31 research outputs found
Возрастная эпидемиология распространенности антительного ответа у детей с пищевой аллергией
Food allergy (FA) is an important health problem which determines lower life quality of a patient and his family. Egg proteins, milk, soy, wheat, and nuts provoke FA more often but any food product may potentially cause allergic reactions. So the aim was to study the age-specific dynamics of antibody response and select the most meaningful IgE production triggers in children with PA. Materials and Methods. The study included 682 children with FA divided into groups according to age: 2−5 months, 6−18 months, 1.5−4 years, 4−10 years, older than 10 years. The IgE levels to cereals, vegetables, bananas, meat, and poultry allergens were measured in blood samples. Results. The age dynamic of IgE-positive responses was detected. The frequency of positive responses was higher in older children. The most significant IgE production triggers for 2−5 months children were allergens of potatoes, pork and cereals (8−14%); for 6−18 month children potatoes (22.7%), buckwheat (19,3%), cereals (10−15%); for 1.5−4 years children ― bananas (29.5%), cereals, carrots and potatoes (19,5−24%); for 4−10 years children ― bananas, carrots and cereals (20−28%); for the senior children ― carrots (47.5%), bananas, cereals and tomatoes (30−36%). Chicken-specific IgE-positive response was minimal for all ages, and meat or poultry specific IgE were observed in 8−15% of patients. Conclusion. Different groups of food allergens provoke sensitization in children during their life. The range of food products with low allergenic activity remains constant in various ages. Age characteristics of IgE production requires differentiated diagnosis approach. Пищевая аллергия (ПА) ― важная проблема здравоохранения, значительно ухудшающая качество жизни пациента и членов его семьи. ПА у детей наиболее часто обусловлена белками яйца, молока, сои, пшеницы и орехов, однако любой пищевой продукт может потенциально вызвать аллергическую реакцию. В связи с этим цель исследования ― изучить возрастную динамику антительного ответа и выбрать наиболее значимые триггеры образования специфических IgE у детей с ПА. Материалы и методы. В исследование включены 682 ребенка с ПА, разделенные на группы в соответствии с возрастом: 2−5 месяцев, 6−18 месяцев, 1,5−4 года, 4−10 лет, старше 10 лет. Пациентам определен уровень IgE к аллергенам злаков, овощей, банана, мяса и птицы. Результаты. Выявлена возрастная динамикачисла IgE-положительных ответов. Для детей 2−5 месяцев наиболее значимыми триггерами образования IgE являлись картофель, свинина и злаки (8−14%). Высокая частота позитивных ответов наблюдалась у более старших детей. Наиболее значимыми триггерами образования IgE для детей 6−18 месяцев являлись аллергены картофеля (22,7%), гречки (19,3%), злаков (10−15%), для детей 1,5−4 лет ― аллергены банана (29,5%), злаков, моркови и картофеля (19,5−24%), для детей 4−10 лет ― аллергены банана, моркови и злаков (20−28%), для детей старше 10 лет ― аллергены моркови (47,5%), банана, злаков и томатов (30−36%). Среди всех детей, включенных в исследование, число пациентов с позитивным ответом на курицу было минимальным, а IgE к животным аллергенам встречались у 8−15% из них. Заключение. У детей разных возрастных периодов сенсибилизация обусловлена различными аллергенами, она расширяется по мере взросления, при этом спектр пищевых продуктов с низкой аллергенной активностью остается для пациентов постоянным. Возрастные особенности антительного ответа требуют дифференцированного подхода в диагностике.
