Identification of coronaviruses in bats and rodents in northern and central Argentina

Due to the present pandemic situation and the many animal species that are epidemiologically involved, there has been a surge of renewed interest in investigating the coronavirus (CoV) population circulating in wildlife, especially bats and rodents, which are potential reservoirs of new human pathogens. In Argentina, information about the viruses present in these mammals is very limited. To investigate the presence of coronaviruses in this country, we obtained 457 samples from hematophagous, insectivorous, and frugivorous bats and rodents from two regions of Argentina. We report here the detection of alphacoronavirus sequences in three groups of bats as well as in rodents. Phylogenetic analysis showed the closest relationships to alphacoronaviruses from Brazil.Fil: Lucero Arteaga, Franco Exequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Pampa; ArgentinaFil: Miragaya, Marcelo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Investigación y Tecnología en Reproducción Animal; ArgentinaFil: Molina, Nicolas. Ministerio de Agricultura, Ganadería, Pesca y Alimento. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria; ArgentinaFil: Mondino, Mariela. Universidad Nacional de La Pampa; ArgentinaFil: Bracamonte, Julio Cesar. Ministerio de Ambiente y Cambio Climático de Jujuy; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Capitelli, Gabriel Mario. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Mundo, Silvia Leonor. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Bratanich, Ana Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal; Argentin