the treatment of various diseases, such as malaria. This plant presents highly efficient endophytic bacterial isolates with biocontrol properties. Bacillus sp. is responsible for the production of a variety of non-ribosomal synthesized cyclic lipopeptides which highlight the surfactins. Surfactins have a wide range of antimicrobial activity, including antiplasmodial activity. There is scientific evidence that surfactin structure 2d-01 can be a potent inhibitor against a Plasmodium falciparum sirtuin (Sir2) by acting on the Sir2A protein as the target. The Pf genome encodes two known sirtuins, PfSir2A and PfSir2B, where PfSir2A is a regulator of asexual growth and var gene expression. Herein, we have identified six surfactins produced by endophytic bacteria and performed in silico analysis to elucidate the binding mode of surfactins at the active site of the PfSir2A enzyme. Among the characterized surfactins, 1d-02 showed the highest affinity for the PfSir2A enzyme, with binding energy values equal to −45.08 ± 6.0 and −11.95 ± 0.8 kcal/mol, using MM/GBSA and SIE methods, respectively. We hope that the information about the surfactin structures obtained in this work, as well as the potential binding affinity with an important enzyme from P. falciparum, could contribute to the design of new compounds with antimalarial activity

ESCHERICHIA COLI ENTEROHEMORRÁGICA E PERFIL DE RESISTÊNCIA A ANTIMICROBIANOS EM SUÍNOS CRIADOS NO ESTADO DO PARÁ

O objetivo deste estudo foi investigar a ocorrência e o perfil de resistência antimicrobiana de Escherichia coli enterohemorrágica em suínos criados no Estado do Pará. 200 amostras fecais de suínos foram coletadas e semeadas em caldos Escherichia coli e Gram negativo, e posteriormente incubadas em Agar MacConkey. Colônias suspeitas foram identificadas em ágar tríplice açúcar ferro para caracterização bioquímica e analisadas a partir de PCR Multiplex, seguido de investigação de susceptibilidade aos agentes antimicrobianos disponíveis usando o sistema VITEK® 2 Compact (bioMérieux)®. Das 15 propriedades estudadas, foram verificadas E. coli enterohemorrágica (EHEC) em seis, sendo isoladas em 11% (22/200) dos animais pesquisados. O teste de susceptibilidade aos antimicrobianos demonstrou que 50% dos casos apresentaram resistência a pelo menos um antimicrobiano: 31,81% para ácido nalidíxico, 27,27% para trimetoprim-sulfametoxazol, 18,18% para ampicilina e 13,63% para cefalotina. Neste estudo, cepas de Escherichia coli enterohemorrágica foram identificadas em suínos,  e foi possível verificar a resistência dessas cepas patogênicas a alguns antimicrobianos utilizados na rotina veterinária e humana, como trimetoprim-sulfametoxazol e ampicilina, que são indicados para combatê-las, surgindo preocupação quanto ao tratamento de doenças que envolvem E. coli patogênica, bem como a seleção de genes de resistência em bactérias presentes na microbiota animal utilizada como alimento, e a possibilidade de transferência desses genes para bactérias do trato intestinal humano

Perfil epidemiológico y caracterización molecular de Salmonella Typhi aisladas en el Estado de Pará, Brasil

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.A Salmonella enterica sorotipo Typhi é o agente etiológico da febre tifoide, doença sistêmica que ocasiona quadros de febres prolongadas juntamente com distúrbios intestinais, podendo evoluir até a perfuração intestinal. No Estado do Pará, a endemicidade reflete um vasto número de surtos e de casos esporádicos em diferentes municípios. O presente estudo teve como objetivo realizar uma caracterização epidemiológica e molecular de Salmonella Typhi isoladas no Pará. Foram analisados quatro genes de virulência (viaB, prt, fliC-d e invA) em 75 casos de febre tifoide com isolamento a partir de hemoculturas e coproculturas, no período de 2009 a 2011. Para averiguação de reação cruzada, foram incluídas seis espécies de outras enterobactérias (Escherichia coli, Salmonella Paratyphi A, Salmonella Typhimurium, Salmonella Panama, Proteus mirabilis e Shigella flexneri). Do total de amostras analisadas, 64% são oriundas de indivíduos do gênero masculino e 36%, do feminino, com diferença significativa entre os sexos (p = 0,0209). Na análise da distribuição anual dos casos de febre tifoide destaca-se a maior ocorrência em 2010, com 31 casos. A maioria destes foi detectada na hemocultura (72%) em relação à coprocultura (28%) (p = 0,0002). A PCR convencional, com quatro pares de primers, identificou corretamente S. Typhi, produzindo quatro bandas positivas, observadas em 100% das amostras analisadas. Na análise genética, as cepas S. Typhi foram altamente similares para os genes analisados, que permaneceram estáveis ao longo das análises, desde o isolamento. Desta forma, os quatros pares de primers apresentaram-se específicos e, deste modo, passíveis de serem utilizados na identificação e caracterização de S. Typhi.Salmonella enterica serotype Typhi, the etiological agent of typhoid fever, a systemic disease that causes prolonged fevers with intestinal disorders and may progress to bowel perforation. In Pará State, Brazil, the endemicity reflects a great number of outbreaks and sporadic cases in different municipalities. The aim of this present study was to carry out an epidemiologic and molecular characterization of Salmonella Typhi strains isolated in Pará State. Four virulence genes (viaB, prt, fliC-d and invA) were analyzed in 75 cases with typhoid fever isolation from blood cultures and stool cultures in the period 2009 to 2011. In order to investigate the cross-reactivity, six other species of enterobacteria (Escherichia coli, Salmonella Paratyphi, Salmonella Typhimurium, Salmonella Panama, Proteus mirabilis, and Shigella flexneri) were included. Samples were analyzed and 64% of them are from male subjects and 36% from female ones, with a significant difference between sexes (p = 0.0209). The analysis of annual distribution of typhoid cases highlights the biggest event in 2010, with 31 cases. Most of the cases was detected in blood culture (72%) compared to fecal culture (28%) (p = 0.0002). Conventional PCR with four pairs of primers identified S. Typhi correctly, producing four positive bands observed in 100% of samples. In the genetic analysis, the S. Typhi strains were highly similar to the genes analyzed which remained stable throughout the analysis since their isolation. Thus, the four pairs were specific primers capable of being used in the identification and characterization of S. Typhi

