Rede de recursos genéticos animais da Embrapa: espécies nativas com potencial econômico.

É previsto um grande aumento da população humana nas regiões em desenvolvimento do globo nos próximos anos. Tais regiões serão inevitavelmente demandadas por aumento na produção de alimentos. Espécies ainda não domesticadas ou semi-domesticadas possuem enorme potencial para alimentar o número crescente de pessoas do planeta. Ciente de tais desafios, a Embrapa inclui desde 2009 em sua Plataforma Nacional de conservação de Recursos Genéticos, os animais silvestres de interesse econômico. Coleções de animais, bancos de DNA e bancos de germoplasma são mantidos por unidades da empresa e por parceiros da rede, com vistas ao desenvolvimento do setor agropecuário em bases sustentáveis. A plataforma e suas redes de conservação de recursos genéticos propiciam pesquisas sobre as espécies conservadas, gerando uma notável quantidade de informações sobre o genótipo, o fenótipo e o potencial aproveitamento de tais animais em sistemas sustentáveis de produção, para benefício da população humana. Por seu caráter contínuo, a necessidade de captar recursos para manutenção das ações da plataforma é constante

Monitorando a fauna de abelhas de um castanhal no Amazonas: abundância e diversidade.

O objetivo deste trabalho foi realizar monitoramento da entomofauna antófila (Apoidea) em plantio comercial de castanheira com o intuito de determinar a diversidade local dos polinizadores

ANÁLISE NÃO LINEAR DA INFLUÊNCIA DA FISSURAÇÃO NA RESISTÊNCIA AO ARRANCAMENTO DE PINOS EMBUTIDOS EM CONCRETO

Quando conectores de aço com cabeça são solicitados à tração, uma forma de ruptura é ocasionada pelo destacamento de uma região de concreto em torno do conector, em formato de cone. Sabe-se que o aumento do grau de fissuração na região do cone influencia negativamente na resistência do conjunto. Este trabalho apresenta uma modelagem computacional com base em uma série de ensaios experimentais caracterizados pelo arrancamento de conectores de aço embutidos em prismas bi-apoiados de concreto armado. A modelagem visou avaliar a influência do grau de fissuração na resistência do conjunto, onde variou-se a taxa de armadura de flexão de 0,3 até 3,2% entre os modelos, resultando em diferentes graus de fissuração. A análise numérica foi realizada usando o software MIDAS FEA. Foi feito um estudo paramétrico em um dos modelos, para ajustar as propriedades do concreto, sendo os alvos do estudo a resistência à tração, o módulo de elasticidade e a energia de fratura. Os valores definidos na análise foram extrapolados para os outros modelos. Foram determinadas cargas de ruptura e gráficos de carga x deslocamento para os modelos numéricos. Tais resultados foram comparados com os resultados experimentais, apresentando boa correlação, v dos modelos computacionais

Managed native bees (Scaptotrigona aff. postica) and wild pollinators impact on açaípalm (Euterpe oleraceaMart.) yield in eastern Brazilian Amazon. .

Agricultural expansion is a major driver of habitat loss, which triggers biodiversitydecline, including wild pollinators, and affects crop production. 76% of world crops are dependenton biotic pollination, therefore Integrated Crop Pollination (ICP), the arrangement of managed andwild bees combined with farm practices that support wild pollinators (e.g. habitat management),could help reverse negative impacts of pollinators deficit in tropical crops, while maximisingbenefits to producers. In the Amazon River delta, the Açaí palm (Euterpe oleracea Mart.Arecaceae) is unmatched among native forest plants in its cultural, social and economic importanceto the region. Its thick juice (?vinho do açaí?) is an important staple food in both rural and urbanpopulations. We applied the ICP approach to açaí palm production in the eastern Brazilian Amazonand evaluated the effects of a native managed stingless bee, Scaptotrigona postica, and landscape-level forest conservation on yield and socioeconomic outcomes, on 18 açaí palm plantations innortheast Pará state, Brazil. We found that managed stingless bees and forest cover enhancedflower visitor abundance on açaí palm inflorescences, but visitor abundance increases attributed tomanaged bees were associated with shifts in flower visitor evenness and diversity, due to reducedvisitation of wild bees close to managed colonies. Fruit production on inflorescences waspositively related to bee abundance and bee diversity. Consequently, overall pollination efficiencywas lower in plantations dominated by managed bees, especially when native forest cover in thesurroundings was low. At the hectare scale, managed bees and landscape-level forest conservationhad complementary effects on fruit yields, but additional costs of bee colonies mean profits werelargely explained by surrounding forest cover. We concluded that managed bees have greatpotential to boost açaí fruit yields, but the increased environmental and socioeconomic risksassociated with this activity indicates that growers should prioritise forest conservation and habitatrestoration to safeguard natural pollination ecosystem service and improve the overall sustainability of açaí fruit production in the eastern Brazilian Amazon

