Le gène de fusion EML4-ALK dans l'adénocarcinome pulmonaire (étude de différentes méthodes diagnostiques)

l'éventuel impact thérapeutique de la connaissance du type de variant en cause et de son niveau d'expression. Le gène de fusion EML4-ALK, exclusif des mutations d'EGFR et KRAS, est observé dans 5 % des adénocarcinomes pulmonaires, préférentiellement chez le non-fumeur. L'intérêt de son diagnostic repose sur les résultats encourageants obtenus par un inhibiteur de ALK dans un essai clinique de phase II. Aucun laboratoire français ne proposant encore un diagnostic du réarrangement de ALK dans cette indication, le but de ce travail a été de comparer les performances diagnostiques de 4 techniques différentes, en vue d'un transfert à la pratique quotidienne. Vingt adénocarcinomes pulmonaires, non mutés EGFR et survenant chez des patients non- ou faiblement fumeurs, ont été étudiés. A partir de matériel congelé, une RT-PCR multiplex a permis d'identifier 4 cas positifs. Ces cas ont été confirmés par séquençage et par RT-PCR quantitative. Sur échantillons inclus en paraffine, la RT-PCR quantitative a permis de retrouver 2 des 4 cas positifs, les 2 négatifs l'étant probablement pour des raisons d'hétérogénéité intratumorale du réarrangement de ALK pour un cas ou de fixation inadéquate pour l'autre. La FISH a retrouvé 3 des 4 cas positifs, le cas restant n'ayant pas permis d'obtenir une hybridation des sondes. De 4 autres cas présentant un aspect histologique évocateur, la FISH a identifié 2 cas comme étant positifs, dont l'un a été confirmé par RT-PCR a partir de matériel inclus en paraffine. Les techniques de FISH et de RT-PCR ont montré leur robustesse diagnostique. Ces deux approches apparaissent néanmoins comme étant encore complémentaires, avant que ne soit connuPARIS6-Bibl.Pitié-Salpêtrie (751132101) / SudocSudocFranceF