Invasive fungal infection in immunosuppressed patients treated in a tertiary hospital

Antecedentes: las infecciones fúngicas invasivas son una causa importante de morbimortalidad mundial. El aumento en la incidencia de estas micosis se relaciona con el incremento de las condiciones de inmunosupresión. Objetivo: Describir las características demográficas y clínicas de pacientes inmunosuprimidos tratados con antifúngicos por sospecha de infecciones fúngicas invasivas en una institución de tercer nivel. Materiales y métodos: estudio descriptivo de corte transversal, en el que se incluyeron pacientes que recibieron tratamiento antifúngico durante 2012 y 2013, por sospecha de infecciones fúngicas invasivas (aspergilosis, criptococosis, histoplasmosis y mucormicosis) y condición de inmunosupresión. Resultados: se analizaron 81 pacientes, con predominio masculino (66,5%) y una media de edad de 44 años. El diagnóstico de base más frecuente fue neoplasia hematolinfoide seguido de infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). La aspergilosis angioinvasiva (52%) y la criptococosis (28%) fueron las sospechas clínicas más frecuentes. El 43 y 85% de los pacientes tuvieron hallazgos anormales en radiografía y tomografía axial computarizada de tórax respectivamente. De aquellos con sospecha de aspergilosis, el 23% tuvo prueba de galactomanano positiva, en tanto que en aquellos con sospecha de criptococosis pulmonar, el 75% fue positivo para el antígeno capsular. El 22% de los pacientes fallecieron y el 17% requirieron estancia en UCI y soporte hemodinámico. Conclusión: es importante sospechar de forma temprana la infecciones fúngicas invasivas, así como establecer un algoritmo diagnóstico e instaurar el tratamiento antifúngico de manera anticipada para disminuir los desenlaces fatales. La dificultad en la confirmación microbiológica de las infecciones fúngicas invasivas continúa siendo una problemática local, similar a lo reportado en la literatura mundial.Artículo original10-17Background: invasive fungal infections (IFI) are a major cause of mortality and morbidity worldwide. The increased incidence of these fungal infections are associated with an increase in immunosuppressive conditions. Objective: to describe demographic and clinical characteristics of immunosuppressed patients treated with antifungals for suspected invasive fungal infection (IFI) in a tertiary hospital. Materials and methods: in this descriptive cross-sectional study, immunosuppressed patients receiving antifungal treatment during 2012 and 2013, with suspected IFI (aspergillosis, cryptococcosis, mucormicosis and histoplasmosis) were included. Results: 81 patients, predominantly men (66.5%), with a mean age of 43.8 years were analyzed. The most common underlying conditions were lymphoproliferative disorders followed by HIV infection. Angioinvasive aspergillosis (52%) and cryptococcosis (28%) were most frequently suspected. 43% and 85% of patients had abnormal findings on chest radiograph and CT, respectively. 22% of the patients died and 17% required monitoring in the ICU and hemodynamic support. Conclusion: This highlights the importance of a high index of suspicion and early diagnosis of IFI, following an algorithm that enables the timely initiation of antifungal treatment to reduce fatal outcomes. It also identifies the obstacles of getting microbiological confirmation of these pathogens; the difficulties being similar in our institution to those reported elsewhere

