Regulation of proteinaceous effector expression in phytopathogenic fungi

Effectors are molecules used by microbial pathogens to facilitate infection via effector-triggered susceptibility or tissue necrosis in their host. Much research has been focussed on the identification and elucidating the function of fungal effectors during plant pathogenesis. By comparison, knowledge of how phytopathogenic fungi regulate the expression of effector genes has been lagging. Several recent studies have illustrated the role of various transcription factors, chromosome-based control, effector epistasis, and mobilisation of endosomes within the fungal hyphae in regulating effector expression and virulence on the host plant. Improved knowledge of effector regulation is likely to assist in improving novel crop protection strategies

Impact d’un amorçage olfactif sur la prise alimentaire auprès de patients Alzheimer

Dans le contexte d’une population vieillissante, la dénutrition chez les personnes âgées est devenue une préoccupation majeure de santé publique, en France comme dans la plupart des pays occidentaux (PNNS, 2011). La dénutrition correspond à un déficit des apports nutritionnels, en termes de calories et/ou de nutriments et micronutriments. Sans prise en charge, elle entraîne une diminution de la mobilité, un risque accru de chutes ou de fractures, une vulnérabilité vis-à-vis des maladies infectieuses et une aggravation des maladies chroniques. En parallèle des stratégies « nutritionnelles » (conseils nutritionnels, utilisation de compléments nutritionnels), l’objectif du programme AUPALESENS était de tester l’efficacité de stratégies « sensorielles » pour prévenir et lutter contre la dénutrition chez les seniors. Spécifiquement, ce programme a permis : -De mesurer l’impact de facteurs sensoriels, psychologiques et sociologiques sur le comportement alimentaire et le statut nutritionnel du senior. Ce travail repose sur une enquête pluridisciplinaire menée auprès de 559 français de plus de 65 ans présentant différents degrés de dépendance (personnes autonomes vivant à domicile ; personnes bénéficiant d’une aide à domicile ; personnes vivant en institution). -D’identifier des leviers permettant d’améliorer l’appétence et le plaisir associés aux repas pour les seniors dépendants. Pour ce travail, nous avons développé et testé des outils et des stratégies permettant d’améliorer 1. la qualité sensorielle des aliments proposés aux seniors (contenu de l’assiette) et 2. le contexte du repas (réappropriation du repas). -D’évaluer l’impact de leviers sensoriels sur la prise alimentaire au cours d’un repas. Pour ce travail, nous avons réalisé près de 100 repas expérimentaux au sein de différentes institutions afin de mesurer les quantités ingérées par les résidents en fonction des améliorations sensorielles proposées. Le 26 novembre 2013 s’est tenu à Dijon le colloque de restitution du programme AUPALESENS. Co-labellisé par les pôles de compétitivité Valorial® et Vitagora®, soutenu par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), ce programme a été coordonné par le CHU de Dijon en partenariat avec l’Inra de Dijon et l’ESA d’Angers. Aupalesens a permis de montrer que le maintien du plaisir de manger et d’être à table est une bonne stratégie sensorielle pour répondre à la problématique nutritionnelle du sujet âgé et lutter contre la dénutrition. Le vieillissement s’accompagne de changements qui peuvent influer sur le comportement alimentaire et conduire à une dénutrition. Donnée difficile à évaluer, et souvent sous-estimée, on considère que la dénutrition touche environ 15 à 40% des personnes âgées vivant en institution, et de 50% à 70% de celles hospitalisées. En partant de ce constat, et en se distinguant d’une approche exclusivement nutritionnelle, le programme de recherche Aupalesens a testé l’efficacité de stratégies « sensorielles » pour prévenir et lutter contre la dénutrition chez les seniors. Des liens forts ont ainsi été mis en évidence entre dépendance alimentaire, perte d’autonomie, diminution des capacités sensorielles, plaisir alimentaire et dénutrition. Un risque accru de dénutrition lié à la perte d’autonomie alimentaire Les scientifiques ont mesuré l’impact des facteurs sensoriels, psychologiques et sociologiques sur le comportement alimentaire et le statut nutritionnel du senior. Ce travail repose sur une enquête pluridisciplinaire menée auprès de 559 français de plus de 65 ans présentant différents degrés de dépendance (personnes autonomes vivant à domicile, personnes bénéficiant d’une aide à domicile, personnes vivant en institution). La mise en place des aides chez les personnes en perte d’autonomie est incontournable mais pose la question du bénéfice réel apporté sur l’état nutritionnel par la délégation de tout ou partie des activités culinaires. En effet, 46% des personnes âgées bénéficiant d'une aide pour leur alimentation (à domicile ou en institution) sont dénutries ou à risque de dénutrition, contre seulement 4 à 16% des personnes ne bénéficiant pas d'une aide pour leur alimentation. Des leviers pour améliorer l’appétence et le plaisir associés aux repas des seniors dépendants L’acte alimentaire ne se limitant pas à la satisfaction d’un besoin physiologique, mais étant intimement lié à la dimension plaisir, l’équipe du programme Aupalesens a développé et testé des outils et des stratégies permettant d’améliorer à la fois la qualité sensorielle des aliments proposés aux seniors (contenu de l’assiette) et le contexte du repas, en passant notamment par la réappropriation du repas. Près de 100 repas expérimentaux ont été réalisés au sein de différentes institutions afin de mesurer les quantités ingérées par les résidents en fonction des améliorations sensorielles proposées. La mise à disposition de condiments à table s’est révélée être une stratégie efficace pour augmenter le plaisir à manger. La présence de deux légumes plutôt qu’un seul dans l’assiette a permis d’augmenter la consommation de viande des résidents testés d’environ 32%. L’amélioration organoleptique des plats et l’introduction de variété sensorielle dans l’environnement des repas ont chacune entraîné une augmentation significative des quantités consommées et de l’appréciation du repas. En revanche, ces deux leviers n’ont pas d’effet cumulatif. Projet ambitieux et pluridisciplinaire, le programme Aupalesens a permis d’ouvrir une nouvelle aire dans la lutte contre la dénutrition des seniors dépendants, en montrant avant tout qu’une bonne alimentation consiste non seulement à satisfaire leurs besoins nutritionnels, mais aussi à leur proposer des plats qu’ils consomment… avec plaisir. A la suite du colloque AUPALESENS, l’Inra organisait également en partenariat avec Vitagora®, le 27 novembre 2013, un Carrefour de l’Innovation Agronomique à Dijon sur la thématique « L'alimentation des seniors et le bien vieillir », dont la restitution vidéo est accessible sur le site institutionnel (inra.fr). AUPALESENS a été financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR). Ce programme a rassemblé 7 organismes de recherche publique : le CHU de Dijon Service de Médecine Interne Gériatrie, l’ESA d’Angers, l’unité Sensométrie et Chimiométrie de Nantes (ONIRIS/Inra), l’unité LARGECIA de Nantes (ONIRIS), l’unité Aliss (Inra, Paris), l’UMR CSGA (Inra, CNRS, Université de Bourgogne, Dijon), le Service d’endocrinologie et diabétologie du CHU d’Angers, et le Département de psychologie des âges de la vie de l’Université François Rabelais (Tours). Sept structures privées ont également été impliquées : Les Repas Santé (Beaune), Livrac groupe Terrena (Haute Goulaine), Frutarom (Dijon), Lactalis (Retiers), Cecab D’aucy (Saint Thurien), Entremont Alliance (Malestroit). AUPALESENS est un programme labellisé par Valorial® et Vitagora® deux pôles de compétitivité guidant ses acteurs scientifiques et industriels vers des projets collaboratifs débouchant sur des produits et services innovant visant la conquête de marchés alimentaires en France et à l’export

