Exploratory factor analysis in studying the structure of multivariate observations

W pracy przedstawiono podstawy i zastosowania praktyczne w naukach rolniczych eksplora¬cyjnej analizy czynnikowej, EFA. Opisano zagadnienia numeryczne związane z prowadzeniem niezbędnych obliczeń. Na przykładach przedstawiono sposób interpretacji wyników EFA oraz przykłady jej wykorzystania w badaniach rolniczych.The paper presents the basic principles and practical applications in agricultural sciences of exploratory factor analysis, EFA. We described the numerical issues related to conducting the necessary calculations. Presented examples demonstrated how to interpret the results of EFA and examples of its use in agricultural research

The application of chosen similarity measures for binary data in multivariate analysis in molecular experiments

W pracy przedstawiono możliwości wykorzystania ośmiu miar podobieństwa genetycznego w analizie danych binarnych, będących matematycznym obrazem żeli elektroforetycznych uzyskiwanych w badaniach molekularnych. Scharakteryzowano miary zgodności (Gowera), Jaccarda, Nei’a i Li (Dice’a), Hamanna, Ochiai, współczynnik Y Yule’a, współczynnik Q Yule’a oraz zero-jedynkowy odpowiednik współczynnika korelacji Pearsona (phi 4-point correlation). Na przykładzie analizy porównawczej 14 odmian marchwi jadalnej (Daucus carota L.) przedstawiono wykorzystanie tych miar w analizach wielocechowych — analizie skupień metodą UPGMA oraz analizie głównych współrzędnych PCoA. Przedstawiono i omówiono wyniki przeprowadzonych analiz oraz opisano różnice pomiędzy nimi. Porównano istniejące w literaturze miary podobieństwa dla danych molekularnych pod względem zgodności wyników uzyskiwanych z analiz statystycznych.The article presents the possibility of using eight measures of genetic similarity in analysis of binary data which are a mathematical image of the electrophoresis gels obtained in molecular studies. We characterized similarity measures: simple matching (Gower), Jaccard, Nei and Li (Dice), Hamann, Ochiai, Yule Y coefficient, Yule Q coefficient and zero-one equivalent of the Pearson correlation coefficient (phi 4-point correlation). Then, the example of a comparative analysis of 14 varieties of carrots (Daucus carota L.) presents the use of these measures in a multivariate analysis — UPGMA cluster analysis and principal coordinates analysis PCoA. The results of the analysis and the differences between them were presented and discussed. The similarity measures for the molecular data existing in the literature were compared in terms of results compliance obtained from statistical analyses

Proposal of a method for assessment of biological and technological progress in crops cultivation on the example of winter wheat

W pracy, na podstawie danych produkcyjnych, zidentyfikowane cztery główne czynniki odpowiedzialne za kształtowanie się efektywności uprawy pszenicy ozimej. Przeprowadzono szczegółową analizę struktury tych czynników oraz analizę trendów zmian wartości tych czynników w latach badań. Dodatkowo przeanalizowano zmiany w czynnikach nakładowych jakie miały miejsce w badanym okresie. Przeprowadzono również analizę zmian w efektywności technologii produkcji pszenicy ozimej oraz w efektywności doboru odmian do uprawy tego gatunku.In this work, based on production data, four main factors were identified responsible for profitability of winter wheat cultivation. A detailed analysis of structure of these factors was performed and trends of changes in the factors’ values in the years of study were assayed. Additionally, changes in the costs factors were analyzed which occurred during this period. The changes in efficiency of winter wheat production technology and efficiency of selection of varieties were also examined

The application of orthogonal contrasts to determine homogeneous groups

The paper presents a modified approach to analysis of data obtained from experiments carried out according to classical factorial designs. Four examples were discussed in order to present details of proposed method. Modification of the analysis of variance presented here enables more effective use of information on how studied factors affect the means of dependent variable. The specificity of this approach is based on alternative multiple comparison procedure incorporating orthogonal contrasts to determine homogeneous groups

Canonical correlations in studying grain yield and protein content as affected by yield components: An ontogenetic approach.

In the paper, we have proposed an approach to studying the relationship between two sets of variables, when one of the sets comprises plant traits that develop sequentially. The approach joins two statistical methods, namely canonical correlations and sequential yield analysis (Mądry et al., 2005, J. New Seeds 7(1), pp. 85-107). Using the approach, grain yield and protein content in grain of two spring barley cultivars—Rasbet (with hulled grains) and Rastik (with hulless grains)—were studied as the effect of yield components that develop sequentially (number of spikes per m2, number of kernels per spike, and kernel weight)..