Histoplasmosis : results of the Colombian National Survey, 1992-2008

Introducción. La histoplasmosis está caracterizada por variadas manifestaciones que van desde la afección subclínica a la enfermedad diseminada, y suele presentarse tanto en huéspedes inmunocompetentes como inmunosuprimidos. Como la enfermedad no es de notificación obligatoria en Colombia, se diseñó una encuesta para recolectar información de los casos diagnosticados en el país. Objetivo. El objetivo de este trabajo fue analizar los datos recolectados desde 1992 hasta 2008. Materiales y métodos. La encuesta incluyó datos demográficos, factores de riesgo, manifestaciones clínicas, estudios de imágenes, métodos diagnósticos y tratamiento antifúngico. Los pacientes se agruparon de acuerdo con los factores de riesgo y se compararon los correspondientes hallazgos. Resultados. Se examinaron 434 encuestas provenientes de 20 de los departamentos colombianos. La mayoría (96,1 %) correspondían a adultos, 77 % eran hombres con edad promedio de 38,4 años, y sólo 3,9 % eran niños o adolescentes. En los adultos, 70,5 % tenían sida y 7 % presentaban otra inmunosupresión. Las manifestaciones predominantes fueron fiebre (76,1 %), tos (54,8 %) y síntomas constitucionales (56,8 %). En las radiografías, las anormalidades fueron principalmente infiltrados (65,9 %) y nódulos (17,1 %). El diagnóstico se estableció por observación microscópica de H. capsulatum en 49,6 % casos, por cultivo en 58 % y por pruebas serológicas en 14,6 %. El tratamiento se informó sólo en 52,5 % casos. Conclusiones. Se demostró que la histoplasmosis es frecuente en Colombia, especialmente en grupos de riesgo como son los pacientes infectados con el VIH. El análisis de este número relevante de pacientes permitió establecer comparaciones válidas sobre aspectos de la histoplasmosis en nuestro país.Q4Q3344-356Introduction. Histoplasmosis, a fungal disorder characterized by a wide spectrum of manifestations that range from subclinical infections to disseminated processes, affects both immunocompetent and immunosuppressed individuals. Histoplasmosis is not a reportable disease in Colombia and consequently, a survey was designed to collect histoplasmosis cases diagnosed in the country. Objective. The aim of this work was to analyze the data collected from 1992 to 2008. Materials and methods. The survey included demographic data, risk factors, clinical manifestations, imaging data, diagnostic methods and antifungal treatment. Patients were grouped according to risk factors and comparisons of the various findings were done. Results. A total of 434 surveys were gathered from 20 of the countryâ s Departments. Most patients (96.1%) were adults, 77% were males with a mean age of 38.4 years. Only 3.9% were children less than 15 years of age. In the adult population, AIDS was reported in 70.5% of the cases; additionally, in 7.0% patients other immunosuppressive conditions were informed. The most frequent clinical manifestations were fever (76.1%), cough (54.8%) and constitutional symptoms (56.8%). X rays abnormalities were represented mainly by infiltrates (65.9%) and nodules (17.1%). Diagnosis was made by microscopic observation of H. capsulatum in 49.6% patients, by culture in 58.0% and by serological test in 14.6% cases. Antifungal use was recorded in 52.5% cases. Conclusions. Histoplasmosis is frequent in Colombia, especially in certain risk factor groups such as the HIV-infected population. Data collected from this large number of cases has allowed valid comparisons on various aspects of histoplasmosis in Colombia

Fusarium spp. : un modelo para el análisis de patógenos multihospedero

Fusarium es un hongo filamentosos saprófito del suelo que se ha caracterizado por ser patógeno de diferentes hospederos, con un enorme impacto a nivel fitopatógeno y clínico, por considerarse patógeno emergente. Su habilidad para causar enfermedad en un amplio rango de hospederos lo convierten un organismo modelo para analizar mecanismos patogenicidad. En este trabajo se propuso evaluar aislamientos de Fusarium de diferentes orígenes con el fin de entender su capacidad como patógeno multihospedero. Cuarenta aislamientos de Fusarium spp. origen humano (superficial y sistémico), animal y vegetal fueron identificados a nivel de especie, morfológica y molecularmente. Luego se caracterizaron por ERIC-PCR y REP-PCR, se evaluó su comportamiento frente a diferentes factores moduladores de patogenicidad (respuesta a diferentes temperaturas, pH y sustrato, y actividad ureasa) y su perfil de susceptibilidad a antifúngicos de uso en terapia clínica. Se identificaron diferentes especies en los aislamientos de Fusarium de los cuatro orígenes, siendo Fusarium oxysporum la especie más representativa. Sin embargo, los resultados obtenidos mostraron inconsistencias entre identificación morfológica y molecular al momento de interpretar los resultados. En la caracterización molecular no se observó formación de conglomerados definidos por origen de aislamiento o por especie identificada, mostrando un alto grado de diversidad en los aislamientos estudiados, lo que explica porque Fusarium spp. puede considerarse un modelo de patógeno multihospedero, con la capacidad para adaptarse a diferentes condiciones de temperatura, pH y actividad ureasa, así como la resistencia presentada frente a diferentes antifúngicos. Los resultados derivados de este trabajo permiten sugerir a Fusarium spp. como modelo para el análisis de patógenos multihospedero

Análise retrospectiva (2009-2010) das alterações dermatológicas, óticas e oftalmológicas com diagnóstico clínico presuntivo de micose em cães e gatos.