Transcriptome and small RNAome profiling uncovers how a recombinant begomovirus evades RDRγ-mediated silencing of viral genes and outcompetes its parental virus in mixed infection

International audienceTomato yellow leaf curl virus (TYLCV, genus Begomovirus, family Geminiviridae) causes severe disease of cultivated tomatoes. Geminiviruses replicate circular single-stranded genomic DNA via rolling-circle and recombination-dependent mechanisms, frequently generating recombinants in mixed infections. Circular double-stranded intermediates of replication also serve as templates for Pol II bidirectional transcription. IS76, a recombinant derivative of TYLCV with a short sequence in the bidirectional promoter/origin-of-replication region acquired from a related begomovirus, outcompetes TYLCV in mixed infection and breaks disease resistance in tomato Ty-1 cultivars. Ty-1 encodes a gamma-clade RNA-dependent RNA polymerase (RDR gamma) implicated in Dicer-like (DCL)-mediated biogenesis of small interfering (si)RNAs directing gene silencing. Here, we profiled transcriptome and small RNAome of Ty-1 resistant and control susceptible plants infected with TYLCV, IS76 or their combination at early and late infection stages. We found that RDR gamma boosts production rates of 21, 22 and 24 nt siRNAs from entire genomes of both viruses and modulates DCL activities in favour of 22 and 24 nt siRNAs. Compared to parental TYLCV, IS76 undergoes faster transition to the infection stage favouring rightward transcription of silencing suppressor and coat protein genes, thereby evading RDR gamma activity and facilitating its DNA accumulation in both single and mixed infections. In coinfected Ty-1 plants, IS76 efficiently competes for host replication and transcription machineries, thereby impairing TYLCV replication and transcription and forcing its elimination associated with further increased siRNA production. RDR gamma is constitutively overexpressed in Ty-1 plants, which correlates with begomovirus resistance, while siRNA-generating DCLs (DCL2b/d, DCL3, DCL4) and genes implicated in siRNA amplification (alpha-clade RDR1) and function (Argonaute2) are upregulated to similar levels in TYLCV- and IS76-infected susceptible plants. Collectively, IS76 recombination facilitates replication and promotes expression of silencing suppressor and coat proteins, which allows the recombinant virus to evade the negative impact of RDR gamma-boosted production of viral siRNAs directing transcriptional and posttranscriptional silencing.In plants, endogenous and antiviral RNAi mediated by Dicers generating siRNAs and Argonautes binding siRNAs to silence plant and viral genes transcriptionally and/or posttranscriptionally can be amplified by RNA-dependent RNA polymerases (RDRs) of alpha-clade generating precursors of secondary siRNAs. To establish successful infection, viruses evade or suppress antiviral RNAi. Here we undertook small RNAome and transcriptome profiling to uncover how a recombinant ssDNA begomovirus evades repressive siRNAs, overcomes resistance in Ty-1 tomato cultivars mediated by a gamma-clade RDR and outcompetes parental viruses in mixed infection. We found that the recombination event within the intergenic region carrying bidirectional promoter and origin-of-replication elements facilitates viral DNA replication and promotes rightward transcription of RNAi suppressor and coat protein genes. This allows the recombinant virus to evade the negative impact of RDR gamma-boosted production of 22 and 24 nt siRNAs which effectively repress the parental virus, leading to its elimination in mixed infection