PhageWeb – Web Interface for Rapid Identification and Characterization of Prophages in Bacterial Genomes

This study developed a computational tool with a graphical interface and a web-service that allows the identification of phage regions through homology search and gene clustering. It uses G+C content variation evaluation and tRNA prediction sites as evidence to reinforce the presence of prophages in indeterminate regions. Also, it performs the functional characterization of the prophages regions through data integration of biological databases. The performance of PhageWeb was compared to other available tools (PHASTER, Prophinder, and PhiSpy) using Sensitivity (Sn) and Positive Predictive Value (PPV) tests. As a reference for the tests, more than 80 manually annotated genomes were used. In the PhageWeb analysis, the Sn index was 86.1% and the PPV was approximately 87%, while the second best tool presented Sn and PPV values of 83.3 and 86.5%, respectively. These numbers allowed us to observe a greater precision in the regions identified by PhageWeb while compared to other prediction tools submitted to the same tests. Additionally, PhageWeb was much faster than the other computational alternatives, decreasing the processing time to approximately one-ninth of the time required by the second best software. PhageWeb is freely available at http://computationalbiology.ufpa.br/phageweb

Data standardization of plant-pollinator interactions

Background: Animal pollination is an important ecosystem function and service, ensuring both the integrity of natural systems and human well-being. Although many knowledge shortfalls remain, some high-quality data sets on biological interactions are now available. The development and adoption of standards for biodiversity data and metadata has promoted great advances in biological data sharing and aggregation, supporting large-scale studies and science-based public policies. However, these standards are currently not suitable to fully support interaction data sharing. Results: Here we present a vocabulary of terms and a data model for sharing plant–pollinator interactions data based on the Darwin Core standard. The vocabulary introduces 48 new terms targeting several aspects of plant–pollinator interactions and can be used to capture information from different approaches and scales. Additionally, we provide solutions for data serialization using RDF, XML, and DwC-Archives and recommendations of existing controlled vocabularies for some of the terms. Our contribution supports open access to standardized data on plant–pollinator interactions. Conclusions: The adoption of the vocabulary would facilitate data sharing to support studies ranging from the spatial and temporal distribution of interactions to the taxonomic, phenological, functional, and phylogenetic aspects of plant–pollinator interactions. We expect to fill data and knowledge gaps, thus further enabling scientific research on the ecology and evolution of plant–pollinator communities, biodiversity conservation, ecosystem services, and the development of public policies. The proposed data model is flexible and can be adapted for sharing other types of interactions data by developing discipline-specific vocabularies of terms.Fil: Salim, José A. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Saraiva, Antonio M.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Zermoglio, Paula Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones En Recursos Naturales, Agroecologia y Desarrollo Rural. - Universidad Nacional de Rio Negro. Instituto de Investigaciones En Recursos Naturales, Agroecologia y Desarrollo Rural.; ArgentinaFil: Agostini, Kayna. Universidade Federal do São Carlos; BrasilFil: Wolowski, Marina. Universidade Federal de Alfenas; BrasilFil: Drucker, Debora P.. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (embrapa);Fil: Soares, Filipi M.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Bergamo, Pedro J.. Jardim Botânico do Rio de Janeiro; BrasilFil: Varassin, Isabela G.. Universidade Federal do Paraná; BrasilFil: Freitas, Leandro. Jardim Botânico do Rio de Janeiro; BrasilFil: Maués, Márcia M.. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (embrapa);Fil: Rech, Andre R.. Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; BrasilFil: Veiga, Allan K.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Acosta, Andre L.. Instituto Tecnológico Vale; BrasilFil: Araujo, Andréa C. Universidade Federal do Mato Grosso do Sul; BrasilFil: Nogueira, Anselmo. Universidad Federal do Abc; BrasilFil: Blochtein, Betina. Pontificia Universidade Católica do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Freitas, Breno M.. Universidade Estadual do Ceará; BrasilFil: Albertini, Bruno C.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Maia Silva, Camila. Universidade Federal Rural Do Semi Arido; BrasilFil: Nunes, Carlos E. P.. University of Stirling; BrasilFil: Pires, Carmen S. S.. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (embrapa);Fil: Dos Santos, Charles F.. Pontificia Universidade Católica do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Queiroz, Elisa P.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Cartolano, Etienne A.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: de Oliveira, Favízia F. Universidade Federal da Bahia; BrasilFil: Amorim, Felipe W.. Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho; BrasilFil: Fontúrbel, Francisco E.. Pontificia Universidad Católica de Valparaíso; ChileFil: da Silva, Gleycon V.. Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; BrasilFil: Consolaro, Hélder. Universidade Federal de Catalão; Brasi