Objective. To determine the prevalence of dermatological, ear and ophthalmological alterations clinically suspected to be caused by fungi and to analyze their occurrence demographically. Materials and methods. We carried out a retrospective study in a clinic in Bogota for small animals. We reviewed the medical histories of patients who requested medical appointments due to dermatological, ear and ophtalmological alterations in 2009 and 2010. Results. In the assessed period, the prevalence of dermatological alterations in dogs was of 7.8%, 4.2% of ear alterations and of 3.3% of ophtalmological alterations. The main etiological suspects through clinical diagnosis were: dermatophytes with an incidence of 86.9% among dermatological alterations, Malassezia with an 86.5% of incidence in ear alterations, and Candida with 83.3% of incidence in ophtalmological alterations. Statistical analysis of variables showed no association with symptoms or clinically diagnosed etiological agents, but the categorized evaluation showed associations of races and ages with the etiologies through clinical diagnosis. The diagnosis of fungal etiologies was accomplished in most cases by clinical findings and less frequently by skin scrapings and ear cytology; in none of the cases a mycological culture was done. The feline population showed no dermatological, ear or ophtalmological alterations compatible with a fungal etiology.  Conclusion. In canines, the prevalence of dermatological alterations clinically compatible with dermatophytes was of 86.9%; ear alterations associated with Malassezia were of 86.5%; and ophtalmological alterations Candida-suspected were 83.3%. Final diagnoses were accomplished with the help of clinical findings without following standard diagnostic methodologies such as cultivation. Key words: canines, felines, dermatophytes, Malassezia, Candida Objetivo. Determinar la prevalencia de las alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente sospechosas de ser causadas por hongos y analizar demográficamente su presentación. Materiales y métodos. Se realizó un estudio retrospectivo en una clínica para pequeños animales en Bogotá; se revisaron historias clínicas de pacientes que consultaron por alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas durante 2009 y 2010. Resultados. En el período evaluado la prevalencia de las alteraciones dermatológicas en caninos fue de 7,8%, las óticas de 4,2% y las oftalmológicas de 3,3%. Dentro de las alteraciones dermatológicas, la sospecha principal etiológica por diagnóstico clínico fueron los dermatofitos con 86,9%, en las alteraciones óticas fue Malassezia con 86,5% y para las oftalmológicas fue Candida con 83,3%. El análisis estadístico de variables no  mostró asociación con los síntomas ni con los agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; sin embargo, la evaluación categorizada evidenció asociaciones entre razas y edades con las etiologías por diagnóstico clínico. El diagnóstico de las etiologías micóticas se estableció en la mayoría de los casos por hallazgos clínicos y con menor frecuencia por raspado de piel y citología ótica; en ninguno de los casos se realizó cultivo micológico. La población felina no presentó alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente compatibles con etiología fúngica. Conclusión. En caninos, la prevalencia de las alteraciones dermatológicas clínicamente compatibles con dermatofitos fue de 86,9%, los procesos óticos asociados con Malassezia de 86,5% y los oftalmológicos sospechosos de Candida con 83,3%. Los diagnósticos definitivos se establecieron por hallazgos clínicos sin la realización de metodologías diagnósticas estándar como el cultivo. Palabras clave: caninos, felinos, dermatofitos, Malassezia, Candida. Objetivo. Determinar a prevalência das alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente suspeitas de serem causadas por fungos e analisar demograficamente sua apresentação. Materiais e métodos. Foi realizado um estudo retrospectivo numa clínica para pequenos animais em Bogotá; foram revisadas ​​as histórias clínicas de pacientes com alterações dérmicas, óticas e oftalmicas em 2009 e 2010. Resultados. Durante o período de avaliação a prevalência das alterações dérmicas em cães foi de 7,8%, as óticas de 4,2% e as oftálmicas de 3,3%. Dentro das alterações dérmicas, a principal suspeita etiológica por diagnóstico clínico foram os dermatófitos com 86,9%, nas alterações óticas foi Malassezia com 86,5% e para as oftálmicas foi  Candida com 83,3%. A análise estatística das variáveis ​​não apresentou associação com os sintomas ou com os agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; embora, a avaliação categorizada evidenciou associações entre raças e idades com as etiologias por diagnóstico clínico. O diagnóstico das etiologias micóticas foi estabelecido na maioria dos casos pelos achados clínicos e, menos freqüentemente por raspados de pele e citologia ótica, em nenhum dos casos foi realizada uma cultura micótica. A população felina não apresentou alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente compatíveis com etiologia fúngica. Conclusão. Em cães, a prevalência das alterações dérmicas clinicamente compatíveis com dermatófitos foi de 86,9%, os processos óticos associados com Malassezia foi de 86,5% e os oftálmicos suspeitos de Candida foi de 83,3%.  Os diagnósticos definitivos foram estabelecidos pelos achados clínicos sem a realização de métodos diagnósticos padroes, como o cultivo.   Palavras-chave: cães, gatos, dermatófitos, Malassezia, Candid

