Reliable flow cytometric estimation of nuclear DNA content in coffee trees

La cytométrie en flux a permis d'obtenir des mesures précises de la taille des génomes de deux taxons (#C. liberica dewevrei et #C. pseudozanguebariae). L'iodure de propidium (IP) et le #Petunia hybrida ont été utilisés, respectivement, comme fluorochrome et standard interne. La linéarité de la relation entre la quantité d'ADN et le signal fluorescent digitalisé a été vérifiée. Cinq résultats majeurs ressortent : des conditions expérimentales optimales ont été définies pour l'estimation de la position des pics (moyenne et mode), le temps de coloration (au moins deux minutes), le voltage du photomultiplicateur (557 V) et de la concentration en IP (330 microg/ml) ; les effets du voltage et de la concentration en IP ont été paramétrés ; deux biais dus aux variations de voltage et de concentration en IP ont été décelés dans l'estimation de la quantité d'ADN par noyau. Ces biais ont été minimisés ; les tailles de génome de #C. liberica dewevrei et de #C. pseudozanguebariae$ ont été estimées avec précision (respectivement 2C = 1,421 plus ou moins 0,005 pg et 2C = 1,129 plus ou moins 0,005 pg) ; des variations entre génotypes ont été mises en évidence dans chaque taxon. (Résumé d'auteur

Les caféiers en Afrique : diversité génétique et amélioration des plantes

Des collectes de caféiers sauvages, dans la zone tropicale humide africaine, ont permis de constituer une collection vivante des différentes espèces de #Coffea. L'étude de leur diversité génétique a été entreprise en utilisant des descripteurs botaniques et enzymatiques, ainsi que des tests d'hybridation interspécifique. On constate que les espèces de caféiers sont inégalement réparties sur l'ensemble de l'aire de la forêt tropicale humide. A l'intérieur des espèces, une structure génétique peut être mise en évidence, différente d'une espèce à l'autre. En combinant ces résultats aux observations des hybridations interspécifiques, il est proposé une organisation du genre #Coffea en trois sections. D'une façon générale, une réflexion est menée sur la notion d'espèce et l'évolution de ces espèces, en liaison avec les modifications du paléoenvironnement. Les conséquences pratiques de ces études pour l'amélioration des caféiers sont les suivantes : 1. L'introgression des formes cultivées est tentée avec les espèces sauvages possédant des caractères particuliers d'intérêt agronomique ; 2. L'espèce #C. canephora$ est constituée de deux groupes et les hybrides F1 entre les deux groupes sont très productifs ; un schéma de Sélection Récurrente Réciproque avec création d'hybrides F1 est donc appliqué. (Résumé d'auteur

Classical Morphology of Plants as an Elementary Instance of Classical Invariant Theory

It has long been known that structural chemistry shows an intriguing correspondence with Classical Invariant Theory (CIT). Under this view, an algebraic binary form of the degree n corresponds to a chemical atom with valence n and each physical molecule or ion has an invariant-theoretic counterpart. This theory was developed using the Aronhold symbolical approach and the symbolical processes of convolution/transvection in CIT was characterized as a potential “accurate morphological method”. However, CIT has not been applied to the formal morphology of living organisms. Based on the morphological interpretation of binary form, as well as the process of convolution/transvection, the First and Second Fundamental Theorems of CIT and the Nullforms of CIT, we show how CIT can be applied to the structure of plants, especially when conceptualized as a series of plant metamers (phytomers). We also show that the weight of the covariant/invariant that describes a morphological structure is a criterion of simplicity and, therefore, we argue that this allows us to formulate a parsimonious method of formal morphology. We demonstrate that the “theory of axilar bud” is the simplest treatment of the grass seedling/embryo. Our interpretations also represent Troll's bauplan of the angiosperms, the principle of variable proportions, morphological misfits, the basic types of stem segmentation, and Goethe's principle of metamorphosis in terms of CIT. Binary forms of different degrees might describe any repeated module of plant organisms. As bacteria, invertebrates, and higher vertebrates are all generally shared a metameric morphology, wider implications of the proposed symmetry between CIT and formal morphology of plants are apparent

MAORY for ELT: preliminary design overview

MAORY is one of the approved instruments for the European Extremely Large Telescope. It is an adaptive optics module, enabling high-angular resolution observations in the near infrared by real-time compensation of the wavefront distortions due to atmospheric turbulence and other disturbances such as wind action on the telescope. An overview of the instrument design is given in this paper