NGS-based identification of druggable alterations and signaling pathways – hepatocellular carcinoma case report
Aim. To identify potential cancer driving or clinically relevant molecular events for a patient with hepatocellular carcinoma. Methods. In order to achieve this goal, we performed RNA-seq and exome sequencing for the tumor tissue and its matched control. We annotated the alterations found using several publicly available databases and bioinformatics tools. Results. We identified several differentially expressed genes linked to the classical sorafenib treatment as well as additional pathways potentially druggable by therapies studied in clinical trials (Erlotinib, Lapatinib and Temsirolimus). Several germline mutations, found in XRCC1, TP53 and DPYD, according to the data from other clinical trials, could be related to the increased sensitivity to platinum therapies and reduced sensitivity to 5-Fluorouracil. We also identified several potentially driving mutations that could not be currently linked to therapies, like deletion in CIRBP, SNVs in BTG1, ERBB3, TCF7L2 et al. Conclusions. The presented study shows the potential usefulness of the integrated approach to the NGS data analysis, including the analysis of germline mutations and transcriptome in addition to the cancer panel or the exome sequencing data.Мета. Ідентифікувати потенційно онкодрайверні або клінічно значущі молекулярні події у пацієнта з гепатоклітинною карциномою. Методи. РНК- та екзомне секвенування пухлинної тканини та відповідного контролю. Анотування знайдених змін, використовуючи декілька загальнодоступних баз даних та біоінформатичних програм. Ми також порівняли транскрипційний профіль досліджуваної пухлини з транскриптомами клітинних ліній з бази даних Genomics of Drug Sensitivity in Cancer. Результати. Ідентифіковано кілька генів, що дифференційно експресуються, і пов’язані як з класичною терапією сорафенібом, так і з додатковими сигнальними шляхами, що потенційно вразливі до терапії препаратами, які досліджувались у клініческих випробуваннях (ерлотініб, лапатініб та темсіролімус). Декілька гермінативних мутацій, знайдених в XRCC1, TP53 та DPYD, згідно з даними інших клінічних випробувань, можуть бути пов’язані з підвищеною чутливістю до платинових терапій та зменшеною чутливістю до 5-фторурацилу. Ми також ідентифікували декілька потенційно драйверних мутацій, які на цей час не можуть бути пов’язані з терапіями, наприклад делеції у CIRBP, заміни в BTG1, ERBB3, TCF7L2 тощо. Висновки. Запропоноване дослідження демонструє потенційну корисність інтегрованого підходу до NGS аналізу даних, в тому числі аналізу гермінативних мутацій та транскриптому у додаток до використання онкологічних генних панелей або даних секвенування екзому.Цель. Выявлении ключевых или клинически значимых молекулярных событий для пациента с гепатоцеллюлярной карциномой. Методы. РНК- и экзомное секвенирования опухолевой и нормальной ткани. Мы проаннотировали найденные генетические нарушения, используя несколько общедоступных баз данных и биоинформатических инструментов. Результаты. Мы определили несколько дифференциально экспрессированных генов, связанных с классической схемой лечения препаратом сорафениб, а также дополнительные пути потенциально поддающиеся терапии препаратами, включенными в клинические испытания (Эрлотиниб, Лапатиниб и Темсиролимус). Несколько герминативных мутаций, найденных в XRCC1, TP53 и DPYD, по данным из других клинических испытаний, могут быть связаны с повышенной чувствительностью к препаратам платины и пониженной чувствительностью к 5-фторурацилу. Мы также определили несколько потенциально драйверных мутаций в генах CIRBP, замены в BTG1, ErbB3, TCF7L2 и др., которые в настоящее время не связаны с терапией. Выводы. Данное исследование показывает потенциальную значимость комплексного подхода к анализу данных NGS, в том числе анализа герминативных мутаций и транскриптома в дополнение к данным из генных панелей или секвенирования экзома
Transcriptome-based identification of PDGFA as a candidate secreted biomarker for hepatocellular carcinoma
Aim. Identification of candidate secreted biomarkers for hepatocellular carcinoma (HCC) diagnosis. Methods. Genes upregulated in HCC tissue and encoding secreted proteins were identified by RNA-seq. Gene expression changes in HCC were evaluated by RT-qPCR and meta-analysis of public databases. Biomarker properties were studied using ROC-curves, correlation and survival analysis. Results. PDGFA was identified by RNA-seq as an overexpressed gene encoding for a secreted protein in 5 HCC cases. PDGFA and GPC3 up-regulation was revealed in 17 of 19 HCC samples and in most cases from the public databases. Combination of PDGFA and GPC3 discerned HCC and non-tumor tissue better than PDGFA or GPC3 alone. PDGFA overexpression was associated with better overall survival of the patients at early HCC stage and with weaker tumor invasion into blood vessels. Conclusion. PDGFA is a valuable secreted biomarker for HCC that might be used in combination with GPC3 to increase its sensitivity.