13 research outputs found

    A deep learning system accurately classifies primary and metastatic cancers using passenger mutation patterns.

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    In cancer, the primary tumour's organ of origin and histopathology are the strongest determinants of its clinical behaviour, but in 3% of cases a patient presents with a metastatic tumour and no obvious primary. Here, as part of the ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, we train a deep learning classifier to predict cancer type based on patterns of somatic passenger mutations detected in whole genome sequencing (WGS) of 2606 tumours representing 24 common cancer types produced by the PCAWG Consortium. Our classifier achieves an accuracy of 91% on held-out tumor samples and 88% and 83% respectively on independent primary and metastatic samples, roughly double the accuracy of trained pathologists when presented with a metastatic tumour without knowledge of the primary. Surprisingly, adding information on driver mutations reduced accuracy. Our results have clinical applicability, underscore how patterns of somatic passenger mutations encode the state of the cell of origin, and can inform future strategies to detect the source of circulating tumour DNA

    Acompanhamento da vida escolar dos alunos ingressantes no curso de graduação em enfermagem numa escola brasileira: período 1984 a 1988 Acompañamiento de la vida escolar de los alumnos ingresantes en el curso de graduación en enfermería en una escuela brasileña Completion of undergraduate nursing training at a Brazilian nursing college from 1984 to 1988: período 1984 a 1988

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    Foi realizado um estudo da vida escolar dos alunos que se matriculavam na EERP-USP nos anos de 19840 1988, num total de 336 alunos, visando identificar a forma de ingresso, egressão e tempo deformação. Através de um levantamento identificou-se todos os que se matricularam em cada ano, procedendo a análise e acompanhamento de cada aluno, até sua saída da Escola. Durante o período estudado, 197 (58,6%) alunos concluíram o curso; 2 permaneceram cursando e 137 (40,7%) evadiram-se. Desses, 26 (7,7%,) se transferiram; 15 (4,4%,) trancaram a matrícula e 96 (28,5%) abandonaram o curso.<br>Fue realizado un estudio de la vida escolar de los alumnos que se matriculaban en la EERP-USP en los años 1984 a 1988, en un total de 336 alumnos, procurando identificar informa de ingreso, egreso y tiempo de formación. A través de un levantamiento se identificó a todos los que se matricularon en cada año, procediendo a un análisis y acompañamiento de cada alumno, hasta su salida de la escuela. Durante el período estudiado, 197 (58,6%) alumnos concluyeron el curso; 2 permanecieron cursando y 137 (40,7%) se evadieron. De esos, 26 (7,7%) se transfirieron; 15 (4,4%,) palarizaron momentaneamente sus estudios y 96 (28,5%) abandonaron el curso.<br>An investigation of professional nursing training was carried out by examining the time spent in nursing school of the 336 students registered at the Nursing College of Ribeirão Preto at University of São Paulo from 1984 to 1988. The data showed that during this time 197 (58.6%) students graduated, two students were still enrolled, 26 (7.7%) transferred to other schools, 15 (4.4%) officially interrupted their course of study, and 96 (28.5%) abandoned the school

    Pensamento crítico: um enfoque na educação de enfermagem Pensamiento crítico: un enfoque en la educación de enfermería Critical thinking: a focus in nursing education

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    Neste estudo identificamos e analisamos os artigos que apresentavam o termo "pensamento crítico" no título ou no resumo, publicados em periódicos nacionais e internacionais, de julho/1992 a julho/1997. Essa pesquisa bibliográfica buscou responder os questionamentos dos educadores de como melhorar o ensino da enfermagem. Analisamos cinqüenta e dois artigos publicados nos índices Comprehensive Medline, Lilacs e Cinahl. A análise dos dados confirmou que o desenvolvimento do pensamento crítico é uma opção para a mudança do paradigma do processo ensino-aprendizagem. Precisa ser implementado na educação de enfermagem, mas exige planejamento dos currículos e estratégias de ensino que favoreça a participação ativa do aluno.<br>El objetivo de este estudio fue identificar y analizar los artículos publicados en revistas nacionales e internacionales en los últimos cinco años, de julio/1992 a julio/1997, que contenían la expresión "pensamiento crítico" en el título o en su resumen. Realizamos una Investigación bibliográfica buscando responder a las preguntas de los educadores sobre cómo mejorar la enseñaza de Enfermería. Analizamos 52 artículos publicados en los índices Comprehensive Medline, Lilacs e Cinahl. El análisis de los datos demostró que el desarrollo del pensamiento crítico necesita ser materializado en la educación de Enfermería, lo que exige planeación de los currículos y estrategias de enseñanza que favorezcan la participación activa del alumno.<br>In this study we identify and analyse articles published in national and international journals, that used the term "critical thinking" in the title or summary. The aim of the analysis was to seek answers to educators' queries as to how to improve teaching-learning the process in nursing. We analysed 52 articles published in the indexes Comprehensive Medline, Lilacs and Cinahl, in the last five years, from July, 1992 to July, 1997. Data analysis showed that critical thinking should be implemented in nursing education, what demands syllabus planning and teaching-learning strategies that will favour active participation by both educators and learners

    Plantas visitadas por abelhas africanizadas em duas localidades do estado de São Paulo Plants visited by africanized honey bees in two localites of the state of São Paulo

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    O conhecimento das plantas de uma região, sua época de florescimento e as características do pólen, auxiliam na determinação das espécies vegetais que contribuem para a composição do mel. Durante o período de 1994 a 1997 foram inventariadas, semanalmente, em diferentes horários e num raio de aproximadamente 300m dos apiários da USP/ESALQ, em Piracicaba,SP (22°43'S, 47°27'W e 580 m) e do Instituto de Zootecnia, em Pindamonhangaba, SP (22°57'S, 45°27'W e 560 m), as plantas que estavam sendo visitadas por abelhas. Foram anotados o mês e o período de florescimento das plantas inventariadas. Em Piracicaba foram identificadas 94 espécies de plantas pertencentes a 41 famílias (maior número de espécies nas famílias Asteraceae e Myrtaceae) e em Pindamonhangaba, 76 espécies, pertencentes a 26 famílias (maior número de espécies nas famílias Asteraceae e Verbenaceae). Os resultados indicam que 21 famílias, 22 gêneros e 15 espécies de plantas visitadas pelas abelhas africanizadas foram comuns em ambas as localidades.<br>The knowledge of plants from a given region, as well as the blooming period and the pollen characteristics, help for the determination of the plant species which contribute for the honey composition. Plants visited by honey bees were listed during the period 1994 to 1997. The survey was carried out weekly, at different times and within a 300 m radius at two sites: the apiaries of USP/ESALQ in Piracicaba, SP (22°43'S, 47°27'W e 580 m) and of the 'Instituto de Zootecnia', in Pindamonhangaba, SP (22°57'S, 45°27'W e 560 m), both in Brazil. The month and the blooming period were recorded. A total of 94 plants species, from 41 families was identified in Piracicaba (the largest number of species in Asteraceae and Myrtaceae) and 76 plant species of 26 families, in Pindamonhangaba (the largest number of Asteraceae and Verbenaceae). The results indicated that 21 families, 22 genera and 15 species were common for both localities
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