Discriminating small wooded elements in rural landscape from aerial photography: a hybrid pixel/object-based analysis approach

While small, fragmented wooded elements do not represent a large surface area in agricultural landscape, their role in the sustainability of ecological processes is recognized widely. Unfortunately, landscape ecology studies suffer from the lack of methods for automatic detection of these elements. We propose a hybrid approach using both aerial photographs and ancillary data of coarser resolution to automatically discriminate small wooded elements. First, a spectral and textural analysis is performed to identify all the planted-tree areas in the digital photograph. Secondly, an object-orientated spatial analysis using the two data sources and including a multi-resolution segmentation is applied to distinguish between large and small woods, copses, hedgerows and scattered trees. The results show the usefulness of the hybrid approach and the prospects for future ecological applications

Stress and strain patterns, kinematics and deformation mechanisms in a basement-cored anticline: Sheep Mountain Anticline, Wyoming

International audienceIn order to characterize and compare the stress-strain record prior to, during, and just after folding at the macroscopic and the microscopic scales and to provide insights into stress levels sustained by folded rocks, we investigate the relationship between the stress-strain distribution in folded strata derived from fractures, striated microfaults, and calcite twins and the development of the Laramide, basement-cored Sheep Mountain Anticline, Wyoming. Tectonic data were mainly collected in Lower Carboniferous to Permian carbonates and sandstones. In both rock matrix and veins, calcite twins recorded three different tectonic stages: the first stage is a pre-Laramide (Sevier) layer-parallel shortening (LPS) parallel to fold axis, the second one is a Laramide LPS perpendicular to the fold axis, and the third stage corresponds to Laramide late fold tightening with compression also perpendicular to the fold axis. Stress and strain orientations and regimes at the microscale agree with the polyphase stress evolution revealed by populations of fractures and striated microfaults, testifying for the homogeneity of stress record at different scales through time. Calcite twin analysis additionally reveals significant variations of differential stress magnitudes between fold limbs. Our results especially point to an increase of differential stress magnitudes related to Laramide LPS from the backlimb to the forelimb of the fold possibly in relation with motion of an underlying basement thrust fault that likely induced stress concentrations at its upper tip. This result is confirmed by a simple numerical model. Beyond regional implications, this study highlights the potential of calcite twin analyses to yield a representative quantitative picture of stress and strain patterns related to folding

Télédétection et Ecologie du paysage

National audienc

Les paysages boisés sont-ils propices aux syrphidés auxiliaires du blé?

Les éléments semi-naturels des paysages agricoles (bois, haies, bandes enherbées, autres bords de champs) seraient favorables aux insectes auxiliaires des cultures présents naturellement dans les paysages agricoles. Ce « réseau vert » offrirait : i) des abris pour passer l’hiver, ii) des ressources complémentaires et des hôtes de substitution. Dans cette étude, nous avons testé l’hypothèse selon laquelle les syrphes prédateurs des pucerons du blé seraient plus abondants dans des paysages boisés. Ainsi, les pucerons et les syrphes (oeufs, larves, pupes) présents dans les parcelles de blé de deux paysages différant par leur taux de boisement (Boisé : 28%, Peu Boisé : 16%) ont été échantillonnés durant les printemps 2003-2004-2005. De plus, un modèle multi-agent simulant la dynamique hivernale d’une espèce de syrphe (Episyrphus balteatus), a été utilisé sur ces deux paysages. Globalement, les abondances de pucerons et de syrphes prélevés sur le terrain ne diffèrent pas significativement entre les deux paysages. Par contre, les syrphes sont présents plus tôt et sont significativement plus nombreux en paysage boisé. Les simulations de la dynamique hivernale sur le modèle ont montré que les taux de survie hivernale sont plus forts dans les paysages boisés grâce à la présence de prairies et de lisières boisées orientées au Sud. En conclusion, les paysages boisés permettraient une survie plus importante en hiver qui expliquerait des abondances printanières plus fortes. Cet effet disparaîtrait avec l’avancée du printemps. Cette fenêtre temporelle courte (hiver / début du printemps) pourrait être décisive dans la régulation précoce des populations de pucerons

Contrôle du remplissage détritique tardiglaciaire à holocène d'une haute vallée alpine par les dynamiques de versant : l'exemple de la moyenne Maurienne (Savoie).