Мета. Ідентифкація потенційних біомаркерів, що секретується для діагностики гепатоцелюлярної карциноми (ГК). Методи. Гени, експресія яких підвищена в тканині ГК і які кодують білки, що секретуються, виявляли РНК-секвенуванням. Експресію генів оцінювали ЗТ-ПЛР або використовували інформацію з відкритих баз даних. Біомаркерні властивості оцінювали за допомогою ROC-кривих, аналізу кореляцій і виживання. Результати. РНК-секвенування п’яти випадків ГК виявило гіперекспресію PDGFA, що кодує секретуємий білок. Підвищення експресії PDGFA та GPC3 виявлено в 17 з 19 зразків ГК та для більшого випадку зразків у базах даних. Спільне використання PDGFA та GPC3 дозволяє точніше відрізнити ГК від непухлинної тканини печінки , ніж PDGFA або GPC3 окремо. Гіперекспресія PDGFA асоційована з кращим прогнозом для пацієнтів з ранніми стадіями ГК і низькою інвазією пухлини в судини. Висновки. PDGFA – перспективний біомаркер ГК, що секретується, який може бути використаний разом з GPC3 для підвищення його чутливості.Цель. Поиск потенциальных секретируемых биомаркеров для диагностики гепатоцеллюлярной карциномы (ГК). Методы. Гены, экспрессия которых повышена в ткани ГК и кодирующие секретируемые белки, выявляли РНК-секвенированием. Экспрессию генов оценивали ОТ-ПЦР или использовали информацию из открытых баз данных. Биомаркерные свойства оценивали с помо-щью ROC-кривых, анализа корреляций и выживаемости. Результаты. РНК-секвенирование 5 случаев ГК выявило гиперэкспрес-сию PDGFA, кодирующего секретируемый белок. Повышение экспрессии PDGFA и GPC3 выявлено в 17 из 19 образцов ГК и в большинстве случаев из баз данных. Совместное использование двух маркерных генов PDGFA и GPC3 позволяет дифференци-ровать ткань ГК от неопухолевой ткани печени лучше, чем PDGFA или GPC3 по отдельности. Гиперэкспрессия PDGFA ассо-циирована с лучшим прогнозом для пациентов с ранними стадиями ГК и низкой инвазией опухоли в сосуды. Выводы. PDGFA – перспективный секретируемый биомаркер ГК, который может быть использован вместе с GPC3 для повышения его чувстви-тельности
Retinoprotective therapy of glaucoma
A.S. Makarova
Krasnov Research Institute of Eye Diseases, Moscow, Russian Federation
Background: a fluctuating blood pressure (BP) and particularly an overnight hypotension is the key adverse factor leading to the progression of glaucomatous optic neuropathy.
Aim: to study the effectiveness of a neuroprotective drug (a complex of water-soluble polypeptide fractions) in patients with unstable primary open-angle glaucoma and normalized ophthalmotonus by monitoring the morphological and functional parameters of the retina and optic nerve.
Patients and Methods: this six-month study included 30 patients (60 eyes) with primary open-angle stage 2 or 3 compensated glaucoma and unstable course. At the first stage of the study, a daily blood pressure monitoring (DBPM) was used for all patients to assess changes in systemic hemodynamics. The patients were split into 2 groups, each group consisting of 15 individuals, who received a different number of intramuscular (IM) injections of a neuroprotective drug, 5.0 mg: 10 injections in group 1 and 20 injections group 2. A comprehensive examination of patients was carried out at the beginning of the follow-up period, and at 3 and 6 months after the completion of the course of treatment with the drug. It included visometry, tonometry, static perimetry and optical coherence tomography of the retina and optic nerve.
Results: based on the DBPM, the normal circadian BP pattern was disturbed in 27 (90%) patients. During the entire follow-up period, both groups demonstrated an improvement in visual acuity. The results of static perimetry indicated the stabilization of the glaucoma process in group 1 patients, while in group 2 where the treatment course with the neuroprotective drug lasted twice longer, it was possible to achieve an improvement in photosensitivity of the retina, as proven by the positive trends in MD and PSD indices. The results of the functional studies fully correlated with the morphological findings as demonstrated by a reliable stabilization of the status of the retinal nerve fiber layer and ganglion complex, as well as the volume of the optic nerve head. At the same time, a longer course of therapy with the drug was accompanied not only by a significant increase in the above parameters, but also by a decline in the volume of excavatio n of the optic nerve disc.
Conclusions: the use of the neuroprotective drug in patients with the progression of primary open-angle glaucoma co-occurring with the changes in systemic hemodynamics enabled to achieve stabilization and improvement of the visual functions.
Keywords: glaucoma, systemic blood pressure, peptide preparation, retinal ganglion cells, neuroprotection, retinoprotection.
For citation: Makarova A.S. Retinoprotective therapy of glaucoma. Russian Journal of Clinical Ophthalmology. 2022;22(4):210–215 (in Russ.). DOI: 10.32364/2311-7729-2022-22-4-210-215.