Análisis retrospectivo (2009-2010) de las alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas con diagnóstico clínico presuntivo de micosis en caninos y felinos

A retrospective analysis (2009-2010) of the dermatological, ear and ophtalmological alterations with presumptive clinical diagnosisof mycosis in canines and felines. Objective. To determine the prevalence of dermatological, ear and ophthalmological alterationsclinically presumptive to be caused by fungi and to analyze their occurrence demographically. Materials and methods. We carriedout a retrospective study in a clinic in Bogota for small animals. We reviewed the medical histories of patients who requested medicalappointments due to dermatological, ear and ophtalmological alterations in 2009 and 2010. Results. In the assessed period, the prevalenceof dermatological alterations in dogs was of 7.8%, 4.2% of ear alterations and of 3.3% of ophtalmological alterations. The main etiologicalsuspects through clinical diagnosis were: dermatophytes with an incidence of 86.9% among dermatological alterations, Malasseziawith an 86.5% of incidence in ear alterations, and Candida with 83.3% of incidence in ophtalmological alterations. Statistical analysisof variables showed no association with symptoms or clinically diagnosed etiological agents, but the categorized evaluation showedassociations of races and ages with the etiologies through clinical diagnosis. The diagnosis of fungal etiologies was accomplished in mostcases by clinical findings and less frequently by skin scrapings and ear cytology; in none of the cases a mycological culture was done.The feline population showed no dermatological, ear or ophtalmological alterations compatible with a fungal etiology. Conclusion. In canines, the prevalence of dermatological alterations clinically compatible with dermatophytes was of 86.9%; ear alterations associated with Malassezia were of 86.5%; and ophtalmological alterations Candida-suspected were 83.3%. Final diagnoses were accomplished with the help of clinical findings without following standard diagnostic methodologies such as cultivation

Análise retrospectiva (2009-2010) das alterações dermatológicas, óticas e oftalmológicas com diagnóstico clínico presuntivo de micose em cães e gatos.