Les cônes de déjection constituent le trait morphologique majeur de l'étroite vallée de l'Arc (Savoie), entre les ombilics de Saint-Jean-de-Maurienne et Saint-Michel-de-Maurienne. Une reconstitution géométrique des différents corps sédimentaires constitutifs de ces cônes a été rendue possible grâce à la corrélation de données géomorphologiques, à la synthèse des données de forages de diverses campagnes de reconnaissance pour EDF et Alpetunnel et à l'utilisation de données géophysiques. Un calage stratigraphique a été établi à partir de datations de bois fossilisés puis une évolution paléogéographique est proposée. Elle montre que, dans cette gorge de raccordement, le remplissage tardiglaciaire à holocène est fortement contrôlé par les dépôts torrentiels latéraux, des coulées boueuses, des écroulements rocheux massifs et glissements de terrain. En barrant cette étroite vallée, ces dépôts gravitaires favorisent localement une sédimentation lacustre

Regional-scale paleofluid system across the Tuscan Nappe–Umbria–Marche Apennine Ridge (northern Apennines) as revealed by mesostructural and isotopic analyses of stylolite–vein networks

We report the results of a multiproxy study that combines structural analysis of a fracture–stylolite network and isotopic characterization of calcite vein cements and/or fault coating. Together with new paleopiezometric and radiometric constraints on burial evolution and deformation timing, these results provide a first-order picture of the regional fluid systems and pathways that were present during the main stages of contraction in the Tuscan Nappe and Umbria–Marche Apennine Ridge (northern Apennines). We reconstruct four steps of deformation at the scale of the belt: burial-related stylolitization, Apenninic-related layer-parallel shortening with a contraction trending NE–SW, local extension related to folding, and late-stage fold tightening under a contraction still striking NE–SW. We combine the paleopiezometric inversion of the roughness of sedimentary stylolites – that constrains the range of burial depth of strata prior to layer-parallel shortening – with burial models and U–Pb absolute dating of fault coatings in order to determine the timing of development of mesostructures. In the western part of the ridge, layer-parallel shortening started in Langhian time (∼15 Ma), and then folding started at Tortonian time (∼8 Ma); late-stage fold tightening started by the early Pliocene (∼5 Ma) and likely lasted until recent/modern extension occurred (∼3 Ma onward). The textural and geochemical (δ18O, δ13C, Δ47CO2 and 87Sr∕86Sr) study of calcite vein cements and fault coatings reveals that most of the fluids involved in the belt during deformation either are local or flowed laterally from the same reservoir. However, the western edge of the ridge recorded pulses of eastward migration of hydrothermal fluids (>140 ∘C), driven by the tectonic contraction and by the difference in structural style of the subsurface between the eastern Tuscan Nappe and the Umbria–Marche Apennine Ridge

Resultados de la tercera temprada de campo 2001 del proyecto Peten noroccidente - La Joyanca, la libertad, Peten

International audienceSe presenta la información arqueológica y geográfica más reciente recuperada en el Noroccidente de Petén a través de investigaciones sistemáticas realizadas tanto en el centro y la periferia del sitio arqueológico La Joyanca como en la región circundante, proponiendo una visión de carácter local y regional. En general, ha existido una laguna de información y excavaciones en esta región de la tierras bajas mayas. Dichas investigaciones aqui resumidas en la presente ponencia aportan nuevos datos sobre las formas del asentamiento de La Joyanca, una "ciudad" de tercer orden, y de otros sitios estudiados en la región

Au pays maya des lacs et des marais recherches archéologiques et géographiques (1999-2001)