<br
Implementation and verification of nuclear interactions in a Monte-Carlo code for the Procom-ProGam proton therapy planning system
A great breakthrough in proton therapy has happened in the new century: several tens of dedicated centers are now operated throughout the world and their number increases every year. An important component of proton therapy is a treatment planning system. To make calculations faster, these systems usually use analytical methods whose reliability and accuracy do not allow the advantages of this method of treatment to implement to the full extent. Predictions by the Monte Carlo (MC) method are a “gold” standard for the verification of calculations with these systems. At the Institute of Experimental and Theoretical Physics (ITEP) which is one of the eldest proton therapy centers in the world, an MC code is an integral part of their treatment planning system. This code which is called IThMC was developed by scientists from RFNC-VNIITF (Snezhinsk) under ISTC Project 3563
Optical properties of a new decorative stone—rayizite
In this paper, we present the findings of research on absorption spectra, reflection spectra, and luminescence spectra for a new decorative stone—rayizite, which is a mixture of antigorite, dolomite, and a small amount of talc. This stone exhibits the alexandrite effect, and the color is due to chromian antigorite. The Y and U bands in the absorption spectra and the R line at 686.6 nm in the luminescence spectra indicate that Cr3+ ions are present. The emission spectrum also includes the emission of Fe2+ ions at wavelength 615 nm. The band at 650 nm, which becomes active under the action of a pulsed electron beam and does not occur during photoexcitation, is a distinguishing feature. This band belongs to a center associated with emission from nonbridging oxygen. In this paper, we discuss the mechanism for the formation of such luminescence centers
USING OF BENZATIN-PENICILLIN FOR SECONDARY RHEUMATISM PREVENTION: PROBLEMS AND APPROACHES
Aim: To study the efficacy and lolerability of new benzatin-penicitlin (Extencillin, A VENTIS, France, Germany) as a means of prevention of A-streptococcal tonsillites and following repeated rheumatic attacks and also the data of comparative pharmacokinetics assessment for three therapeutical forms of benzatin-penicillin (Extencillin powder for injections 2.4 tnln U.; Bicillin-5 powder for injections 1.5 mln U, SYNTHESIS. Kurgan, Russia). Results: On prescribing Extencillin in dosage of 2.4 mln U i.m. once per three weeks to 60 pts with reliable rheumatism for 3 years the stable normalization of titers of antistreptolysin-0 was noticed in 8S.2% pts, absence of hemolytic streptococci in fauces - in 86.7%. There were no repeated rheumatic attacks in any patient. In 6.67% cases side effects were noticed (eosinophilia, skin itching) which were short-termed, reversible, and did not require cancellation of the drug. In comparative study off pharmacokinetics it was determined that after Extencillin administration in dosage of 2.4 mln U. concentration of benzyl-penicillin was enough for inhibition of 13-hemolytic A-streptococci (> 0.025 mkg/ml) was preserved for 3-weeks term in 83.3% of cases. After injection of Extencillin 1.2 mln U of Bicillin-5 1.5 mln U this level of benzyl-penicillin was noticed on 21 day’ in 30 and 0% cases cotrespondingly Conclusion: High and prolonged antistreptococcal activity> and good tolerability of Extencillin 2.4 mln U. allow us to recommend it as an effective remedy for secondary prevention of rheumatism. Due to discrepancy to pharmacokinetic requirements to preventive drugs, medical forms of benzatin-penicillin such as Extencillin 1. 2 mln U and Bicillin-5 1.5 mln U. are not acceptable for adequate rheumatism prevention in adult patients
Indenyl Rhodium Complexes with Arene Ligands: Synthesis and Application for Reductive Amination
An efficient protocol for synthesis of indenyl rhodium complexes with arene ligands has been developed. The hexafluoroantimonate salts [(σ5-indenyl)Rh(arene)](SbF6)2 (arene = benzene (2a), o-xylene (2b), mesitylene (2c), durene (2d), hexamethylbenzene (2e), and [2.2]paracyclophane (2g)) were obtained by iodide abstraction from [(σ5-indenyl)RhI2]n (1) with AgSbF6 in the presence of benzene and its derivatives. The procedure is also suitable for the synthesis of the dirhodium arene complex [(μ-σ:σ′-1,3-dimesitylpropane){Rh(σ5-indenyl)}2](SbF6)4 (3) starting from 1,3-dimesitylpropane. The structures of [2e](SbF6)2, [2g](SbF6)2, and [3](SbF6)4 were determined by X-ray diffraction. The last species has a sterically unfavorable conformation, in which the bridgehead carbon atoms of the indenyl ligand are arranged close to the propane linker between two mesitylene moieties. Experimental and DFT calculation data revealed that the benzene ligand in 2a is more labile than that in the related cyclopentadienyl complexes [(C5R5)Rh(C6H6)]2+. Complex 2c effectively catalyzes the reductive amination reaction between aldehydes and primary (or secondary) amines in the presence of carbon monoxide, giving the corresponding secondary and tertiary amines in very high yields (80-99%). This protocol is the most active in water. © 2018 American Chemical Society