A study of GJB2 and delGJB6-D13S1830 mutations in Brazilian non-syndromic deaf children from the Amazon region

Hearing impairment affects about 1 in 1000 newborns. Mutations in the connexin 26 (GJB2) gene rank among the most frequent causes of non-syndromic deafness in different populations, while delGJB6-D13S1830 mutation located in the DFNB30 locus is known to cause sensorineural hearing loss. Despite the many studies on the involvement of GJB2 mutations in hearing impairment in different populations, there is little information on genetic deafness in Brazil, especially in the Amazon region. OBJECTIVE: To determine the prevalence of GJB2 mutations and delGJB6-D13S1830 in 77 sporadic non-syndromic deaf patients. METHOD: The coding region of the GJB2 gene was sequenced and polymerase chain reaction was performed to detect the delGJB6-D13S1830 mutation. RESULTS: Mutant allele 35delG was found in 9% of the patients (7/77). Mutations M34T and V95M were detected in two distinct heterozygous patients. Non-pathogenic mutation V27I was detected in 28.6% of the patients (22/77). None of the deaf patients carried the delGJB6-D13S1830 mutation. CONCLUSION: Mutant alleles on gene GJB2 were observed in 40% (31/77) of the subjects in the sample. Pathogenic variants were detected in only 12% (9/77) of the individuals. More studies are required to elucidate the genetic causes of hearing loss in miscegenated populations.A deficiência auditiva afeta cerca de 1 em cada 1000 recém-nascidos. Mutações no gene da conexina 26 (GJB2) são as causas mais frequentes de surdez não sindrômica em diferentes populações e é sabido que a mutação delGJB6-D13S1830 em DFNB30 é causadora de surdez neurossensorial. Muitos estudos descrevem o envolvimento de mutações no gene GJB2 com a deficiência auditiva em diferentes populações. Entretanto, existe pouca informação sobre a surdez genética no Brasil, especialmente na região Amazônica. OBJETIVO: Determinar a prevalência de mutações no gene GJB2 e da mutação delGJB6-D13S1830 em 77 casos esporádicos de surdez não sindrômicas. MÉTODO: A região codificante do gene GJB2 foi sequenciada e a PCR foi realizada para detectar a mutação delGJB6-D13S1830. RESULTADOS: O alelo 35delG foi encontrado em 9% dos pacientes (7/77). As mutações M34T e V95M foram detectadas em dois distintos pacientes heterozigotos. A mutação não patogênica V27I foi detectada em 28,6% (22/77). Não foi detectada a mutação delGJB6-D13S1830 em nenhum paciente estudado. CONCLUSÃO: Alelos mutantes no gene GJB2 foram observados em 40% (31/77) da amostra. Variantes patogênicas foram detectadas em apenas 12% (9/77). Mais estudos são necessários para elucidar causas genéticas de deficiência auditiva em populações miscigenadas

Paleogenetic and taphonomic analysis of human bones from Moa, Beirada, and Zé Espinho Sambaquis, Rio de Janeiro, Brazil

The present paper discusses mtDNA and taphonomy of human remains from Moa, Beirada, and Zé Espinho sambaquis of Saquarema, state of Rio de Janeiro, Brazil. New human bone dating by 14C-AMS for Moa archeological site (3810+50 BP - GX-31826-AMS) is included. Preservation of microscopic lamellae and DNA is not related to the macroscopic integrity of the bones. Results here suggest that the preservation of amplifiable DNA fragments may have relation to the preservation of the lamellar arrangement as indicated by optical microscopic examination (polarized light). In 13 human bone fragments from Moa, Beirada, and Zé Espinho it was possible to sequence mtDNA from the 3 individuals of Moa, and from 1 of 4 individuals of Beirada, whose bones also show extensive areas with preserved lamellar structures. The 6 human bone fragments of Zé Espinho and 3 of the 4 fragments of Beirada showed extensive destruction of cortical microstructure represented by cavities, intrusive minerals, and agglomerated microscopic bodies of fungi and bacteria; it was not possible to extract mtDNA from these samples. The results support the hypothesis that the preservation of the microscopic osteon organization is a good predictor for DNA preservation. It was also confirmed the C haplogroup antiquity in Brazil