Оптимизация твердофазного синтеза полиамидных миметиков нуклеиновых кислот с применением MALDI-TOF-МАСС-спектрометрии

The solid-phase synthesis of a tetrameric model sequence of polyamide nucleic acid mimetics (PANAM) incorporating terminal chiral and charged unit was performed. As a result during the synthesis and cleavage from the resin the tendency of PANAM with the N-terminal negatively charged monomer to cyclization with simultaneous N-acyl transfer of carboxyethyl base residue was found. Application of MALDI-TOF mass - spectrometry allowed us to find suitable conditions for obtaining PANAM oligomers without the significant amount of by-products.Осуществлен твердофазный синтез тетрамерной модельной последовательности поли-амидных миметиков нуклеиновых кислот (ПАНКМ) с включением концевого хирального заряженного звена. Выявлена склонность ПАНКМ, содержащих N -концевой отрицательно заряженный мономер на основе L -глутаминовой кислоты, к циклизации с одновременным N -ацильным переносом карбоксиэтильного производного нуклеинового основания в ходе синтеза и отщепления со смолы. Использование MALDI - TOF -масс-спектрометрии в ходе эксперимента позволило найти подходящие условия отщепления олигомеров ПАНКМ, приводящие к существенному снижению количества побочных продуктов

OPTIMIZATION OF SOLID-PHASE SYNTHESIS OF POLYAMIDE NUCLEIC ACID MIMETICS WITH APPLICATION OF MALDI-TOF MASS-SPECTROMETRY

The solid-phase synthesis of a tetrameric model sequence of polyamide nucleic acid mimetics (PANAM) incorporating terminal chiral and charged unit was performed. As a result during the synthesis and cleavage from the resin the tendency of PANAM with the N-terminal negatively charged monomer to cyclization with simultaneous N-acyl transfer of carboxyethyl base residue was found. Application of MALDI-TOF mass - spectrometry allowed us to find suitable conditions for obtaining PANAM oligomers without the significant amount of by-products