National audienceLes sociétés mayas des hautes terres ont connu un déclin culturel marqué à la fin du Préclassique (vers 100-250 apr. JC) au moment où, pour la plupart, les cités mayas des basses terres prenaient leur essor au début du Classique (250-300 apr. J.C.). Environ 600 ans plus tard, celles du Petén (Guatemala) étaient presque toutes abandonnées alors que celles des basses terres du nord connaissaient leur apogée jusqu'au début du Postclassique. En termes géographiques, il s'agit d'analyser l'évolution d'anthropo-systèmes formés en forêt tropicale humide de mousson, soit une des rares zones où s'est développée dans le passé une civilisation puissante, agricole et urbaine sur une longue durée. Le projet Petén nord-ouest La Joyanca a pour objet l'étude d'une communauté socio-politique de rang moyen, d'époque classique, située dans une région des basses terres jusqu'à présent quasiment inconnue du point de vue archéologique. Ce projet est particulier, d'une part car il associe une approche archéologique et géographique, cherchant à restituer l'histoire des hommes en même temps que l'histoire du milieu, d'autre part parce que l'initiative de cette recherche et son financement proviennent d'une compagnie pétrolière. Ce site de la Joyanca apporte des éléments nouveaux dans le corpus des "cités" mayas classiques des basses terres du Petén : désintégration du centre politico-religieux et des ensembles de palais, association étroite au centre, dans le temps et dans l'espace, des lieux de culte et d'un grand édifice politique complexe, faible densité de l'habitat

NKX3.1 is a direct TAL1 target gene that mediates proliferation of TAL1-expressing human T cell acute lymphoblastic leukemia

TAL1 (also known as SCL) is expressed in >40% of human T cell acute lymphoblastic leukemias (T-ALLs). TAL1 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor that can interfere with the transcriptional activity of E2A and HEB during T cell leukemogenesis; however, the oncogenic pathways directly activated by TAL1 are not characterized. In this study, we show that, in human TAL1–expressing T-ALL cell lines, TAL1 directly activates NKX3.1, a tumor suppressor gene required for prostate stem cell maintenance. In human T-ALL cell lines, NKX3.1 gene activation is mediated by a TAL1–LMO–Ldb1 complex that is recruited by GATA-3 bound to an NKX3.1 gene promoter regulatory sequence. TAL1-induced NKX3.1 activation is associated with suppression of HP1-α (heterochromatin protein 1 α) binding and opening of chromatin on the NKX3.1 gene promoter. NKX3.1 is necessary for T-ALL proliferation, can partially restore proliferation in TAL1 knockdown cells, and directly regulates miR-17-92. In primary human TAL1-expressing leukemic cells, the NKX3.1 gene is expressed independently of the Notch pathway, and its inactivation impairs proliferation. Finally, TAL1 or NKX3.1 knockdown abrogates the ability of human T-ALL cells to efficiently induce leukemia development in mice. These results suggest that tumor suppressor or oncogenic activity of NKX3.1 depends on tissue expression

Pan-Cancer Analysis of lncRNA Regulation Supports Their Targeting of Cancer Genes in Each Tumor Context

Long noncoding RNAs (lncRNAs) are commonly dys-regulated in tumors, but only a handful are known toplay pathophysiological roles in cancer. We inferredlncRNAs that dysregulate cancer pathways, onco-genes, and tumor suppressors (cancer genes) bymodeling their effects on the activity of transcriptionfactors, RNA-binding proteins, and microRNAs in5,185 TCGA tumors and 1,019 ENCODE assays.Our predictions included hundreds of candidateonco- and tumor-suppressor lncRNAs (cancerlncRNAs) whose somatic alterations account for thedysregulation of dozens of cancer genes and path-ways in each of 14 tumor contexts. To demonstrateproof of concept, we showed that perturbations tar-geting OIP5-AS1 (an inferred tumor suppressor) andTUG1 and WT1-AS (inferred onco-lncRNAs) dysre-gulated cancer genes and altered proliferation ofbreast and gynecologic cancer cells. Our analysis in-dicates that, although most lncRNAs are dysregu-lated in a tumor-specific manner, some, includingOIP5-AS1, TUG1, NEAT1, MEG3, and TSIX, synergis-tically dysregulate cancer pathways in multiple tumorcontexts