Objective. To determine the prevalence of dermatological, ear and ophthalmological alterations clinically suspected to be caused by fungi and to analyze their occurrence demographically. Materials and methods. We carried out a retrospective study in a clinic in Bogota for small animals. We reviewed the medical histories of patients who requested medical appointments due to dermatological, ear and ophtalmological alterations in 2009 and 2010. Results. In the assessed period, the prevalence of dermatological alterations in dogs was of 7.8%, 4.2% of ear alterations and of 3.3% of ophtalmological alterations. The main etiological suspects through clinical diagnosis were: dermatophytes with an incidence of 86.9% among dermatological alterations, Malassezia with an 86.5% of incidence in ear alterations, and Candida with 83.3% of incidence in ophtalmological alterations. Statistical analysis of variables showed no association with symptoms or clinically diagnosed etiological agents, but the categorized evaluation showed associations of races and ages with the etiologies through clinical diagnosis. The diagnosis of fungal etiologies was accomplished in most cases by clinical findings and less frequently by skin scrapings and ear cytology; in none of the cases a mycological culture was done. The feline population showed no dermatological, ear or ophtalmological alterations compatible with a fungal etiology.  Conclusion. In canines, the prevalence of dermatological alterations clinically compatible with dermatophytes was of 86.9%; ear alterations associated with Malassezia were of 86.5%; and ophtalmological alterations Candida-suspected were 83.3%. Final diagnoses were accomplished with the help of clinical findings without following standard diagnostic methodologies such as cultivation. Key words: canines, felines, dermatophytes, Malassezia, Candida Objetivo. Determinar la prevalencia de las alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente sospechosas de ser causadas por hongos y analizar demográficamente su presentación. Materiales y métodos. Se realizó un estudio retrospectivo en una clínica para pequeños animales en Bogotá; se revisaron historias clínicas de pacientes que consultaron por alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas durante 2009 y 2010. Resultados. En el período evaluado la prevalencia de las alteraciones dermatológicas en caninos fue de 7,8%, las óticas de 4,2% y las oftalmológicas de 3,3%. Dentro de las alteraciones dermatológicas, la sospecha principal etiológica por diagnóstico clínico fueron los dermatofitos con 86,9%, en las alteraciones óticas fue Malassezia con 86,5% y para las oftalmológicas fue Candida con 83,3%. El análisis estadístico de variables no  mostró asociación con los síntomas ni con los agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; sin embargo, la evaluación categorizada evidenció asociaciones entre razas y edades con las etiologías por diagnóstico clínico. El diagnóstico de las etiologías micóticas se estableció en la mayoría de los casos por hallazgos clínicos y con menor frecuencia por raspado de piel y citología ótica; en ninguno de los casos se realizó cultivo micológico. La población felina no presentó alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente compatibles con etiología fúngica. Conclusión. En caninos, la prevalencia de las alteraciones dermatológicas clínicamente compatibles con dermatofitos fue de 86,9%, los procesos óticos asociados con Malassezia de 86,5% y los oftalmológicos sospechosos de Candida con 83,3%. Los diagnósticos definitivos se establecieron por hallazgos clínicos sin la realización de metodologías diagnósticas estándar como el cultivo. Palabras clave: caninos, felinos, dermatofitos, Malassezia, Candida. Objetivo. Determinar a prevalência das alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente suspeitas de serem causadas por fungos e analisar demograficamente sua apresentação. Materiais e métodos. Foi realizado um estudo retrospectivo numa clínica para pequenos animais em Bogotá; foram revisadas ​​as histórias clínicas de pacientes com alterações dérmicas, óticas e oftalmicas em 2009 e 2010. Resultados. Durante o período de avaliação a prevalência das alterações dérmicas em cães foi de 7,8%, as óticas de 4,2% e as oftálmicas de 3,3%. Dentro das alterações dérmicas, a principal suspeita etiológica por diagnóstico clínico foram os dermatófitos com 86,9%, nas alterações óticas foi Malassezia com 86,5% e para as oftálmicas foi  Candida com 83,3%. A análise estatística das variáveis ​​não apresentou associação com os sintomas ou com os agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; embora, a avaliação categorizada evidenciou associações entre raças e idades com as etiologias por diagnóstico clínico. O diagnóstico das etiologias micóticas foi estabelecido na maioria dos casos pelos achados clínicos e, menos freqüentemente por raspados de pele e citologia ótica, em nenhum dos casos foi realizada uma cultura micótica. A população felina não apresentou alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente compatíveis com etiologia fúngica. Conclusão. Em cães, a prevalência das alterações dérmicas clinicamente compatíveis com dermatófitos foi de 86,9%, os processos óticos associados com Malassezia foi de 86,5% e os oftálmicos suspeitos de Candida foi de 83,3%.  Os diagnósticos definitivos foram estabelecidos pelos achados clínicos sem a realização de métodos diagnósticos padroes, como o cultivo.   Palavras-chave: cães, gatos, dermatófitos, Malassezia, Candid

Genotyping of Malassezia pachydermatis disclosed genetic variation in isolates from dogs in Colombia

ABSTRACT: Malassezia pachydermatis is a lipophilic and lipid-dependent yeast mostly isolated from animals’ skin; hence, it is regarded as a zoophilic species causing otitis externa in dogs. Aspects associated with its epidemiology and pathogenicity is a matter of interest. This study aimed to conduct a molecular characterization of 43 isolates of M. pachydermatis obtained from dogs with otitis externa. For this purpose, the 5.8S internal transcribed spacer 2 (ITS2) and D1/D2 26S rRNA regions were amplified, sequenced and analyzed using restriction fragment length polymorphism (RFLP) with AluI, CfoI, and BstF5I endonucleases. Phylogenetic analyses revealed that these isolates grouped with the sequence types I, IV and V, previously proposed for M. pachydermatis. Interestingly, we found a new polymorphic RFLP pattern using BstF5I, these isolates were associated with the sequence types IV and V, nevertheless an association between polymorphic RFLP patterns, and fosfolipase activity or canine population data was not observed. These findings underline the genetic diversity of M. pachydermatis and provide new insights about the epidemiology of this species in the analyzed population