Evaluation of ultrasmall gadolinium-based nanoparticles for theranostic applications

National audienc

Synthesis and characterization of multimodal Gd-Nanoparticles vectorized for Amyloidosis diagnosis, and their affinity evaluation using Biacore.

International audienceAmyloidosis is a systemic disorder in which proteins form insoluble aggregates (or fibrils) in extracellular tissues. Depending of the protein nature and its deposition area, this accumulation could lead to different pathologies. In this project, we focus on three kind of amyloidosis forms: i) Amyloid Aβ, ii) Islet Amyloid PolyPeptide IAPP, iii) Transthyretin TTR, which are respectively responsible of Alzheimer Disease, type II diabetes and finely cardiomyopathy and polyneuropathy. We are investigating two different strategies to target the fibrils: i) Camelid heavy chain antibody fragment (or Nanobody)[1], ii) Peptides derived from the protein responsible of the aggregate

Synthesis and characterization of multimodal Gd-Nanoparticles vectorized for Amyloidosis diagnosis, and their affinity evaluation using Biacore.

International audienceAmyloidosis is a systemic disorder in which proteins form insoluble aggregates (or fibrils) in extracellular tissues. Depending of the protein nature and its deposition area, this accumulation could lead to different pathologies. In this project, we focus on three kind of amyloidosis forms: i) Amyloid Aβ, ii) Islet Amyloid PolyPeptide IAPP, iii) Transthyretin TTR, which are respectively responsible of Alzheimer Disease, type II diabetes and finely cardiomyopathy and polyneuropathy. We are investigating two different strategies to target the fibrils: i) Camelid heavy chain antibody fragment (or Nanobody)[1], ii) Peptides derived from the protein responsible of the aggregate

Development of a UV-Stabilized Topical Formulation of Nifedipine for the Treatment of Raynaud Phenomenon and Chilblains

Raynaud’s Phenomenon is a vascular affliction resulting in pain and blanching of the skin caused by excessive and prolonged constriction of arterioles, usually due to cold exposure. Nifedipine is a vasodilatory calcium channel antagonist, which is used orally as the first-line pharmacological treatment to reduce the incidence and severity of attacks when other interventions fail to alleviate the condition and there is danger of tissue injury. Oral administration of nifedipine, however, is associated with systemic adverse effects, and thus topical administration with nifedipine locally to the extremities would be advantageous. However, nifedipine is subject to rapid photodegradation, which is problematic for exposed skin such as the hands. The goal of this project was to analyze the photostability of a novel topical nifedipine cream to UVA light. The effect of incorporating the photoprotectants rutin, quercetin, and/or avobenzone (BMDBM) into the nifedipine cream on the stability of nifedipine to UVA light exposure and the appearance of degradation products of nifedipine was determined. Rutin and quercetin are flavonoids with antioxidant activity. Both have the potential to improve the photostability of nifedipine by a number of mechanisms that either quench the intermolecular electron transfer of the singlet excited dihydropyridine to the nitrobenzene group or by preventing photoexcitation of nifedipine. Rutin at either 0.1% or 0.5% (w/w) did not improve the stability of nifedipine 2% (w/w) in the cream after UVA exposure up to 3 h. Incorporation of quercetin at 0.5% (w/w) did improve nifedipine stability from 40% (no quercetin) to 77% (with quercetin) of original drug concentration after 3 h UVA exposure. A combination of BMDBM and quercetin was the most effective photoprotectant for maintaining nifedipine concentration following up to 8 h UVA exposure.Pharmaceutical Sciences, Faculty ofNon UBCReviewedFacult